Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2012
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | kostenfrei Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Nebentitel: Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis |
| Beschreibung: | 168 S. Ill., graph. Darst. |
Internformat
MARC
| LEADER | 00000nam a2200000 c 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | BV040634795 | ||
| 003 | DE-604 | ||
| 005 | 20190218 | ||
| 007 | t | ||
| 008 | 121214s2012 gw ad|| m||| 00||| ger d | ||
| 035 | |a (OCoLC)858927144 | ||
| 035 | |a (DE-599)BVBBV040634795 | ||
| 040 | |a DE-604 |b ger |e rakwb | ||
| 041 | 0 | |a ger | |
| 044 | |a gw |c DE | ||
| 049 | |a DE-188 | ||
| 082 | 0 | |a 572 | |
| 082 | 0 | |a 500 | |
| 082 | 0 | |a 570 | |
| 100 | 1 | |a Dorn, Matthias |e Verfasser |0 (DE-588)1028983824 |4 aut | |
| 245 | 1 | 0 | |a Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |c vorgelegt von Matthias Dorn |
| 246 | 1 | 3 | |a Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis |
| 264 | 1 | |c 2012 | |
| 300 | |a 168 S. |b Ill., graph. Darst. | ||
| 336 | |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |b nc |2 rdacarrier | ||
| 500 | |a Nebentitel: Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis | ||
| 502 | |a Berlin, Freie Univ., Diss., 2012 | ||
| 655 | 7 | |0 (DE-588)4113937-9 |a Hochschulschrift |2 gnd-content | |
| 776 | 0 | 8 | |i Erscheint auch als |n Online-Ausgabe |o urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000040363-4 |
| 856 | 4 | 1 | |u http://www.diss.fu-berlin.de/diss/receive/FUDISS_thesis_000000040363 |z kostenfrei |3 Volltext |
| 856 | 4 | 2 | |m DNB Datenaustausch |q application/pdf |u http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=025461978&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |3 Inhaltsverzeichnis |
| 912 | |a ebook | ||
| 999 | |a oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-025461978 | ||
Datensatz im Suchindex
| _version_ | 1804149747228868608 |
|---|---|
| adam_text | IMAGE 1
INHALT
INHALT
1 EINLEITUNG 16
1.1 PHOTOREZEPTOREN - KLASSEN, EIGENSCHAFTEN & FUNKTIONEN 16
1.2 PHOTOREZEPTOREN - MECHANISMEN & UNTERSUCHUNGSMETHODEN 20
1.3 PHOTO TROPINE 24
1.3.1 PHOTOTROPINE - MECHANISMEN DER INTRAMOLEKULAREN SIGNALTRANSDUKTION
25
1.4 LICHTDETEKTION DURCH LOV-DOMAENEN - STRUKTUR UND FUNKTION 32
1.4.1 STRUKTURMERKMALE VON LOV-DOMAENEN 33
1.4.2 PHOTOCHEMIE VON LOV-DOMAENEN 36
1.5 DER BLAULICHT-SENSITIVE PHOTOREZEPTOR YTVA AUS BACILLUS SUBTILIS 39
1.5.1 YTVA - STRUKTURELLE CHARAKTERISTIKA 41
1.5.2 YTVA - INTRAMOLEKULARE SIGNALTRANSDUKTION 44
2 ZIELSTELLUNG 46
3 MATERIAL & METHODEN 48
3.1.1 CHEMIKALIEN 48
3.1.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE UND BIOCHEMISCHE KITS 49
3.1.3 NAEHRMEDIEN UND LOESUNGEN 49
3.1.4 GERAETE, MESSINSTRUMENTE UND TECHNISCHE SYSTEME 50
3.1.5 BAKTERIENSTAEMME 51
3.1.6 KLONIERUNGSVEKTOR 51
3.1.7 OLIGONUKLEOTIDE 52
3.1.8 SOFTWARE 52
3.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN 54
3.2.1 POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) 54
3.2.2 AGAROSEGELELEKTROPHORESE 54
3.2.3 KLONIERUNG 55
3.2.4 RESTRIKTIONSVERDAU 55
3.2.5 ISOLIERUNG VON PLASMIDEN AUS E. COLI 56
3.3 MIKROBIOLOGISCHE METHODEN 56
3.3.1 TRANSFORMATION VON E. COLI 56
3.3.2 HERSTELLUNG VON GLYCEROL-DAUERKULTUREN 56
3.3.3 EXPRESSIONSTEST UND KLONSELEKTION 56
3.3.4 OPTIMIERUNG DER EXPRESSIONSBEDINGUNGEN 57
3.3.5 EXPRESSION IN SCHUETTELKULTUR 57
3.3.6 HOCHZELLDICHTEFERMENTATION (HZDF) 57
3.3.7 KULTIVIERUNG VON BACILLUS SUBTILIS 60
3.3.8 ZELLERNTE 60
8
HTTP://D-NB.INFO/1031961267
IMAGE 2
INHALT
3.3.9 ZELLAUFSCHLUSS UND SEPARATION LOESLICHER PROTEINE 60
3.4 BIOCHEMISCHE METHODEN 61
3.4.1 NATRIUMDODECYLSULFAT-POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE (SDS-PAGE) 61
3.4.2 PROBENHERSTELLUNG FUER SDS-PAGE 61
3.4.3 AUFREINIGUNG REKOMBINANT EXPRIMIERTER PROTEINE 61
3.4.4 HERSTELLUNG VON UNIFORM 1: N-MARKIERTEM APOPROTEIN 63
3.4.5 BESTIMMUNG DER PROTEINKONZENTRATION MITTELS BCA-METHODE 64
3.4.6 ANALYSE DER CHROMOPHORSPEZIES IN REKOMBINANT EXPRIMIERTER
LOV-DOMAENE 65
3.4.7 ANALYSE VON FLAVIN-DERIVATEN AUS BACILLUS SUBTILIS 65
3.4.8 REINIGUNG VON KOMMERZIELLEM FMN 66
3.4.9 AUFBEREITUNG FLAVIN-REKONSTITUIERTER PROBEN AUS ITC-EXPERIMENTEN
66
3.5 BIOPHYSIKALISCHE METHODEN 66
3.5.1 PHOTOMETRISCHE MESSUNG VON PROTEINKONZENTRATIONEN 66
3.5.2 PHOTOCHEMISCHE AKTIVITAET UND MESSUNG VON HALBWERTSZEITEN 67
3.5.3 CIRCULAR DICHROISMUS SPEKTROSKOPIE (CD-SPEKTROSKOPIE) 68
3.5.4 ANALYTISCHE ULTRAZENTRIFUGATION (AUZ) 68
3.5.5 ISOTHERME TITRATIONSKALORIMETRIE (ITC) 69
3.5.6 KLEINWINKEL-ROENTGENSTREUUNG (SAXS) 70
3.5.7 LOESUNGS-NMR-SPEKTROSKOPIE 72
4 ERGEBNISSE 76
4.1 KONSTRUKTION LED-BASIERTER LICHTQUELLEN ZUR UNTERSUCHUNG
UNBELICHTETER & PHOTOAKTIVIERTER YTVA-KONSTRUKTE 76
4.1.1 HOCHLEISTUNGS-RGB-LED-LICHTQUELLE 76
4.1.2 AUZ-LED-LICHTQUELLE 77
4.1.3 FASERGEKOPPELTE LED-LICHTQUELLE 78
4.2 EXPRESSION UND PRAEPARATION VON YTVA-KONSTRUKTEN 82
4.2.1 EXPRESSIONSBEDINGUNGEN 82
4.2.2 PRAEPARATION VON JA-STAS UND STAS 82
4.2.3 PRAEPARATION VON YTVA-LOV-VARIANTEN 85
4.2.4 MARKIERUNGSMUSTER UND AUSBEUTEN PRAEPARIERTER YTVA-KONSTRUKTE 87
4.3 STRUKTURELLE CHARAKTERISIERUNG DER STAS-DOMAENE 88
4.3.1 NMR-SPEKTROSKOPISCHE UNTERSUCHUNGEN 88
4.3.2 OLIGOMERISIERUNGSZUSTAND 90
4.4 UNTERSUCHUNG DER INTERAKTION VON GTP MIT YTVA BZW. DER STAS-DOMAENE
92
4.4.1 FLUORESZENZSPEKTROSKOPIE 93
4.4.2 ISOTHERMALE TITRATIONSKALORIMETRIE 94
4.4.3 LOESUNGS-NMR-SPEKTROSKOPIE 97
4.5 CHARAKTERISIERUNG VERSCHIEDENER YTVA-LOV-VARIANTEN 104
9
IMAGE 3
INHALT
4.5.1 PHOTOCHEMISCHE AKTIVITAET 104
4.5.2 CD-SPEKTROSKOPISCHE SEKUNDAERSTRUKTURANALYSE DER JA-SEQUENZ 106
4.5.3 OLIGOMERISIERUNGSZUSTAND 108
4.5.4 NMR-SPEKTROSKOPISCHE UNTERSUCHUNGEN 110
4.5.5 UNTERSUCHUNG LICHTINDUZIERTER STRUKTURAENDERUNGEN IN NCAP-LOV-JA
MIT KLEINWINKEL-ROENTGENSTREUUNG 124
4.5.6 STRUKTURMODELL VON UNBELICHTETEM NCAP-LOV-JA 126
4.6 FLAVINBINDUNGSSTUDIEN 129
4.6.1 THERMODYNAMIK DER FLAVIN-APOPROTEIN-WECHSELWIRKUNG 129
4.6.2 CHARAKTERISIERUNG VON DEFLAVINIERTEM & REKONSTITUIERTEM NCAP-LOV
131
4.6.3 DEFLAVINIERTES NCAP-LOV ALS MOLEKULARE SONDE ZUM FLAVIN-NACHWEIS
.... 136
5 DISKUSSION 138
5.1 WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN YTVA & GTP 138
5.2 ABGRENZUNG, FUNKTION & INTRAMOLEKULARE ORGANISATION DISTINKTER
STRUKTUREINHEITEN VON YTVA 142
5.3 PRINZIP DER LICHTGETRIEBENEN MOLEKULAREN SCHALTFUNKTION VON YTVA 147
6 ZUSAMMENFASSUNG 149
7 SUMMARY 151
8 LITERATUR 153
9 VEROEFFENTLICHUNGEN 163
10 EIDESSTATTLICHE ERKLAERUNG 164
11 ANHANG 165
10
|
| any_adam_object | 1 |
| author | Dorn, Matthias |
| author_GND | (DE-588)1028983824 |
| author_facet | Dorn, Matthias |
| author_role | aut |
| author_sort | Dorn, Matthias |
| author_variant | m d md |
| building | Verbundindex |
| bvnumber | BV040634795 |
| collection | ebook |
| ctrlnum | (OCoLC)858927144 (DE-599)BVBBV040634795 |
| dewey-full | 572 500 570 |
| dewey-hundreds | 500 - Natural sciences and mathematics |
| dewey-ones | 572 - Biochemistry 500 - Natural sciences and mathematics 570 - Biology |
| dewey-raw | 572 500 570 |
| dewey-search | 572 500 570 |
| dewey-sort | 3572 |
| dewey-tens | 570 - Biology 500 - Natural sciences and mathematics |
| discipline | Allgemeine Naturwissenschaft Biologie |
| format | Thesis Book |
| fullrecord | <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><collection xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim"><record><leader>01709nam a2200385 c 4500</leader><controlfield tag="001">BV040634795</controlfield><controlfield tag="003">DE-604</controlfield><controlfield tag="005">20190218 </controlfield><controlfield tag="007">t</controlfield><controlfield tag="008">121214s2012 gw ad|| m||| 00||| ger d</controlfield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(OCoLC)858927144</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(DE-599)BVBBV040634795</subfield></datafield><datafield tag="040" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-604</subfield><subfield code="b">ger</subfield><subfield code="e">rakwb</subfield></datafield><datafield tag="041" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">ger</subfield></datafield><datafield tag="044" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">gw</subfield><subfield code="c">DE</subfield></datafield><datafield tag="049" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-188</subfield></datafield><datafield tag="082" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">572</subfield></datafield><datafield tag="082" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">500</subfield></datafield><datafield tag="082" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">570</subfield></datafield><datafield tag="100" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Dorn, Matthias</subfield><subfield code="e">Verfasser</subfield><subfield code="0">(DE-588)1028983824</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="245" ind1="1" ind2="0"><subfield code="a">Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis</subfield><subfield code="c">vorgelegt von Matthias Dorn</subfield></datafield><datafield tag="246" ind1="1" ind2="3"><subfield code="a">Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis</subfield></datafield><datafield tag="264" ind1=" " ind2="1"><subfield code="c">2012</subfield></datafield><datafield tag="300" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">168 S.</subfield><subfield code="b">Ill., graph. Darst.</subfield></datafield><datafield tag="336" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">txt</subfield><subfield code="2">rdacontent</subfield></datafield><datafield tag="337" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">n</subfield><subfield code="2">rdamedia</subfield></datafield><datafield tag="338" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">nc</subfield><subfield code="2">rdacarrier</subfield></datafield><datafield tag="500" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Nebentitel: Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis</subfield></datafield><datafield tag="502" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Berlin, Freie Univ., Diss., 2012</subfield></datafield><datafield tag="655" ind1=" " ind2="7"><subfield code="0">(DE-588)4113937-9</subfield><subfield code="a">Hochschulschrift</subfield><subfield code="2">gnd-content</subfield></datafield><datafield tag="776" ind1="0" ind2="8"><subfield code="i">Erscheint auch als</subfield><subfield code="n">Online-Ausgabe</subfield><subfield code="o">urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000040363-4</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="1"><subfield code="u">http://www.diss.fu-berlin.de/diss/receive/FUDISS_thesis_000000040363</subfield><subfield code="z">kostenfrei</subfield><subfield code="3">Volltext</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="2"><subfield code="m">DNB Datenaustausch</subfield><subfield code="q">application/pdf</subfield><subfield code="u">http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=025461978&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA</subfield><subfield code="3">Inhaltsverzeichnis</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">ebook</subfield></datafield><datafield tag="999" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-025461978</subfield></datafield></record></collection> |
| genre | (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content |
| genre_facet | Hochschulschrift |
| id | DE-604.BV040634795 |
| illustrated | Illustrated |
| indexdate | 2024-07-10T00:27:56Z |
| institution | BVB |
| language | German |
| oai_aleph_id | oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-025461978 |
| oclc_num | 858927144 |
| open_access_boolean | 1 |
| owner | DE-188 |
| owner_facet | DE-188 |
| physical | 168 S. Ill., graph. Darst. |
| psigel | ebook |
| publishDate | 2012 |
| publishDateSearch | 2012 |
| publishDateSort | 2012 |
| record_format | marc |
| spelling | Dorn, Matthias Verfasser (DE-588)1028983824 aut Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis vorgelegt von Matthias Dorn Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis 2012 168 S. Ill., graph. Darst. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Nebentitel: Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis Berlin, Freie Univ., Diss., 2012 (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Erscheint auch als Online-Ausgabe urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000040363-4 http://www.diss.fu-berlin.de/diss/receive/FUDISS_thesis_000000040363 kostenfrei Volltext DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=025461978&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
| spellingShingle | Dorn, Matthias Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |
| subject_GND | (DE-588)4113937-9 |
| title | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |
| title_alt | Studies on the structure, dynamics and interactions of domains of the bacterial photoreceptor YtvA from Bacillus subtilis |
| title_auth | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |
| title_exact_search | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |
| title_full | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis vorgelegt von Matthias Dorn |
| title_fullStr | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis vorgelegt von Matthias Dorn |
| title_full_unstemmed | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis vorgelegt von Matthias Dorn |
| title_short | Struktur-, Dynamik- und Interaktionsstudien an Domänen des bakteriellen Photorezeptors YtvA aus Bacillus subtilis |
| title_sort | struktur dynamik und interaktionsstudien an domanen des bakteriellen photorezeptors ytva aus bacillus subtilis |
| topic_facet | Hochschulschrift |
| url | http://www.diss.fu-berlin.de/diss/receive/FUDISS_thesis_000000040363 http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=025461978&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |
| work_keys_str_mv | AT dornmatthias strukturdynamikundinteraktionsstudienandomanendesbakteriellenphotorezeptorsytvaausbacillussubtilis AT dornmatthias studiesonthestructuredynamicsandinteractionsofdomainsofthebacterialphotoreceptorytvafrombacillussubtilis |