Datenbank-gestützte molekularbiologische Analyse melanomrelevanter Gene:
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2013
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| adam_text | AUS DER ABTEILUNG FUER MOLEKULARE PATHOLOGIE
FRAU PROF. DR. RER. NAT. ANJA-KATRIN BOSSERHOFF
DER FAKULTAET FUER MEDIZIN
DER UNIVERSITAET REGENSBURG
DATENBANK-GESTUETZTE MOLEKULARBIOLOGISCHE
ANALYSE MELANOMRELEVANTER GENE
INAUGURAL - DISSERTATION
ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES
DER MEDIZIN
DER FAKULTAET FUER MEDIZIN
DER UNIVERSITAET REGENSBURG
VORGELEGT VON
SONJA HETTERICH
2013
HTTP://D-NB.INFO/1058560867
INHALTSVERZEICHNIS
ZUSAMMENFASSUNG 8
1 EINLEITUNG 10
1.1 STRUKTUR UND AUFBAU DER HAUT 10
1.1.1 EPIDERMIS 10
1.1.2 DERMIS 13
1.1.3 SUBKUTIS 13
1.2 DAS MALIGNE MELANOM 13
1.2.1 EPIDEMIOLOGIE UND RISIKOFAKTOREN 14
1.2.2 KLASSIFIKATION 16
1.2.3 STADIENEINTEILUNG 17
1.2.4 PROGNOSE 18
1.2.5 PATHOGENESE 20
1.2.6 BEREITS BEKANNTE GENE BEI DER ENTSTEHUNG DES MALIGNEN
MELANOMS 21
1.2.7 MOLEKULARE GRUNDLAGEN BEI DER ENTSTEHUNG DES MALIGNEN
MELANOMS 24
1.3 BESCHREIBUNG DER INTERNETSEITE DES NATIONAL CENTER FOR BIOTECHNOLOGY
INFORMATION (NCBI) UND DER MICROARRAYS 29
2 MATERIAL UND METHODEN 31
2.1 MATERIALIEN 31
2.1.1 STUDIEN DER DATENBANK GEO PROFILES DES NCBI (NATIONAL CENTER
FOR BIOTECHNOLOGY INFORMATION) 31
2.1.2 SAEUGERZELLLINIEN 34
2.1.3 GEWEBEPROBEN 34
2.1.4 HUMANE OLIGONUKLEOTIDE 35
2.1.5 ALLGEMEINE MATERIALIEN 35
2.1.6 GERAETE 36
2.1.7 LOESUNGEN 36
2.1.8 GRAPHPAD PRISM PROGRAMM 37
2.2 METHODEN 37
2.2.1 RNA-ISOLATION AUS SAEUGERZELLEN 37
2.2.2 VERMESSEN DER RNA 38
2.2.3 REVERSE TRANSKRIPTION 38
2.2.4 REALTIME-PCR 40
2.2.5 GELELEKTROPHORESE 41
3 ERGEBNISSE 42
3.1 ERGEBNISSE DER INTERNETRECHERCHE 42
3.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE UEBERPRUEFUNG DER GENEXPRESSION AUSGEWAEHLTER
GENE.. 71
3.3 ZUSAMMENFASSUNG DER ERGEBNISSE 76
3.3.1 KCNN2 76
3.3.2 SHFM1 77
3.3.3 PLXNA1 78
4 DISKUSSION 80
4.1 KCNN2
(POTASSIUM INTERMEDIATE/SMALL CONDUCTANCE CALCIUM-ACTIVATED
CHANNEL, SUBFAMILY
N,
MEMBER
2) 80
4.1.1 ALLGEMEINE FUNKTIONEN VON KCNN2 80
4.1.2 ROLLE VON KCNN2 IN MELANOMZELLEN UNTER HYPOXISCHEN
BEDINGUNGEN 81
4.2 SHFM1 (SPLIT HAND/FOOT MALFORMATION (ECTRODACTYLY) TYPE 1) 84
4.2.1 ALLGEMEINE FUNKTIONEN VON SHFM1 84
4.2.2 MOEGLICHE INDUKTION DER MELANOGENESE DURCH INTERAKTION VON
SHFM1 MIT P53 84
4.2.3 SCHWAECHUNG DER REPARATURMECHANISMEN DER ZELLEN DURCH
MANGEL AN SHFM1 85
4.2.4 VERAENDERUNGEN DER KONTAKTINHIBITION IN EPIDERMALEN ZELLEN
DURCH SHFM1 87
4.2.5 CHROMOSOMALE INSTABILITAET DURCH AUSSCHALTEN VON SHFM1 88
4.3 PLXNA1 CPLEXIN AI) 90
4.3.1 ALLGEMEINE FUNKTIONEN VON PLXNA 1 90
4.3.2 ROLLE VON PLEXIN AI BEI ANGIOGENESE UND TUMORPROLIFERATION 91
4.3.3 ERHOEHUNG DER AKTIVITAET DES VEGF-REZEPTORS UND AKTIVIERUNG
DES NFKB-WEGES 92
4.3.4 ROLLE DER PLEXINE IM MALIGNEN MELANOM 93
4.3.5 GENEXPRESSION VON PLEXIN AI IN WEITEREN TUMORARTEN 94
4.4 DISKUSSION DER METHODE DER ANALYSE EINER INTERNETDATENBANK ALS
QUELLE
FUER MELANOMRELEVANTE GENE 96
4.4.1 GENE MIT BEREITS BEKANNTER REGULATION IM MELANOM 96
4.4.2 AFFYMETRIX MICROARRAYS ALS AUSGANGSPUNKT DER ANALYSE 99
4.4.3 MOEGLICHE URSACHEN DER DIFFERENZEN ZWISCHEN DER ANALYSE DER
AFFYMETRIX MICROARRAYS UND DEN EIGENEN EXPERIMENTELLEN
UNTERSUCHUNGEN 100
5 LITERATURVERZEICHNIS 104
6 ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 119
7 DANKSAGUNG 123
8 CURRICULUM VITAE,
124
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