Polymorphismen des Toll-like- Rezeptors 5 bei chronisch-entzündlichen Darmerkrankungen:
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2014
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adam_text | 1. EINLEITUNG
1. 1. CHRONISCH-ENTZUENDLICHE DARMERKRANKUNGEN (CED)
1.1.1. OBERBLICK
1.1.2. EPIDEMIOLOGIE DER CED
1.2. KRANKHEITSBILD UND THERAPIE DES MORBUS CROHN
1.2.1. SYMPTOMATIK UND BEFUNDE
1.2.2. VERLAUF UND KLASSIFIKATION
1.2.3. THERAPIE
1.3. KRANKHEITSBILD UND THERAPIE DER COLITIS ULCEROSA
1.3.1. SYMPTOMATIK UND BEFUNDE
1.3.2. VERLAUF UND KLASSIFIKATION
1.3.3. THERAPIE
1.4. PATHOGENESE VON MORBUS CROHN UND COLITIS ULCEROSA
1.4.1. DIE ROLLE VON UMWELTFAKTOREN
1.4.2. DIE ROLLE DER BAKTERIELLEN DARMFLORA
1.4.3. DIE DARMMUKOSA
1.4.4. DIE ROLLE DES MUKOSALEN IMMUNSYSTEMS
1.5. TOLL-LIKE REZEPTOR 5 (TLR5)
1.5.1. DIE FAMILIE DER TLRS
1.3.2. AUFBAU UND FUNKDON DER TLRS
1.5.3. TRL5
1.5.4. DIE ROLLE VON TLR5 UND FLAGELLIN BEIM GESUNDEN
1.5.5.. TLR5 ALS BINDEGLIED ZWISCHEN ANGEBORENER UND ADAPTIVER
IMMUNANTWORT
- RELEVANZ FUER CED
1.6. DIE ROLLE GENETISCHER FAKTOREN IN DER AETIOLOGIE DER CED
1.7. ANSAETZE ZUR IDENTIFIZIERUNG KRANKHEITSRELEVANTER GENE
1.8. BEISPIELE FILR SUSZEPTIBILITAETSGENE BEI DEN CED
1.8.1. NOD2
1.8.2. TLR4
1.8.3. TLR9
1.8.4. IL23R
1.8.5. ATG16LI
2. ZIELSETZUNG
3. METBODEN
3.1. GENOTYPOSIERUNG BZGL. DER POLYMORPHISMEN TLR5 1174T/C. 1775A/G UND
1174C/T
3.1.1. ALLGEMEINE VORGEHENSWEISE
3.1.2. PROBENGEWINNUNG
3.1.3. DNA-ISOLIERUNG MITTELS QIAAMP DNA BLOOD MINI KIT
3
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3.1.4. BESTIMMUNG DER KONZENTRATION VON NUKLEINSAEUREN
3.1.5. PRAEZIPITATION DER DNA MIT ETHANOL
3.1.6. POLYMERASEKETTENREAKTION (PCR)
3.1.7. RESTRIKTIONS-FRAGMENT-LAENGEN-POLYMORPHISMUS (RFLP)-ANALYSE
3.1.8. AGAROSEGELEKTROPHORESE
3.1.9. GENOTYPISIEMNG DES POLYMORPHISMUS TLR5 1174T/C
3.1.10. GENOTYPISIEMNG DES POLYMORPHISMUS TLR5 1775A/G
3.1.11. GENOTYPISIEMNG DES POLYMORPHISMUS TLR5 1S46T/C
3.2. ANALYSE DER EXONSEQUENZ DES TLR5-GENS
3.2.1. ALLGEMEINE VORGEHENSWEISE
3.2.2. AMPLIFIZIERUNG DER 7
,
ZJ?5-EXONSEQUENZ MITTELS PCR
3.2.3. ISOLIERUNG UND REINIGUNG DER PCR-PRODUKTE
3.2.4. FUNKTIONSPRINZIP DER SEQUENZIERUNG
3.2.5. PROTOKOLL DER SEQUENZIEMNGSREAKTION
3.2.6. FAELLUNG UND WASCHEN DER SEQUENZIERTEN PRODUKTE
3.2.7. DENATURIERENDE POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
3.3. STATISTISCHE ANALYSE
3.3.1. ALLGEMEINE VORGEHENSWEISE
3.3.2. VORAUSSETZUNGEN
3.3.3. HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT
3.3.4. BONFERRONI-KORREKTUR
4. MATERIAL
4.1. STUDIENKOLLEKTIV
4.1.1 PATIENTENKOLLEKTIV
4.1.2. KONTROLLKOLLEKTIV
4.2 MATERIALIEN FUER DIE DNA-ISOLIERUNG
4.3. MATERIALIEN FUER DIE RFLP-ANALYSE
4.3.1. MATERIALIEN FUER DIE PCR UND DIE REINIGUNG DER PCR-PRODUKTE
4.3.2 PCR-PRIMER
4.3.3. MATERIALIEN FLLR DEN RESTRIKTIONSVERDAU
4.3.4. MATERIALIEN FIIR DIE AGAROSEGELELEKTROPHORESE
4.3.5. GERAETE FUER DIE RFLP-ANALYSE
4.4. MATERIALIEN FUER DIE SEQUENZIERUNG DES TLR5-EXONS
4.4.1. PRIMER FUER DIE AMPLIFIZIERUNG DER FRAGMENTE A UND B
4.4.2. PRINTER FUER DIE SEQUENZANALYSE DER FRAGMENTE A UND B
4.4.3. CHEMIKALIEN UND ANDERE REAGENZIEN
4.4.4. GERAETE FUER DIE SEQUENZANALYSE
4
5. ERGEBNISSE
5.1. STUDIENDESIGN
5.2. ALLEL- UND GENOTYPENVEITEIIUNG DER 7 L/?5-POLYMOPHISMEN IN DEN
STUDIENKOLLEKTIVEN
5.3. TLR5 ZWEI- UND DREIPUNKT-HAPLOTYPEN SIND NICHT MIT MORBUS CROHN
ODER COLITIS ULCEROSA ASSOZIIERT
5.4. GEN-GEN-INTERAKTIONEN DER DREI TLR5-POLYMORPHISMEN MIT CED
ASSOZIIERTEN VARIANTEN IN NOD2,
TLR4 UND TLR9
5.5. TLR5 VARIANTEN SIND NICHT MIT EINEM KLINISCHEN SUBTYP BEIM MORBUS
CROHN ASSOZIIERT
5.6. TLR5 VARIANTEN SIND NICHT MIT EINEM KLINISCHEN SUBTYP BEI DER
COLITIS ULCEROA ASSOZIIERT
5.7. SUCHE NACH WEITEREN MOEGLICHEN MIT COLITIS ULCEROSA UND MORBUS CROHN
ASSOZIIERTEN VARIANTEN IM
TLR5-GCN
5.8. ZUSAMMENFASSUNG DER ERGEBNISSE
6. DISKUSSION
6.1. DIE ROLLE DES FLAGELLINS UND DES TLR5 BEI CED
6.2. DIE ANWENDUNG GENETISCHER ERKENNTNISSE
6.3. ERGEBNISDISKUSSION
6.3.1. ALLEL- UND GENOTYPENFREQUENZEN
6.3.2. HAPLOYPENANALYSE
6.3.3. EPISTASIS-ANALYSEN
6.3.4. GENOTYP-PHAENOTYP-ANALYSE
6.3.5. SEQUENZANALYSE
7. ZUSAMMENFASSUNG
8. ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
9. TABELLENVERZEICHNIS
10. ABBILDUNGSVERZEICHNIS
11. LITERATURVERZEICHNIS
12. DANKSAGUNG
13. LEBENSLAUF
5
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