Verfügbarkeit: Untersuchungen zur Kausalität von HPV-DNA-Integration in der Zervixkarzinogenese

Untersuchungen zur Kausalität von HPV-DNA-Integration in der Zervixkarzinogenese:

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Carow, Katrin 1988- (VerfasserIn)
Format:	Abschlussarbeit Buch
Sprache:	German
Veröffentlicht:	Jena [2018]
Schlagworte:	Hochschulschrift
Online-Zugang:	Inhaltsverzeichnis Inhaltsverzeichnis
Beschreibung:	135 Seiten Illustrationen 30 cm 1 CD-ROM

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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS 1 ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 3 ZUSAMMENFASSUNG 4 1 EINLEITUNG 6 1.1 DAS ZERVIXKARZINOM UND SEINE VORSTUFEN 1.2 RISIKOFAKTOREN UND PRAEVENTION DES ZERVIXKARZINOMS 1.3 HUMANE PAPILLOMVIREN 1.3.1 GENOM 1.3.2 NATUERLICHER LEBENSZYKLUS 10 1.3.3 HPV IN DER ZERVIXKARZINOGENESE 12 1.4 HPV-DNA-INTEGRATION 15 1.4.1 HOT SPOTS UND MECHANISMUS 16 1.4.2 AUSWIRKUNGEN AUF ZELLULAERER EBENE 17 1.4.3 AUSWIRKUNGEN AUF VIRALER EBENE 18 1.4.4 ZEITPUNKT DER HPV-DNA-INTEGRATION UND BEZUG ZUR PROGRESSION 19 1.4.5 DETEKTION VON HPV-DNA-INTEGRATEN 19 1.5 INTRATUMORALE HETEROGENITAET UND KLONALITAET 21 1.6 TUMORSPEZIFISCHE NUKLEINSAEUREN 22 1.7 DIGITALE PCR 23 1.8 DAS ZIM-PROJEKT 24 1.9 FRAGESTELLUNG 26 2 MATERIALEN 28 2.1 CHEMIKALIEN 28 2.2 ENZYME 28 2.3 KITS UND FERTIGLOESUNGEN 29 2.4 VERBRAUCHSMATERIALIEN 29 2.5 SOFTWARE 29 2.6 PUFFER 30 2.7 GERAETE 30 2.8 ZELLLINIEN-DNAS 31 2.9 OLIGONUKLEOTIDE 31 2.10 KLINISCHE PROBEN 31 2.10.1 VERGLEICH VON QPCR UND DPCR 31 2.10.2 TUMOR-UND ABSTRICH-DNA VON PATIENTINNEN MIT ZERVIXKARZINOM 32 2.10.3 PROBEN VON CIN-PATIENTINNEN 34 3 METHODEN 36 3.1 PROBENVORBEREITUNG 36 3.1.1 DNA-ISOLATION 36 3.1.2 RNA-ISOLATION 36 3.1.3 CDNA-SYNTHESE 37 3.1.4 KLONIERUNG VON VIRAL-ZELLULAEREN UEBERGANGSSEQUENZEN 37 3.2 PCR 38 3.2.1 VCJ-PCR 38 3.2.2 QUANTITATIVE PCR 38 3.2.3 DIGITALE PCR - RAINDANCE TECHNOLOGIES 39 3.2.4 TAQMAN-PCR 40 3.2.5 DIGITALE PCR - KOOPERATION MIT DEM IPHT JENA 41 3.2.5.1 DIGITALE-PCR 41 SO OO O S 3.2.5.2 BERECHNUNGEN 42 3.2.6 DUPLEX-NESTED-PCR 42 3.3 IDENTIFIZIERUNG VON VIRAL-ZELLULAEREN UEBERGANGSSEQUENZEN 43 3.3.1 DAS TEN 16-VERFAHREN 43 3.3.2 DER APOT-ASSAY 49 3.4 RNA--S*7N-HYBRIDISIERUNG MITTELS BDNA-TECHNOLOGIE 50 3.5 STATISTISCHE AUSWERTUNG 52 4 ERGEBNISSE 53 4.1 PROJEKTUEBERSICHT UND EINORDNUNG VORANGEGANGENER STUDIEN 53 4.2 UNTERSUCHUNGEN ZUR DIGITALEN PCR 54 4.2.1 VERGLEICH VON QPCR UND DPCR ANHAND DER QUANTIFIZIERUNG VON HPV-MRNA 54 4.2.2 QUANTIFIZIERUNG VON VIRAL-ZELLULAEREN UEBERGANGSSEQUENZEN MITTELS DPCR 57 4.3 BEGLEITUNG DES TEN16-TECHNOLOGIETRANSFERS 59 4.3.1 IDENTIFIZIERUNG GEEIGNETER PROBEN 59 4.3.2 LEISTUNGSBEWERTUNG DES TEN16-VERFAHRENS 60 4.3.2.1 VERGLEICH DER TEN16-LEISTUNG VON DKFZ UND ATLAS BIOLABS GMBH 61 4.3.2.2 VERGLEICH DER TEN16-LEISTUNG MIT DNA AUS TUMORGEWEBE UND DNA AUS ABSTRICHEN 62 4.3.2.3 IDENTIFIZIERUNG VON VIRAL-ZELLULAEREN UEBERGANGSSEQUENZEN IN DER KANDIDATENLISTE 63 4.3.2.4 VCJ-PCRS NEUER KANDIDATEN 64 4.4 KAUSALITAET VON HPV-DNA-INTEGRATION 65 4.4.1 INTEGRATIONSHAEUFIGKEIT IN KREBSVORSTUFEN 66 4.4.2 ZEITLICHES AUFKOMMEN UND ZEITLICHE STABILITAET VON HPV-DNA-INTEGRATEN 67 4.4.3 RAEUMLICHE STABILITAET VON HPV-DNA-INTEGRATEN 69 4.4.3.1 ANALYSE DER VCJ-FRAGMENT-VERTEILUNG MITTELS IN-STTW-HYBRIDISIERUNG 70 4.4.3.2 ANALYSE DER VCJ-FRAGMENT-VERTEILUNG DURCH MIKRODISSEKTION UND VCJ-PCR 73 4.4J.3 ANALYSE DER VCJ-FRAGMENT-VERTEILUNG WEITERER PROBEN 75 4.4.4 LOKALISATION UND GENETISCHER KONTEXT DELEKTIERTER HPV-DNA-INTEGRATE 78 5 DISKUSSION 80 5.1 DIGITALE PCR 80 5.2 BEGLEITUNG DES TEN16-TECHNOLOGIETRANSFERS 85 5.2.1 TEN 16-LEISTUNGSBEWERTUNG ANHAND VON TUMOR-DNA 86 5.2.2 TEN 16-LEISTUNGSBEWERTUNG ANHAND VON ABSTRICH-DNA 87 5.2.3 ARTEFAKTE 88 5.2.4 TEN16-AUSGANGSMATERIAL 90 5.3 KAUSALITAET VON HPV-DNA-INTEGRATION 92 5.3.1 INTEGRATIONSHAEUFIGKEIT IN KREBSVORSTUFEN 93 5.3.2 ZEITLICHES AUFKOMMEN UND ZEITLICHE STABILITAET VON HPV-DNA-INTEGRATEN 95 5.3.3 RAEUMLICHE STABILITAET VON HPV-DNA-INTEGRATEN 97 5.3.4 LOKALISATION UND GENETISCHER KONTEXT DELEKTIERTER HPV-DNA-INTEGRATE 100 5.4 SCHLUSSFOLGERUNGEN 103 ANHANG 105 LITERATURVERZEICHNIS 116 ABBILDUNGSVERZEICHNIS 130 TABELLENVERZEICHNIS 131 DANKSAGUNG 133 EIDESSTATTLICHE ERKLAERUNG 135
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