Molekulare Epidemiologie vancomycin-resistenter E. faecium-Isolate an einem südwestdeutschen Krankenhaus der Maximalversorgung:
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Format: | Abschlussarbeit Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Gießen
VVB Laufersweiler
2013
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Ausgabe: | 1. Aufl. |
Schlagworte: | |
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Beschreibung: | 165 S. graph. Darst. 21 cm, 250 g |
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adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
1. EINLEITUNG UND
THEMENBEZOGENE LITERATURUEBERSICHT 1
1.1 EINLEITUNG - 1
1.2 THEMENBEZOGENE LITERATURUEBERSICHT 3
1.2.1 TAXONOMIE UND EIGENSCHAFTEN
DER ENTEROKOKKEN 3
1.2.2 NATUERLICHES VORKOMMEN UND BEDEUTUNG DER ENTEROKOKKEN
IM LEBENSMITTELBEREICH 4
1.2.3 POTENTIELLE PATHOGENITAET DER ENTEROKOKKEN 5
1.2.4 THERAPIE VON ENTEROKOKKEN-INFEKTIONEN 6
1.2.5 GLYCOPEPTID-ANTIBIOTIKA 6
1.2.6 NATUERLICHE UND ERWORBENE RESISTENZEN DER ENTEROKOKKEN 7
1.2.7 GLYCOPEPTID-RESISTENZ DER ENTEROKOKKEN 8
1.2.8 EPIDEMIOLOGIE VANCOMYCIN-RESISTENTER ENTEROKOKKEN (VRE) 10
1.2.9 VRE IN DER NUTZTIERHALTUNG 13
1.2.10 RLSIKOFAKTOREN FUER
KOLONISATION UND INFEKTION DURCH VRE
BEIM MENSCHEN 14
1.2.11 UEBERTRAGUNGSWEGE VON ENTEROKOKKEN IM KRANKENHAUS 14
1.2.12 PRAEVENTION NOSOKOMIALER VRE-FAELLE UND VRE-MANAGE-
MENT IM KRANKENHAUS 15
1.2.13 VRE-MANAGEMENT AM DURCHFUEHRUNGSORT DER STUDIE -
EINEM KRANKENHAUS DER MAXIMALVERSORGUNG IN SUEDWEST
DEUTSCHLAND 18
1.2.14 WIRTSCHAFTLICHE BEDEUTUNG VON ENTEROKOKKEN-INFEKTIONEN 20
2. MATERIAL UND METHODEN 22
2.1 MATERIAL 22
2.1.1 BAKTERIENSTAEMME 22
2.1.1.1 PROBENMATERIAL UND ENTEROKOKKEN-ISOLATE 22
2.1.1.2 REFERENZSTAEMME 24
2.1.2 GERAETE 25
2.1.3 VERBRAUCHSMATERIAL 28
2.1.4 KULTURMEDIEN 31
2.1.5 CHEMIKALIEN 33
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INHALTSVERZEICHNIS
2.1.6 ENZYME 35
2.1.7 ANTIBIOTIKA-TESTBLAETTCHEN BZW. ETEST-STREIFEN 36
2.1.8 LOESUNGEN UND
PUFFER 37
2.1.9 MARKER UND PRIMER 44
2.1.10 SOFTWARE 45
2.2 METHODEN 46
2.2.1 STAMMAUSWAHL 46
2.2.2 ISOLIERUNG VON ENTEROKOKKEN-STAEMMEN AUS PROBENMATERIAL 48
2.2.3 LAGERUNG UND ANZUECHTEN DER ENTEROKOKKEN-ISOLATE 50
2.2.4 SPEZIESIDENTIFIZIERUNG MITTELS API RAPID ID 32 STREP 51
2.2.5 UNTERSUCHUNG DER IN V/FRO-EMPFINDLICHKEIT DER ISOLATE
GEGENUEBER VERSCHIEDENEN ANTIBIOTIKA MITTELS AGAR-
DIFFUSIONSTEST
51
2.2.6 DNS-ISOLIERUNG 54
2.2.7 POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) 55
2.2.8 GELELEKTROPHORESE 58
2.2.9 MAKRORESTRIKTIONSANALYSE DES GESAMTGENOMS IN DER PULS
FELDGELELEKTROPHORESE (PFGE) 58
2.2.10 MULTI LOCUS SEQUENCE TYPING (MLST) 62
2.2.11 ERHEBUNG DER ZUGEHOERIGEN KLINISCHEN
DATEN 65
3. ERGEBNISSE 66
3.1 ISOLIERUNG VON ENTEROKOKKEN-STAEMMEN AUS PROBENMATERIAL 66
3.2 SPEZIESIDENTIFIZIERUNG 66
3.3 ERGEBNISSE DER UNTERSUCHUNG DER IN WFRO-EMPFINDLICHKEIT DER
ISOLATE GEGENUEBER VERSCHIEDENEN ANTIBIOTIKA MITTELS AGARDIFFUSIONS-
TEST (TEICOPLANIN UND VANCOMYCIN SIEHE
PUNKT 3.4) 69
3.4 ERGEBNISSE DER PHAENO- UND GENOTYPISCHEN UNTERSUCHUNG DER
TEICOPLANIN- UND VANCOMYCIN-RESISTENZ 73
3.4.1 PHAENOTYP 73
3.4.2 GENOTYP 75
3.5 PCR-DETEKTION DES
ESP (ENTEROCOCCAL SURFACE PROTEIN)-GENS 77
3.6 PCR-DETEKTION DES
HYL-GENS 78
3.7 ERGEBNISSE DER UNTERSUCHUNG DES E. FAECALIS-ISOLATES 79
INHALTSVERZEICHNIS
3.8 ERGEBNISSE DER MAKRORESTRIKTIONSANALYSE DES GESAMTGENOMS IN
DER PULSFELDGELELEKTROPHORESE (PFGE) 79
3.9 ERGEBNISSE DES MULTI LOCUS SEQUENCE TYPINGS (MLST) 83
3.10 KLINISCHE
DATEN 88
3.10.1 GESCHLECHT 88
3.10.2 ALTER 88
3.10.3 KLINIKEN 88
3.10.4 ZEITRAUM ZWISCHEN ERSTER AUFNAHME DES PATIENTEN IM
KLINIKUM UND ERSTEM BEKANNTEN VRE-NACHWEIS 89
3.10.5 HERKUNFT BZW. WOHNORT DER PATIENTEN 90
3.10.6 GRUNDLEIDEN DER PATIENTEN 90
3.10.7 LETZTE INFORMATIONEN, DIE DEM KLINIKUM UEBER DIE IN DIE
UNTERSUCHUNG EINBEZOGENEN PATIENTEN VORLIEGEN 91
4. DISKUSSION 93
4.1 SPEZIESIDENTIFIZIERUNG 93
4.2 IN W FRO-ANTIBIOTIKA-EMPFINDLICHKEITSTESTS DER E. FOEEC/UM-ISOLATE 95
4.2.1 AMPICILLIN 96
4.2.2 DOXYCYCLIN 97
4.2.3 ERYTHROMYCIN 97
4.2.4 GENTAMICIN 97
4.2.5 LEVOFLOXACIN 98
4.2.6 NITROFURANTOIN 99
4.2.7 RESERVE-ANTIBIOTIKA DAPTOMYCIN, LINEZOLID UND TIGECYCLIN 99
4.2.8 RIFAMPICIN 101
4.3 VANCOMYCIN- UND TEICOPLANIN-RESISTENZ DER E. FAECIUM-ISOLATE 101
4.3.1 PHAENO- UND GENOTYPISCHE GLYCOPEPTID-RESISTENZ-
BESTIMMUNG 101
4.3.2 EPIDEMIOLOGIE DER GLYCOPEPTID-RESISTENZ-DETERMINANTEN 103
4.4 NACHWEIS DES ESP-GENS IN E. FAECIUM 107
4.5 NACHWEIS DES HYL-GENS IN E. FAECIUM 109
4.6 GENOTYPISCHE CHARAKTERISIERUNG REPRAESENTATIVER . FEEC/UM-LSOLATE
MITTELS MAKRORESTRIKTIONSANALYSE DES GESAMTGENOMS IN DER PFGE
UND MLST
- ANALYSE DER VERWANDTSCHAFTSVERHAELTNISSE 111
INHALTSVERZEICHNIS
4.6.1 AUSWAHL DER ZU UNTERSUCHENDEN STAEMME 111
4.6.2 DIE METHODEN
UND IHRE ERGEBNISSE IM UEBERBLICK 113
4.6.3 KOMBINATION GENOTYPISCHER UND EPIDEMIOLOGISCHER DATEN 117
4.6.4 HOSPITALE ASSOZIATION 118
4.7 AUSWERTUNG DER ERHOBENEN KLINISCHEN DATEN 118
4.8 EPIDEMIOLOGIE ANIMALER UND
HUMANER VRE-STAEMME INKLUSIVE
POPULATIONS-ANALYTISCHER ASPEKTE 118
4.9 VRE-MANAGEMENT AM DURCHFUEHRUNGSORT DER STUDIE
- EINEM
KRANKENHAUS DER MAXIMALVERSORGUNG IN SUEDWESTDEUTSCHLAND 124
5. ZUSAMMENFASSUNG 128
6. ABSTRACT 130
7. LITERATURVERZEICHNIS 132
8. ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 154
9. ABBILDUNGS- UND TABELLENVERZEICHNIS 158
9.1 ABBILDUNGEN 158
9.2 TABELLEN 159
10. EIGENE PUBLIKATIONEN UND
KONGRESSBEITRAEGE 162
11. ANHANG 163
12. DANKSAGUNG 164
13. EHRENWOERTLICHE ERKLAERUNG
165
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