Genomweite Assoziationsstudie zu Varikosis: genetische Charakterisierung von RS10082399 (STOX1)
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
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2010
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|---|---|
| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
I
INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS,
EINHEITEN
UND
SYMBOLE
..........................................................
IV
TABELLENVERZEICHNIS
.....................................................................................................
VII
ABBILDUNGSVERZEICHNIS
.................................................................................................
VIII
1.
EINLEITUNG
...................................................................................................
1
1.1.
BESCHREIBUNG
UND
ZIELSETZUNG
DER
DURCHGEFUEHRTEN
STUDIE
......................................
1
1.2.
FUNKTION
DES
VENENSYSTEMS
...........................................................................................
4
1.2.1
ANATOMIE
DER
BEINVENEN
........................................................................................................
5
1.3.
AETIOLOGIE
DER
VARIZEN
UND
DER
CV1
.................................................................................
6
1.3.1.
HISTOLOGIE
DER
BEINVENEN
UND
PATHOHISTOLOGIE
DER
VARIZEN.................................................
7
1.3.2.
RISIKOFAKTOREN
FUER
DIE
ENTSTEHUNG
EINER
VARIKOSIS
..............................................................
9
1.4.
KLINISCHE
EINTEILUNG
UND
CEAP-KLASSIFIKATION...........................................................
10
1.5.
ASSOZIATIONSSTUDIEN
BEI
POLYGENETISCHEM
VERERBUNGSMODUS
................................
12
2.
MATERIAL
UND
METHODEN
..................................................................................
14
2.1.
PROJEKTPLANUNG
..............................................................................................................
14
2.1.1.
EINSCHLUSSKRITERIEN
..............................................................................................................
14
2.1.2.
REKRUTIERUNG
.......................................................................................................................
15
2.1.3.
PHAENOTYPISIERUNG
DER
PROBANDEN
.......................................................................................
15
2.1.4.
DATENERFASSUNG
UND
DATENEINGABE......................................................................................
16
2.2.
BIALLELISCHE
GENOTYPISIERUNG
.......................................................................................
18
2.2.1.
DNA-PROBEN
.........................................................................................................................
18
2.2.1.1.
DNA-ISOLATION
..................................................................................................................
18
2.2.1.2.
QUALITAETSSICHERUNG
UND
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
......................................................
20
2.2.1.3.
HERSTELLUNG
DER
PLATTEN
FUER
DIE
TAQMAN
GENOTYPISIERUNG.............................................
21
2.2.1.4.
WHOLE
GENOM
AMPLIFICATION
(WGA)
...............................................................................
21
2.2.2.
GENOTYPISIERUNG...................................................................................................................
22
2.2.2.1.
PRINZIPIEN
DER
BIALLELISCHEN
GENOTYPISIERUNG.................................................................
22
2.2.2.2.
AFFYMETRIXYY
MICROARRAYS
................................................................................................
22
2.2.2.3.
URSPRUENGE
UND
PRINZIP
DER
TAQMAN-PCR
.....................................................................
24
2.2.2.4.
PRAKTISCHE
DURCHFUEHRUNG
UND
PROTOKOLL
DER
TAQMAN-PCR
..........................................
25
II
INHALTSVERZEICHNIS
2.2.3.
EXPORT
DER
DATEN
ALS
MATRIZEN
(*.PRE
DATEIEN
UND
*.MAP
DATEIEN
AUS
DER
DATENBANK]
.....
29
2.2.4.
STATISTISCHE
AUSWERTUNG
.......................................................................................................
29
3.
ERGEBNISSE
............................................................................................................
31
3.1.
PROBANDENKOLLEKTIV
.......................................................................................................
31
3.1.1.
CHARAKTERISIERUNG
DES
PROBANDENKOLLEKTIVES
......................................................................
31
3.1.2.
EINTEILUNG
DES
PROBANDENKOLLEKTIVES
NACH
DEN
KLINISCHEN
SCHWEREGRADEN
DER
CEAP
KLASSIFIKATION
........................................................................................................................
32
3.1.3.
BESCHREIBUNG
DER
ANALYSEKOLLEKTIVE
FUER
DAS
YYGENOM
WIDE
ASSOCIATION
SCREEN
EXPERIMENT
...................................................................
38
3.1.4.
AUSWAHL
DER
ANALYSEKOLLEKTIVE
FUER
DIE
TAQMAN-PCR
........................................................
39
3.1.5.
MINIMIERUNG
VON
STRATIFIZIERUNGSEFFEKTEN
MITTELS
PLINK
......................................................
47
3.2.
GENOTYPISIERUNG
.............................................................................................................
49
3.2.1.
AUSWERTUNG
GENOMWEITE
ASSOZIATIONSSTUDIE
.....................................................................
49
3.2.2.
AUSWERTUNG
DER
PROBANDENKOLLEKTIVE
DER
TAQMAN-PCR
..................................................
52
3.2.2.I.
REPLIKATION
DES
TOP
HITS
RSL0082399
(GEN
STOX1)
......................................................
52
3.2.2.2.
VERGLEICH
DER
PROBANDINNEN
MIT
DEM
WEIBLICHEN
KONTROLLKOLLEKTIV
..............................
53
3.2.2.3.
VERGLEICH
DER
PROBANDEN
MIT
DEM
MAENNLICHEN
KONTROLLKOLLEKTIV..................................
54
4.
DISKUSSION
............................................................................................................
55
4.1.
PROBANDENKOLLEKTIV:
DISKUSSION
DES
GESAMTKOLLEKTIVES
.........................................
55
4.1.1.
PROBANDENKOLLEKTIV
REPLIKATION
...........................................................................................
58
4.2.
BEKANNTE
GENETISCHE
ASSOZIATIONEN
BEZUEGLICH
VARIKOSIS
........................................
58
4.3.
VORTEIL
DES
GEWAEHLTEN
STUDIENDESIGNS
UND
DER
CHIPTECHNIK
...................................
58
4.4.
STRATIFIZIERUNG
IN
ASSOZIATIONSSTUDIEN
.......................................................................
59
4.5.
VERIFIZIERUNG
MITTELS
PLINK
...........................................................................................
60
4.6.
DISKUSSION
DES
TOP
HITS
STOX1
........................................................
60
4.6.1.
STOX1
(STORKHEAD
BOX
1]
......................................................................................................
62
4.6.1.1.
STRUKTUR
DES
GENS
............................................................................................................
62
4.6.1.2.
BEKANNTE
ROLLE
IN
DER
EPIDEMIOLOGIE
..............................................................................
62
4.7.
GENOTYPISIERUNGSERGEBNISSE
.......................................................................................
63
4.8.
AUSBLICK
.......................
64
5.
ZUSAMMENFASSUNG
...............................................................................................
65
6.
LITERATURVERZEICHNIS
........................................................................................................
67
7.
MATERIAL
UND
GERAETE
______________
75
INHALTSVERZEICHNIS
III
7.1.
MATERIAL
......................................
75
7.2.
GERAETE
................................................................................................................................
77
8.
ANHANG...........................................
79
8.1.
CEAP-KLASSIFIKATION
........................................................................................................
79
8.2.
PROBANDENFRAGEBOGEN
....................................................................................................
81
8.3.
EINVERSTAENDNISERKLAERUNG
..............................................................................................
92
9.
LEBENSLAUF
.............................................................................................................
94
10.
ERKLAERUNG...............................................................................................................
95
11.
DANKSAGUNG
...........................................................................................................
96
|
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