Mutationsanalyse neuroendokriner Tumore des Mitteldarms:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2014
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| Beschreibung: | 138 S. Ill., graph. Darst. |
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| adam_text | AUS DEM INSTITUT FUER PATHOLOGIE UND NEUROPATHOLOGIE DER
UNIVERSITAET TUEBINGEN
ABTEILUNG ALLGEMEINE PATHOLOGIE UND PATHOLOGISCHE ANATOMIE
AERZTLICHER DIREKTOR: PROFESSOR DR. F. FEND
MUTATIONSANALYSE NEUROENDOKRINER TUMORE DES
MITTELDARMS
INAUGURAL-DISSERTATION
ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES
DER MEDIZIN
DER MEDIZINISCHEN FAKULTAET
DER EBERHARD KARLS UNIVERSITAET
ZU TUEBINGEN
VORGELEGT VON
KIRSTEN-DESIREE OPPEK
AUS
LUDWIGSBURG
2014
HTTP://D-NB.INFO/1052423752
INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
I TABELLENVERZEICHNIS 6
II ABBILDUNGSVERZEICHNIS 8
III ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 12
1 EINLEITUNG 20
1.1 EPIDEMIOLOGIE GASTROENTEROPANKREATISCHER
NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN 20
1.2 BIOCHEMISCHE MARKER NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN 21
1.3 LOKALISATION NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN 22
1.4 SYMPTOMATIK UND DIAGNOSE
GASTROENTEROPANKREATISCHER
NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN 22
1.5 PROGNOSE GASTROENTEROPANKREATISCHER NEUROENDOKRINER
NEOPLASIEN 24
1.6 THERAPIE GASTROENTEROPANKREATISCHER NEUROENDOKRINER
NEOPLASIEN 25
1.7 EINTEILUNG GASTROENTEROPANKREATISCHER NEUROENDOKRINER
NEOPLASIEN 26
1.8 SYMPTOMATIK UND
DIAGNOSE NEUROENDOKRINER
NEOPLASIEN
DES LLEUMS 28
1.9 PROGNOSE NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN
DES LLEUMS 29
1
1.10 MUTATIONEN 30
1.10.1 MUTATIONEN GASTROENTEROPANKREATISCHER
NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN 30
1.10.2 MUTATIONEN NEUROENDOKRINER NEOPLASIEN DES LLEUMS 31
1.11 ZIELSETZUNG DER ARBEIT 34
2 MATERIAL UND
METHODEN 35
2.1 REAGENZIEN 35
2.2 GERAETE 36
2.3 VERBRAUCHSMATERIALIEN 38
2.4 SONSTIGES ZUBEHOER 40
2.5 PRIMER 40
2.6 PATIENTENKOLLEKTIV 43
2.7 EXOMSEQUENZIERUNG REFERENZTUMORE 43
2.8 DNA-ISOLIERUNG 44
2.8.1 DNA-ISOLIERUNG TUMORGEWEBE
- MAKRODISSEKTION 44
2.8.2 DNA-ISOLIERUNG TUMORGEWEBE
- ROELLCHEN 45
2.8.3 DNA-ISOLIERUNG NORMALGEWEBE 45
2.9 QUALITAETS-PCR 46
2.10 PCR FUER UNTERSUCHTE NUKLEOTIDVARIATIONEN IN DEN GENEN
ATF7IP, DISP1, DSG4,
FLNC, PRUNE2 UND
RECQL4 47
2.10.1 VORGEHENSWEISE 47
2
2.10.2 PCR-ANSATZ MIT ENDVOLUMEN 25PL 48
2.10.3 VARIIERTER PCR-ANSATZ MIT ENDVOLUMEN
25PL 48
2.10.4 PCR-ANSATZ MIT ENDVOLUMEN
50PL 48
2.10.5 PCR-PROGRAMM 50
2.11 PCR FUER UNTERSUCHTE MUTATIONEN IM MUTYH-GEN 50
2.11.1 PCR-ANSATZ MIT ENDVOLUMEN
50PL 50
2.11.2 PCR-PROGRAMM 51
2.12 HERSTELLUNG VON
IXTBE-PUFFER 52
2.13 HERSTELLUNG 1,5%IGES
AGAROSE-GEL 52
2.14 GELELEKTROPHORESE 52
2.15 AUFREINIGUNG VON PCR-PRODUKTEN
ZUR SEQUENZIERUNG MITTELS
AGENCOURT AMPUREOXP 53
2.16 SEQUENZIER-PCR 54
2.17 AUFREINIGUNG DER PRODUKTE
DER SEQUENZIER-PCR MITTELS
AGENCOURT CLEANSEQ 55
2.18 SEQUENZANALYSE NACH SANGER 55
2.19 IN SILICO PATHOGENITAETSABSCHAETZUNG MUTATIONEN
BZW.
NUKLEOTIDVARIATIONEN 56
3 ERGEBNISSE 57
3.1 PATIENTENKOLLEKTIV 57
3.2 VALIDIERUNG EXOMSEQUENZIERUNG 57
3
3.2.1 ATF7IP-GEN 59
3.2.2 DISP1-GEN 61
3.2.3 DSG4-GEN 64
3.2.4 FLNC-GEN 66
3.2.5 MUTYH-GEN 69
3.2.6 PRUNE2-GEN 69
3.2.7 RECQL4-GEN 72
3.3 BESTIMMUNG DER MUTATIONEN
BZW. NUKLEOTIDVARIATIONEN
IM NORMALGEWEBE DER REFERENZTUMORE 75
3.4 UNTERSUCHUNG NUKLEOTIDVARIATIONEN
DER GENE DSG4,
FLNC
UND MUTATIONEN
DES GENS
MUTYH IM KOLLEKTIV 77
3.4.1 DSG4-GEN 77
3.4.2 FLNC-GEN 78
3.4.3 MUTYH-GEN 78
4 DISKUSSION 81
4.1 ATF7IP-GEN 83
4.1.1 TUMORASSOZIATION ATF7IP-GEN 83
4.1.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN ATF7IP-GEN 83
4.2 DISP1-GEN 84
4.2.1 TUMORASSOZIATION DISP1/3-GEN 84
4.2.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN DISP1
-GEN 85
4
4.3 DSG4-GEN 86
4.3.1 TUMORASSOZIATION DESMOGLEINE/DESMOCOLLINE 86
4.3.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN DSG4-GEN 88
4.4 FLNC-GEN 90
4.4.1 TUMORASSOZIATION FILAMINE 90
4.4.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN FLNC-GEN 92
4.5 MUTYH-GEN 93
4.5.1 TUMORASSOZIATION MUTYH-GEN 93
4.5.2 ANALYSIERTE MUTATIONEN
MUTYH-GEN 95
4.6 PRUNE2-GEN 99
4.6.1 TUMORASSOZIATION PRUNE2/PRUNE-GEN 99
4.6.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN
PRUNE2-GEN 101
4.7 RECQL4-GEN 101
4.7.1 TUMORASSOZIATION RECQ-HELICASEN 101
4.7.2 ANALYSIERTE NUKLEOTIDVARIATIONEN RECQL4-GEN 104
4.8 SCHLUSSFOLGERUNG 105
5 ZUSAMMENFASSUNG 108
6 LITERATURVERZEICHNIS 110
7 ANHANG 126
IV DANKSAGUNG 138
5
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