Differentielle Evaluierung des IFN-α- und IFN-γ-dominierten Tumormikromilieus und dessen Einfluss auf die Prognose im Kolonkarzinom:
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| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Erlangen ; Nürnberg
[2017]
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1
ZUSAMMENFASSUNG..................................................................................1
SUMMARY.......................................................................................................
2
2
EINLEITUNG.....................................................................................................3
2.1 DAS KOLOREKTALE KARZINOM
..............................................................................
3
2.1.1 FUNKTION UND AUFBAU DES DICKDARMS
...........................................................
3
2.1.2 EPIDEMIOLOGIE UND AETIOLOGIE DES KOLOREKTALEN KARZINOMS
........................
4
2.1.3 KOLOREKTALE
KARZINOGENESE............................................................................5
2.2 SCHLUESSELMERKMALE VON TUMOREN UND DAS TUMORMIKROMILIEU
..................
6
2.3 DIE FAMILIE DER
INTERFERONE.............................................................................
8
2.3.1 SIGNALWEGE UND MODULATORISCHE EIGENSCHAFTEN VON IFN-OC
......................
9
2.3.2 SIGNALWEGE UND MODULATORISCHE EIGENSCHAFTEN VON IFN-Y
.....................
11
2.4 INTERFERON-STIMULIERTE G EN
E..........................................................................
13
2.4.1
MYXOVIRUS-RESISTENZGEN-1...........................................................................14
2.4.2
GUANYLATBINDUNGSPROTEIN-1..........................................................................15
2.5
ZIELSETZUNG......................................................................................................16
3 MATERIAL UND METHODEN
....................................................................
17
3.1
MATERIAL.............................................................................................................17
3.1.1 SPEZIELLE
CHEMIKALIEN...................................................................................17
3.1.2 SPEZIELLE VERBRAUCHSMITTEL
............................................................................
18
3.1.3 KOMMERZIELLE
REAGENZIENSAETZE....................................................................19
3.1.4 GERAETE UND
APPARATUREN................................................................................19
3.1.5
ENZYME...........................................................................................................20
3.1.6
PRIMAERANTIKOERPER..............................................................................................
20
3.1.7 SEKUNDAERANTIKOERPER
......................................................
21
3.1.6
PLASMIDE..........................................................................................................
21
3.1.9 OLIGONUKLEOTIDE
(PRIM
ER)..............................................................................22
3.1.9.1 SEQUENZIER
-PRIMER
.................................................................................
22
3.1.9.2 QRT-PCR
-PRIMER.....................................................................................22
3.1.10 BIOLOGISCHES MATERIAL
...................................................................................
22
3.1.10.1 PROKARYOTISCHE
ZELLEN............................................................................22
I
3.1.10.2 EUKARYOTISCHE ZELLLINIEN
3.1.10.3 PRIMAERE EUKARYOTISCHE
ZELLEN...............................................................23
3.1.10.4 HUMANE
GEWEBEPROBEN........................................................................
23
3.1.10.5
TISSUE-MICROARRAY..................................................................................
24
3.1.11 MEDIEN, LOESUNGEN UND
PUFFER......................................................................25
3.1.12
COMPUTERPROGRAMME....................................................................................
28
3.2 ZELLBIOLOGISCHE METHODEN
............................................................................
28
3.2.1 KULTIVIERUNG EUKARYOTISCHER
ZELLEN..............................................................26
3.2.2 STIMULIERUNG EUKARYOTISCHER ZELLEN MIT
ZYTOKINEN....................................29
3.2.3 TRANSFEKTION EUKARYOTISCHER
ZELLEN.............................................................30
3.3 MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN
..................................................................
30
3.3.1 PRAEPARATION VON RNA UND DNA
...................................................................
30
3.3.1.1 ISOLIERUNG VON GESAMT-RNA AUS EUKARYOTISCHEN ZELLEN
...................
30
3.3.1.2 ISOLIERUNG PROKARYOTISCHER
PLASMID-DNA.............................................31
3.3.2 BESTIMMUNG VON NUKLEINSAEUREKONZENTRATIONEN
.......................................
31
3.3.3 SPALTUNG VON DNA-MOLEKUELEN MIT RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN
.............
31
3.3.4
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE.........................................................................32
3.3.5 ISOLIERUNG VON DNA-FRAGMENTEN AUS AGAROSEGELEN
...............................
32
3.3.6 DEPHOSPHORYLIERUNG VON
DNA-FRAGMENTEN..............................................32
3.3.7 LIGATION VON DNA-FRAGMENTEN
....................................................................
33
3.3.6 TRANSFORMATION KOMPETENTER PROKARYOTISCHER ZELLEN
................................
33
3.3.8.1
ELEKTROPORATION........................................................................................33
3.3.62
HITZESCHOCKTRANSFORMATION.....................................................................33
3.3.9 DNA-SEQUENZIERUNG
.....................................................................................
34
3.3.10
POLYMERASE-KETTENREAKTION..........................................................................
34
3.3.11 QUANTITATIVE REVERSE-TRANSKRIPTION-POLYMERASEKETTENREAKTION
............
35
3.3.12 RNA-/A7 SITU-HYBRIDISIERUNG
......................................
36
3.3.12.1 HERSTELLUNG DER IN SITU-HYBRIDISIERUNGSSONDEN
.................................
36
3.3.12.2 VORBEREITUNG VON ZELLEN FUER IN
SITU-HYBRIDISIERUNG...........................37
3.3.12.3 RNA
-IN S/FIV-HYBRIDISIERUNG VON ZELLEN UND GEWEBESCHNITTEN
.......
36
3.4 PROTEINBIOCHEMISCHE
METHODEN..................................................................41
3.4.1 HERSTELLUNG VON GESAMTPROTEINZELLEXTRAKTEN
............................................
41
3.4.2 BESTIMMUNG DER GESAMTPROTEINKONZENTRATION
.........................................
41
3.4.3 SDS-POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
.....................................................
41
3.4.4 ELEKTROTRANSFER VON PROTEINEN
......................................................................
42
3.4.5
WESTERN-BLOT-ANALYSE...................................................................................42
3.4.6 IMMUNZYTOCHEMISCHE
FAERBUNG...................................................................43
3.4.7 IMMUNHISTOCHEMISCHE
FAERBUNG..................................................................43
3.4.8 IMMUNFLUORESZENZ-FAERBUNG
........................................................................
45
3.5 STATISTISCHE
AUSWERTUNG...............................................................................
45
4
ERGEBNISSE.................................................................................................
47
4.1 DIE INTERFERON-INDUZIERTE EXPRESSION VON MXA UND G B P
-1....................47
4.1.1 IFN-A INDUZIERT PRAEFERENTIELL DIE EXPRESSION VON MXA IN ZELLEN DES
KOLOREKTALEN
KARZINOMS................................................................................
47
4.1.2 IFN-Y INDUZIERT PRAEFERENTIELL DIE EXPRESSION VON GBP-1 IN ZELLEN
DES
KOLOREKTALEN
KARZINOMS................................................................................
49
4.2 MXA WIRD IM GEWEBE DES KOLOREKTALEN KARZINOMS EXPRIMIERT
...............
50
4.2.1 MXA WIRD IN TUMOR- UND STROMAZELLEN DES KOLOREKTALEN KARZINOMS
EXPRIMIERT........................................................................................................
50
4.2.2 DIE MX1-EXPRESSION AUF RNA-EBENE KORRELIERT MIT DER
PROTEINEXPRESSION VON MXA IM GEWEBE DES KOLOREKTALEN KARZINOMS..54
4.3 EIN IFN-A-DOMINIERTES TUMORMIKROMILIEU VERBESSERT DIE PROGNOSE VON
PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM
.......................................................................
58
4.3.1 IFN-A INDUZIERTES MXA WIRD VON DER HAELFTE DER PATIENTEN MIT
KOLONKARZINOM
EXPRIMIERT.............................................................................
56
4.3.2 DIE PATIENTENKOHORTE DES TMA IST FUER PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM
REPRAESENTATIV..................................................................................................
60
4.3.3 DIE MXA-EXPRESSION IST NICHT MIT KLASSISCHEN PATHOKLINISCHEN
MERKMALEN VON PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM ASSOZIIERT
........................
63
4.3.4 DIE EXPRESSION VON MXA IN DEN TUMORZELLEN IST NICHT MIT EINER
VERBESSERTEN PROGNOSE VON PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM ASSOZIIERT...64
4.3.5 DIE EXPRESSION VON MXA IN DEN STROMAZELLEN DES DESMOPLASTISCHEN
STROMAS IST STATISTISCH SIGNIFIKANT MIT EINER VERBESSERTEN PROGNOSE VON
PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM
ASSOZIIERT.................................................... 65
4.4 IFN-A-INDUZIERTES MXA UND IFN-Y-INDUZIERTES GBP-1 SIND IM GEWEBE
DES KOLOREKTALEN KARZINOMS KOEXPRIMIERT
.................................................
66
4.5 DIE PROGNOSE VON PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM WIRD DURCH EIN IFN-Y-
DOMINIERTES TUMORMIKROMILIEU STAERKER BEEINFLUSST ALS DURCH EIN IFN-OT-
DOMINIERTES
TUMORMIKROMILIEU...................................................................
68
4.5.1 DIE EXPRESSION VON GBP-1 IN DEN STROMAZELLEN IST MIT EINER
STATISTISCH
HOCH SIGNIFIKANT VERBESSERTEN PROGNOSE FUER PATIENTEN MIT
KOLONKARZINOM ASSOZIIERT
.............................................................................
68
4.5.2 DIE EXPRESSION VON MXA UND GBP-1 IN DEN STROMAZELLEN IST KEIN
UNABHAENGIGER FAKTOR FUER DIE PROGNOSE DES
KOLONKARZINOMS..................70
4.5.3 EIN IFN-Y-DOMINIERTES TUMORMIKROMILIEU ZEIGT IM GEGENSATZ ZU EINEM
IFH!--DOMINIERTEN TUMORMIKROMILIEU EINE SIGNIFIKANT VERBESSERTE
PROGNOSE VON PATIENTEN MIT
KOLONKARZINOM..............................................71
5
DISKUSSION..................................................................................................73
5.1 IFN-CT UND IFN-Y STIMULIEREN DIE EXPRESSION VON MXA UND GBP-1 IN
ZELLEN DES KOLOREKTALEN
KARZINOMS............................................................74
5.2
5.3
6
7
6
EIN IFN-Y-DOMINIERTES TUMORMIKROMILIEU IST IM GEGENSATZ ZU EINEM
IFN-A-DOMINIERTEN TUMORMIKROMILIEU MIT EINER SIGNIFIKANT VERBESSERTEN
PROGNOSE VON PATIENTEN MIT KOLONKARZINOM ASSOZIIERT
............................
76
DIE GLEICHZEITIGE ANWESENHEIT VON IFN-A UND IFN-Y IM
TUMORMIKROMILIEU ZEIGT KEINEN SYNERGISTISCHEN EFFEKT AUF DIE PROGNOSE
IM
KOLONKARZINOM...........................................................................................
77
SCHLUSSFOLGERUNG..............................................................................80
LITERATURVERZEICHNIS.........................................................................81
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
...................................................................
92
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| spelling | Grenz, Sandra Verfasser aut Differentielle Evaluierung des IFN-α- und IFN-γ-dominierten Tumormikromilieus und dessen Einfluss auf die Prognose im Kolonkarzinom vorgelegt von Sandra Grenz Differentielle Evaluierung des IFN-Alpha- und IFN-Gamma-dominierten Tumormikromilieus und dessen Einfluss auf die Prognose im Kolonkarzinom Erlangen ; Nürnberg [2017] IV, 95 Seiten Illustrationen, Diagramme 21 cm txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Dissertation Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg 2017 Colonkrebs (DE-588)4148225-6 gnd rswk-swf Interferon gamma- (DE-588)4211188-2 gnd rswk-swf Interferon alpha- (DE-588)4205303-1 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Interferon alpha- (DE-588)4205303-1 s Interferon gamma- (DE-588)4211188-2 s Colonkrebs (DE-588)4148225-6 s DE-604 B:DE-101 application/pdf http://d-nb.info/1152044338/04 Inhaltsverzeichnis DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=030257158&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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