Computerbasierte Analyse von pH-induzierten Effekten auf die Proteinstruktur:
Gespeichert in:
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Format: | Abschlussarbeit Buch |
Sprache: | German English |
Veröffentlicht: |
Erlangen ; Nürnberg
2017
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adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
VORWORT.................................................................................................................................................
VII
SUMMARY...................................................................................................................................................1
ZUSAMMENFASSUNG....................................................................................................................................3
1
EINLEITUNG.........................................................................................................................................5
1.1
PROTEINE.....................................................................................................................................5
1.1.1 EINFLUSS DES PH-WERTES AUF
PROTEINE...................................................................................6
1.1.2 UNTERSUCHTE
PROTEINSYSTEME..............................................................................................
11
1.2 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN VON
PROTEINEN......................................................................15
1.3 BERUECKSICHTIGUNG DES PH-WERTES IN
MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN..................................19
1.3.1 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN MIT KONSTANTER
PROTONIERUNG..........................................19
1.3.2 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN MIT KONSTANTEM PH-WERT
.........................
20
1.3.3 DIE GRUNDIDEE VON PH-TITRIERENDEN MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN
..............................
22
2 ZIELE DER
ARBEIT..............................................................................................................................
25
3 EIGENE
PUBLIKATIONEN......................................................................................................................27
3.1 PUBLIKATION IN SCIENTIFIC
REPORTS.............................................................................................
27
3.2 PUBLIKATION IM JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY.
....................................................................
47
3.3 PUBLIKATION IM JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY
B.....................................................................75
4
AUSBLICK........................................................................................................................................101
4.1 ERWEITERUNG DER PHTMD-SIMULATION AUF EIN EXPLIZITES LOESUNGSMITTEL
..............................
101
4.2 BERUECKSICHTIGUNG DER TEMPERATUR BEI SIMULATIONEN MIT VERAENDERLICHER
PROTONIERUNG....102
4.3 PARAMETRISIERUNG DER N- UND C-TERMINALEN AMINOSAEUREN
.................................................
102
4.4 VISUALISIERUNG VON AMBER-SIMULATIONEN MIT VERAENDERLICHER
PROTONIERUNG.....................104
LITERATURVERZEICHNIS.............................................................................................................................
107
A
ANHANG..........................................................................................................................................
111
A. 1
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS..........................................................................................................111
A.2
ABBILDUNGSVERZEICHNIS..........................................................................................................
112
A.3
TABELLENVERZEICHNIS...............................................................................................................112
A.4 PUBLIKATIONEN UND
KONFERENZBEITRAEGE...................................................................................
113
A.5
DANKSAGUNG...........................................................................................................................
117
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