Molekularbiologische Methoden 2.0:
Gespeichert in:
1. Verfasser: | |
---|---|
Format: | Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Stuttgart
Verlag Eugen Ulmer
[2021]
|
Ausgabe: | 3., aktualisierte Auflage |
Schriftenreihe: | utb
8449 |
Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
Beschreibung: | 328 Seiten Illustrationen, Diagramme |
ISBN: | 9783825287955 |
Internformat
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5
INHALT
VORWORT
ZUR
1.
AUFLAGE
.
12
VORWORT
ZUR
2.
AUFLAGE
.
13
VORWORT
ZUR
3.
AUFLAGE
.
13
1
DAS
LEBEN
UND
SEINE
BESTANDTEILE
1.1
DER
AUFBAU
VON
DNA
UND
RNA
.
17
1.4
PROTEINE
.
.
26
1.5
DIE
ZELLE
.
.
30
1.2
DER
GENETISCHE
CODE
.
20
1.3
DIE
GENE
.
22
1.3.1
DIE
GENSTRUKTUR
IN
PROKARYOTEN
.
22
1.3.2
GENSTRUKTUR
IN
EUKARYOTEN
.
24
2
GRUNDLAGEN
DER
ARBEIT
IM
LABOR
2.1
WASSER
.
,
34
2.9
PROBENLAGERUNG
.
.
46
2.2
MESSUNG
DES
PH-WERTS
.
.
35
2.10
STERILES
ARBEITEN
.
.
46
2.3
PUFFER
.
.
36
2.11
GERAETE
FUER
DEN
AUFSCHLUSS
VON
GEWEBEN
.
.
49
2.4
WAAGEN
.
,
36
2.12
PFLEGE
UND
AUFZUCHT
2.5
MIKROPIPETTEN
.
.
38
VON
ESCHERICHIA
COLI
.
.
51
2.12.1
NAEHRMEDIEN
.
.
52
2.6
GEFAESSE
IM
LABOR
.
.
40
2.12.2
ANTIBIOTIKA
.
.
53
2.12.3
LAGERUNG
VON
BAKTERIEN
.
.
55
2.7
ZENTRIFUGEN
.
.
41
2.8
MISCHEN
UND
KONZENTRIEREN
.
44
2.8.1
KONZENTRIEREN
.
45
2.8.2
PUFFERWECHSEL
.
.
45
6
INHALT
3
AUFREINIGUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
3.1
GEGENSPIELER
ERFOLGREICHER
DNA
UND
RNA-ISOLATIONEN
.
59
3.1.1
NUKLEASEN
.
59
3.1.2
SCHERKRAEFTE
.
60
3.1.3
CHEMISCHE
VERUNREINIGUNGEN
.
60
3.1.4
EDTA
UND
ZWEIWERTIGE
IONEN:
DAS
YIN
UND
YANG
DER
MOLEKULARBIOLOGIE
.
61
3.2
EXTRAKTION
VON
NUKLEINSAEUREN
.
62
3.3
DIE
WEITERE
AUFREINIGUNG
DER
DNA
.
64
3.3.1
PHENOLEXTRAKTION
.
64
3.3.2
ETHANOLFAELLUNG
.
65
3.3.3
ISOPROPANOLFAELLUNG
.
67
3.3.4
PEG-FAELHMG
.
68
3.3.5
ENTFERNEN
VON
POLYSACCHARIDEN
MIT
CTAB
.
68
3.3.6
TROPFENDIALYSE
.
68
3.4
SILICA
MATRICES
.
69
3.4.1
VON
NUKLEINSAEUREN
UND
SILICA
MATRICES
.
69
3.4.2
UEBERSICHT
UEBER
DEN
EINSATZ
VON
KITS
.
70
3.5
AUSGEWAEHLTE
DNA
AUFREINIGUNGSVERFAHREN
.
71
3.5.1
DIE
PLASMIDPRAEPARATION
AUS
E.
COLI
.
71
3.5.2
DIE
ISOLATION
VON
DNA
AUS
PFLANZEN
MIT
CTAB
.
72
3.5.3
ISOLATION
VON
DNA
AUS
BLUT
ODER
ZELLKULTUREN
.
74
3.5.4
ISOLATION
HOCHMOLEKULARER
DNA
.
75
3.6
DIE
ISOLATION
VON
RNA
.
76
3.7
TIPPS
ZUM
ERZIELEN
HOHER
AUSBEUTEN
BEI
DER
ISOLATION
VON
NUKLEINSAEUREN
.
78
3.8
QUANTIFIZIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
.
79
3.8.1
DNA-BESTIMMUNG
IM
PHOTOMETER
.
79
3.8.2
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
MITTELS
OPTISCHER
DICHTE
.
81
4
POLYMERASE-KETTENREAKTION
4.1
PRINZIP
DER
POLYMERASE-
KETTENREAKTION
.
85
4.5.2
4.5.3
GRADIENTEN-PCR
UND
TOUCH-DOWN
PCR
.
NESTED
PCR
.
4.2
4.2.1
4.2.2
4.2.3
4.2.4
DIE
KOMPONENTEN
DER
PCR
.
DIE
AUSGANGS-DNA
.
THERMOSTABILE
DNA-POLYMERASEN
.
PUFFER,
MAGNESIUM
UND
DNTPS
.
PRIMER
.
86
86
86
89
91
4.5.4
4.5.5
4.5.6
MULTIPLEXPCR
.
EINFUHREN
VON
RESTRIKTIONSSCHNITTSTELLEN
.
REVERSE
TRANSKRIPTIONS-PCR
(RT-PCR)
.
4.5.7
KOLONIE-PCR
.
4.3
GERAETE
FUER
DIE
PCR
.
93
4.5.8
QUANTITATIVE
PCR
.
4.4
DIE
STANDARD-PCR
.
94
4.6
ANWENDUNGEN
DER
PCR
.
4.5
AUSGEWAEHLTE
PCR-METHODEN
.
94
4.7
OPTIMIERUNG
DER
PCR-REAKTION
.
4.5.1
TWO-STEP
PCR
.
94
96
97
97
98
99
102
103
105
105
INHALT
I
7
5
KLONIEREN
FUER
EINSTEIGER
5.1
RESTRIKTIONSENZYME
.
109
5.1.1
RESTRIKTIONSENZYME
DES
TYPS
II.
.
110
5.1.2
RESTRIKTIONSENZYME
IM
LABOR
.
113
5.1.3
METHYLASEN
UND
TYP
IIM-ENZYME
.
115
5.1.4
TYP
IIS-ENZYME
.
116
5.2
LIGATION
.
116
5.3 (DE)PHOSPHORYLIERUNG
VON
DNA
.
118
5.3.1
DEPHOSPHORYLIERUNG
.
118
5.3.2
PHOSPHORYLIERUNG
.
119
5.4
ENZYME
FUER
SPEZIELLE
AUFGABEN
.
121
5.5
DIE
TRANSFORMATION
VON
E.
COLI
.
121
5.6 DER
WEG
ZUM
KLONIERTEN
GEN.
.
123
5.7
DER
UNGERICHTETE
EINBAU
EINER
AMPLIFIZIERTEN
DNA
IN
EINEN
VEKTOR
.
123
5.7.1
DIE
KLONIERUNG
UEBER
EINE
RESTRIKTIONSSTELLE
.
124
5.7.2
TA-KLONIERUNG
UND
TOPO-CLONING
125
5.7.3
KLONIERUNG
IN
EIN
LETAL-PLASMID
.
126
5.7.4
ZYKLISCHE
BLUNT
END
KLONIERUNG.
.
126
5.8
DER
GERICHTETE
EINBAU
VON
DNA
IN
EINEN
VEKTOR
.
127
5.9
WENN
ES
MAL
NICHT
KLAPPT
.
129
6
VEKTOREN
6.1
PLASMIDE
.
.
.
132
6.8
KUENSTLICHE
CHROMOSOME:
YACS,
BACS
UND
PACS
.
148
6.2
KLONIERUNGSPLASMIDE
.
.
135
6.2.1
BLAU-WEISS-SCREENING
.
.
135
6.9
HEFEN
ALS
KLONIERUNGS
UND
6.2.2
LETALVEKTOREN
.
.
138
EXPRESSIONSSYSTEM
.
149
6.9.1
HEFE
ALS
MODELLORGANISMUS
.
149
6.3
EXPRESSIONSPLASMIDE
.
.
139
6.9.2
VEKTOREN
FUER
HEFE
.
151
6.3.1
PROMOTOREN
FUER
6.9.3
TRANSFORMATION
VON
HEFE
.
152
EXPRESSIONSVEKTOREN
.
.
140
6.3.2
WEITERE
REGULATIVE
SEQUENZEN
.
.
141
6.10
PFLANZEN
ALS
BIOREAKTOREN
.
152
6.3.3
EXPRESSION
IN DAS
PERIPLASMA
.
.
141
6.10.1
DIE
TRANSFORMATION
VON
PFLANZEN
.
153
6.3.4
EINSCHLUSSKOERPERCHEN
6.10.2
TRANSIENTE
[INCLUSION
BODIES]
.
.
141
TRANSFORMATIONSVERFAHREN
.
155
6.3.5
TAG-SEQUENZEN
.
.
142
6.11
DIE
TRANSFORMATION
6.4
REPORTERGENE
.
.
142
VON
SAEUGETIEREN
UND
TIERISCHEN
ZELLKULTUREN
.
156
6.5
PHAGEN
.
.
146
6.11.1
SAEUGETIERE
ALS
MODELLORGANISMEN
.
156
6.11.2
SAEUGER-ZELLKULTUREN
.
157
6.6
PHAGEMIDE
.
.
147
6.11.3
VEKTOREN
FUER
TIERISCHE
ZELLEN
.
158
6.11.4
TRANSFEKTION
TIERISCHER
6.7
SHUTTLE-VEKTOREN
.
.
147
ZELLKULTUREN
.
159
8
I
INHALT
7
ELEKTROPHORESE
UND
HYBRIDISIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
7.1
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
VON
DNA
.
162
7.2.
DIE
DETEKTION
DER
DNA
IM
GEL
.
167
7.3 PRAEPARATIVE
AGAROSEGELE
.
169
7.4
AUFTRENNEN
VON
RNA
IM
AGAROSEGEL
.
170
7.5
FEHLERSUCHE
BEI
AGAROSE
GELELEKTROPHORESE
.
170
7.6
HYBRIDISIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
.
171
7.6.1
SOUTHERN
UND
NORTHERN
BLOT
.
173
7.6.2
HERSTELLUNG
DER
SONDE
UND
HYBRIDISIERUNG
.
174
7.7
MICROARRAYS
.
174
8
FORTGESCHRITTENE
KLONIERUNG
8.1
KLONSAMMLUNGEN
UND
SYNTHETISCHE
GENE
.
.
179
8.6
BIOBRICKS
.
189
8.1.1
KLONSAMMLUNGEN
.
.
180
8.7
NAHTLOSE
8.1.2
SYNTHETISCHE
GENE
UND
KLONIERUNGSVERFAHREN
.
189
GENFRAGMENTE
.
.
180
8.7.1
GOLDEN
GATE
KLONIERUNG
.
190
8.7.2
CUT-LIGATION
VERFAHREN
.
191
8.2
REKOMBINASE-BASIERTE
8.7.3
MULTIPLE
INSERTIONEN
MITTELS
KLONIERUNG
.
.
181
8.7.4
GOLDEN
GATE
KLONIERUNG
.
GOLDEN
GATE
BASIERTE
TOOL
KITS
AM
192
8.3
MUTAGENESEVERFAHREN
.
.
183
BEISPIEL
DES
MOCLO
KITS
.
192
8.4
PCR-BASIERTE
8.8
GIBSON
ASSEMBLY
.
195
KLONIERUNGSVERFAHREN:
RF-CLONING
UND
OEPCR
.
.
186
8.9
VERGLEICH
DER
VERFAHREN
.
198
8.5
SYNTHETISCHE
BIOLOGIE
.
.
188
INHALT
9
9
PROTEINAUFREINIGUNG
9.1
HOMOGENISATION.
.
.
.
203
9.5
QUANTIFIZIERUNG
9.1.1
PROTEASEN
.
.
204
VON
PROTEINEN
.
.
217
9.1.2
PHENOLOXIDASEN
.
.
206
9.5.1
PROTEINBESTIMMUNG
NACH
BRADFORD
.
.
217
9.2
EXTRAKTION
VON
PROTEINEN
.
.
207
9.5.2
BCA-TEST
.
.
219
9.2.1
HOMOGENISATIONSPUFFER
.
.
207
9.5.3
WELCHEN
TEST
BENUTZEN?
.
.
220
9.2.2
ABTRENNEN
VON
ZELL
UND
GEWEBETRUEMMERN
.
.
208
9.6
AUFREINIGUNGSVERFAHREN
9.2.3
FRAKTIONIERUNG
DES
ROHEXTRAKTS
208
FUER
GETAGGTE
PROTEINE
AUS
E.
COLI
.
.
221
9.3
DIALYSE
UND
KONZENTRIERUNG
.
.211
9.6.1
BAKTERIENANZUCHT
UND
HOMOGENISATION
.
.
222
9.4
WEITERE
9.6.2
WEITERE
AUFREINIGUNG
DES
AUFREINIGUNGSSCHRITTE
.
.
212
HETEROLOGEN
PROTEINS
.
.
224
9.4.1
CHROMATOGRAPHIE
.
.
213
9.4.2
CHROMATOGRAPHISCHE
TRENNPRINZIPIEN
.
.
215
9.4.3
MAGNETIC
BEADS
.
.
216
10
GELELEKTROPHORESE
VON
PROTEINEN
10.1
DIE
POLYACRYLAMID
GELELEKTROPHORESE
(PAGE)
.
229
10.4
WEITERE
ELEKTROPHORESE
VERFAHREN
FUER
PROTEINE
.
.
239
10.4.1
NATIVE
PAGE.
.
239
10.2
DIE
DENATURIERENDE
10.4.2
ISOELEKTRISCHE
FOKUSSIERUNG.
.
.
239
SDS-PAGE
.
229
10.4.3
2-D-GELELEKTROPHORESE
.
.
239
10.2.1
HERSTELLUNG
EINES
PROTEINEXTRAKTS
FUER
DIE
SDS-GELELEKTROPHORESE
.
229
10.5
WESTERN
BLOTTING
.
.
241
10.2.2
HERSTELLEN
DES
GELS
.
232
10.2.3
DER
GELLAUF
.
235
10.6
MASSENSPEKTROMETRISCHE
VERFAHREN
.
.
246
10.3
DAS
FAERBEN
DER
GELE
.
237
10
INHALT
11
IMMUNBIOCHEMISCHE
METHODEN
11.1
ANTIKOERPER
.
.
251
11.3
ELISA
.
261
11.3.1
SANDWICH-ELISA
.
263
11.2
PRINZIPIEN
IMMUN-
11.3.2
KOMPETITIVER
ELISA
.
265
BIOCHEMISCHER
VERFAHREN
.
.
254
11.2.1
IMMUNPRAEZIPITATION
.
.
254
11.4
IMMUNFAERBUNG
NACH
11.2.2
TRAEGERBASIERTE
IMMUNFAERBUNG
.
.
256
WESTERN
BLOT
.
266
11.2.3
IMMOBILISIERUNG
DES
ANTIGENS
.
.
257
11.2.4
BLOCKEN
UEBERSCHUESSIGER
11.5
IMMUNAFFINITAETS
BINDESTELLEN
.
.
257
CHROMATOGRAPHIE
.
269
11.2.5
DETEKTION
DER
BINDUNG
.
.
257
11.2.6
ANTIKOERPER-KASKADEN
.
.
259
11.6
WEITERE
ANTIKOERPER
11.2.7
SPEZIFISCHE
UND
BASIERTE
METHODEN
.
270
UNSPEZIFISCHE
BINDUNGEN
.
.
260
11.6.1
REKOMBINANTE
ANTIKOERPER
.
270
11.6.2
PHAGE
DISPLAY
UND
SCFV
.
271
11.6.3
IMMUNHISTOCHEMISCHE
VERFAHREN
.
273
11.6.4
MARKIERUNG
VON
ZELLEN
.
274
12
FORTGESCHRITTENE
VERFAHREN
12.1
DNA-SEQUENZIERUNG
.
278
12.4
ANALYSE
DER
GENFUNKTION
.
.
286
12.1.1
SEQUENZIERUNG
NACH
SANGER
.
278
12.4.1
REVERSE
GENETIK
UND
12.1.2
HERSTELLEN
VON
PROBEN
FUER
GENE
TARGETING
.
.
.
286
DIE
DNA-SEQUENZIERUNG
.
280
12.4.2
RNAI
.
.
287
12.4.3
DURCHFUEHRUNG
VON
12.2
NEXT
GENERATION
SIRNA-EXPERIMENTEN
.
.
288
SEQUENZIERUNG
.
281
12.5
GENOM
EDITIERUNG
.
.
289
12.3
VON
DEN
YYOMICS
"
ZUR
SYSTEMBIOLOGIE
.
285
13
BIOINFORMATIK
13.1
DATENBANKEN
.
296
13.2
DATEIFORMATE
.
298
13.3
SEQUENZSUCHE
ANHAND
VON
STICHWOERTERN
(ENTREZ)
.
300
13.4
SEQUENZSUCHE
MIT
EINER
SEQUENZ
(BLAST)
.
300
13.5
BIOINFORMATIK
ZUR
PLANUNG
DER
LABORARBEIT
.
305
INHALT
I
11
14
ANHANG
AL
SICHERHEIT
IM
LABOR
.
308
A2
DIE
10
GOLDENEN
LABORREGELN
.
309
A3
DAS
LABORBUCH
UND
DIE
FINALE
ARBEIT
.
311
VERZEICHNIS
DER
YYGUT
ZU
WISSEN
"
-BOXEN
.
313
ABBILDUNGSVERZEICHNIS
.
314
VERZEICHNIS
DER
MAPS
.
316
VERZEICHNIS
DER
PROTOKOLLE
.
316
TABELLENVERZEICHNIS
.
317
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
.
318
SACHVERZEICHNIS
.
321
QUELLENVERZEICHNIS
.
328 |
adam_txt |
5
INHALT
VORWORT
ZUR
1.
AUFLAGE
.
12
VORWORT
ZUR
2.
AUFLAGE
.
13
VORWORT
ZUR
3.
AUFLAGE
.
13
1
DAS
LEBEN
UND
SEINE
BESTANDTEILE
1.1
DER
AUFBAU
VON
DNA
UND
RNA
.
17
1.4
PROTEINE
.
.
26
1.5
DIE
ZELLE
.
.
30
1.2
DER
GENETISCHE
CODE
.
20
1.3
DIE
GENE
.
22
1.3.1
DIE
GENSTRUKTUR
IN
PROKARYOTEN
.
22
1.3.2
GENSTRUKTUR
IN
EUKARYOTEN
.
24
2
GRUNDLAGEN
DER
ARBEIT
IM
LABOR
2.1
WASSER
.
,
34
2.9
PROBENLAGERUNG
.
.
46
2.2
MESSUNG
DES
PH-WERTS
.
.
35
2.10
STERILES
ARBEITEN
.
.
46
2.3
PUFFER
.
.
36
2.11
GERAETE
FUER
DEN
AUFSCHLUSS
VON
GEWEBEN
.
.
49
2.4
WAAGEN
.
,
36
2.12
PFLEGE
UND
AUFZUCHT
2.5
MIKROPIPETTEN
.
.
38
VON
ESCHERICHIA
COLI
.
.
51
2.12.1
NAEHRMEDIEN
.
.
52
2.6
GEFAESSE
IM
LABOR
.
.
40
2.12.2
ANTIBIOTIKA
.
.
53
2.12.3
LAGERUNG
VON
BAKTERIEN
.
.
55
2.7
ZENTRIFUGEN
.
.
41
2.8
MISCHEN
UND
KONZENTRIEREN
.
44
2.8.1
KONZENTRIEREN
.
45
2.8.2
PUFFERWECHSEL
.
.
45
6
INHALT
3
AUFREINIGUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
3.1
GEGENSPIELER
ERFOLGREICHER
DNA
UND
RNA-ISOLATIONEN
.
59
3.1.1
NUKLEASEN
.
59
3.1.2
SCHERKRAEFTE
.
60
3.1.3
CHEMISCHE
VERUNREINIGUNGEN
.
60
3.1.4
EDTA
UND
ZWEIWERTIGE
IONEN:
DAS
YIN
UND
YANG
DER
MOLEKULARBIOLOGIE
.
61
3.2
EXTRAKTION
VON
NUKLEINSAEUREN
.
62
3.3
DIE
WEITERE
AUFREINIGUNG
DER
DNA
.
64
3.3.1
PHENOLEXTRAKTION
.
64
3.3.2
ETHANOLFAELLUNG
.
65
3.3.3
ISOPROPANOLFAELLUNG
.
67
3.3.4
PEG-FAELHMG
.
68
3.3.5
ENTFERNEN
VON
POLYSACCHARIDEN
MIT
CTAB
.
68
3.3.6
TROPFENDIALYSE
.
68
3.4
SILICA
MATRICES
.
69
3.4.1
VON
NUKLEINSAEUREN
UND
SILICA
MATRICES
.
69
3.4.2
UEBERSICHT
UEBER
DEN
EINSATZ
VON
KITS
.
70
3.5
AUSGEWAEHLTE
DNA
AUFREINIGUNGSVERFAHREN
.
71
3.5.1
DIE
PLASMIDPRAEPARATION
AUS
E.
COLI
.
71
3.5.2
DIE
ISOLATION
VON
DNA
AUS
PFLANZEN
MIT
CTAB
.
72
3.5.3
ISOLATION
VON
DNA
AUS
BLUT
ODER
ZELLKULTUREN
.
74
3.5.4
ISOLATION
HOCHMOLEKULARER
DNA
.
75
3.6
DIE
ISOLATION
VON
RNA
.
76
3.7
TIPPS
ZUM
ERZIELEN
HOHER
AUSBEUTEN
BEI
DER
ISOLATION
VON
NUKLEINSAEUREN
.
78
3.8
QUANTIFIZIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
.
79
3.8.1
DNA-BESTIMMUNG
IM
PHOTOMETER
.
79
3.8.2
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
MITTELS
OPTISCHER
DICHTE
.
81
4
POLYMERASE-KETTENREAKTION
4.1
PRINZIP
DER
POLYMERASE-
KETTENREAKTION
.
85
4.5.2
4.5.3
GRADIENTEN-PCR
UND
TOUCH-DOWN
PCR
.
NESTED
PCR
.
4.2
4.2.1
4.2.2
4.2.3
4.2.4
DIE
KOMPONENTEN
DER
PCR
.
DIE
AUSGANGS-DNA
.
THERMOSTABILE
DNA-POLYMERASEN
.
PUFFER,
MAGNESIUM
UND
DNTPS
.
PRIMER
.
86
86
86
89
91
4.5.4
4.5.5
4.5.6
MULTIPLEXPCR
.
EINFUHREN
VON
RESTRIKTIONSSCHNITTSTELLEN
.
REVERSE
TRANSKRIPTIONS-PCR
(RT-PCR)
.
4.5.7
KOLONIE-PCR
.
4.3
GERAETE
FUER
DIE
PCR
.
93
4.5.8
QUANTITATIVE
PCR
.
4.4
DIE
STANDARD-PCR
.
94
4.6
ANWENDUNGEN
DER
PCR
.
4.5
AUSGEWAEHLTE
PCR-METHODEN
.
94
4.7
OPTIMIERUNG
DER
PCR-REAKTION
.
4.5.1
TWO-STEP
PCR
.
94
96
97
97
98
99
102
103
105
105
INHALT
I
7
5
KLONIEREN
FUER
EINSTEIGER
5.1
RESTRIKTIONSENZYME
.
109
5.1.1
RESTRIKTIONSENZYME
DES
TYPS
II.
.
110
5.1.2
RESTRIKTIONSENZYME
IM
LABOR
.
113
5.1.3
METHYLASEN
UND
TYP
IIM-ENZYME
.
115
5.1.4
TYP
IIS-ENZYME
.
116
5.2
LIGATION
.
116
5.3 (DE)PHOSPHORYLIERUNG
VON
DNA
.
118
5.3.1
DEPHOSPHORYLIERUNG
.
118
5.3.2
PHOSPHORYLIERUNG
.
119
5.4
ENZYME
FUER
SPEZIELLE
AUFGABEN
.
121
5.5
DIE
TRANSFORMATION
VON
E.
COLI
.
121
5.6 DER
WEG
ZUM
KLONIERTEN
GEN.
.
123
5.7
DER
UNGERICHTETE
EINBAU
EINER
AMPLIFIZIERTEN
DNA
IN
EINEN
VEKTOR
.
123
5.7.1
DIE
KLONIERUNG
UEBER
EINE
RESTRIKTIONSSTELLE
.
124
5.7.2
TA-KLONIERUNG
UND
TOPO-CLONING
125
5.7.3
KLONIERUNG
IN
EIN
LETAL-PLASMID
.
126
5.7.4
ZYKLISCHE
BLUNT
END
KLONIERUNG.
.
126
5.8
DER
GERICHTETE
EINBAU
VON
DNA
IN
EINEN
VEKTOR
.
127
5.9
WENN
ES
MAL
NICHT
KLAPPT
.
129
6
VEKTOREN
6.1
PLASMIDE
.
.
.
132
6.8
KUENSTLICHE
CHROMOSOME:
YACS,
BACS
UND
PACS
.
148
6.2
KLONIERUNGSPLASMIDE
.
.
135
6.2.1
BLAU-WEISS-SCREENING
.
.
135
6.9
HEFEN
ALS
KLONIERUNGS
UND
6.2.2
LETALVEKTOREN
.
.
138
EXPRESSIONSSYSTEM
.
149
6.9.1
HEFE
ALS
MODELLORGANISMUS
.
149
6.3
EXPRESSIONSPLASMIDE
.
.
139
6.9.2
VEKTOREN
FUER
HEFE
.
151
6.3.1
PROMOTOREN
FUER
6.9.3
TRANSFORMATION
VON
HEFE
.
152
EXPRESSIONSVEKTOREN
.
.
140
6.3.2
WEITERE
REGULATIVE
SEQUENZEN
.
.
141
6.10
PFLANZEN
ALS
BIOREAKTOREN
.
152
6.3.3
EXPRESSION
IN DAS
PERIPLASMA
.
.
141
6.10.1
DIE
TRANSFORMATION
VON
PFLANZEN
.
153
6.3.4
EINSCHLUSSKOERPERCHEN
6.10.2
TRANSIENTE
[INCLUSION
BODIES]
.
.
141
TRANSFORMATIONSVERFAHREN
.
155
6.3.5
TAG-SEQUENZEN
.
.
142
6.11
DIE
TRANSFORMATION
6.4
REPORTERGENE
.
.
142
VON
SAEUGETIEREN
UND
TIERISCHEN
ZELLKULTUREN
.
156
6.5
PHAGEN
.
.
146
6.11.1
SAEUGETIERE
ALS
MODELLORGANISMEN
.
156
6.11.2
SAEUGER-ZELLKULTUREN
.
157
6.6
PHAGEMIDE
.
.
147
6.11.3
VEKTOREN
FUER
TIERISCHE
ZELLEN
.
158
6.11.4
TRANSFEKTION
TIERISCHER
6.7
SHUTTLE-VEKTOREN
.
.
147
ZELLKULTUREN
.
159
8
I
INHALT
7
ELEKTROPHORESE
UND
HYBRIDISIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
7.1
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
VON
DNA
.
162
7.2.
DIE
DETEKTION
DER
DNA
IM
GEL
.
167
7.3 PRAEPARATIVE
AGAROSEGELE
.
169
7.4
AUFTRENNEN
VON
RNA
IM
AGAROSEGEL
.
170
7.5
FEHLERSUCHE
BEI
AGAROSE
GELELEKTROPHORESE
.
170
7.6
HYBRIDISIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
.
171
7.6.1
SOUTHERN
UND
NORTHERN
BLOT
.
173
7.6.2
HERSTELLUNG
DER
SONDE
UND
HYBRIDISIERUNG
.
174
7.7
MICROARRAYS
.
174
8
FORTGESCHRITTENE
KLONIERUNG
8.1
KLONSAMMLUNGEN
UND
SYNTHETISCHE
GENE
.
.
179
8.6
BIOBRICKS
.
189
8.1.1
KLONSAMMLUNGEN
.
.
180
8.7
NAHTLOSE
8.1.2
SYNTHETISCHE
GENE
UND
KLONIERUNGSVERFAHREN
.
189
GENFRAGMENTE
.
.
180
8.7.1
GOLDEN
GATE
KLONIERUNG
.
190
8.7.2
CUT-LIGATION
VERFAHREN
.
191
8.2
REKOMBINASE-BASIERTE
8.7.3
MULTIPLE
INSERTIONEN
MITTELS
KLONIERUNG
.
.
181
8.7.4
GOLDEN
GATE
KLONIERUNG
.
GOLDEN
GATE
BASIERTE
TOOL
KITS
AM
192
8.3
MUTAGENESEVERFAHREN
.
.
183
BEISPIEL
DES
MOCLO
KITS
.
192
8.4
PCR-BASIERTE
8.8
GIBSON
ASSEMBLY
.
195
KLONIERUNGSVERFAHREN:
RF-CLONING
UND
OEPCR
.
.
186
8.9
VERGLEICH
DER
VERFAHREN
.
198
8.5
SYNTHETISCHE
BIOLOGIE
.
.
188
INHALT
9
9
PROTEINAUFREINIGUNG
9.1
HOMOGENISATION.
.
.
.
203
9.5
QUANTIFIZIERUNG
9.1.1
PROTEASEN
.
.
204
VON
PROTEINEN
.
.
217
9.1.2
PHENOLOXIDASEN
.
.
206
9.5.1
PROTEINBESTIMMUNG
NACH
BRADFORD
.
.
217
9.2
EXTRAKTION
VON
PROTEINEN
.
.
207
9.5.2
BCA-TEST
.
.
219
9.2.1
HOMOGENISATIONSPUFFER
.
.
207
9.5.3
WELCHEN
TEST
BENUTZEN?
.
.
220
9.2.2
ABTRENNEN
VON
ZELL
UND
GEWEBETRUEMMERN
.
.
208
9.6
AUFREINIGUNGSVERFAHREN
9.2.3
FRAKTIONIERUNG
DES
ROHEXTRAKTS
208
FUER
GETAGGTE
PROTEINE
AUS
E.
COLI
.
.
221
9.3
DIALYSE
UND
KONZENTRIERUNG
.
.211
9.6.1
BAKTERIENANZUCHT
UND
HOMOGENISATION
.
.
222
9.4
WEITERE
9.6.2
WEITERE
AUFREINIGUNG
DES
AUFREINIGUNGSSCHRITTE
.
.
212
HETEROLOGEN
PROTEINS
.
.
224
9.4.1
CHROMATOGRAPHIE
.
.
213
9.4.2
CHROMATOGRAPHISCHE
TRENNPRINZIPIEN
.
.
215
9.4.3
MAGNETIC
BEADS
.
.
216
10
GELELEKTROPHORESE
VON
PROTEINEN
10.1
DIE
POLYACRYLAMID
GELELEKTROPHORESE
(PAGE)
.
229
10.4
WEITERE
ELEKTROPHORESE
VERFAHREN
FUER
PROTEINE
.
.
239
10.4.1
NATIVE
PAGE.
.
239
10.2
DIE
DENATURIERENDE
10.4.2
ISOELEKTRISCHE
FOKUSSIERUNG.
.
.
239
SDS-PAGE
.
229
10.4.3
2-D-GELELEKTROPHORESE
.
.
239
10.2.1
HERSTELLUNG
EINES
PROTEINEXTRAKTS
FUER
DIE
SDS-GELELEKTROPHORESE
.
229
10.5
WESTERN
BLOTTING
.
.
241
10.2.2
HERSTELLEN
DES
GELS
.
232
10.2.3
DER
GELLAUF
.
235
10.6
MASSENSPEKTROMETRISCHE
VERFAHREN
.
.
246
10.3
DAS
FAERBEN
DER
GELE
.
237
10
INHALT
11
IMMUNBIOCHEMISCHE
METHODEN
11.1
ANTIKOERPER
.
.
251
11.3
ELISA
.
261
11.3.1
SANDWICH-ELISA
.
263
11.2
PRINZIPIEN
IMMUN-
11.3.2
KOMPETITIVER
ELISA
.
265
BIOCHEMISCHER
VERFAHREN
.
.
254
11.2.1
IMMUNPRAEZIPITATION
.
.
254
11.4
IMMUNFAERBUNG
NACH
11.2.2
TRAEGERBASIERTE
IMMUNFAERBUNG
.
.
256
WESTERN
BLOT
.
266
11.2.3
IMMOBILISIERUNG
DES
ANTIGENS
.
.
257
11.2.4
BLOCKEN
UEBERSCHUESSIGER
11.5
IMMUNAFFINITAETS
BINDESTELLEN
.
.
257
CHROMATOGRAPHIE
.
269
11.2.5
DETEKTION
DER
BINDUNG
.
.
257
11.2.6
ANTIKOERPER-KASKADEN
.
.
259
11.6
WEITERE
ANTIKOERPER
11.2.7
SPEZIFISCHE
UND
BASIERTE
METHODEN
.
270
UNSPEZIFISCHE
BINDUNGEN
.
.
260
11.6.1
REKOMBINANTE
ANTIKOERPER
.
270
11.6.2
PHAGE
DISPLAY
UND
SCFV
.
271
11.6.3
IMMUNHISTOCHEMISCHE
VERFAHREN
.
273
11.6.4
MARKIERUNG
VON
ZELLEN
.
274
12
FORTGESCHRITTENE
VERFAHREN
12.1
DNA-SEQUENZIERUNG
.
278
12.4
ANALYSE
DER
GENFUNKTION
.
.
286
12.1.1
SEQUENZIERUNG
NACH
SANGER
.
278
12.4.1
REVERSE
GENETIK
UND
12.1.2
HERSTELLEN
VON
PROBEN
FUER
GENE
TARGETING
.
.
.
286
DIE
DNA-SEQUENZIERUNG
.
280
12.4.2
RNAI
.
.
287
12.4.3
DURCHFUEHRUNG
VON
12.2
NEXT
GENERATION
SIRNA-EXPERIMENTEN
.
.
288
SEQUENZIERUNG
.
281
12.5
GENOM
EDITIERUNG
.
.
289
12.3
VON
DEN
YYOMICS
"
ZUR
SYSTEMBIOLOGIE
.
285
13
BIOINFORMATIK
13.1
DATENBANKEN
.
296
13.2
DATEIFORMATE
.
298
13.3
SEQUENZSUCHE
ANHAND
VON
STICHWOERTERN
(ENTREZ)
.
300
13.4
SEQUENZSUCHE
MIT
EINER
SEQUENZ
(BLAST)
.
300
13.5
BIOINFORMATIK
ZUR
PLANUNG
DER
LABORARBEIT
.
305
INHALT
I
11
14
ANHANG
AL
SICHERHEIT
IM
LABOR
.
308
A2
DIE
10
GOLDENEN
LABORREGELN
.
309
A3
DAS
LABORBUCH
UND
DIE
FINALE
ARBEIT
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311
VERZEICHNIS
DER
YYGUT
ZU
WISSEN
"
-BOXEN
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ABBILDUNGSVERZEICHNIS
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314
VERZEICHNIS
DER
MAPS
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VERZEICHNIS
DER
PROTOKOLLE
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TABELLENVERZEICHNIS
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ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
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318
SACHVERZEICHNIS
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321
QUELLENVERZEICHNIS
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328 |
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