Charakterisierung genetischer und epigenetischer Veränderungen von Medulloblastomzellen mittels MLPA-Analyse:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2013
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| Beschreibung: | 96, [21] Bl. Ill., graph. Darst. 30 cm |
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| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
ZUSAMMENFASSUNG 1
1 EINLEITUNG 3
1.1 MEDULLOBLASTOME 3
1.1.1 MAKRO- UND MIKROSKOPISCHE ASPEKTE 3
1.1.2 THERAPIEPRINZIPIEN & PROGNOSE 6
1.2 MOLEKULARGENETISCHE EIGENSCHAFTEN VON MEDULLOBLASTOMEN 7
1.3 ONKOGENE 9
1.3.1 ZELLULAERE FUNKTION UND BEDEUTUNG VON ONKOGENEN 9
1.3.2 AUSGEWAEHLTE ONKOGENE 10
1.3.2.1 FGF4 10
1.3.2.2 IGFBP5 11
1.3.2.3 PPM1D 11
1.4 TUMORSUPPRESSORGENE 12
1.4.1 ZELLULAERE FUNKTION UND BEDEUTUNG VON TUMORSUPPRESSORGENEN 12
1.4.2 AUSGEWAEHLTE TUMORSUPPRESSORGENE 13
1.4.2.1 ASC 13
1.4.2.2 CASP8 14
1.4.2.3 GATA5 15
1.4.2.4 MGMT 15
1.4.2.5 MSH6 16
1.4.2.6 RASSF1A 17
1.5 AUSGEWAEHLTE ABERRATIONSMECHANISMEN 18
1.6 METHODEN ZUR ERFASSUNG GENETISCHER ABERRATIONEN 19
1.6.1 STANDARDVERFAHREN IN DER UEBERSICHT 19
1.6.2 MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION (MLPA) 20
1.6.2.1 PRINZIP DES MLPA-VERFAHRENS 20
1.6.2.2 PRINZIP DES MS-MLPA-VERFAHRENS 21
2 ZIELSTELLUNG 23
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3 MATERIAL UND METHODEN 24
3.1 ANGABEN ZUM PROBENUMFANG 24
3.2 ERHEBUNG KLINISCHER DATEN . 26
3.3 AUFBEREITUNG DER TUMORPROBEN 27
3.3.1 ANFERTIGUNG HISTOLOGISCHER SCHNITTPRAEPARATE 27
3.3.2 DNA-ISOLIERUNG DES PROBENMATERIALS 27
3.4 MLPA-VERFAHREN 28
3.4.1 VERWENDETER ONKOGEN-KIT 28
3.3.2 VERWENDETE TUMORSUPPRESSORGEN-KITS 29
3.5 DENSITOMETRISCHE AUSWERTUNG 32
3.6 AUSWERTUNG DER ABERRATIONEN 33
3.7 STATISTISCHE BEURTEILUNG 33
4 ERGEBNISSE 35
4.1 HISTOPATHOLOGISCHE AUSWERTUNG 35
4.2 QUALITAET DER TUMORPROBEN 36
4.2.1 KONZENTRATIONSMESSUNG 36
4.2.2 GELELEKTROPHORETISCHE AUSWERTUNG 38
4.3 VISUALISIERUNG DER MLPA-REAKTION 39
4.4 AUSWERTUNG VON KOPIENZAHLAENDERUNGEN 46
4.4.1 ANALYSE DES AMPLIFIKATIONSSTATUS 47
4.4.2 ANALYSE DES DELETIONSSTATUS 49
4.4.3 KOPIENZAHLAENDERUNGEN IN DER UEBERSICHT 51
4.5 AUSWERTUNG DER PROMOTORMETHYLIERUNGEN 55
4.5.1 ANALYSE DES METHYLIERUNGSSTATUS 55
4.5.2 METHYLIERUNGEN IN DER UEBERSICHT 57
4.6 GENABERRATIONEN IN ABHAENGIGKEIT VOM PROBENMATERIAL 59
4.7 HAEUFIG INVOLVIERTE GENE 59
4.8 KORRELATION DES GENSTATUS ZUM KLINISCHEM BILD 60
4.8.1 EINFLUSS VON KOPIENZAHLAENDERUNGEN 61
/
4.8.2 EINFLUSS VON PROMOTORMETHYLIERUNGEN 62
4.8.3 EINFLUSS EINZELNER GENABERRATIONEN 63
4.8.4 UNTERSUCHUNG VON EINZELPROBEN 66
5 DISKUSSION 68
5.1 EINORDNUNG DES STUDIENDESIGNS
68
5.2 EVALUIERUNG ANGEWANDTER METHODEN 70
5.3 MOEGLICHKEITEN UND GRENZEN DES MLPA-VERFAHRENS 73
5.3.1 VORTEILE DER UNTERSUCHUNGSMETHODE 73
5.3.2 NACHTEILE DER UNTERSUCHUNGSMETHODE 74
5.4 AUSSAGEKRAFT DER PROBENMATERIALIEN FUER GENUNTERSUCHUNGEN 75
5.5 WERTUNG DER ABERRATIONEN IN MEDULLOBLASTOMZELLEN 78
5.5.1 KOPIENZAHLAENDERUNGEN 78
5.5.2 PROMOTORMETHYLIERUNGEN 80
5.6 BETRACHTUNG HAEUFIG INVOLVIERTER GENE 81
5.6.1 AUSGEWAEHLTE ONKOGENE 81
5.6.1.1 FGF4 81
5.6.1.2 IGFBP5 82
5.6.1.3 PPM1D 83
5.6.2 AUSGEWAEHLTE TUMORSUPPRESSORGENE 84
5.6.2.1 ASC 84
5.6.2.2 CASP8 85
5.6.2.3 GATA5 87
5.6.2.4 MGMT 88
5.6.2.5 MSH6 90
5.6.2.6 RASSF1A 91
5.7 RISIKOSTRATIFIZIERUNG VON MEDULLOBLASTOMEN 92
5.8 AUSBLICK 93
6 SCHLUSSFOLGERUNG 96
7 LITERATUR- UND QUELLENVERZEICHNIS
8 ANHANG
VOTUM DER ETHIKKOMMISSION
UEBERSICHT ANALYSIERTER GENE
DANKSAGUNG
EHRENWOERTLICHE ERKLAERUNG
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