Einführung in die BIOinformatik: eine Anleitung für Einsteiger
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Berlin
Springer Spektrum
[2022]
|
| Schriftenreihe: | Lehrbuch
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INHALTSVERZEICHNIS
I
KLASSISCHE
TAXONOMIE
UND
MOLEKULARE
BIOLOGIE
1
FUNDAMENT
DER
BIOINFORMATIK:
KLASSISCHE
SYSTEMATIK
UND
PHYLOGENIE
.
3
1.1
WAS
SIND
ARTEN?
.
5
1.2
KLASSISCHE
SYSTEMATIK
(TAXONOMIE)
.
7
1.3
DER
YYRICHTIGE"
STAMMBAUM
DURCH
PARSIMONIE
.
27
1.4
COMPUTERPROGRAMME
ZUR
ABLEITUNG
VON
STAMMBAEUMEN
.
30
1.5
ETHNIZITAET/YYRASSE"/DIVERSITAET
.
31
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
1
-
TAXONOMIE
UND
PHYLOGENETIK
.
35
AUFGABEN
KAPITEL
1
.
37
2
FUNDAMENT
DER
BLOINFORMATIK:
DNA
UND
PROTEINE
.
41
2.1
NUKLEINSAEUREN
.
43
2.2
AMINOSAEUREN
UND
PROTEINE
.
51
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
2
.
69
AUFGABEN
KAPITEL
2:
DNA/RNA
UND
PROTEINE
.
72
II
PRINZIPIEN
DER
BIOINFORMATIK
3
INFORMATION
FUER
DIE
BLOINFORMATIK
.
75
3.1
DER
UNTERSCHIED
VON
INFORMATION
UND
IHRER
BEDEUTUNG
.
77
3.2
INFORMATIONSQUELLEN
BIOLOGISCHER
INFORMATION:
DATENBANKEN
.
82
3.3
WICHTIGE
DATENBANKEN
FUER
GENE
UND
PROTEINE
.
84
3.4
PUBMED
EINE
WICHTIGE
QUELLE
FUER
BIOMEDIZINISCHE
INFORMATION
.
86
3.5
SUCHE
VON
DNA-/RNA-SEQUENZEN
.
87
3.6
SUCHE
VON
PROTEINEN
.
89
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
3
-
INFORMATION
.
91
AUFGABEN
KAPITEL
3
-
INFORMATION
.
92
4
MOLEKULARE
HOMOLOGIE,
DIE
BASIS
DER
BIOINFORMATIK
.
95
4.1
VORAUSSETZUNG
FUER
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
97
4.2
KRITERIEN
FUER
HOMOLOGIE
VON
DNA
UND
PROTEINSEQUENZEN
.
101
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
4
-
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
105
AUFGABEN
KAPITEL
4
-
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
106
5
ALIGNMENT,
DAS
WERKZEUG
ZUR
UNTERSUCHUNG
VON
MOLEKULAREN
HOMOLOGIEN
.
109
5.1
PAARWEISES
ALIGNMENT
.
112
5.2
SUBSTITUTIONSMATRIZEN
.
123
5.3
DURCHFUEHRUNG
PAARWEISER
ALIGNMENTS
.
140
5.4
HEURISTISCHE
SEQUENZSUCHE
IN
DATENBANKEN
.
146
5.5
MULTIPLES
ALIGNMENT
.
152
5.6
ALIGNMENT
VON
3-D-STRUKTUREN
.
158
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
5
-
ALIGNMENT
.
162
AUFGABEN
FUER
KAPITEL
5
-
ALIGNMENT
.
165
6
DURCHFUEHRUNG
MOLEKULAR-PHYLOGENETISCHER
ANALYSEN
.
167
6.1
MOLEKULARE
SYSTEMATIK:
DNA-BARCODING
.
170
6.2
MOLEKULARE
PHYLOGENIE:
SEQUENZ
IST
NICHT
ALLES.
173
6.3
MOLEKULARE
UHR:
TIMING
IST
ALLES
.
174
6.4
ABLEITUNG
VON
PHYLOGENETISCHEN
STAMMBAEUMEN
.
176
6.5
PROTEIN-ODER
NUKLEOTIDSEQUENZEN?
.
188
6.6
SCHRITTEZUR
ABLEITUNG
EINER
MOLEKULAREN
PHYLOGENIE
.
189
6.7
GENOMBASIERTE
PHYLOGENIEN
VON
MIKROORGANISMEN
.
190
6.8
ABLEITUNG
MOLEKULARER
PHYLOGENIEN
VON
VIREN
.
191
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
6
-
MOLEKULARE
PHYLOGENIE
.
201
AUFGABEN
KAPITEL
6
-
MOLEKULARE
PHYLOGENIE
.
205
7
MODERNE ANWENDUNGEN
DER
BIOINFORMATIK
.
209
7.1
TRANSCRIPTOMICS
-
SERIAL
ANALYSIS
OF
GENE
EXPRESSION
(SAGE)
.
211
7.2
TRANSCRIPTOMICS
-
GENE
ARRAY
.
213
7.3
TRANSCRIPTOMICS
-
DNA
MICROARRAYS
.
216
7.4
VORHERSAGE
VON
GENOMSTRUKTUREN
.
223
7.5
VORHERSAGE
DER
SEKUNDAERSTRUKTUR
VON
PROTEINEN
.
226
7.6
VORHERSAGE
VON
TRANSMEMBRANPROTEINEN
MIT
.
233
7.7
VORHERSAGE
VON
TRANSMEMBRANPROTEINEN
MIT
SS-FALTBLATT
STRUKTUREN
.
237
7.8
VORHERSAGE
VON
SEKUNDAERSTRUKTUREN
VON
RNA
.
239
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
7
-
MODERNE
METHODEN
.
240
AUFGABEN
KAPITEL
7
-
MODERNE
ANWENDUNGEN
.
242
SERVICETEIL
ANHANG
.
246
LITERATUR
.
270
STICHWORTVERZEICHNIS
.
275 |
| adam_txt |
INHALTSVERZEICHNIS
I
KLASSISCHE
TAXONOMIE
UND
MOLEKULARE
BIOLOGIE
1
FUNDAMENT
DER
BIOINFORMATIK:
KLASSISCHE
SYSTEMATIK
UND
PHYLOGENIE
.
3
1.1
WAS
SIND
ARTEN?
.
5
1.2
KLASSISCHE
SYSTEMATIK
(TAXONOMIE)
.
7
1.3
DER
YYRICHTIGE"
STAMMBAUM
DURCH
PARSIMONIE
.
27
1.4
COMPUTERPROGRAMME
ZUR
ABLEITUNG
VON
STAMMBAEUMEN
.
30
1.5
ETHNIZITAET/YYRASSE"/DIVERSITAET
.
31
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
1
-
TAXONOMIE
UND
PHYLOGENETIK
.
35
AUFGABEN
KAPITEL
1
.
37
2
FUNDAMENT
DER
BLOINFORMATIK:
DNA
UND
PROTEINE
.
41
2.1
NUKLEINSAEUREN
.
43
2.2
AMINOSAEUREN
UND
PROTEINE
.
51
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
2
.
69
AUFGABEN
KAPITEL
2:
DNA/RNA
UND
PROTEINE
.
72
II
PRINZIPIEN
DER
BIOINFORMATIK
3
INFORMATION
FUER
DIE
BLOINFORMATIK
.
75
3.1
DER
UNTERSCHIED
VON
INFORMATION
UND
IHRER
BEDEUTUNG
.
77
3.2
INFORMATIONSQUELLEN
BIOLOGISCHER
INFORMATION:
DATENBANKEN
.
82
3.3
WICHTIGE
DATENBANKEN
FUER
GENE
UND
PROTEINE
.
84
3.4
PUBMED
EINE
WICHTIGE
QUELLE
FUER
BIOMEDIZINISCHE
INFORMATION
.
86
3.5
SUCHE
VON
DNA-/RNA-SEQUENZEN
.
87
3.6
SUCHE
VON
PROTEINEN
.
89
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
3
-
INFORMATION
.
91
AUFGABEN
KAPITEL
3
-
INFORMATION
.
92
4
MOLEKULARE
HOMOLOGIE,
DIE
BASIS
DER
BIOINFORMATIK
.
95
4.1
VORAUSSETZUNG
FUER
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
97
4.2
KRITERIEN
FUER
HOMOLOGIE
VON
DNA
UND
PROTEINSEQUENZEN
.
101
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
4
-
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
105
AUFGABEN
KAPITEL
4
-
MOLEKULARE
HOMOLOGIE
.
106
5
ALIGNMENT,
DAS
WERKZEUG
ZUR
UNTERSUCHUNG
VON
MOLEKULAREN
HOMOLOGIEN
.
109
5.1
PAARWEISES
ALIGNMENT
.
112
5.2
SUBSTITUTIONSMATRIZEN
.
123
5.3
DURCHFUEHRUNG
PAARWEISER
ALIGNMENTS
.
140
5.4
HEURISTISCHE
SEQUENZSUCHE
IN
DATENBANKEN
.
146
5.5
MULTIPLES
ALIGNMENT
.
152
5.6
ALIGNMENT
VON
3-D-STRUKTUREN
.
158
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
5
-
ALIGNMENT
.
162
AUFGABEN
FUER
KAPITEL
5
-
ALIGNMENT
.
165
6
DURCHFUEHRUNG
MOLEKULAR-PHYLOGENETISCHER
ANALYSEN
.
167
6.1
MOLEKULARE
SYSTEMATIK:
DNA-BARCODING
.
170
6.2
MOLEKULARE
PHYLOGENIE:
SEQUENZ
IST
NICHT
ALLES.
173
6.3
MOLEKULARE
UHR:
TIMING
IST
ALLES
.
174
6.4
ABLEITUNG
VON
PHYLOGENETISCHEN
STAMMBAEUMEN
.
176
6.5
PROTEIN-ODER
NUKLEOTIDSEQUENZEN?
.
188
6.6
SCHRITTEZUR
ABLEITUNG
EINER
MOLEKULAREN
PHYLOGENIE
.
189
6.7
GENOMBASIERTE
PHYLOGENIEN
VON
MIKROORGANISMEN
.
190
6.8
ABLEITUNG
MOLEKULARER
PHYLOGENIEN
VON
VIREN
.
191
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
6
-
MOLEKULARE
PHYLOGENIE
.
201
AUFGABEN
KAPITEL
6
-
MOLEKULARE
PHYLOGENIE
.
205
7
MODERNE ANWENDUNGEN
DER
BIOINFORMATIK
.
209
7.1
TRANSCRIPTOMICS
-
SERIAL
ANALYSIS
OF
GENE
EXPRESSION
(SAGE)
.
211
7.2
TRANSCRIPTOMICS
-
GENE
ARRAY
.
213
7.3
TRANSCRIPTOMICS
-
DNA
MICROARRAYS
.
216
7.4
VORHERSAGE
VON
GENOMSTRUKTUREN
.
223
7.5
VORHERSAGE
DER
SEKUNDAERSTRUKTUR
VON
PROTEINEN
.
226
7.6
VORHERSAGE
VON
TRANSMEMBRANPROTEINEN
MIT
.
233
7.7
VORHERSAGE
VON
TRANSMEMBRANPROTEINEN
MIT
SS-FALTBLATT
STRUKTUREN
.
237
7.8
VORHERSAGE
VON
SEKUNDAERSTRUKTUREN
VON
RNA
.
239
ZUSAMMENFASSUNG
KAPITEL
7
-
MODERNE
METHODEN
.
240
AUFGABEN
KAPITEL
7
-
MODERNE
ANWENDUNGEN
.
242
SERVICETEIL
ANHANG
.
246
LITERATUR
.
270
STICHWORTVERZEICHNIS
.
275 |
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