Untersuchungen zur genetischen Variabilität porciner Circoviren (PCV2) aus geimpften und ungeimpften Herden:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2016
|
| Schriftenreihe: | Edition Scientifique
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | IX, 119 Seiten 21 cm x 14.6 cm, 256 g |
| ISBN: | 9783835964297 3835964291 |
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|---|---|
| adam_text | ABBILDUNGSVERZEICHNIS..............................................................................................................
IV
TABELLEN
VERZEICHNIS...................................................................................................................VI
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS.............................................................................................................IX
1
EINLEITUNG.............................................................................................................................1
2
LITERATURUEBERSICHT................................................................................................................
3
2.1 PORZINE
CIRCOVIREN.....................................................................................................3
2.1.1
GESCHICHTE............................................................................................................
3
2.1.2
TAXONOMIE...........................................................................................................
3
2.1.3
NOMENKLATUR........................................................................................................4
2.1.4 GENOMISCHE
ORGANISATION....................................................................................7
2.1.5 OFFENE
LESERAHMEN..............................................................................................9
2.1.5.1
ORF1................................................................................................................9
2.1.5.2
ORF2..............................................................................................................
10
2.1.5.3
ORF3..............................................................................................................
11
2.1.5.4
ORF4..............................................................................................................
12
2.1.5.5 MUTATIONEN INNERHALB GENETISCHER ELEMENTE DES PCV2-GENOMS
.................
12
2.2
PATHOGENESE............................................................................................................
15
2.2.1 UEBERTRAGUNG VON
PCV2.....................................................................................
16
2.2.2
PCV2-ZIELZELLEN................................................................................................
18
2.2.3
KOFAKTOREN.........................................................................................................20
2.2.4
GENETIK...............................................................................................................22
2.2.5
IMMUNMODULATION..............................................................................................22
2.2.6
PCV2-GENOTYPEN...............................................................................................23
2.3 PCV2-ASSOZIIERTE ERKRANKUNGEN
.........
.
................................................................. 25
2.3.1 SUBKLINISCHE
PCV2-INFEKTION............................................................................27
2.3.2 PCV2-SYSTEMISCHE
ERKRANKUNG.........................................................................28
2.3.3 PC V
2-ATEMWEGSERKRANKUNG.............................................................................30
2.3.4
PCV2-DARMERKRANKUNG.....................................................................................31
2.3.5
PCV2-REPRODUKTIONSSTOERUNGEN.........................................................................32
2.3.6 PORZINES DERMATITIS UND NEPHROPATHIE SYNDROM (PDNS)
...............................
34
2.4
PCV2-IMMUNISIERUNG............................................................................................35
2.4.1 IN DEUTSCHLAND ZUGELASSENE KOMMERZIELLE PCV2-VAKZINEN
............................
36
2.4.2 VAKZINATION DER
MUTTERTIERE...............................................................................37
2.4.3 VAKZINATION DER
FERKEL......................................................................................
38
2.4.4 EFFEKTIVITAET DER KOMMERZIELLEN PCV2-VAKZINEN
..............................................
40
3 MATERIAL UND
METHODEN....................................................................................................
42
3.1 UNTERSUCHUNGSMATERIAL
............................................................................................
42
3.1.1 GERAETE UND
VERBRAUCHSMATERIAL.........................................................................42
3.1.2 CHEMIKALIEN UND
KITS........................................................................................
42
3.1.3 LOESUNGEN UND
PUFFER..........................................................................................
43
3.1.4 VERWENDETE SOFTWARE UND
INTEMETADRESSEN......................................................43
3.1.4.1 NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION (NCBI) UND BLAST
.......
43
3.1.4.2
OLIGO...........................................................................................................44
3.1.4.3 APE - A PLASMID
EDITOR.................................................................................44
3.1.4.4
CLUSTALX.........................................................................................................44
3.1.4.5 BIOEDIT - SEQUENCE ALIGNEMENT EDITOR
.........................................................
44
3.1.4.6
SPSS...............................................................................................................44
3.1.5
PROBENMATERIAL...................................................................................................
45
3.2 U
NTERSUCHUNGSMETHODEN........................................................................................
46
3.2.1 PROBEN
VORBEREITUNG............................................................................................
46
3.2.2 AMPLIFIKATION DES GESAMTEN PCV2-GENOM MITTELS PCR
.................................
47
3.2.2.1
PRIMER.............................................................................................................47
3.2.2.2 POLYMERASE-KETTENREAKTION
...........................................................................
48
3.2.3
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE...............................................................................
51
3.2.4 AUSWERTUNG DER
PCR-ERGEBNISSE......................................................................
51
3.2.5
DNA-SEQUENZIERUNG..........................................................................................
52
3.2.6 AUSWERTUNG DER
DNA-SEQUENZEN.....................................................................52
3.2.7 STATISTISCHE
AUSWERTUNG.....................................................................................
52
4
ERGEBNISSE........................................................................................................................
54
4.1 PROBEN UND
BETRIEBE.................................................................................................54
4.2
PCV2-SEQUENZEN....................................................................................................
57
4.3 PC
V2-GENOTYPEN...................................................................................................
61
4.4
ORF3-GENOTYPEN...................................................................................................
62
4.5
VIRUSMENGE............................................................................................................
64
4.6 MUTATIONEN INNERHALB DER 62 UNTERSUCHTEN PCV2-SEQUENZEN
..............................
66
4.6.1 MUTATIONEN MIT SIGNIFIKANTER ASSOZIATION ZU PCV2-GENOTYP UND
IMPFSTATUS. 67
4.6.2 MUTATIONEN MIT ASSOZIATION ZUR
VIRUSMENGE....................................................70
4.6.3 ZUSAMMENFASSUNG SNP G.
1182G T..................................................................72
4.7 UNGEWOEHNLICHE SEQUENZ-DUPLIKATION IM REP-GEN
...........................................
74
5
DISKUSSION.........................................................................................................................
76
6
ZUSAMMENFASSUNG.............................................................................................................
85
7
SUMMARY...........................................................................................................................
86
8
LITERATURVERZEICHNIS...........................................................................................................
87
9
ANHANG.............................................................................................................................109
|
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