Gesamtgenomscan bei nicht verwandten Warmblutpferden mit chronisch obstruktiver Bronchiolitis:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2012
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| Ausgabe: | 1. Aufl. |
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| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | IX, 121 S. |
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS L-V
INHALTSVERZEICHNIS VI-IX
1 EINLEITUNG 1
2 LITERATURUEBERSICHT 3
2.1 ZUM HUMANEN ASTHMA 3
2.1.1 DEFINITION DES ASTHMA BRONCHIALE 3
2.1.2 KLINISCHES BILD, AUSLOESENDE FAKTOREN UND PRAEVALENZ DES ASTHMAS 4
2.1.3 PATHOMECHANISMEN DES ASTHMAS UND IMMUNOLOGISCHE HINTERGRUENDE 5
2.1.4 GENETISCHE UNTERSUCHUNGEN 6
2.2 ZUR CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE (COPD) 8
2.2.1 DEFINITION DER CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE (COPD) 8
2.2.2 KLINISCHES BILD, AUSLOESENDE FAKTOREN UND PRAEVALENZ DER COPD 8
2.2.3 PATHOMECHANISMEN DER COPD UND IMMUNOLOGISCHE HINTERGRUENDE 10
2.2.4 GENETISCHE UNTERSUCHUNGEN 12
2.3 ZUR EQUINEN CHRONISCH OBSTRUKTIVEN BRONCHI(OLI)TIS (COB) 16
2.3.1 DEFINITION COB/RAO/HEAVES 16
2.3.2 INFLAMMATORY AIRWAY DISEASE (IAD) 18
2.3.3 KLINISCHES BILD, AUSLOESENDE FAKTOREN UND PRAEVALENZ DER COB 18
2.3.4 PATHOMECHANISMEN DER COB UND IMMUNOLOGISCHE HINTERGRUENDE 20
2.3.5 VERGLEICH DER EQUINEN COB MIT DEM HUMANEN ASTHMA UND DER COPD 23
2.3.5.1 GEMEINSAMKEITEN DER EQUINEN COB MIT DEM HUMANEN ASTHMA 23
V I
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IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS
2.3.5.2 GEMEINSAMKEITEN DER EQUINEN COB MIT DER HUMANEN COPD 24
2.3.6 GENETISCHE UNTERSUCHUNGEN 24
2.3.7 FRAGEBOGEN ZUR UNTERSUCHUNG DER EQUINEN COB 29
2.4 GRUNDLAGEN ZUR GENETISCHEN ANALYTIK 30
2.4.1 GENOTYP UND PHAENOTYP 31
2.4.2 GENETISCHE MARKER 31
2.4.3 DNA-POLYMORPHISMUS 32
2.4.4 SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS (SNPS) 32
2.4.5 GESAMTGENOMSCAN 34
3 EIGENE UNTERSUCHUNGEN 37
3.1 MATERIAL 37
3.1.1 PATIENTEN 37
3.1.1.1 EINSCHLUSSKRITERIEN 37
3.1.1.2 STANDARDISIERTER FRAGEBOGEN (HOARSI) 37
3.1.1.3 AUSWERTUNG VON HOARSI INFORMATIONEN 39
3.1.1.4 KLINISCHE UNTERSUCHUNG 43
3.1.1.5 BLUTPROBENENTNAHME 43
3.1.1.6 BLUTPROBENVERARBEITUNG UND -LAGERUNG 44
3.2 METHODEN 45
3.2.1 ISOLIERUNG VON DNA AUS EDTA-BLUT 45
3.2.2 SNP-CHIP-UNTERSUCHUNG (LLLUMINA SNP50 GENOTYPING BEAD CHIP) 46
3.2.3 MULTIDIMENSIONALE SKALIERUNGEN (MDS-PLOTS) 47
3.2.4 GENOMWEITE ASSOZIATIONSSTUDIEN (GWAS) 47
VII
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
3.2.4.1 AUSWAHL DER PHAENOTYPEN FUER DIE GWAS 48
3.2.4.2 BERECHNUNG UND DARSTELLUNG DER GWAS 49
3.2.4.3 INTERNE KONTROLLE DER GWAS: ASSOZIATIONSBERECHNUNG ZUR
FUCHSFARBE 50
3.3 ERGEBNISSE 51
3.3.1 PATIENTENDATEN UND GRUPPENVERGLEICH 51
3.3.2 ERGEBNISSE DER KLINISCHEN UNTERSUCHUNG 53
3.3.3 ERGEBNISSE DER MULTIDIMENSIONALEN SKALIERUNGEN (MDS-PLOTS) 54
3.3.4 ERGEBNISSE DER GENOMWEITEN ASSOZIATIONSSTUDIEN (GWAS) 56
3.3.5 ERGEBNISSE DER INTERNEN KONTROLLE: GWAS FUCHSFARBE 63
4 DISKUSSION 65
4.1 DISKUSSION VON MATERIAL UND METHODEN 65
4.1.1 DISKUSSION DER EINSCHLUSSKRITERIEN 65
4.1.2 DISKUSSION DES STANDARDISIERTEN FRAGEBOGENS 67
4.1.2.1 VALIDITAET DES STANDARDISIERTEN FRAGEBOGENS 67
4.1.2.2 DATENERHEBUNG ANHAND DES STANDARDISIERTEN FRAGEBOGENS 69
4.1.2.3 BEWERTUNG DER BESITZERANGABEN DURCH SCORE-PUNKTE 70
4.1.2.4 HOARSI 74
4.1.3 DISKUSSION DER KLINISCHEN UNTERSUCHUNG 76
4.1.4 DISKUSSION DER SNP-CHIP-UNTERSUCHUNG 77
4.1.5 DISKUSSION DER METHODIK DER MULTIDIMENSIONALEN SKALIERUNGEN 78
4.1.6 DISKUSSION DER METHODIK DER GENOMWEITEN ASSOZIATIONSSTUDIEN 79
4.1.7 DISKUSSION ZUR BERECHNUNG DER POWER VON GENETISCHEN UNTERSUCHUNGEN
80
VIII
IMAGE 4
INHALTSVERZEICHNIS
4.2 DISKUSSION DER ERGEBNISSE 83
4.2.1 DISKUSSION DER PATIENTENDATEN 83
4.2.2 DISKUSSION DER ERGEBNISSE DER MULTIDIMENSIONALEN SKALIERUNGEN 86
4.2.3 DISKUSSION DER DER ERGEBNISSE DER GENOMWEITEN ASSOZIATIONSSTUDIEN
89
5 SCHLUSSFOLGERUNGEN 96
6 ZUSAMMENFASSUNG 97
7 SUMMARY 99
8 LITERATURVERZEICHNIS 101
9 ANHANG 115
9.1 TABELLENVERZEICHNIS 115
9.2 ABBILDUNGSVERZEICHNIS 116
9.3 DATENVERZEICHNIS 117
IX
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