Beschreibung dynamischer molekularer Systeme mit effizienten linear-skalierenden QM- und QM/MM-Methoden:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
München
Ludwig-Maximilians-Univ.
2012
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|---|---|
| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG 7
2 THEORETISCHE GRUNDLAGEN 11
2.1 SCHROEDINGER-GLEICHUNG UND KERN-ELEKTRON-SEPARATION 11
2.2 MOLEKULARDYNAMISCHE METHODEN 14
2.3 QUANTENCHEMISCHE ELEKTRONENSTRUKTUR-METHODEN 16
2.4 BERECHNUNG STATISCHER MOLEKUELEIGENSCHAFTEN 24
2.5 MOLEKULARMECHANISCHE METHODEN 30
2.6 QM/MM-METHODEN 32
3 EFFIZIENTE LINEAR-SKALIERENDE SCF-VERFAHREN 37
3.1 EINFUEHRUNG 37
3.2 LINEAR-SKALIERENDES QUASI-INDIREKTES BZW. SEMIDIREKTES SCF-VERFAHREN
38
3.3 ABSTANDS-ABHAENGIGES SCHWARZ-SCREENING 51
3.4 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 53
4 QM-ANSAETZE ZUR EFFIZIENTEN BESCHREIBUNG DER MOLEKULARDYNAMIK 55
4.1 EINFUEHRUNG 55
4.2 EXTRAPOLATIONSMETHODE FUER CPSCF-ANFANGSSCHAETZUNGEN 57
4.3 INTEGRALWIEDERVERWENDUNG FUER VERAENDERTE KONFORMATIONEN 62
4.4 QM/MM-IMPLEMENTIERUNG FUER MOLEKULARDYNAMIK 70
4.5 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 71
5 QM- UND QM/MM-BERECHNUNG VON NMR-VERSCHIEBUNGEN 73
5.1 EINFUEHRUNG 73
5.2 GENAUIGKEITEN VON NMR-VERSCHIEBUNGEN AUF GIAO-SCF- UND MP2-NIVEAU .
. 75
5
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INHALTSVERZEICHNIS
5.3 INTERMEDIAERE REFERENZEN BEI DER BERECHNUNG VON NMR-VERSCHIEBUNGEN 82
5.4 KONVERGENZ VON QM/MM-ABSCHIRMUNGEN MIT DER GROEEE DER QM-REGION ....
88
5.5 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 105
6 ENZYMATISCHE REPARATUR OXIDATIVER DNA-SCHAEDEN 109
6.1 EINFUEHRUNG 109
6.2 EINZELHEITEN ZUR STRUKTURAUSWAHL UND
-VORBEREITUNG
111
6.3 GESAMTE SCHADENSSTABILISIERUNG 112
6.4 INDIVIDUELLE BEITRAEGE DER ENZYMRESIDUEN ZUR SCHADENSSTABILISIERUNG
116
6.5 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 121
7 ALLGEMEINE ZUSAMMENFASSUNG 123
ANHANG A Q-CHEM-CHEMSHELL-INTERFACE 127
ANHANG B MOLEKULARER TESTSATZ 129
ANHANG C DETAILS ZUR QM-GROESSENKONVERGENZ VON NMR-ABSCHIRMUNGEN 131
ANHANG D DETAILS ZUR UNTERSUCHUNG DER DNA-REPARATUR 143
TABELLEN- UND ABBILDUNGSVERZEICHNIS 145
LITERATURVERZEICHNIS 151
VEROEFFENTLICHUNGEN UND LEBENSLAUF 161
6
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