Qānūn-i adab - BSB Cod.pers. 296:
قانون ادب
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| Sprache: | Persian Arabic |
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| Online-Zugang: | Ausführliche Beschreibung Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Kurzaufnahme einer Handschrift Inhalt: Arabisch-persisches Wörterbuch. Ein Verzeichnis der arabischen Nomina, Verba und Partikeln nach den Formen zusammengestellt. - Als Anhang folgende grammatische Abhandlungen: Fol. 324: über arabische Namen, Fol. 328b: Pluralformen, Fol. 341b: über die Formen der Nomina actionis, Fol. 344-369: über die Konjugation der Verba (arabisch-persisch). - Die Anordnung des Wörterbuchs ist so, dass die arabischen Wörter mit ihrer persischen Interpretation einen fortlaufenden Text bilden Unvollständig: Am Schluss fehlt einiges Altsignatur: Quatremère 205 BSB-Provenienz: Étienne Quatremère (1782-1857) |
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IMAGE 1
CONTENTS
LIST O F ABBREVIATION X
AMINO ACID CODE XIII
SUMMARY XIV
ZUSAMMENFASSUNG XVII
1. INTRODUCTION 1
1.1 THE EXTRACELLULAR MATRIX (ECM) 3
1.2 COLLAGEN 5
1.3 PROTEOGLYCANS 8
1.3.1 AGGREGATING PROTEOGLYCANS 9
1.3.2 NON-AGGREGATING PROTEOGLYCANS 10
1.3.3 DECORIN 12
1.3.4 DECORIN-COLLAGEN INTERACTION: STATE O F THE ART AND CHALLENGES 14
2. AIM O F THE PH.D. THESIS 17
3. CONCEPTS AND STRATEGIES 19
4. DEVELOPMENT, SYNTHESIS, AND CHARACTERIZATION O F CONSENSUS SEQUENCES
DERIVED FROM DECORIN CORE PROTEIN 23
4.1 DEVELOPMENT O F THE CONSENSUS SEQUENCES 23
4.1.1 ANALYSIS O F DECORIN CRYSTAL STRUCTURE USING PYMOL 23
4.1.2 ALIGNMENT O F PEPTIDE SEQUENCES FROM THE INNER SURFACE O F DECORIN
CORE
PROTEIN 25
VI
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IMAGE 2
CONTENTS
4.1.3 ALIGNMENT O F PEPTIDE SEQUENCES FROM THE OUTER SURFACE O F DECORIN
CORE
PROTEIN 29
4.1.4 INVESTIGATION O F THE SECONDARY STRUCTURE PROPENSITY USING PYMOL
AND
DISCOVERY STUDIO 31
4.2 SYNTHESIS O F THE PROPOSED CONSENSUS SEQUENCES 32
4.3 CHARACTERIZATION O F THE PEPTIDES 33
4.3.1 PURIFICATION O F THE PEPTIDES BY RP-HPLC AND CHARACTERIZATION BY
MALDI-TOF-MS 33
4.3.2 CHARACTERIZATION BY 'H-NMR AND 2D-NMR SPECTROSCOPY 36
4.4 INVESTIGATION O F THE SECONDARY STRUCTURE BY CD SPECTROSCOPY 40
4.5 INVESTIGATION O F THE BINDING AFFINITY BY SPR 46
5. APPLICATION O F THE COLLAGEN BINDING PEPTIDES 51
5.1 PHYSICAL CROSSLINKING O F A COLLAGEN GEL BY A PEPTIDE DIMER 51
5.1.1 SYNTHESIS AND CHARACTERIZATION O F THE ALKYNE-FUNCTIONALIZED
PEPTIDE AND
THE PEPTIDE DIMER 52
5.1.2 INVESTIGATION O F THE MECHANICAL PROPERTIES O F GELS BASED ON
COLLAGEN AND
PEPTIDE DIMER 56
5.1.3 MORPHOLOGICAL INVESTIGATION O F GELS BASED ON COLLAGEN AND PEPTIDE
DIMER 59
5.2 PEPTIDE-DYE CONJUGATE FOR DIFFUSION CONTROL IN A COLLAGEN GEL 61
5.2.1 SYNTHESIS AND CHARACTERIZATION O F A PEPTIDE-DYE CONJUGATE 62
5.2.2 DIFFUSION TEST O F A PEPTIDE-DYE CONJUGATE ON A COLLAGEN GEL 64
5.3 GRAFTING O F A PEPTIDE TO HYALURONIC ACID TO TAILOR THE MECHANICAL
PROPERTIES
O F A COLLAGEN GEL 69
VII
IMAGE 3
CONTENTS
5.3.1 SYNTHESIS AND CHARACTERIZATION O F HYALURONIC ACI D-GRAFTED-
PEPTIDE
(HA-G-PEPTIDE) 70
5.3.2 STRUCTURAL AND MECHANICAL INVESTIGATION O F GELS BASED ON
COLLAGEN, HA,
AND HA-G-PEPTIDE 76
5.3.3 MORPHOLOGICAL INVESTIGATION O F THE GELS BY SEM 87
6. CONCLUSION AND OUTLOOK 89
7. EXPERIMENTAL 95
7.1 MATERIALS 95
7.2 INSTRUMENTS AND METHODS 95
7.2.1 PEPTIDE SYNTHESIS BY AUTOMATED PEPTIDE SYNTHESIZER 95
7.2.1.1 SYNTHESIS O F THE ALKYNE-FUNCTIONALIZED PEPTIDE 96
7.2.2 REVERSED-PHASE HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY 96
7.2.3 MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION TIME-OF-FLIGHT MASS
SPECTROMETRY 97
7.2.4 SURFACE PLASMON RESONANCE ANALYZES 97
7.2.5 CIRCULAR DICHROISM MEASUREMENTS 98
7.2.6 NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY 99
7.2.7 WIDE ANGLE X-RAY SCATTERING 99
7.2.8 SCANNING ELECTRON MICROSCOPY 101
7.2.9 FURIER TRANSFORM INFRARED SPECTROSCOPY 102
7.2.10 THERMOGRAVIMETRIC ANALYSIS 102
7.2.11 RHEOLOGICAL MEASUREMENTS 102
7.2.12 DIFFUSION TEST 103
7.2.12.1 PREPARATION O F SAMPLE SOLUTIONS 103
VIII
IMAGE 4
CONTENTS
7.3 APPENDIX O F SYNTHESES AND CHARACTERIZATIONS 104
7.4 PREPARATION O F HYALURONIC ACID .117
7.5 COUPLING O F THE PEPTIDE TO HYALURONIC ACID 117
7.6 PREPARATION O F THE SAMPLES BASED ON COLLAGEN, HA, AND HA-G-PEPTIDE
118
7.7 SYNTHESIS O F THE AZIDO-FLUORESCENT DYE 118
7.8 SYNTHESIS O F THE PEPTIDE DIMER AND THE PEPTIDE-DYE CONJUGATE BY
COPPER
CATALYZED AZIDE-ALKYNE CYCLOADDITION REACTION 119
7.9 PREPARATION O F THE SAMPLES BASED ON COLLAGEN AND PEPTIDE DIMER 119
7.10 PREPARATION O F COLLAGEN AND HYALURONIC ACID GELS FOR THE DIFFUSION
TEST. 120
8. APPENDIX 121
8.1 SEQUENCE ALIGNMENT 121
8.2 SOLID-PHASE PEPTIDE SYNTHESIS (SPPS) 122
8.2.1 AUTOMATED MICROWAVE PEPTIDE SYNTHESIS 124
8.3 REVERSED PHASE-HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY 125
8.4 MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION TIME-OF-FLIGHT MASS
SPECTROMETRY 125
8.5 CIRCULAR DICHROISM SPECTROSCOPY 126
8.6 SURFACE PLASMON RESONANCE 128
9. REFERENCES 131
ACKNOWLEDGMENTS 139
IX |
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