Verfügbarkeit: Die Bedeutung von IL23R-Genvarianten bei chronisch entzündlichen Darmerkrankungen

Die Bedeutung von IL23R-Genvarianten bei chronisch entzündlichen Darmerkrankungen:

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Bibliographische Detailangaben
1. Verfasser:	Wetzke, Martin 1976- (VerfasserIn)
Format:	Abschlussarbeit Buch
Sprache:	German
Veröffentlicht:	2011
Schlagworte:	Hochschulschrift
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Beschreibung:	V, 128 Bl. graph. Darst. 21 cm

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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS 1. EINLEITUNG ............................................................................................ 1 1.1. CHRONISCH ENTZUENDLICHE DARMERKRANKUNGEN - EPIDEMIOLOGIE UND ERKRANKUNGSBILD ......................................................................................................... 1 1.1.1. EPIDEMIOLOGIE .......................................................................................... 1 1.1.2. ERKRANKUNGSBILD, DIAGNOSTIK UND THERAPIE DES MORBUS CROHN .......... 3 1.1.3. ERKRANKUNGSBILD, DIAGNOSTIK UND THERAPIE DER COLITIS ULCEROSA ......... 5 1.2. DIE PATHOGENESE CHRONISCH ENTZUENDLICHER DARMERKRANKUNGEN ....................... 8 1.2.1. CHARAKTERISTIKA DES MUKOSALEN IMMUNSYSTEMS UND IHRE ROLLE BEI DER PATHOGENESE VON CHRONISCH ENTZUENDLICHEN DARMERKRANKUNGEN ................ 9 1.2.2. GENETISCHE EPIDEMIOLOGIE: WELCHE ROLLE SPIELT DIE GENETIK? .......... 13 1.2.3. EINFLUSS VON KOMMENSALER FLORA UND ANDERER UMWELTFAKTOREN ........ 15 1.3. IDENTIFIZIERUNG GENETISCHER DETERMINATEN FUER CHRONISCH ENTZUENDLICHE DARMERKRANKUNGEN .................................................................................................. 19 1.3.1. STRATEGIEN ZU IDENTIFIZIERUNG VON ERKRANKUNGSGENEN ......................... 19 1.3.2. GENOMWEITE ASSOZIATIONSSTUDIEN UND IHRE REPLIKATION ..................... 21 1.4. IL23R, NOD2 UND WEITERE SUSZEPTIBILITAETSGENE FUER CHRONISCH ENTZUENDLICHE DARMERKRANKUNGEN .......................................................................... 25 1.4.1. KOPPLUNGSREGIONEN FUER CHRONISCH ENTZUENDLICHE DARMERKRANKUNGEN 25 1.4.2. NOD2 UND ANDERE SUSZEPTIBILTAETSGENE DER PRAE-GWAS-AERA ............. 26 1.4.3. DIE IDENTIFIKATION VON IL23R ALS SUZEPTIBILITAETSGEN BEI CHRONISCH ENTZUENDLICHEN DARMERKRANKUNGEN .................................................................. 28 1.4.4. WEITERE BEFUNDE AUS GWAS BEI CHRONISCH ENTZUENDLICHEN DARMERKRANKUNGEN .......................................................................................... 31 1.5. DIE IL-23/TH17-ACHSE ...................................................................................... 34 1.5.1. LNTERLEUKIN-23 UND SEIN REZEPTOR ......................................................... 34 1.5.2. DIE BEDEUTUNG VON IL-23 FUER DIE ZELLULAERE IMMUNITAET .......................... 35 1.6. ZIELSETZUNG DER ARBEIT ...................................................................................... 37 2. MATERIAL .............................................................................................. 39 2.1. STUDIENPOPULATION ............................................................................................ 39 2.1.1. PATIENTENKOLLEKTIV ................................................................................... 39 2.1.2. KONTROLLKOLLEKTIV ...................................................................................... 40 2.2. KITS UND CHEMIKALIEN ....................................................................................... 40 2.2.1. MATERIALIEN FUER DIE PCR UND REINIGUNG DER PCR-PRODUKTE ............... 40 2.2.2. MATERIALIEN FUER DIE AGAROSEGELELEKTROPHORESE .................................... 40 2.2.3. MATERIALIEN FUER DIE GENOTYPISIERUNG MITTELS HYBRIDISIERUNGSSONDEN IM LIGHTCYCLER ............................................................................................... 41 2.3. OLIGONUKLEOTIDE ................................................................................................ 41 2.4. GERAETE ............................................................................................................... 43 2.5. SOFTWARE ............................................................................................................ 43 3. METHODEN ........................................................................................... 44 3.1. ALLGEMEINE BEMERKUNGEN ............................................................................... 44 3.2. MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN ..................................................................... 45 3.2.1. BESTIMMUNG DER KONZENTRATION VON NUKLEINSAEUREN ............................ 45 3.2.2. GENOTYPISIERUNG IM LIGHTCYCLER MITTELS HYBRIDISIERUNGSSONDEN .... 45 3.2.3. GELELEKTROPHORESE VON PCR-PRODUKTEN .............................................. 57 3.3. STATISTISCHE AUSWERTUNG .................................................................................. 58 3.3.1. VORAUSSETZUNGEN ................................................................................... 58 3.3.2. HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT ............................................................ 58 3.3.3. CHI-QUADRAT-TEST ................................................................................... 59 3.3.4. QUOTENVERHAELTNIS .................................................................................... 59 3.3.5. BONFERTONI-KORREKTUR BEI MULTIPLEN PAARVERGLEICHEN ............................ 60 4. ERGEBNISSE ....................................................................................... 61 4.1. ALLGEMEINE BEMERKUNGEN ................................................................................ 61 4.2. DETEKTION VON /L23R-POLYMORPHISMEN .......................................................... 61 4.3. IL23R-POLYMORPHISMEN IN PATIENTEN UND KONTROLLGRUPPE ............................ 64 4.4. GENOTYP-PHAENOTYP-ANALYSE VON IL23R-POLYMORPHISMEN ............................ 68 4.5. ANALYSE VON GENINTERAKTION ZWISCHEN IL23R UND NOD2-VARIANTEN ............ 71 5. DISKUSSION ........................................................................................ 73 5.1. STUDIENDESIGN UND METHODE ........................................................................... 73 5.1.1. DAS STUDIENDESIGN GENETISCHER ASSOZIATIONSTUDIEN ......................... 73 5.1.2. AUFBAU DER REPLIKATIONSSTUDIE .............................................................. 76 5.1.3. VALIDITAET DER VERWENDETEN GENOTYPISIERUNGSMETHODE ........................ 77 5.2. BEWERTUNG DER ERGEBNISSE AUS GENETISCHER SICHT ........................................ 78 5.2.1. FREQUENZEN DER IL23R-SNPS IN DER KONTROLLPOPULATION ..................... 78 5.2.2. FREQUENZEN DER IL23R-SNPS BEI M. CROHN UND COLITIS ULCEROSA .... 80 5.2.3. BEDEUTUNG VON IL23R-SEQUENZVARIANTEN BEI ANDEREN ERKRANKUNGEN MIT CHRONISCHER INFLAMMATION ................................................. 87 5.2.4. INTERAKTION VON IL23R UND NOD2-VARIANTEN BEI MORBUS CROHN ...... 87 5.2.5. GENOTYP-PHAENOTYP-ANALYSE FUER DAS M. CROHN-KOLLEKTIV .................... 89 5.3. BEWERTUNG DER ERGEBNISSE AUS FUNKTIONELLER SICHT ....................................... 91 5.3.1. DIE AUSWIRKUNG DER IL23R-MUTATIONEN AUF DAS GENPRODUKT ............ 91 5.3.2. DIE IL-23/TH17-ACHSE UND INTESTINALE INFLAMMATION ........................... 93 5.3.3. DIE IL-23/TH17-ACHSE ALS THERAPEUTISCHES INTERVENTIONSZIEL BEI CHRONISCH ENTZUENDLICHEN DARMERKRANKUNGEN ................................................ 97 5.3.4. BEFUNDE NACHFOLGENDER GWAS .............................................................98 5.4. AUSBLICK: ANALYSE VON COPY NUMBER VANANTS - EIN NEUER ANSATZ ZUR IDENTIFIKATION VON SUSZEPTIBILITAETSLOCI? ................................................................. 100 6. ZUSAMMENFASSUNG ..................................................................... 101 7. REFERENZEN ..................................................................................... 103 8. ABBILDUNGVERZEICHNIS ............................................................... 118 9. TABELLENVERZEICHNIS .......................................... 120 10. ABKUERZUNGSVERZEICHNIS ........................................................ 121 11. DANKSAGUNG ............................................................................... 124 12. CURRICULUM VITAE ....................................................................... 125
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