Vorkommen und Verteilung von non-LEE Effektorprotein- und Adhäsin-kodierenden Genen in Escherichia coli O26:H11/H ̄ klinischen Isolaten:
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Veröffentlicht: |
Münster
2018
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adam_text | INHALT
1
EINLEITUNG......................................................................................................................
1
1.1 EHEC ALS KRANKHEITSERREGER
..........................................................................
1
1.2 COLI 026 H11/H : PATHOLOGIE UND KLINISCHE BEDEUTUNG
......
..........................
3
1.3 ADHAESIN-KODIERENDE GENE
...............................................................................
5
1.3.1 LOC
7.........................................................................................................6
1.4 TYP
ILL-SEKRETIONSMECHANISMUS.....................................................................7
1.5 NON-LEE- KODIERTE EFFEKTORPROTEINE
.................................................................
8
1.5.1
NLEA..........................................................................................................8
1.5.2 ESPJ
..............
9
1.5.3
ESPM........................................................................................................9
1.5.4
CIF.............................................................................................................9
1.5.5
TCCP.......................................................................................................10
1.5.6 NLEB, C, D, E, H1+2, OSPG,
ESPK.........................................................10
1.6
ZIELSETZUNG....................................................................................................12
2 MATERIAL UND
METHODEN...........................................................................................
13
2.1 ZUSAMMENSTELLUNG DER UNTERSUCHTEN
STAEMME.............................................13
2.2 GENOTYPISCHE
UNTERSUCHUNGEN....................................................................
15
2.2.1 GEWINNUNG DES DNA
TEMPLATES.............................................................15
2.2.2
POLYMERASEKETTENREAKTION.....................................................................
15
2.2.3
GELELEKTROPHORESE.................................................................................
20
2.2.4 ISOLIERUNG CHROMOSOMALER DNA AUS . COLI
...........................................
21
2.2.5 DNA KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
.
..........................................................
22
2.2.6 DOT BLOTTING VON DNA (NACH TERRY BROWN (15))
......................................
22
2.2.7 SONDENMARKIERUNG, HYBRIDISIERUNG UND ENTWICKLUNG
............................
24
2.2.8 ELUTION MARKIERTER
SONDEN.....................................................................25
2.3 STATISTISCHE
ANALYSE.....................................................................................
25
3 ERGEBNISSE
.........
.
.......................................................................................................26
3.1 GENOTYPISCHE ANALYSE DER . CO//-STAEMME MITTELS PCR
..............................
26
3.1.1 PCR-ERGEBNISSE ADHAESIN-KODIERENDER GENE DER LOC-GRUPPE
................
26
3.1.2 PCR-ERGEBNISSE FUER NON-LEE-KODIERTE EFFEKTORPROTEINE DES T3SS
.....
32
3.2 KONTROLLE DER PCR-ERGEBNISSE MITTELS DOT BLOT (15)
.....................................
43
3.2.1 DOT BLOTS ADHAESIN-KODIERENDER
GENE.....................................................43
3.2.2 DOT BLOTS NON-LEE KODIERTER EFFEKTORPROTEINE DES T3SS
........................
43
3.3 ZUSAMMENFASSUNG UND
ANALYSE...................................................................
46
4 DISKUSSION
......................................................................
52
5
LITERATURVERZEICHNIS.................................................................................................58
6
ANHANG........................................................................................................................
74
6.1
TABELLENVERZEICHNIS......................................................................................
74
6.2
ABBILDUNGSVERZEICHNIS..................................................................................
74
6.3
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS................................................................................
75
7
LEBENSLAUF.................................................................................................................
77
8
DANKSAGUNG..............................................................................................................
79
|
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