Untersuchungen zum Vorkommen und zur Bedeutung von Mykoplasmen bei Weißstörchen (Ciconia ciconia, LINNAEUS, 1758) und Beschreibung einer neuen Spezies (Mycoplasma ciconiae sp. nov.):
Gespeichert in:
1. Verfasser: | |
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Format: | Abschlussarbeit Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2016
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Schriftenreihe: | Edition Scientifique
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Schlagworte: | |
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Beschreibung: | XVIII, 200 Seiten 21 cm x 14.6 cm, 340 g |
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adam_text | I. INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG...........................................................................................................
1
2
LITERATURUEBERSICHT.......................................................................................4
2.1 MOLLICUTES
(MYKOPLASMEN)................................................................................4
2.1.1 PHYLOGENESE UND
TAXONOMIE...........................................................................4
2.1.2
BIOLOGIE.............................................................................................................
6
2.1.3 VETERINAERMEDIZINISCHE
BEDEUTUNG....................................................................
9
2.1.4 GEFLUEGELPATHOGENE MYKOPLASMEN
..................................................................
12
2.1.4.1 MYCOPLASMA GALLISEPTICUM
(MG).....................................................................12
2.1.4.2 MYCOPLASMA GALLISEPTICUM BEI
FINKENVOEGELN..................................................16
2.1.4.3 MYCOPLASMA SYNOVIAE
(MS)............................................................................18
2.1.4.4 MYCOPLASMA MELEAGRIDIS (MM)
......................................................................
21
2.1.4.5 MYCOPLASMA IOWAE
(ML).................................................................................
22
2.1.5 WEITERE AVIAERE
MYKOPLASMEN..........................................................................23
2.1.6 AVIAERE
UREAPLASMEN......................................................................................
30
2.1.7 UNBEKANNTE UND NICHT VALIDE BESCHRIEBENE MYKOPLASMENSPEZIES
.................
31
2.2 BEDEUTUNG VON MYKOPLASMEN FUER WILDVOEGEL UND WILDVOGELPOPULATIONEN
......
32
2.3 DIAGNOSTIK AVIAERER
MYKOPLASMEN....................................................................36
2.3.1 DIREKTE
NACHWEISVERFAHREN.............................................................................38
2.3.1.1 KULTIVIERUNG VON
MYKOPLASMEN......................................................................
36
2.3.1.2 IDENTIFIZIERUNG VON MYKOPLASMENISOLATEN
......................................................
40
2.3.1.3 MOLEKULARBIOLOGISCHE NACHWEISMETHODEN
.....................................................
42
2.3.2 INDIREKTE
NACHWEISVERFAHREN...........................................................................47
2.4 BESCHREIBUNG NEUER SPEZIES DER KLASSE
MOLLICUTES.......................................48
2.5 DER
WEISSSTORCH................................................................................................51
2.5.1 BIOLOGIE DES WEISSSTORCHES
..............................................................................
53
2.5.2 UEBERSICHT MIKROBIOLOGISCHER UND TOXIKOLOGISCHER BEFUNDE BEI
WEISSSTOERCHEN .54
2.6
FRAGESTELLUNG...................................................................................................56
3 MATERIAL UND
METHODEN............................................................................57
3.1
MATERIAL............................................................................................................57
3.1.1 GERAETE, REAGENZIEN UND VERBRAUCHSMATERIAL
.................................................
57
3.1.2 BEZEICHNUNG UND HERKUNFT DER
MYKOPLASMENKULTUREN....................................57
3.2
METHODEN.........................................................................................................63
3.2.1 KULTIVIERUNG VON
MYKOPLASMEN.......................................................................
63
3.2.2 KULTIVIERUNG ANDERER
BAKTERIEN........................................................................
64
3.2.3 MOLEKULARBIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN
...........................................................
64
3.2.3.1 EXTRAKTION DER
DNA.........................................................................................65
3.2.3.2 BESTIMMUNG DER DNA-KONZENTRATION IN LOESUNGEN
.........................................
65
3.2.3.3 POLYMERASE-KETTENREAKTIONEN
(PCR)..............................................................65
3.2.3.3.1 16S-RRNA-PCR
NACH
VAN
K
UPPEVELD
ET
AL.
(1992), MODIFIZIERT
NACH H
AGEN
(2007)
(168-RRNA-PCR).................................................................................
66
3.2.3.3.2 16S-23S-LNTERGENIC-TRANSCRIBED-SPACER-REGION-PCR NACH
R
AM
I
REZ
ET AL.
(2008) (ITS-PCR)
............................................................................................
67
3.2.3.3.3 ETABLIERUNG EINER SPEZIESSPEZIFISCHEN PCR FUER DAS ISOLAT ST57
(ST57-PCR)68
3.2.3.4
AGAROSEGELELEKTROPHORESE...............................................................................
69
3.2.3.5 AUFREINIGUNG DER
DNA-AMPLIKONS...................................................................
70
3.2.3.6 SEQUENZIERUNG UND
SEQUENZANALYSEN............................................................
70
3.2.4 SEROLOGISCHE UND ZUSAETZLICHE PHAENOTYPISCHE UNTERSUCHUNGEN
.......................
73
3.2.4.1 BIOCHEMISCHE
EIGENSCHAFTEN...........................................................................
73
3.2.4.1.1 FERMENTATION VON
GLUCOSE...............................................................................
74
3.2.4.1.2 HYDROLYSE VON ARGIN
IN......................................................................................
75
3.2.4.1.3 HYDROLYSE VON
HARNSTOFF..................................................................................
76
3.2.4.2 ABHAENGIGKEIT DES WACHSTUMS VON DER TEMPERATUR
........................................
77
3.2.4.3
ULTRAFILTRATION.....................................................................................................
78
3.2.4.4
LICHTMIKROSKOPIE..............................................................................................
78
3.2.4.5
ELEKTRONENMIKROSKOPIE....................................................................................
76
3.2.4.6 ABHAENGIGKEIT DES WACHSTUMS VON CHOLESTERIN
...............................................
79
3.2.4 7 IMMUNOBINDING
ASSAY.....................................................................................61
3.2.5 HERSTELLUNG SPEZIFISCHER KANINCHENHYPERIMMUNSEREN GEGEN DAS ISOLAT
ST
57..............................................................................................................
62
3.2.5.1 ANTIGENPRAEPARATION
.........................................................................................
83
3 2.5.2 BESTIMMUNG DER PROTEINKONZENTRATION MITTELS
BICINCHONINSAEURE-ASSAY (BCA)83
3.2 5.3 IMMUNISIERUNG, BLUTENTNAHME UND
SERUMGEWINNUNG.....................................64
3.2.6
PRAEVALENZSTUDIE..............................................................................................85
4
ERGEBNISSE.........................................................................................................87
4.1 KULTIVIERUNG VON MYKOPLASMEN
.......................................................................
87
4.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN
...........................................................
88
4.2.1 16S-RRNA-GENSEQUENZVERGLEICHE UND PHYLOGENETISCHER STAMMBAUM
..........
69
4.2.2 ITS-SEQUENZVERGLEICHE UND PHYLOGENETISCHER STAMMBAUM
...........................
95
4.3 SEROLOGISCHE UND ZUSAETZLICHE PHAENOTYPISCHE UNTERSUCHUNGEN
.....................
100
4.3.1 BIOCHEMISCHE
EIGENSCHAFTEN.........................................................................100
4.3.1.1 FERMENTATION VON
GLUCOSE..............................................................................
100
4.3.1.2 HYDROLYSE VON ARGIN IN
.....................................................................................
101
4.3.1.3 HYDROLYSE VON
HARNSTOFF..................................................................................
102
4.3.2 ABHAENGIGKEIT DES WACHSTUMS VON DER TEMPERATUR
......................................
102
4.3.3
ULTRAFILTRATION...................................................................................................104
4.3.4
LICHTMIKROSKOPIE............................................................................................106
4.3.5
ELEKTRONENMIKROSKOPIE...................................................................................108
4.3.6 ABHAENGIGKEIT DES WACHSTUMS VON CHOLESTERIN
.............................................
109
4.3.7 SEROLOGISCHE EIGENSCHAFTEN
..........................................................................
109
4.4 FORMALE BESCHREIBUNG VON MYCOPLASMA CICONIAE SP. NOV
............................
112
4.5 PRAEVALENZSTUDIE ZU MYCOPLASMA CICONIAE SP.
NOV.........................................113
4.5.1 SPEZIESSPEZIFISCHE PCR FUER DAS ISOLAT ST57 (ST57-PCR)
...........................
113
4.5.2 GEOGRAPHISCHE
VERTEILUNG..............................................................................116
4.5.3 STATISTISCHE
AUSWERTUNG.................................................................................120
5
DISKUSSION......................................................................................................
121
5.1 GENOTYPISCHE UND PHYLOGENETISCHE UNTERSUCHUNGEN
...................................
122
5.1.1 MYCOPLASMA CICONIAE SP.
NOV........................................................................122
5.1.2 WEITERE MYKOPLASMENISOLATE
........................................................................
123
5.2 NACHWEIS VON MYKOPLASMEN
........................................................................
125
5.2.1 ZUSAETZLICHE PHAENOTYPISCHE UNTERSUCHUNGEN
................................................
129
5.3
PRAEVALENZSTUDIE............................................................................................
134
5.3.1 ETABLIERUNG EINER SPEZIESSPEZIFISCHEN PCR FUER DAS ISOLAT ST57,
TYPSTAMM
VON MYCOPLASMA CICONIAE SP. NOV. (ST57-PCR)
...........................................
134
5.3.2 BEDEUTUNG VON MYCOPLASMA CICONIAE SP. NOV. FUER WEISSSTOERCHE
...................
137
5.4
SCHLUSSFOLGERUNG..........................................................................................
142
6
ZUSAMMENFASSUNG......................................................................................143
7
SUMMARY..........................................................................................................
146
8
LITERATURVERZEICHNIS..............................................................................
149
9
ANHANG.............................................................................................................
174
ANHANG I: GERAETE UND
VERBRAUCHSMATERIAL......................................................174
L.L
GERAETE....................................................................................................
174
L.LL
VERBRAUCHSMATERIAL..................................................................................
176
ANHANG II:
REAGENZIEN........................................................................................177
ANHANG III: LOESUNGEN UND PUFFER
.....................................................................
178
ANHANG IV: MEDIEN FUER MYKOPLASMEN-ANZUCHT
..............................................
180
IV.I SP4-MEDIUM NACH
B
RADBURY
(1998)
......................................................
180
IV.L.L SP4-FLUESSIGMEDIUM
181
IV.I.II
SP4-AGARMEDIUM..........................................................................................181
IV.LL MYKOPLASMEN-STANDARDMEDIUM NACH P
OVEDA
(1998)
.................................
182
IV.LL.L STANDARD-FLUESSIGMEDIUM MIT 20% SERUM
....................................................
182
IV.LL.II STANDARD-FLUESSIGMEDIUM MIT 10% SERUM
....................................................
162
IV.LL.III
STANDARD-FESTMEDIUM...................................................................................182
IV.LLL BIOCHEMIE-TEST- UND KONTROLLMEDIEN NACH
P
OVEDA
(1998)
..........................
183
IV.LLL.L GLUCOSE-, ARGININ- UND UREA-TESTMEDIUM
....................................................
183
IV.LLL.II
BIOCHEMIE-KONTROLLMEDIUM...........................................................................163
IV.IV UREAP/ASMA-FLUESSIG- UND AGARMEDIUM (DSMZ 1076B)
...............................
164
IV.IV.I
UREAPLASMA-FLUESSIGMEDIUM.........................................................................164
IV.IV. II
L/REAP/ASMA-AGARMEDIUM.............................................................................164
IV.V FLUESSIGMEDIUM MODIFIZIERT NACH H
AYFLICK
...................................................
185
IV. V.I AS-FLUESSIGMEDIUM (10%, 5%, 2,5%, 1%)
....................................................
165
ANHANG V: SEQUENZEN FUER PHYLOGENETISCHE UNTERSUCHUNGEN
................................
186
V. L VERWENDETE NUKLEOTIDSEQUENZEN AVIAERER MYKOPLASMEN
..............................
166
V.LL SEQUENZEN NICHT-AVIAERER MYKOPLASMENSPEZIES DES SYNOVIAE-CLUSTERS
.....
187
V.LLL SEQUENZEN NICHT-AVIAERER MYKOPLASMENSPEZIES DES HOMINIS-CLUSTERS
.......
167
V.IV SEQUENZEN ANDERER MYKOPLASMEN
..............................................................
166
V.V ITS-SEQUENZEN DER MYKOPLASMEN-ISOLATE AUS DER PHD-ARBEIT VON S
UAEREZ
-
PLZREZ
(2011)..................................................................................................169
ANHANG VI: STATISTISCHE AUSWERTUNG
190
VI.I BERECHNUNG DER OPTIMALEN WACHSTUMSTEMPERATUR DER ISOLATE ST57 UND
81101...........................................................................................................
190
VI.II
PRAEVALENZSTUDIE.................................................................................................
190
DANKSAGUNG.......................................................................................................................
193
SELBSTSTAENDIGKEITSERKLAERUNG...........................................................................................
195
|
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publisher | VVB Laufersweiler Verlag |
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spelling | Möller Palau-Ribes, Franca 1985- Verfasser (DE-588)1035404656 aut Untersuchungen zum Vorkommen und zur Bedeutung von Mykoplasmen bei Weißstörchen (Ciconia ciconia, LINNAEUS, 1758) und Beschreibung einer neuen Spezies (Mycoplasma ciconiae sp. nov.) eingereicht von Franca Möller Palau-Ribes, Bad Godesberg Gießen, Lahn VVB Laufersweiler Verlag 2016 XVIII, 200 Seiten 21 cm x 14.6 cm, 340 g txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Edition Scientifique Dissertation Justus-Liebig-Universität 2016 bird cabt bacteria cabt mycoplasma cabt ciconiidae cabt Doktorarbeit Uni Wissenschaft (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content VVB LAUFERSWEILER Verlag (DE-588)1065553803 pbl DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=030307621&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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