Eignung unterschiedlicher Primer und DNA-Extraktionsmethoden zum PCR-Nachweis von Vertretern des Mycobacterium-avium-intracellulare-Komplexes (MAIC):
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Berlin
Mensch und Buch Verl.
2010 [erschienen] 2011
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| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | kostenfrei Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Nebentitel: Testing different primers and DNA extraction methods to detect members of Mycobacterium avium-intracellulare complex (MAIC) by using PCR |
| Beschreibung: | III, 164 S. Ill., graph. Darst. |
| ISBN: | 9783863870041 |
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- I-
INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG - 1 -
2 LITERATUR - 2 -
2.1 DIE FAMILIE DER MYCOBACTERIACEAE - 2 -
2.1.1 TAXONOMIE UND NOMENKLATUR - 2 -
2.1.2 DIE GATTUNG MYCOBATERIUM - 2 -
2.1.3 DER MYCOBACTERIUM AVIUM-INTRACELLULARE-KOMP EX (MAIC) - 7 - 2.1.4
VORKOMMEN, EPIDEMIOLOGIE UND BEDEUTUNG DER MYKOBAKTERIEN BEI TIER UND
MENSCH - 8 -
2.1.4.1 VORKOMMEN UND EPIDEMIOLOGIE (INSBESONDERE BEIM SCHWEIN) - 8 -
2.1.4.2 MYKOBAKTERIEN BEIM SCHWEIN -12 -
2.1.4.3 MYKOBAKTERIEN BEIM RIND -15 -
2.1.4.4 MYKOBAKTERIEN BEIM GEFLUEGEL -16 -
2.1.4.5 MYKOBAKTERIEN BEI ANDEREN TIERARTEN -17 -
2.1.4.6 MYKOBAKTERIEN BEIM MENSCHEN - 1 8-
2.1.5 PATHOLOGIE UND KLINIK (SCHWEIN) - 22 -
2.1.5.1 PATHOGENESE - 2 2-
2.1.5.2 PATHOMORPHOLOGIE - 23 -
2.1.5.3 HISTOPATHOLOGIE - 24 -
2.1.5.4 KLINISCHE SYMPTOMATIK - 25 -
2.1.6 FLEISCHHYGIENERECHTLICHE BESTIMMUNGEN - 27 -
2.1.6.1 RECHTSGRUNDLAGE - 27 -
2.1.6.2 FLEISCHUNTERSUCHUNGSSTATISTIK - 29 -
2.2 DIE POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) - 31 -
2.2.1 GRUNDLAGEN DER PCR - 31 -
2.2.2 NACHWEIS DES AMPLIFIZIERTEN PRODUKTES - 3 2-
2.2.3 FAKTOREN, DIE DIE PCR BEEINFLUSSEN - 32 -
2.2.3.1 TEMPERATUR UND ZEIT - 3 2-
2.2.3.2 REAKTIONSKOMPONENTEN - 3 3-
2.2.3.3 PRIMER - 3 4-
2.2.3.4 TARGET-DNA - 34 -
2.2.3.5 KONTAMINATIONEN - 35 -
2.2.3.6 INHIBITOREN - 36 -
2.3 DIAGNOSTIK VON MYKOBAKTERIEN - 39 -
2.3.1 KONVENTIONELLE DIAGNOSTIK VON MYKOBAKTERIEN - 40 *
2.3.1.1 PROBENENTNAHME -40 -
2.3.1.2 MIKROSKOPIE - 4 0-
2.3.1.3 KULTURELLE ANZUECHTUNG -41 -
2.3.1.4 DIFFERENZIERUNG VON MYKOBAKTERIEN -44 -
2.3.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE DIAGNOSTIK VON MYKOBAKTERIEN - 46 * 2.3.2.1
GENETISCHE GRUNDLAGEN DES MAIC -46 -
2.3.2.2 MOLEKULARBIOLOGISCH BEDEUTSAME ZIELSEQUENZEN - 47 * 2.3.2.3
MOLEKULARBIOLOGISCHE NACHWEISMETHODEN - 57 *
2.4 FRAGESTELLUNGEN DIESER ARBEIT - 65 *
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN HTTP://D-NB.INFO/1014352665
DIGITALISIERT DURCH
IMAGE 2
- I I-
3 MATERIAL UND METHODEN - 66 *
3.1 ARBEITSMATERIALIEN - 66 *
3.1.1 VERWENDETE MIKROORGANISMEN - 66 *
3.1.2 NAEHRMEDIEN ZUR STAMMHALTUNG UND KULTIVIERUNG - 66 *
3.1.3 REAGENZIEN ZUR ISOLIERUNG DER DNA UND FUER DIE PCR - 6 7-
3.1.4 ARBEITSGERAETE UND LABORMATERIAL - 69 *
3.2 UNTERSUCHUNGSABLAUF - 70 -
3.2.1 UNTERSUCHUNGSSCHEMA - 70 *
3.2.1.1 VORVERSUCH: UEBERPRUEFUNG DER IN DER LITERATUR BESCHRIEBENEN
PCR-PROTOKOLLE - 70 *
3.2.1.2 HAUPTVERSUCH (TEIL A): VORGEHEN ZUR ERMITTLUNG DER
NACHWEISGRENZEN BEI VERWENDUNG VON REINKULTUREN - 71 * 3.2.1.3
HAUPTVERSUCH (TEIL B): VORGEHEN ZUR ERMITTLUNG DER NACHWEISGRENZEN BEI
VORHANDENSEIN VON LYMPHKNOTENMATRIX.. - 72 - 3.2.2 METHODEN DER
DNA-FREISETZUNG - 75 *
3.2.2.1 KOCHEN - 75 -
3.2.2.2 CHLOROFORM/ PHENOL-EXTRAKTION - 76 -
3.2.2.3 ULTRASCHALLBEHANDLUNG MIT ANSCHLIESSENDEM KOCHEN - 78 - 3.2.2.4
HIGH PURE PCR TEMPLATE KIT - 78 -
3.2.3 DIE POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) - 80 -
3.2.3.1 DURCHFUEHRUNG DER PCR (ALLGEMEIN) - 80 -
3.2.3.2 PRIMERABHAENGIGE PCR-BEDINGUNGEN - 81 -
3.2.3.3 GELELEKTROPHORESE - 8 4-
4 ERGEBNISSE - 86 -
4.1 KEIMZAHLBESTIMMUNG DER VERWENDETEN MYKOBAKTERIEN- BOUILLONKULTUREN -
86 *
4.2 VORVERSUCH: MOEGLICHE PRIMER-/ STAMMKOMBINATIONEN - 89 - 4.3
HAUPTVERSUCH (TEIL A): ERGEBNISSE BEI DER VERWENDUNG VON REINKULTUREN -
90 -
4.4. HAUPTVERSUCH (TEIL B): ERGEBNISSE BEI VORHANDENSEIN
VON LYMPHKNOTENMATRIX - 98 -
4.5 BERECHNUNG DER NACHWEISGRENZEN -105 -
5 DISKUSSION - 1 1 4-
5.1 FRAGESTELLUNG/ VERSUCHSZIEL -114 -
5.2 VERSUCHSAUFBAU - 1 1 5-
5.3 EINGESETZTE STAEMME -116 -
5.4 EINGESETZTE ZEILAUFSCHLUSSVERFAHREN -118 -
5.5 BEWERTUNG DER PRIMER -121 -
5.6 BEWERTUNG DER ERZIELTEN NACHWEISRATEN -124 -
5.7 FOLGERUNGEN/ KONSEQUENZEN -125 -
6 ZUSAMMENFASSUNG - 126 -
7 SUMMARY - 128 -
8 LITERATURVERZEICHNIS - 130 -
9 ANHANG - 160 -
10 DANKSAGUNG - 163 -
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| spelling | Großpietsch, Robin Verfasser aut Eignung unterschiedlicher Primer und DNA-Extraktionsmethoden zum PCR-Nachweis von Vertretern des Mycobacterium-avium-intracellulare-Komplexes (MAIC) vorgelegt von Robin Großpietsch Testing different primers and DNA extraction methods to detect members of Mycobacterium avium intracellulare complex (MAIC) by using PCR Berlin Mensch und Buch Verl. 2010 [erschienen] 2011 III, 164 S. Ill., graph. Darst. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Nebentitel: Testing different primers and DNA extraction methods to detect members of Mycobacterium avium-intracellulare complex (MAIC) by using PCR Berlin, Freie Univ., Diss., 2010 Mycobacterium avium complex cabt polymerase chain reaction cabt pig diseases cabt DNA cabt MAIC cabt PCR cabt Schlachtschwein (DE-588)4179652-4 gnd rswk-swf Polymerase-Kettenreaktion (DE-588)4256726-9 gnd rswk-swf Mycobacterium avium (DE-588)4232106-2 gnd rswk-swf Nachweis (DE-588)4115334-0 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Schlachtschwein (DE-588)4179652-4 s Mycobacterium avium (DE-588)4232106-2 s Nachweis (DE-588)4115334-0 s Polymerase-Kettenreaktion (DE-588)4256726-9 s DE-604 Erscheint auch als Online-Ausgabe urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000024719-0 http://www.diss.fu-berlin.de/diss/receive/FUDISS_thesis_000000024719 kostenfrei Volltext DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=024402813&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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