Verfügbarkeit: Populationsstruktur, antimikrobielle Resistenz und Fitness von Pseudomonas aeruginosa bei Menschen und Tieren

Populationsstruktur, antimikrobielle Resistenz und Fitness von Pseudomonas aeruginosa bei Menschen und Tieren:

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Dambon, Franziska (VerfasserIn)
Format:	Abschlussarbeit Buch
Sprache:	German
Veröffentlicht:	Gießen VVB Laufersweiler Verlag 2021
Ausgabe:	1. Auflage
Schriftenreihe:	Edition Scientifique
Schlagworte:	Pseudomonas aeruginosa antibiotic resistance virulence factors cystic fibrosis dogs cats population structure Mikroben Population Bakterien Hochschulschrift
Online-Zugang:	Inhaltsverzeichnis
Beschreibung:	VI, 166 Seiten Illustrationen, Diagramme 21 cm x 14.8 cm, 250 g
ISBN:	9783835970052 3835970054

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adam_text	1 INHALT 1 INHALT ...................................................................................................................................... I 2 ABKUERZUNGSVERZEICHNIS ..................................................................................................... IV 3 EINLEITUNG .............................................................................................................................. 1 4 LITERATURUEBERSICHT ................................................................................................................. 3 4.1 BIOLOGIE VON P. AERUGINOSA ............................................................................................ 3 4.2 P. AERUGINOSA ALS KRANKHEITSERREGER ............................................................................ 4 4.2.1 P. AERUGINOSA-LEKTIONEN BEI IMMUNKOMPETENTEN MENSCHEN ............................. 4 4.2.2 NOSOKOMIALE INFEKTIONEN DURCH P. AERUGINOSA BEIM MENSCHEN ........................... 5 4.2.3 CYSTISCHE FIBROSE - MUKOVISZIDOSE ........................................................................ 6 4.2.4 PSEUDOMONAS AERUGINOSA- NTEKI ONEN BEI TIEREN ............................................... 7 4.3 POPULATIONSSTRUKTUR VON P. AERUGINOSA ........................................................................ 9 4.4 NATUERLICHE RESISTENZ ..................................................................................................... 11 4.5 DURCH MUTATION ERWORBENE RESISTENZ ......................................................................... 12 4.5.1 EFFLUXSYSTEME ......................................................................................................... 12 4.5.2 VERLUST DES OPRD-PORINS ....................................................................................... 13 4.5.3 UEBEREXPRESSION DER AMPC-SS-LAKTAMASE ............................................................ 13 4.5.4 MUTATIONEN IN TYP-IL TOPOISOMERASE & TOPOISOMERASE-IV ................................. 14 4.5.5 RESISTENZ GEGEN POLYMYXINE ................................................................................ 14 4.6 RESISTENZ VERMITTELT DURCH ERWORBENE RESISTENZGENE ................................................ 15 4.6.1 AMINOGLYKOSID-MODIFIZIERENDE ENZYME (AME) .................................................... 15 4.6.2 ERWORBENE SS-LAKTAMASEN ..................................................................................... 16 4.6.3 ERWORBENE SS-LAKTAMASEN BEI P. AERUGINOSA- SO ATEN VON TIEREN .................... 20 4.7 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA .............................................................. 23 4.7.1 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA- SOLATEN VON MENSCHEN ................. 23 4.7.2 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON HUNDEN UND KATZEN 24 4.7.3 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON NUTZTIEREN ................. 29 4.7.4 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON PFERDEN ................... 30 4.8 VIRULENZFAKTOREN ........................................................................................................... 30 4.8.1 LPS ......................................................................................................................... 32 4.8.2 FLAGEILUM UND TYP-IV PILI ...................................................................................... 33 4.8.3 TYP-3-SEKRETIONSSYSTEM (T3SS) .......................................................................... 33 4.8.4 EXIA ........................................................................................................................ 34 4.8.5 TOXA ....................................................................................................................... 35 4.8.6 PROTEASEN, ELASTASEN ............................................................................................ 36 4.8.7 WEITERE VIRULENZFAKTOREN ...................................................................................... 36 4.9 BIOFILM ........................................................................................................................... 37 5 MATERIAL UND METHODEN .................................................................................................... 41 5.1 MATERIAL ......................................................................................................................... 41 5.1.1 CHEMIKALIEN, NAEHRMEDIEN, LOESUNGEN UND PUFFER .............................................. 41 5.1.2 VERWENDETE COMPUTERPROGRAMME ...................................................................... 41 5.1.3 HERKUNFT DER P. AERUGINOSA- SO ATE VOM TIER ...................................................... 41 5.1.4 HERKUNFT DER HUMANEN P. ...................................................................................... 43 5.1.5 REFERENZ UND KONTROLLSTAEMME .............................................................................. 44 5.2 METHODEN ...................................................................................................................... 45 5.2.1 ANTIMIKROBIELLE EMPFINDLICHKEITSPRUEFUNG ............................................................... 45 5.2.2 MHK-BESTIMMUNG VON IMIPENEM MITTELS EPSILOMETERTEST .................................. 46 5.2.3 ASSERVIERUNG DER ISOLATE ........................................................................................46 5.2.4 MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN ............................................................................ 46 5.2.5 UNTERSUCHUNG ZUR BIOFILMBILDUNG ........................................................................... 52 5.2.6 UNTERSUCHUNG DER MOTILITAET .................................................................................... 54 5.2.7 UNTERSUCHUNG DER IN .. ............................................................................................ 55 5.2.8 TESTUNG DER IN VIVO-VIRULENZ IM GALLERIA .............................................................. 55 6 ERGEBNISSE ......................................................................................................................... 57 6.1 ANTIMIKROBIELLE EMPFINDLICHKEIT ..................................................................................... 57 6.2 RESISTENZGENTESTUNG ..................................................................................................... 63 6.3 CHROMOSOMALE, MUTATIONSBEDINGTE RESISTENZEN ........................................................ 68 6.3.1 MUTATIONSBEDINGTES RESISTOM GEGEN SS-LAKTAM-ANTIBIOTIKA ................................ 69 6.3.2 MUTATIONSBEDINGTES RESISTOM GEGEN FLUORCHINOLONE ......................................... 74 6.3.3 AMINOGLYKOSID-RESISTENZ VERMITTELNDE GENE ...................................................... 77 6.3.4 COLISTINRESISTENZ VERMITTELNDE MUTATIONEN ............................................................ 78 6.4 VIRULENZGENTESTUNG ....................................................................................................... 79 6.5 PHYLOGENETISCHE UNTERSUCHUNGEN ................................................................................ 80 6.6 KRISTALLVIOLETT-MIKROTITERPLATTENTEST (KV-MTP-TEST) ...................................................... 86 6.7 SILIKONFOLIENASSAY ........................................................................................................... 89 6.8 IN VITRO KOMPETITIONSASSAY ............................................................................................. 91 6.9 UNTERSUCHUNG DER SCHWIMMENDEN FORTBEWEGUNG ...................................................... 93 6.9.1 EINFLUSS EINER SUBINHIBITORISCHEN ANTIBIOTIKAKONZENTRATION AUF DIE SCHWIMMENDE FORTBEWEGUNG VON P. 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AERUGINOSA .......................................................... 113 7.4 PHAENOTYPISCHE UNTERSUCHUNGEN ZUR VIRULENZ, BIOFILMBILDUNG UND MOTILITAET .............. 116 II 7.4.1 BIOFILMBILDUNG ....................................................................................................... 116 7.4.2 VIRULENZGENE ........................................................................................................ 118 7.4.3 IN VITRO FITNESS IMIPENEM-RESISTENTER P. 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adam_txt	1 INHALT 1 INHALT . I 2 ABKUERZUNGSVERZEICHNIS . IV 3 EINLEITUNG . 1 4 LITERATURUEBERSICHT . 3 4.1 BIOLOGIE VON P. AERUGINOSA . 3 4.2 P. AERUGINOSA ALS KRANKHEITSERREGER . 4 4.2.1 P. AERUGINOSA-LEKTIONEN BEI IMMUNKOMPETENTEN MENSCHEN . 4 4.2.2 NOSOKOMIALE INFEKTIONEN DURCH P. AERUGINOSA BEIM MENSCHEN . 5 4.2.3 CYSTISCHE FIBROSE - MUKOVISZIDOSE . 6 4.2.4 PSEUDOMONAS AERUGINOSA-\NTEKI\ONEN BEI TIEREN . 7 4.3 POPULATIONSSTRUKTUR VON P. AERUGINOSA . 9 4.4 NATUERLICHE RESISTENZ . 11 4.5 DURCH MUTATION ERWORBENE RESISTENZ . 12 4.5.1 EFFLUXSYSTEME . 12 4.5.2 VERLUST DES OPRD-PORINS . 13 4.5.3 UEBEREXPRESSION DER AMPC-SS-LAKTAMASE . 13 4.5.4 MUTATIONEN IN TYP-IL TOPOISOMERASE & TOPOISOMERASE-IV . 14 4.5.5 RESISTENZ GEGEN POLYMYXINE . 14 4.6 RESISTENZ VERMITTELT DURCH ERWORBENE RESISTENZGENE . 15 4.6.1 AMINOGLYKOSID-MODIFIZIERENDE ENZYME (AME) . 15 4.6.2 ERWORBENE SS-LAKTAMASEN . 16 4.6.3 ERWORBENE SS-LAKTAMASEN BEI P. AERUGINOSA-\SO\ATEN VON TIEREN . 20 4.7 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA . 23 4.7.1 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-\ SOLATEN VON MENSCHEN . 23 4.7.2 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON HUNDEN UND KATZEN 24 4.7.3 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON NUTZTIEREN . 29 4.7.4 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON PFERDEN . 30 4.8 VIRULENZFAKTOREN . 30 4.8.1 LPS . 32 4.8.2 FLAGEILUM UND TYP-IV PILI . 33 4.8.3 TYP-3-SEKRETIONSSYSTEM (T3SS) . 33 4.8.4 EXIA . 34 4.8.5 TOXA . 35 4.8.6 PROTEASEN, ELASTASEN . 36 4.8.7 WEITERE VIRULENZFAKTOREN . 36 4.9 BIOFILM . 37 5 MATERIAL UND METHODEN . 41 5.1 MATERIAL . 41 5.1.1 CHEMIKALIEN, NAEHRMEDIEN, LOESUNGEN UND PUFFER . 41 5.1.2 VERWENDETE COMPUTERPROGRAMME . 41 5.1.3 HERKUNFT DER P. AERUGINOSA-\SO\ATE VOM TIER . 41 5.1.4 HERKUNFT DER HUMANEN P. . 43 5.1.5 REFERENZ UND KONTROLLSTAEMME . 44 5.2 METHODEN . 45 5.2.1 ANTIMIKROBIELLE EMPFINDLICHKEITSPRUEFUNG . 45 5.2.2 MHK-BESTIMMUNG VON IMIPENEM MITTELS EPSILOMETERTEST . 46 5.2.3 ASSERVIERUNG DER ISOLATE .46 5.2.4 MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN . 46 5.2.5 UNTERSUCHUNG ZUR BIOFILMBILDUNG . 52 5.2.6 UNTERSUCHUNG DER MOTILITAET . 54 5.2.7 UNTERSUCHUNG DER IN . . 55 5.2.8 TESTUNG DER IN VIVO-VIRULENZ IM GALLERIA . 55 6 ERGEBNISSE . 57 6.1 ANTIMIKROBIELLE EMPFINDLICHKEIT . 57 6.2 RESISTENZGENTESTUNG . 63 6.3 CHROMOSOMALE, MUTATIONSBEDINGTE RESISTENZEN . 68 6.3.1 MUTATIONSBEDINGTES RESISTOM GEGEN SS-LAKTAM-ANTIBIOTIKA . 69 6.3.2 MUTATIONSBEDINGTES RESISTOM GEGEN FLUORCHINOLONE . 74 6.3.3 AMINOGLYKOSID-RESISTENZ VERMITTELNDE GENE . 77 6.3.4 COLISTINRESISTENZ VERMITTELNDE MUTATIONEN . 78 6.4 VIRULENZGENTESTUNG . 79 6.5 PHYLOGENETISCHE UNTERSUCHUNGEN . 80 6.6 KRISTALLVIOLETT-MIKROTITERPLATTENTEST (KV-MTP-TEST) . 86 6.7 SILIKONFOLIENASSAY . 89 6.8 IN VITRO KOMPETITIONSASSAY . 91 6.9 UNTERSUCHUNG DER SCHWIMMENDEN FORTBEWEGUNG . 93 6.9.1 EINFLUSS EINER SUBINHIBITORISCHEN ANTIBIOTIKAKONZENTRATION AUF DIE SCHWIMMENDE FORTBEWEGUNG VON P. AERUGINOSA-ISOLATEN . 96 6.10 T ESTUNG DER IN VIVO-VIRULENZ IM GALLERIA MELLONELLA-MODEW . 100 7 DISKUSSION . 103 7.1 AUFBAU DER STUDIE . 103 7.2 PHAENOTYPISCHE RESISTENZ VON P. AERUGINOSA-ISOLATEN VON TIEREN . 103 7.3 GENOTYPISCHE RESISTENZEIGENSCHAFTEN BEI P. AERUGINOSA-ISOLATEN VOM TIER . 109 7.3.1 POPULATIONSSTRUKTUR VON P. AERUGINOSA . 113 7.4 PHAENOTYPISCHE UNTERSUCHUNGEN ZUR VIRULENZ, BIOFILMBILDUNG UND MOTILITAET . 116 II 7.4.1 BIOFILMBILDUNG . 116 7.4.2 VIRULENZGENE . 118 7.4.3 IN VITRO FITNESS IMIPENEM-RESISTENTER P. AERUGINOSA-\SO\ATE . 120 7.4.4 MOTILITAET . 121 8 ZUSAMMENFASSUNG . 123 9 SUMMARY . 126 10 LITERATUR . 129 11 ANHANG . 145 11.1 UEBERSICHT UEBER VERWENDETE CHEMIKALIEN, GERAETE UND VERBRAUCHSMATERIALIEN . 145 11.2 VERWENDETE PUFFER UND LOESUNGEN . 150 11.3 VERWENDETE NAEHRMEDIEN . 153 11.4 REFERENZSTAEMME . 154 11.5 GEN-BANK ACCESSION-NUMMERN UND REFERENZEN DER UNTERSUCHTEN GENE . 155 11.5.1 SEROTYPEN . 155 11.5.2 VIRULENZ-ASSOZIIERTE GENE . 156 11.6 SONSTIGE EINMALIG AUFTRETENDE SEQUENZTYPEN . 160 12 ABBILDUNGSVERZEICHNIS . 161 13 TABELLENVERZEICHNIS . 163 14 DANKSAGUNG . 165 III
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