MiRNA-Bioinformatik als Werkzeug medizinischer Forschung: Etablierung eines Datenbank- und Zielvorhersagesystems zur Bearbeitung von miRNA-bezogenen Fragestellungen
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1
EINLEITUNG
7
1.1
D
AS
G
ENOM
7
1.2
D
AS
T
RANSKRIPTOM
8
1.3
MICRORNA
UEBERBLICK
8
1.4
M
ICRO
RNA
B
IOGENESE
10
1.5
MICRORNA
WIRKMECHANISMEN
11
1.6
M
ICRO
RNA
R
EGULATION
12
1.7
M
ICRO
RNA
Z
IEL
-V
ORHERSAGE
13
1.7.1
TARGETSCAN
14
1.7.2
MIRANDA
15
1.7.3
RNA22
15
1.7.4
PITA
16
1.7.5
M
IR
T
ARGET
2
16
1.7.6
P
IC
T
AR
17
1.7.7
T
AR
B
ASE
17
1.8
BEDEUTUNG
VON
MIRNAS
IN
DER
MEDIZIN
18
2
PROBLEMATIK
UND
ZIELSETZUNG
20
3
MATERIAL
UND
METHODEN
25
3.1
OEFFENTLICH
VERFUEGBARE
DATENSAETZE
25
3.2
D
ATENBANKEN
UND
M
ICRO
RNA
K
LASSIFIKATION
25
3.3
ZIELVORHERSAGE-METHODEN
26
3.4
D
ATENBANKDESIGN
26
3.5
E
RMITTLUNG
DES
S
IGNIFIKANZNIVEAUS
VON
MIRNAS,
DIE
IHR
H
OST
-G
EN
KONTROLLIEREN
27
3.6
S
TATISTISCHE
T
ESTS
28
4ERGEBNISSE
29
4.1
E
NTWICKLUNG
EINES
K
ONSENSUSVERFAHRENS
ZUR
MI
RNA-Z
IELVORHERSAGE
29
4.2
A
NALYSE
AN
EINEM
PRAKTISCHEN
B
EISPIEL
:
D
IE
R
OLLE
VON
M
IRNAS
IN
DER
S
EPSIS
33
4.3
C
HARAKTERISTIKA
INTRONISCHER
MIRNA
S
39
4.3.1 V
ERHAELTNIS
MI
RNA
-H
OST
-G
EN
41
4.3.2
C
HARAKTERISTIKA
VON
H
OST
-
UND
Z
IEL
-G
ENEN
43
5
DISKUSSION
______________________________________________________________
46
5.1
E
TABLIERUNG
EINES
K
ONSENS
-V
ERFAHRENS
FUER
6
Z
IEL
-V
ORHERSAGE
-
METHODEN
47
5.2
S
EPSIS
UND
MI
RNA-B
IOINFORMATIK
49
5.3
INTRONISCHE
MIRNA
S
53
5.4
L
IMITATIONEN
55
5.5
Z
USAMMENFASSUNG
55
DANKSAGUNG
66
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