Untersuchung der Genexpression apoptotischer und mikrokernbildender Prozesse:
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2010
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LEHRSTUHL FUER STRAHLENTHERAPIE UND MEDIZINISCHE ONKOLOGIE
DES KLINIKUMS RECHTS DER ISAR DER TECHNISCHEN UNIVERSITAET MUENCHEN
(DIREKTOR: UNIV.-PROF. DR. M. MOLLS)
UNTERSUCHUNG DER GENEXPRESSION APOPTOTISCHER UND MIKROKERNBILDENDER
PROZESSE
SYLVIA DOLESCHEL
VOLLSTAENDIGER ABDRUCK DER VON DER FAKULTAET FUER MEDIZIN DER TECHNISCHEN
UNIVERSITAET MUENCHEN ZUR ERLANGUNG DES AKADEMISCHEN GRADES EINES
DOKTORS DER MEDIZIN
GENEHMIGTEN DISSERTATION.
VORSITZENDER: UNIV.-PROF. DR. D. NEUMEIER
PRUEFER DER DISSERTATION: 1. APL. PROF. DR. M. ABEND 2. UNIV.-PROF. DR.
TH. A. MEITINGER
DIE DISSERTATION WURDE AM 11.05.2009 BEI DER TECHNISCHEN UNIVERSITAET
MUENCHEN EINGEREICHT UND DURCH DIE FAKULTAET FUER MEDIZIN AM 24.03.2010
ANGENOMMEN.
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN HTTP://D-NB.INFO/1008502642
DIGITALISIERT DURCH
IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS SEITE
INHALTSVERZEICHNIS I
VERZEICHNIS DER ABKUERZUNGEN III
VERZEICHNIS DER IN DIESER ARBEIT DIFFERENTIELL EXPRIMIERTEN GENE VI
1 EINLEITUNG 1
2 STAND DES WISSENS 3
2.1 ZELLTODESFORMEN 3
2.1.1 APOPTOSE 3
2.1.1.1 DEFINITION 3
2.1.1.2 MORPHOLOGIE 3
2.1.1.3 SIGNALTRANSDUKTION 4
2.1.2 BILDUNG MIKROKEMHALTIGER ZELLEN 5
2.1.2.1 DEFINITION UND ENTSTEHUNG DER MIKROKERNHALTIGEN ZELLEN 5
2.1.2.2 MORPHOLOGIE 5
2.1.2.3 SIGNALTRANSDUKTION 6
2.2 ZELLLINIE UND STRESSOR 6
2.2.1 ZELLLINIE 6
2.2.2 STRESSOR 7
3 MATERIAL UND METHODEN 9
3.1 VORARBEITEN 9
3.1.1 VORBEREITUNG UND BEHANDLUNG DER ZELLEN 9
3.1.2 AUFBEREITUNG UND WEITERVERARBEITUNG DER BEHANDELTEN ZELLEN 10
3.1.3 DER ATLAS* MOUSE 1.2 ARRAY (CLONTECH) 11
3.2 AUSWERTUNG 11
3.2.1 DIGITALISIERUNG 12
3.2.2 ERMITTLUNG DES NORMALISIERUNGSFAKTORS DER DIGITALISIERTEN ARRAYS
13 3.2.3 AUSRICHTUNG DER AUSWERTUNGSMASKE AN DIE HYBRIDISIERTE
NYLON-MEMBRAN 16 3.2.4 DATENANALYSE I 17
3.2.4.1 EINSTELLUNG VON REPRODUZIERBARKEIT UND SENSITIVITAET 19
3.2.4.2 BERECHNUNG DER DIFFERENTIELLEN GENEXPRESSION UNTER 21
BERUECKSICHTIGUNG DER ERGEBNISSE AUS DER EINSTELLUNG VON
REPRODUZIERBARKEIT UND SENSITIVITAET 3.2.5 DATENANALYSE II 22
3.2.5.1 SELEKTION VON GENEN UND GRAPHISCHE DARSTELLUNG 22
3.2.5.2 PLAUSIBILITAETSKONTROLLE DURCH SEMIQUANTITATIVEN OPTISCHEN
VERGLEICH 22
4 ERGEBNISSE 26
4.1 SELEKTION GEEIGNETER DATENSAETZE UND NORMALISIERUNG 26
4.1.1 SELEKTION 26
4.1.2 NORMALISIERUNG 30
4.1.3 EINFLUSS DER AUG (AREALE MIT UNDEFINIERTEN GRAUWERTEN) AUF DIE 32
GESAMTGENEXPRESSION 4.2 EINSTELLUNG VON REPRODUZIERBARKEIT UND
SENSITIVITAET 33
4.3 OPTISCHE UEBERPRUEFUNG DER ERGEBNISSE 34
4.4 DATENAUSWERTUNG 37
4.4.1 UNTERSUCHUNG DER ANZAHL EXPRIMIERTER/DIFFERENTIELL EXPRIMIERTER
GENE 37 GEGEN DIE ZEIT
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
4.4.2 UNTERSCHIEDE/GEMEINSAMKEITEN DIFFERENTIELL EXPRIMIERTER GENE NACH
38 100 PM BZW. 5.000 PM VM-26 4.4.3 UNTERSCHIEDE/GEMEINSAMKEITEN
DIFFERENTIELL EXPRIMIERTER GENE NACH 44 100 PM BZW. 5.000 PM VM-26 UNTER
BERUECKSICHTIGUNG DER
FUNKTIONELLEN HAUPTGRUPPEN A-F 4.4.4 UNTERSCHIEDE/GEMEINSAMKEITEN
DIFFERENTIELL EXPRIMIERTER GENE NACH 45 100 PM BZW. 5.000 PM VM-26 IN
ABHAENGIGKEIT VON IHRER ZUGEHOERIGKEIT ZU
EINER DER FUNKTIONELLEN 38 SUBGRUPPEN
5 DISKUSSION 51
5.1 VOR-UND NACHTEILE DES VERFAHRENS UND SEINER AUSWIRKUNGEN AUF 51
SENSITIVITAET UND REPRODUZIERBARKEIT 5.2 GENEXPRESSION RELATIV ZUR VM-26
KONZENTRATION 53
5.3 VERGLEICH DER MIKROKERNBILDUNG NACH VM-26 (L929-ZELLEN) UND 57 NACH
IONISIERENDEN STRAHLEN (L929- UND MCF-7-ZELLEN) 5.3.1 VERGLEICH MIT DER
GENEXPRESSION VON L929-ZELLEN NACH IONISIERENDER 58 STRAHLUNG
5.3.2 VERGLEICH MIT DER GENEXPRESSION VON MCF-7-ZELLEN NACH
IONISIERENDER 59 STRAHLUNG 5.3.3 VERGLEICH MIT DER GENEXPRESSION VON
L929-UND MCF-7-ZELLEN 59 NACH IONISIERENDER STRAHLUNG
6 ZUSAMMENFASSUNG/AUSBLICK 61
7 LITERATUR 62
8 ANHANG 72
DANKSAGUNG 101
LEBENSLAUF 102
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