Evaluation eines diagnostischen Markersets auf Basis der DNA-Methylierung für das Harnblasenkarzinom:
Gespeichert in:
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| Veröffentlicht: |
Jena
[2020]
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|---|---|
| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
......................................................................................
VI
ZUSAMMENFASSUNG
............................................................................................
VIII
1
EINLEITUNG
.............................................................................................
1
1.1
DAS
HAMBLASENKARZINOM
...........................................................................
1
1.1.1
ANATOMIE
UND
HISTOLOGIE
DER
HARNBLASE
................................................................
1
1.1.2
EPIDEMIOLOGIE
........................................................................................................
2
1.1.3
RISIKOFAKTOREN
........................................................................................................
2
1.1.4
KLASSIFIKATION
.........................................................................................................
3
1.1.5
SYMPTOME
UND
DIAGNOSTIK
.....................................................................................
5
1.1.6
THERAPIE
UND
PROGNOSE
...........................................................................................
6
1.2
EPIGENETIK
..................................................................................................
7
1.2.1
ALLGEMEINES
............................................................................................................
7
1.2.2
DNA-METHYLIERUNG
...............................................................................................
8
1.2.3
DNA-METHYLIERUNG
BEI
MALIGNEN
ERKRANKUNGEN
..................................................
9
1.2.4
DNA-METHYLIERUNG
BEIM
HAMBLASENKARZINOM
..................................................
11
1.3
ZIELSETZUNG
................................................................................................
12
2
MATERIAL
UND
METHODEN
..............................................................14
2.1
MATERIAL
.....................................................................................................
14
2.1.1
GERAETE
...................................................................................................................
14
2.1.2
MATERIALIEN
...........................................................................................................
15
2.1.3
KITS
.......................................................................................................................
15
2.1.4
CHEMIKALIEN
........................................................................................................
15
2.1.5
SOFTWARE
...............................................................................................................
16
INHALTSVERZEICHNIS
2.1.6
PUFFER
UND
LOESUNGEN
...........................................................................................
17
2.1.7
PRIMER
FUER
QUANTITATIVE
METHYLIERUNGSANALYSEN
...................................................
18
2.1.8
ZELLEN
....................................................................................................................
19
2.1.9
PATIENTENMATERIAL
.................................................................................................
19
2.2
METHODEN
...............................................................................................
22
2.2.1
VERSUCHSSCHEMA
..................................................................................................
22
2.2.2
AUFTAUEN,
KULTIVIERUNG
UND
ERNTE
DER
ZELLEN
.......................................................
22
2.2.3
GEFRIERSCHNITTE
.....................................................................................................
23
2.2.4
DNA-ISOLATION
.....................................................................................................
24
2.2.5
BISULFITBEHANDLUNG
..............................................................................................
25
2.2.6
IN-VITRO
METHYLIERUNG
..........................................................................................
25
2.2.7
POLYMERASE-KETTENREAKTION
.................................................................................
26
2.2.7.1
ALLGEMEINES
..................................................................................................................
26
2.2.7.2
GRADIENTEN-PCR
...........................................................................................................
27
2.2.7.3
KLASSISCHE
QUANTITATIVE
METHYLIERUNGSSPEZIFISCHE
PCR
(QMS-PCR)
......................
27
2.2.7.4
GYNTECT
ASSAY
.............................................................................................................
28
2.2.8
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
.................................................................................
29
2.2.9
STATISTISCHE
ANALYSE
.............................................................................................
29
3
ERGEBNISSE
.........................................................................................
30
3.1
BISULFITBEHANDLUNG
....................................................................................
30
3.2
ETABLIERUNG
METHYLIERUNGSSPEZIFISCHER
PRIMER
......................................
30
3.3
GRADIENTEN-PCR
.......................................................................................
31
3.4
AUSWERTUNG
DER
GEWEBEPROBEN
.............................................................
33
3.4.1
DNA-METHYLIERUNG
IN
URETERN
...........................................................................
33
3.4.2
HE-SCHNITTE
DER
UROTHELKARZINOME
......................................................................
33
3.4.3
DNA-METHYLIERUNG
IM
TUMORGEWEBE
.................................................................
35
3.5
DNA-METHYLIERUNG
IN
DEN
URINPROBEN
..................................................
37
3.6
VERGLEICH
DER
GEWEBE-
UND
URINPROBEN
................................................
41
IV
INHALTSVERZEICHNIS
4
DISKUSSION
.........................................................................................
43
4.1
DISKUSSION
DER
METHODIK
........................................................................
44
4.1.1
PATIENTEN-
UND
PROBENKOLLEKTIV
..........................................................................
44
4.1.2
DNA-ISOLATION
.....................................................................................................
44
4.1.3
BISULFITBEHANDLUNG
..............................................................................................
45
4.1.4
QMS-PCR
............................................................................................................
45
4.2
DISKUSSION
DER
ERGEBNISSE
......................................................................
47
4.2.1
DNA-METHYLIERUNG
IN
GEWEBEPROBEN
................................................................
47
4.2.2
DNA-METHYLIERUNG
IN
URINPROBEN
......................................................................
48
4.2.3
VERGLEICH
DER
GEWEBE-
UND
URINPROBEN
.............................................................
51
4.3
AKTUELLER
STAND
........................................................................................
52
4.4
SCHLUSSFOLGERUNGEN
..................................................................................
53
5
LITERATUR-
UND
QUELLEN
VERZEICHNIS
...............................................
54
6
ABBILDUUNGSVERZEICHNIS
.................................................................
66
7
TABELLENVERZEICHNIS
.....................................................................66
8
ANHANG
..............................................................................................
67
DANKSAGUNG
..........................................................................................................
70
EHRENWOERTLICHE
ERKLAERUNG
.................................................................................
71
V
|
| adam_txt |
INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
.
VI
ZUSAMMENFASSUNG
.
VIII
1
EINLEITUNG
.
1
1.1
DAS
HAMBLASENKARZINOM
.
1
1.1.1
ANATOMIE
UND
HISTOLOGIE
DER
HARNBLASE
.
1
1.1.2
EPIDEMIOLOGIE
.
2
1.1.3
RISIKOFAKTOREN
.
2
1.1.4
KLASSIFIKATION
.
3
1.1.5
SYMPTOME
UND
DIAGNOSTIK
.
5
1.1.6
THERAPIE
UND
PROGNOSE
.
6
1.2
EPIGENETIK
.
7
1.2.1
ALLGEMEINES
.
7
1.2.2
DNA-METHYLIERUNG
.
8
1.2.3
DNA-METHYLIERUNG
BEI
MALIGNEN
ERKRANKUNGEN
.
9
1.2.4
DNA-METHYLIERUNG
BEIM
HAMBLASENKARZINOM
.
11
1.3
ZIELSETZUNG
.
12
2
MATERIAL
UND
METHODEN
.14
2.1
MATERIAL
.
14
2.1.1
GERAETE
.
14
2.1.2
MATERIALIEN
.
15
2.1.3
KITS
.
15
2.1.4
CHEMIKALIEN
.
15
2.1.5
SOFTWARE
.
16
INHALTSVERZEICHNIS
2.1.6
PUFFER
UND
LOESUNGEN
.
17
2.1.7
PRIMER
FUER
QUANTITATIVE
METHYLIERUNGSANALYSEN
.
18
2.1.8
ZELLEN
.
19
2.1.9
PATIENTENMATERIAL
.
19
2.2
METHODEN
.
22
2.2.1
VERSUCHSSCHEMA
.
22
2.2.2
AUFTAUEN,
KULTIVIERUNG
UND
ERNTE
DER
ZELLEN
.
22
2.2.3
GEFRIERSCHNITTE
.
23
2.2.4
DNA-ISOLATION
.
24
2.2.5
BISULFITBEHANDLUNG
.
25
2.2.6
IN-VITRO
METHYLIERUNG
.
25
2.2.7
POLYMERASE-KETTENREAKTION
.
26
2.2.7.1
ALLGEMEINES
.
26
2.2.7.2
GRADIENTEN-PCR
.
27
2.2.7.3
KLASSISCHE
QUANTITATIVE
METHYLIERUNGSSPEZIFISCHE
PCR
(QMS-PCR)
.
27
2.2.7.4
GYNTECT
ASSAY
.
28
2.2.8
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
.
29
2.2.9
STATISTISCHE
ANALYSE
.
29
3
ERGEBNISSE
.
30
3.1
BISULFITBEHANDLUNG
.
30
3.2
ETABLIERUNG
METHYLIERUNGSSPEZIFISCHER
PRIMER
.
30
3.3
GRADIENTEN-PCR
.
31
3.4
AUSWERTUNG
DER
GEWEBEPROBEN
.
33
3.4.1
DNA-METHYLIERUNG
IN
URETERN
.
33
3.4.2
HE-SCHNITTE
DER
UROTHELKARZINOME
.
33
3.4.3
DNA-METHYLIERUNG
IM
TUMORGEWEBE
.
35
3.5
DNA-METHYLIERUNG
IN
DEN
URINPROBEN
.
37
3.6
VERGLEICH
DER
GEWEBE-
UND
URINPROBEN
.
41
IV
INHALTSVERZEICHNIS
4
DISKUSSION
.
43
4.1
DISKUSSION
DER
METHODIK
.
44
4.1.1
PATIENTEN-
UND
PROBENKOLLEKTIV
.
44
4.1.2
DNA-ISOLATION
.
44
4.1.3
BISULFITBEHANDLUNG
.
45
4.1.4
QMS-PCR
.
45
4.2
DISKUSSION
DER
ERGEBNISSE
.
47
4.2.1
DNA-METHYLIERUNG
IN
GEWEBEPROBEN
.
47
4.2.2
DNA-METHYLIERUNG
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URINPROBEN
.
48
4.2.3
VERGLEICH
DER
GEWEBE-
UND
URINPROBEN
.
51
4.3
AKTUELLER
STAND
.
52
4.4
SCHLUSSFOLGERUNGEN
.
53
5
LITERATUR-
UND
QUELLEN
VERZEICHNIS
.
54
6
ABBILDUUNGSVERZEICHNIS
.
66
7
TABELLENVERZEICHNIS
.66
8
ANHANG
.
67
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.
70
EHRENWOERTLICHE
ERKLAERUNG
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