Verfügbarkeit: Ependymome im Kindesalter

Ependymome im Kindesalter: histologische und molekulargenetische Charakterisierung mit dem Ziel präziserer Diagnostik und optimierter Risikostratifizierung

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Jünger, Stephanie (VerfasserIn)
Format:	Abschlussarbeit Buch
Sprache:	German
Veröffentlicht:	Bonn 2019
Schlagworte:	Ependymom Diagnostik Tumor Zellfusion Hochschulschrift
Online-Zugang:	Inhaltsverzeichnis
Beschreibung:	130 Seiten Illustrationen 21 cm

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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS 1. EINLEITUNG .................................................................................................................... 7 1.1. EINLEITUNG IN DIE METHODIK ............................................. 7 1.2. ZIELE UND FRAGESTELLUNG DER ARBEIT .................................................................... 21 2. MATERIAL UND METHODEN ............................................................................................ 22 2.1. TUMORPROBEN ..................................................................................................... 22 2.2. HISTOPATHOLOGIE .................................................................................................. 26 2.3. UNTERSUCHUNG DER SPEZIFITAET NUKLEAERER P65-RELA-EXPRESSION FUER DIE ENTITAET DES EPENDYMOMS MIT RELA- ALTERATION .......................................................................... 28 2.4. IMMUNHISTOCHEMISCHE UNTERSUCHUNG VON P16-PROTEINEXPRESSION BEI FAELLEN MIT HOMO-/HETEROZYGOTEN CDKN2A VERLUST ................................................................... 29 2.5. DNA-EXTRAKTION .................................................................................................. 29 2.6. DATENANALYSE .................................................................................................... 30 2.7 VERGLEICH ZWISCHEN MIR- UND SNP-ARRAYS ........................................................ 30 2.8. RNA-SEQUENZIERUNG UND FUSIONSDETEKTION ...................................................... 33 2.9. GENEXPRESSIONSANALYSE UND UNTERSUCHUNG DES METHYLIERUNGSPROFILS ............ 34 2.10 STATISTISCHE ANALYSE VON UEBERLEBENSDATEN UND KORRELATIONEN ...................... 34 2.11. UNTERSUCHUNG EINES REM-FUSIONSTRANSKRIPTS IN FFPE-MATERIAL .................. 35 3. ERGEBNISSE .......................................................................................................... 37 3.1. VERGLEICH DER TUMOREN BEZUEGLICH IHRER LOKALISATION ........................................ 37 3.2. GESAMTHEIT DER GENOMISCHEN VERAENDERUNGEN IN BEZUG AUF DIE EINZELNEN LOKALISATIONEN SUPRATENTORIELL, INFRATENTORIELL UND SPINAL ......................................... 41 3.3. GISTIC-ANALYSE ................................................................................................49 3.4. KORRELATION SPEZIFISCHER PARAMETER .................................................................. 51 3.5. VERGLEICH DER GENOMISCHEN VERAENDERUNG ZWISCHEN PRIMARIUS UND REZIDIV ... 57 3.6. ANALYSE DER DIFFERENTIELLEN EXPRESSION ....... ...................................................... 58 3.7. IDENTIFIKATION INFRATENTORIELLER PFB EPENDYMOME ............................................. 61 3.8. ANALYSE DES RELA-F USIONSTRANSKRIPTS IN FFPE-MATERIAL ................................. 63 3.9. YAP-FUSIONEN ................................................................................................... 64 3.10. P65-RELA IMMUNHISTOCHEMIE ZUM NACHWEIS DER NUKLEAEREN PROTEINEXPRESSION ALS DIFFERENTIALDIAGNOSTISCHE METHODE ..................................................................... 65 3.11. UNTERSUCHUNG DER P16 PROTEINEXPRESSION ZUR VALIDIERUNG EINES CDKN2A VERLUSTES .................................................................................................................. 72 3.12. ANALYSE PROGNOSTISCH RELEVANTER PARAMETER .................................................. 73 3.12. ENTWICKLUNG VON GEEIGNETEN RISIKOSTRATIFIZIERUNGSMODELLEN ...................... 87 6 3.12.1. RISIKOSTRATIFIZIERUNGSMODELL FUER TUMOREN SUPRATENTORIELLER LOKALISATION . 87 3.12.2. RISIKOSTRATIFIZIERUNGSMODELL FUER TUMOREN INFRATENTORIELLER LOKALISATION ... 89 3.12.3. ZUSAMMENFASSUNG DER PARAMETER DER RISIKOSTRATIFIZIERUNGSMODELLE .... 91 4. DISKUSSION ............................................................................................................. 93 4.1. MOLEKULARE-INVERSIONS-PROBEN-ANALYSE ERLAUBT DIE GENOMWEITE RETROSPEKTIVE ANALYSE GROSSER STUDIENKOLLEKTIVE ANHAND VON FFPE-MATERIAL ................................. 93 4.2. UNTERSUCHUNG ZUR SPEZIFITAET DER RELA-MRNA-FUSION UND NUKLEAERER P65-RELA- PROTEIN-EXPRESSION .................................................................................................... 95 4.3. DIE KLINISCHEN PARAMETER ALTER, LOKALISATION UND RESEKTIONSAUSMASS ZEIGEN EINE WESENTLICHE PROGNOSTISCHE RELEVANZ ...............................................................96 4.4. HISTOLOGISCHE PARAMETER HABEN EINE PROGNOSTISCHE RELEVANZ IN PAEDIATRISCHEN EPENDYMOMEN .......................................................................................................... 97 4.5. GENOMWEITE DNA-KOPIENANZAHLANALYSEN ZEIGEN SIGNIFIKANTE UNTERSCHIEDE ZWISCHEN SUPRA- UND INFRATENTORIELLEN EPENDYMOMEN ............................................. 99 4.6. ZUGEWINN DES LANGEN ARMS DES CHROMOSOMS 1 STELLT EINEN UNABHAENGIGEN PROGNOSTISCHEN PARAMETER IN INFRATENTORIELLEN EPENDYMOMEN DAR ........................ 104 4.7. IM REZIDIV ZEIGEN TUMOREN HAEUFIGER STRUKTURELLE GENOMISCHE VERAENDERUNGEN 105 4.8. IN DER MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONS-ANALYSE ERGEBEN SICH UNABHAENGIGE KLINISCHE, HISTOLOGISCHE UND GENETISCHE PARAMETER HINSICHTLICH DER PROGNOSE PAEDIATRISCHER EPENDYMOME .................................................................................... 106 4.9. DIE IDENTIFIKATION UNABHAENGIGER PROGNOSTISCH UNGUENSTIGER PARAMETER ERMOEGLICHT DAS ERSTELLEN VON RISIKOSTRATIFIZIERUNGSMODELLEN ................................. 107 4.10. ZIEL DER IDENTIFIKATION VON RISIKOPARAMETER IST DIE OPTIMIERUNG DER DERZEITIGEN THERAPIESTRATIFIZIERUNG ............................................................................................. 110 4.11. SCHLUSSFOLGERUNG ............................................................................................ 111 4.12. AUSBLICK .......................................................................................................... 113 5. ZUSAMMENFASSUNG ................................................................................................. 114 6. LITERATURVERZEICHNIS ................................................................................................. 116 7. ABKUERZUNGSVERZEICHNIS .......................................................................................... 126 8. DANKSAGUNG ........................................................................................................... 130
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