Verfügbarkeit: Molekulare und funktionelle Charakterisierung von Guanylat-bindenden Proteinen in Arabidopsis thaliana

Molekulare und funktionelle Charakterisierung von Guanylat-bindenden Proteinen in Arabidopsis thaliana:

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Schachtler, Christina 1989- (VerfasserIn)
Format:	Abschlussarbeit Buch
Sprache:	German
Veröffentlicht:	Erlangen ; Nürnberg [2018]
Schlagworte:	Apoptosis Ackerschmalwand Immunreaktion Rho-Proteine Hochschulschrift
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Beschreibung:	VII, 187 Seiten Illustrationen, Diagramme 21 cm

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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS 1 ZUSAMMENFASSUNG .............................................................. 1 2 SUMMARY.............................................................................................................................3 3 EINLEITUNG.............................................................................................................................5 3.1 GROSSE GUANOSINTRIPHOSPHAT-BINDENDE PROTEINE ................................................. 5 3.2 SUPERFAMILIE DER DYNAMINE-LIKE PROTEINS............................................................5 3.3 GUANYLAT-BINDENDE PROTEINE (GBPS) ............................................. 7 3.4 DAS PFLANZLICHE IMMUNSYSTEM .............................................................................. 10 3.5 PSEUDOMONAS SYRINGAE PATHOVAR TOMATO (P ST).................................................12 3.6 COLLETOTRICHUM HIGGINSIANUM.................................................................................12 3.7 DER ZELLTOD.................................................................................................................13 3.8 DER EINFLUSS VON STRESS UND ROS AUF P C D ........................................................17 3.9 DAS WURZELAPIKALMERISTEM.................................................................................... 18 3.10 ZIELSETZUNG DIESER ARBEIT....................................................................................... 22 4 ERGEBNISSE....................................................................................................................... 24 4.1 IDENTIFIZIERUNG UND BIOINFORMATISCHE ANALYSE VON ATGBPS ............................. 24 4.2 SUBZELLULAERE LOKALISATION DER ATGBPS ................................................................ 29 4.3 GEWEBESPEZIFISCHE EXPRESSIONSANALYSE DER ATGBPS ..................................... 32 4.4 FUNKTIONELLE CHARAKTERISIERUNG VON ATGBPB.....................................................35 4.4.1 NACHWEIS DER GTPASE- UND ATPASE-AKTIVITAET ........................................... 35 4.4.2 CHARAKTERISIERUNG DER ATGBPB-KNOCK-DOWN-MUIANIE (GABI-KAT 028F01) 37 4.4.3 INFEKTIONSANALYSEN MIT PSEUDOMONAS SYRINGAE PV. TOMATO ..................... 39 4.4.4 INFEKTIONSANALYSEN MIT COLLETOTRICHUM HIGGINSIANUM ................................. 41 4.4.5 KOMPLEMENTAEREN DER ATGBPB-MUTANTE ......................................................... 43 4.4.6 ANALYSE DES WURZELWACHSTUMS DER ATGBPB-MUTANTE ................................ 45 4.4.7 WEITERE CHARAKTERISIERUNG DES WURZELPHAENOTYPS DER ATGBPB-MUTANTE. 46 4.4.6 NAEHERE UNTERSUCHUNG DER TOTEN ZELLEN IN AFGFRPFR-WURZELN ...................... 53 4.4.9 VISUALISIERUNG VON F-AKTIN, MIKROTUBULI UND CHROMATIN IN AFGBPB-WURZELN 56 4.4.10 VERGLEICH DES TRANSKRIPTOMS VON WT-PFLANZEN UND AFGBPB-MUTANTEN IM KEIMLINGSSTADIUM AUF DER BASIS VON RNA-SEQUENZIERUNG (RNA-SEQ) ............... 59 4.5 FUNKTIONELLE CHARAKTERISIERUNG VON ATGBPA UND ATG BPC ............................. 64 4.5.1 CHARAKTERISIERUNG VON A. F/7A//ANA-MUTANTEN FUER ATGBPA UND ATGBPC. 64 4.5.2 INFEKTIONSANALYSEN MIT P S T............................................................................ .6 8 4.5.3 INFEKTIONSANALYSEN MIT COLLETOTRICHUM HIGGINSIANUM..................................70 5 DISKUSSION.........................................................................................................................74 5.1 ALLGEMEINER VERGLEICH DER ATGBPS MIT DEN HSGBPS ...................................... 74 5.2 ATGBPS SPIELEN KEINE ROLLE BEI DER PATHOGENABWEHR ..................................... 77 5.3 ATGBPB WEIST EINE GTPASE-AKTIVITAET AUF............................................................ 80 5.4 EINE REDUKTION DER EXPRESSION VON ATGBPB WIRKT SICH AUF DIE WURZELENTWICKLUNG A U S ...................................................................................................... 82 5.5 ENTWICKLUNGSSPEZIFISCHE DEFEKTE UND EINE DESORGANISATION DER ZELLSTRUKTUR IM WURZELMERISTEM VON ATGBPB............................................................... 84 5.5.1 DER PHAENOTYP DER ATGBPB-MUTANTE ZEIGT EINE AKKUMULATION VON TOTEN ZELLEN 88 5.6 TRANSKRIPTOM-ANALYSE DURCH RNA-SEQUENZIERUNG WEIST AUF EINE STRESSINDUZIERTE URSACHE DES WURZELPHAENOTYPS H IN ...................................................89 5.7 DIE ATGBPS ALS MITGLIEDER DER SUPAERFAMILIE DER DYNAMINE-LIKE PROTEINS 101 6 MATERIAL UND METHODEN.................................................................................................103 6.1 M ATERIAL................................................................................................................... 103 6.1.1 ORGANISMEN..................................................................................................... 103 6.1.2 VEKTOREN............................................................................................................ 104 6.1.3 OLIGONUKLEOTIDE................................................................................................105 6.1.4 LOESUNGEN UND PUFFER.......................................................................................106 6.1.5 ANZUCHTMEDIEN ..................... 109 6.1.6 CHEMIKALIEN UND ENZYME 6.1.7 VERBRAUCHSMATERIAL 115 6.1.8 GERAETE UND SOFTWARE........................................................................................116 6.2 METHODEN................................................................... 117 6.2.1 KULTIVIERUNGSBEDINGUNGEN............................................................................. 117 6.2.2 ALLGEMEINE MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN ............................................. 119 6.2.3 METHODEN ZUR ARBEIT MIT BAKTERIEN ............................................................ 126 6.2.4 METHODEN ZUR ARBEIT MIT PFLANZEN ............................................................... 130 6.2.5 MIKROSKOPIE-TECHNIKEN..................................................................................142 6.2.6 BIOINFORMATISCHE ANALYSEN............................................................................ 143 7 LITERATURVERZEICHNIS...................................................................................................... 146 8 ANHANG.......................................................................................... 164 6.1 LOKALISIERUNG UND GENEXPRESSION..................................................................... 164 6.2 GTPASE-AKTIVITAET................................................. 166 8.3 T U N E L .................................................................................................................... 170 6.4 A. TOA/ZANA-MARKERLINIEN ....................................................................................... 171 8.5 RNA-SEQ..................................................................................................................173 6.6 A. FHA/ZANA-LNSERTIONSLINIEN..................................................................................174 8.7 INFEKTIONSVERSUCHE............................................................................................... 174 6.8 PLASMIDKARTEN........................................................................................................ 175 8.9 PROTEIN-ALIGNMENTS UND PROTEINSEQUENZEN ..................................................... 176 9 LEBENSLAUF...................................................................................................................... 164 10 DANKSAGUNG...................................................................................................................165 11 ERKLAERUNG........................................................................................................................ 167
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