The analysis of complex traits in livestock using dense genomic information - tools and applications:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | English |
| Veröffentlicht: |
Kiel
Selbstverlag des Instituts für Tierzucht und Tierhaltung der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
[2016]
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|---|---|
| adam_text | CONTENTS
GENERAL INTRODUCTION 1
CHAPTER 1
NOVEL USE OF DERIVED GENOTYPE PROBABILITIES TO DISCOVER SIGNIFICANT
DOMINANCE
EFFECTS FOR MILK PRODUCTION TRAITS IN DAIRY CATTLE 5
CHAPTER 2
THE IMPACT OF LINKAGE DISEQUILIBRIUM ON ESTIMABLE GENETIC EFFECTS AT
MARKERS IN
THE PRESENCE OF DOMINANCE 27
CHAPTERS
CPGEN* A PACKAGE FOR PARALLEL GENOMIC EVALUATIONS IN R 33
CHAPTER 4
GENOMIC PREDICTION OF UNORDERED CATEGORICAL TRAITS* AN APPLICATION TO
SUBPOPULA
TION ASSIGNMENT IN GERMAN WAMBLOOD HORSES 47
GENERAL DISCUSSION 73
1 THE DETECTION AND USE OF DOMINANCE EFFECTS IN ANIMAL BREEDING
......... 73
2 INCOIPORATING NON-GENOTYPED BUT PHENOTYPED INDIVIDUALS IN GENOMIC
ANALYSIS . 74
2.1 CALCULATION OF GENOTYPE PROB^^ . . 74
2.2 SINGLE STEP GENOMIC
PREDICTION............................................. 76
3 COMPUTATIONAL CHAUENGES IN ANIMAL B RE E D IN G
.................................................... 78
3.1 P * E L COM
PUTING...................................................................
78
3.2 VARIABLE SELECTION TO REDUCE DIMENSIONALITY
..........................................
80
4 G ENODE PREDICTION OF UNORDERED CATEGORICAL *AITS
........................................... 82
5 CONCLUDING R E M A S
..............................................................................................
83
SUMMARY 88
ZUSAMMENFASSUNG 91
SUPPLEMENTARY MATERIAL 94
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