Molekulargenetische Charakterisierung funktioneller Kandidatengene für Moderhinkeempfänglichkeit beim Schaf:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Giessen
DVG Service
2012
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| Ausgabe: | 1. Aufl. |
| Schriftenreihe: | Edition scientifique
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INHALTSVERZEICHNIS
VERZEICHNIS D E R A B B I L D U N G E N I V
VERZEICHNIS D E R T A B E L L E N VI
VERZEICHNIS D E R A B K UE R Z U N G E N IX
1 EINLEITUNG 1
2 LITERATURUEBERSICHT 3
2.1 MODERHINKE 3
2.1.1 D E F I N I T I O N U N D B E D E U T U N G 3
2.1.2 AETIOLOGIE 4
2.1.3 PATHOGENESE 5
2.1.4 E P I D E M I O L O G I E 6
2.1.4.1 U M W E L T F A K T O R E N 6
2.1.4.2 T I E R I N D I V I D U E L L E FAKTOREN 6
2.1.4.3 I N F E K T I O N S Q U E L L E N U N D UE B E R T R A G U N G 8
2.1.5 KLINISCHES BILD U N D D I A G N O S E 9
2.1.6 B E H A N D L U N G 11
2.1.6.1 K L A U E N S C H N I T T 11
2.1.6.2 K L A U E N B A D 13
2.1.6.3 A N T I B I O S E 13
2.1.6.4 KURATIVE I M P F U N G 14
2.1.7 PRAEVENTION 14
2.1.7.1 I M M U N I S I E R U N G 14
2.1.7.2 ERADIKATION 16
2.1.7.3 HERITABILITAETEN (H Z) 17
2.1.7.4 RESISTENZZUCHT 18
2.1.7.5 FOOTROT G E N E - M A R K E R T E S T 18
2.2 MOLEKULARGENETISCHE CHARAKTERISIERUNG DES GENOMS 19
2.2.1 U N T E R S U C H U N G V O N P O L Y M O R P H I S M E N A U F D
N A - B A S I S 19
2.2.1.1 S E Q U E N Z I E R U N G 20
2.2.2. ASSOZIATION V O N G E N O T Y P U N D P H AE N O T Y P 21
2.2.2.1 K A N D I D A T E N G E N A N S A T Z 22
2.2.3. STAND D E R G E N O M A N A L Y S E B E I M SCHAF 22
2.3 KANDIDATENGENE FUER MODERHINKEEMPFAENGLICHKEIT 24
2.3.1 T R A N S G L U T A M I N A S E 1 ( TGM1 ) 24
2.3.2 LORICRIN (LOK) 25
2.3.3 Y2-UNTEREINHEIT D E S LAMININ-332 ( LAMC2 ) 26
2.3.4 KERATINOCYTE G R O W T H FACTOR ( KGF ) 28
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IMAGE 2
3 MATERIAL U N D METHODEN 30
3.1 P R O B E N M A T E R I A L 30
3.1.1 P R O B E N M A T E R I A L F UE R D I E S E Q U E N Z I E R U N G
30
3.1.2 P R O B E N M A T E R I A L F UE R D I E A S S O Z I A T I O N S S
T U D I E N 30
3.1.3 P R O B E N M A T E R I A L F UE R D I E A L L E L F R E Q U E N Z
B E S T I M M U N G 31
3.2 V E R B R A U C H S M A T E R I A L I E N 32
3.2.1 C H E M I K A L I E N 33
3.2.2 D N A - G R OE SS E N M A R K E R 34
3.2.3 E N Z Y M E 34
3.2.4 K O M M E R Z I E L L E KITS 34
3.2.5 O L I G O N U K L E O T I D E 35
3.3 GERAETE 35
3.4 C O M P U T E R P R O G R A M M E 36
3.5 D A T E N B A N K E N 37
3.6 G E N B A N K - S E Q U E N Z E N 37
3.7 EXTERNE LABORATORIEN 37
3.8 M E T H O D E N 38
3.8.1 B L U T E N T N A H M E U N D A U F B E R E I T U N G D E R B L U
T P R O B E N 38
3.8.2 DNA-EXTRAKTION 38
3.8.3 E T A B L I E R U N G D E R P O L Y M E R A S E K E T T E N R E A
K T I O N Z U R A M P L I F I K A T I O N E I N Z E L N E R G E N A B S
C H N I T T E 38
3.8.3.1 A U S W A H L D E R P R I M E R 38
3.8.3.2 ETABLIERUNG D E R P C R 41
3.8.4 A M P L I F I K A T I O N B E S T I M M T E R A B S C H N I T T E
D E R K A N D I D A T E N G E N E 42
3.8.5 A U F R E I N I G U N G D E R P C R - P R O D U K T E 43
3.8.6 AGAROSEGELELEKTROPHORESE 43
3.8.6.1 UE B E R P R UE F E N D E R P C R 4 3
3.8.6.2 K O N Z E N T R A T I O N S S C H AE T Z U N G N A C H A U F R E
I N I G U N G D E R P C R - P R O D U K T E 44
3.8.7 S E Q U E N Z I E R U N G 44
3.8.7.1 S E Q U E N Z I E R R E A K T I O N 46
3.8.7.2 S E Q U E N Z I E R U N G M I T D E M ABI G E N E T I C A N A L
Y Z E R 3130 47
3.8.8 U N T E R S U C H U N G D E R S N P S 47
3.8.8.1 G E N O T Y P I S I E R U N G 47
3.8.9 STATISTISCHE M E T H O D E N 49
3.8.9.1 VERGLEICH D E R G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N 49
3.8.9.2 V A R I A N Z A N A L Y S E 50
3.8.10 A L L E L F R E Q U E N Z B E S T I M M U N G 50
4 ERGEBNISSE 51
4.1 S E Q U E N Z I E R U N G 51
4.1.1 TGM1 ~ 51
4.1.2 L O R 54
4.1.3 KGF 55
4.1.4 LAMC2 57
4.2 M O D E R H I N K E - P R AE V A L E N Z A U F D E N BETRIEBEN 62
4.3 G E N O T Y P I S I E R U N G 63
I I
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
4.3.1 TGM1 64
4.3.1.1 ERGEBNIS V O N X 2- U N D F I S H E R S EXACT T E S T 64
4.3.1.2 ERGEBNIS D E R VARIANZANALYSE 65
4.3.1.3 G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N S I G N I F I K A N T E R S N
P S A U F D E N B E T R I E B E N 65
4.3.1.4 ALLEL- U N D G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N 66
4.3.2 L O R 69
4.3.2.1 ERGEBNIS V O N X 2- U N D F I S H E R S EXACT T E S T 69
4.3.2.2 ERGEBNIS D E R V A R I A N Z A N A L Y S E 69
4.3.2.3 G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N D E S S N P S A U F BETRIEB 2
70
4.3.2.4 ALLEL- U N D G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N 70
4.3.3 KGF 71
4.3.3.1 ERGEBNIS V O N X 2- U N D FISHER S EXACT T E S T 71
4.3.3.2 ERGEBNIS D E R V A R I A N Z A N A L Y S E 72
4.3.3.3 G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N D E S S N P S KGF_1 A U F
BETRIEB 1 73
4.3.3.4 ALLEL- U N D G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N 73
4.3.4 LAMC2 75
4.3.4.1 ERGEBNIS V O N X Z_ U N D FISHER S EXACT T E S T 75
4.3.4.2 ERGEBNIS D E R V A R I A N Z A N A L Y S E 79
4.3.4.3 G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N S I G N I F I K A N T E R S N
P S A U F D E N B E T R I E B E N 80
4.3.4.4 ALLEL- U N D G E N O T Y P F R E Q U E N Z E N 84
5 DISKUSSION 96
6 ZUSAMMENFASSUNG 119
7 SUMMARY 121
8 LITERATURVERZEICHNIS 123
9 ANHANG 147
I I I
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