Rezeptorcharakterisierung von extraintestinal pathogenen Escherichia coli-Bakterien:
Gespeichert in:
1. Verfasser: | |
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Format: | Abschlussarbeit Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Münster
2017
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adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG............................................................................................................................
1
1.1
HAMWEGSINFEKTION.......................................................................................................
1
1.1.1
EPIDEMIOLOGIE..................................................................................................1
1.1.2 DEFINITION UND
EINTEILUNG...............................................................................1
1.1.3 K
LINIK...............................................................................................................
2
1.1.4
PATHOGENESE......................................................................................................2
1.2 ESCHERICHIA COLI ALS
INFEKTIONSERREGER.......................................................................
3
1.2.1 VIRULENZFAKTOREN VON E.
COLI.........................................................................
4
1.2.2 O-, H- UND
K-ANTIGENE..................................................................................4
1.2.3 A
DHAESINE..........................................................................................................
6
1.2.4 WEITERE UPEC-SPEZIFISCHE
VIRULENZFAKTOREN..............................................9
1.2.5 DAS ABU
E. CO/Z-ISOLAT
83972....................................................................
10
1.3
GLYKOSPHINGOLIPIDE....................................................................................................
10
1.3.1 AUFBAU UND NOMENKLATUR
............................................................................
11
1.3.2 VORKOMMEN UND FUNKTION
...........................................................................
12
1.4 CHARAKTERISIERUNG DER BAKTERIELLEN ADHAESION AN WIRTSZELLREZEPTOREN
..................
14
1.4.1 NACHWEIS DER REZEPTORSPEZIFISCHEN ADHAESION MITTELS
DUENNSCHICHTCHROMATOGRAPHIE......................................................................
14
1.5 ZIELSETZUNG DER A
RBEIT...............................................................................................16
2 MATERIAL UND
METHODEN..................................................................................................17
2.1
MATERIAL.......................................................................................................................
17
2.1.1 GERAETE UND
CHEMIKALIEN...............................................................................17
2.2
METHODEN....................................................................................................................17
2.2.1 DUENNSCHICHTCHROMATOGRAPHIE
.....................................................................
17
2.2.2 BESCHICHTUNG DER DC-PLATTEN MIT
PLEXIGUM...............................................18
2.2.3
ORCINFAERBUNG..................................................................................................18
2.2.4 DC OVERLAY-ASSAY ZUM NACHWEIS VON G SL
..............................................19
2.3 MIKROBIOLOGISCHE
METHODEN.....................................................................................21
2.3.1
BAKTERIENSTAEMME...........................................................................................
21
2.3.2 KONSERVIERUNG DER
BAKTERIEN.......................................................................22
2.3.3 KULTIVIERUNG DER
BAKTERIEN..........................................................................22
2.3.4 BESTIMMUNG DER
BAKTERIENZAHL...................................................................22
2.3.5 BIOTINYLIERUNG VON MEMBRANPROTEINEN DER BAKTERIENOBERFLAECHE
............
22
2.3.6 DOT
BLOT..........................................................................................................24
2.3.7 DC OVERLAY-ASSAY MIT BIOTINYLIERTEN E.
CO/Z-BAKTERIEN...........................26
2.3.8 NACHWEIS DER MANNOSE-RESISTENTEN
HAEMAGGLUTINATION..............................27
3
ERGEBNISSE.........................................................................................................................
28
3.1 ANTIKOERPERBASIERTE DETEKTION VON UNTERSCHIEDLICHEN EXPEC-STAEMMEN
UND DEM EHEC-STAMM 493/89
...............................................................................
28
3.2 DETEKTION VON EXPEC-STAEMMEN MITTELS BIOTINYLIERUNG VON
MEMBRANPROTEINEN DER BAKTERIENOBERFLAECHE
..........................................................
31
3.3 NEUTRALE REFERENZ-GLYKOSPHINGOLIPIDE NACH DUENNSCHICHTCHROMATOGRAPHIE
.....
33
3.4 ETABLIERUNG EINES DC OVERLAY-ASSAYS ZUM NACHWEIS
REZEPTORSPEZIFISCHER
BAKTERIELLER ADHAESION VON BIOTINYLIERTEN
BAKTERIEN................................................35
3.4.1 KONTROLL-OVERLAY-ASSAY OHNE BAKTERIEN ODER G
SL...................................35
3.4.2 EINFLUSS DER BAKTERIENANZAHL UND DES BAKTERIEN/BIOTINVERHAELTNISSES
AUF DIE
SIGNALSTAERKE.......................................................................................36
3.4.3 EINFLUSS DER GSL MENGE UND DER INKUBATIONSBEDINGUNGEN AUF DIE
SIGNALQUALITAET DER DC
OVERLAY-ASSAYS........................................................
38
3.4.4 EINFLUSS DER TEMPERATUR WAEHREND DER BAKTERIENINKUBATION AUF DEN
DC-PLATTEN......................................................................................................40
3.4.5 FEINABSTIMMUNG DES BAKTERIEN/BIOTINVERHAELTNISSES, DER GSL-MENGE
UND DER BAKTERIELLEN WACHSTUMSBEDINGUNGEN
...........................................
41
3.5 BINDUNG KLINISCHER EXPEC-ISOLATE MIT UNTERSCHIEDLICHEN
PAPG-ADHAESINVARIANTEN AN
GSL..............................................................................
44
3.5.1 DC OVERLAY-ASSAYS DER STAEMME CFT073 (PAPGLL+,PAPGLL+),
24703 (PAPGLL+) UND IHE3034
(PAP-).......................................................44
3.5.2 DC OVERLAY-ASSAYS DER UPEC J96 (PAPGL+,PAPGLLL+) UND J96-M1
(PAPGL+)........................................................................................................46
3.6 BINDUNG DES E. COLI ABU-ISOLATES 83972 UND VERSCHIEDENER RE-ISOLATE
AN
NEUTRALE G
SL..............................................................................................................
48
3.6.1 DC OVERLAY-ASSAYS DES ABU STAMMES 83972 UND DES RE-ISOLATES
FIM
636..........................................................................................................49
3.6.2 DC-OVERLAY-ASSAYS MIT DEN RE-ISOLATEN BU 05 35364
UND BU 04
68088..........................................................................................
50
3.6.3 DC OVERLAY-ASSAYS DER ZWEI KLONE DES RE-ISOLATES BU 04 63630
.........
50
3.7 NACHWEIS VON P-FIMBRIEN MITTELS MANNOSE-RESISTENTER HAEMAGGLUTINATION
.......
51
3.8 SEQUENZALIGNMENT DER PAPG-PROTEINE DER VERWENDETEN E. CO/Z -STAEMME
.............
53
4
DISKUSSION.........................................................................................................................
60
4.1 IMMUNCHEMISCHE DETEKTION VON VERSCHIEDENEN EXPEC-STAEMMEN UND DEM
EHEC-STAMM
493/89.........................................................................................
4.2 BIOTINYLIERUNG VON MEMBRANPROTEINEN AN DER OBERFLAECHE VON EXPEC
...............
64
4.3 REZEPTORSPEZIFISCHE ADHAESION VON
E. CO/Z -BAKTERIEN DURCH P-FIMBRIEN..............66
5 A
USBLICK............................................................................................................................
74
6
LITERATURVERZEICHNIS.......................................................................................................
76
7
DANKSAGUNG......................................................................................................................
88
8
LEBENSLAUF.........................................................................................................................
89
9
ANHANG.................................................................................................................................
I
9.1 T
ABELLENVERZEICHNIS......................................................................................................I
9.2
ABBILDUNGSVERZEICHNIS...............................................................................................
II
9.3
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS..........................................................................................
VIII
9.4
MATERIALIENVERZEICHNISSE..........................................................................................XI
9.4.1 CHEMIKALIEN UND
REAGENZIEN.....................................................................XI
9.4.2
VERBRAUCHSMATERIALIEN................................................................................XII
9.4.3 VERWENDETE
GERAETE......................................................................................
XII
|
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