Molekulare Biotechnologie: Konzepte, Methoden und Anwendungen
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Weitere Verfasser: | |
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Format: | Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Weinheim
Wiley-VCH
2011
|
Ausgabe: | 2., aktualisierte Aufl. |
Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Inhaltstext Inhaltsverzeichnis |
Beschreibung: | XXXIII, 654 S. Ill., graph. Darst. 28 cm |
ISBN: | 9783527326556 |
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IMAGE 1
INHALTSVERZEICHNIS
VORWORT V
AUTORENVERZEICHNIS X I X
ABKUERZUNGEN XXI
TEIL I GRUNDLAGEN DER ZELL- UND MOLEKULARBIOLOGIE I
1 DIE ZELLE IST DIE GRUNDEINHEIT DES LEBENS 3 M . WINK
2 AUFBAU UND FUNKTION DER ZELLULAEREN MAKROMOLEKUELE 29 M . WINK
2.1 AUFBAU UND FUNKTION DER ZUCKER 8
2.2 STRUKTUREN DER MEMBRANLIPIDE 10 2.3 AUFBAU UND FUNKTION DER PROTEINE
14 2.4 AUFHAU VON NUCLEOTIDEN UND NUCLEINSAEUREN (DNA UND RNA) 22
STRUKTUR UND FUNKTION DER ZELLE 29 M. WINK AUFBAU DER EUKARYOTENZELLE 29
AUFBAU UND FUNKTION DER CYTOPLASMAMEMBRAN 29
MEMBRANPERMEABILITAET 30 TRANSPORTVORGAENGE AN BIOMEMBRANEN 31 REZEPTOREN
UND SIGNALTRANSDUKTION AN DER BIOMEMBRAN 34 DAS ENDOMEMBRANSYSTEM DER
EUKARYOTENZELLE 38 MITOCHONDRIEN UND CHLOROPLASTEN 40 CYTOPLASMA 46
CYTOSKELETT 47 ZELLWAENDE 50 AUFBAU VON BAKTERIEN 51 AUFBAU VON VIREN 52
DIFFERENZIERUNG DER ZELLEN 54
4 BIOSYNTHESE UND FUNKTION DER MAKROMOLEKUELE (DNA, RNA UND PROTEINE) 59
M. WINK 4.1 GENOME, CHROMOSOMEN UND REPLIKATION 59 4.1.1 GENOMGROESSE 59
4.1.2 AUFBAU UND FUNKTION DER CHROMOSOMEN 64 4.1.3 MITOSE UND MEIOSE 66
4.1.4 REPLIKATION 68
4.1.5 MUTATIONEN UND REPARATURMECHANISMEN 69
MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE: KONZEPTE. METHODCN UND ANWENDUNGEN, 2. AUFL.
HERAUSGEGEBEN VON MICHAEL WINK COPYRIGHT 0 2011 WILEY-VCH VERLAG G M B H
& CO. KGAA. WEINHEIM ISBN: 978.3-527-32665.6
IMAGE 2
TEIL II
TRANSKRIPTION: VOM GEN ZUM PROTEIN 73 PROTEINBIOSYNTHESE (TRANSLATION)
78
VERTEILUNG DER PROTEINE IN DER ZELLE (PROTEIN SORTING) 83 M. WINK IMPORT
UND EXPORT VON PROTEINEN UEBER DIE KERNPORE 84 IMPORT VON PROTEINEN IN
MITOCHONDRIEN UND CHLOROPLASTEN 85
PROTEINTRANSPORT IN DAS ENDOPLASMATISCHE RETICULUM 87 VESIKELTRANSPORT
VOM ER VIA GOLGI-APPARAT ZUR CYTOPLASMAMEMBRAN 88
EVOLUTION UND DIVERSITAET DER ORGANISMEN 93 M. WINK PROKARYOTEN 93
EUKARYOTEN 93
STANDARDMETHODEN DER MOLEKULAREN BIOTECHNOLOGIE 101
ISOLIERUNG UND REINIGUNG VON PROTEINEN 103 7: WIELAND, M. LUTZ
EINLEITUNG 103 HERSTELLUNG EINES PROTEINHALTIGEN EXTRAKTS 104
GELELEKTROPHORETISCHE TRENNMETHODEN 106
DAS PRINZIP DER ELEKTROPHORESE 106 NATIVE GELELEKTROPHORESE 106
DISKONTINUIERLICHE ~ATRIUMDODEC~LSULFAT-~OLYACRYLAMID-
GELELEKTROPHORESE (SDS-PAGE) 106 ZWEIDIMENSIONALE
(2D)-GELELEKTROPHORESE, ISOELEKTRISCHE FOKUSSIEMNG (IEF) 108 DETEKTION
VON PROTEINEN IN GELEN 108
PRAEZIPITATIONSMETHODEN 109 SAEULENCHROMATOGRAPHISCHE METHODEN 11 0
ALLGEMEIN VERWENDBARE TRENNPRINZIPIEN 110
GROESSENAUSSCHLUSS-CHROMATOGRAPHIE (GELFILTRATION) 1 10
HYDROPHOBE INTERAKTIONSCHROMATOGRAPHIE (HIC) 112
IONENAUSTAUSCH-CHROMATOGRAPHIE 1 1 2 CHROMATOGRAPHIE AN HYDROXYLAPATIT
113 GRUPPENSPEZIFISCHE TRENNPRINZIPIEN 114 CHROMATOGRAPHIE AN PROTEIN A
ODER PROTEIN G 114 CHROMATOGRAPHIE AN CIBACRON BLUE (BLAUGEL) 114
CHROMATOGRAPHIE AN LEKTINEN 114 CHROMATOGRAPHIE AN HEPARIN 115 REINIGUNG
VON REKOMBINANTEN FUSIONSPROTEINEN 115 CHROMATOGRAPHIE AN CHELATBILDNERN
11 6
CHROMATOGRAPHIE AN GLUTATHION-MATRICES 1 1 6 BEISPIELE I 16 BEISPIEL 1:
AUFREINIGUNG DER NUCLEOSIDDIPHOSPHAT-KINASE
AUS DEM CYTOSOL DER STAEBCHENZELLEN DER RINDERRETINA 116 BEISPIEL 2:
REINIGUNG VON REKOMBINANTEM HIS6-RGSL6 NACH EXPRESSION IN E. COLI 118
PEPTID- UND PROTEINANALYTIK MIT ~LEKTROSPRAY-TANDEM- MASSENSPEKTROMETRIE
1 1 9 A. SCHLOSSER, W. D. LEHMANN
EINLEITUNG 1 19 PRINZIP DER MASSENSPEKTROMETRIE 11 9 MASSENPRAEZISION,
AUFLOESUNG UND ~SOTOENVERTEILUNG 120
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
I IX
PRINZIP DER ELEKTROSPRAY-IONISATION I20 TANDEM-MASSENSPEKTROMETER 122
MASSENANALYSATOREN 122 TRIPLE-QUADRUPOL 122
LTQ UND LTQ-ORBITRAP 123 Q-TOF 123 Q-FT-ICR 123 SEQUENZIERUNG VON
PEPTIDEN MITTELS MSJMS 124 PROTEINIDENTIFIZIERUNG MITTELS MSJMS-DATEN
UND PROTEINDATENBANKEN 125
DATENBANKSUCHE MIT MS/MS-ROHDATEN 125 MOLEKUELMASSENBESTIMMUNG VON
PROTEINEN 126 ANALYSE KOVALENTER PROTEINMODIFIKATIONEN 127 RELATIVE UND
ABSOLUTE QUANTIFIZIERUNG 129
ISOLIERUNG VON DNA UND RNA 131 H . WEIHER, R. ZWACKA, I. HERR EINFUEHRUNG
13 1 DNA-ISOLIERUNG 132 RNA-ISOLIERUNG 133 MESSENGER-RNA
(MRNA)-ANREICHERUNG 134
CHROMATOGRAPHIE UND ELEKTROPHORESE VON NUCLEINSAEUREN 135 H. WEIHER, R.
ZWACKA, I. HERR EINFUEHRUNG 135 CHROMATOGRAPHISCHE TRENNUNG VON
NUCLEINSAEUREN 135
ELEKTROPHORESE 136 AGAROSE-GELELEKTROPHORESE-SUBMARINE-TECHNIK 136
PULSED-FIELD-AGAROSE-GELELEKTROPHORESE 137
POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE (PAGE) 137
HYBRIDISIERUNG VON NUCLEINSAEUREN 139 H . WEIHER, R. ZWACKA, I . HERR
BEDEUTUNG DER BASENPAARUNG 139 EXPERIMENTELLE HYBRIDISIERUNG, KINETISCHE
UND THERMODYNAMISCHE KONTROLLE 139 ANALYSETECHNIKEN 140
KLONDETEKTION, SOUTHERN-BLOT, NORTHERN-BLOT UND GENDIAGNOSE 140
SYSTEMATISCHE GENDIAGNOSE UND EXPRESSIONS-SCREENING MITHILFE VON
GEN-ARRAYS 141 IN SITU-HYBRIDISIERUNG 141
ENZYME ZUR MODIFIKATION VON NUCLEINSAEUREN 143 A. GROTH, R. ZWACKA, H.
WEIHER, I . HERR RESTRIKTIONSENZYME (RESTRIKTIONSENDONUCLEASEN) 143
LIGASEN 145
METHYLTRANSFERASEN 145 DNA-POIYMERASEN 146 RNA POLYMERASEN UND REVERSE
TRANSKRIPTASEN 147 NUCLEASEN 147 T4-POLYNUCLEOTID-KINASE 148
PHOSPHATASEN 148
POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) 149 A. MOHR, H. WEIHER, I . HERR, R.
ZWACKA EINLEITUNG 149 TECHNIKEN 149
IMAGE 4
STANDARD-PCR 149 RT-PCR 151 QUANTITATIVE/KEAL-TIME-PCR 151 RAPID
AMPLIFICATION OF CDNA ENDS (RACE) 153 ANWENDUNGSGEBIETE 153 GENOMANALYSR
153
KLONIERUNGSMETHODE 153 EXPRESSIONSSTUDIEN 154
SEQUENZIERUNG VON DNA 155 R. ZWACKA, A. MOHR, I . HERR, H . WEIHER
EINLEITUNG 155 DNA-SEQUENZIERUNGSMETHODEN 155 CHEMISCHE
SEQUENZIERUNGSMETHODE (MAXAM-GILBERT-METHODE) 156
ENZYMATISCHE SEQUENZIERUNG (SANGER-METHODE) 156 PYROSEQUENZIERUNG 157
STRATEGIEN FUER DIE SEQUENZIERUNG DES HUMANEN GENOMS 158 PRAKTISCHE
BEDEUTUNG DER DNA-SEQUENZIERUNG 158
KLONIERUNGSVERFAHREN 159 T. WIELAND, S . LUTZ
EINLEITUNG 159 HERSTELLUNG REKOMBINANTER VEKTOREN 160 DAS INSERT 160 DER
VEKTOR 162 ESSENTIELLE BESTANDTEILE VON VEKTOREN 163
DER BAKTERIELLE REPLIKATIONSURSPRUNG (ORIGIN OF REPLICATION, ORI) 163
DIE ANTIBIOTIKARESISTENZ 163 DER POLYLINKER 163 KLONIEREN MIT
REKOMBINATIONSSYSTEMEN 164 WEITERE BESTANDTEILE VON VEKTOREN
FUER PROKARYOTISCHE EXPRESSIONSSYSTEME 165 DER PROMOTOR 165 DIE
RIBOSOMENBINDUNGSSTELLE 165 DIE TERMINATIONSSEQUENZ 166
DIE FUSIONSSEQUENZ 166 WEITERE BESTANDTEILE EUKARYOTISCHER
EXPRESSIONSVEKTOREN 166 EUKARYOTISCHE EXPRESSIONSVEKTOREN FUER HEFEN 167
EUKARYOTISCHE EXPRESSIONSVEKTOREN FUER SAEUGERZELLEN 168 VIRALE
EXPRESSIONSSYSTEME FUER SAEUGERZELLEN 171
NONVIRALE EINBRINGUNG HETEROLOGER DNA IN WIRTSORGANISMEN
(TRANSFORMATION, TRANSFEKTION) 172 TRANSFORMATION VON PROKARYOTEN 172
TRANSFORMATION VON HEFEZELLEN 173 TRANSFEKTION VON SAEUGERZELLEN 173
EXPRESSION REKOMBINANTER PROTEINE 175 T. WIELAND, S. LUTZ
EINLEITUNG 175 EXPRESSION VON REKOMBINANTEN PROTEINEN IN IRTSORGANISMEN
176 EXPRESSION IN E. COLI 179 EXPRESSION IN HEFEN 180 EXPRESSION IN
INSEKTENZELLEN 182 EXPRESSION MITHILFE REKOMBINANTER BACULOVIREN 182
EXPRESSION VON PROTEINEN IN STABIL TRANSFIZIERTEN ~NSEKTENZELLEN 183
EXPRESSION VON PROTEINEN IN SAEUGERZELLEN 184 EXPRESSION IN ZELLFREIEN
SYSTEMEN 185
IMAGE 5
INHALTSVERZEICHNIS I
TEIL III
EXPRESSION VON PROTEINEN IN RETICULOCYTENLYSATEN 186 PROTEINEXPRESSION
MIT E. COLI-EXTRAKTEN 186
PATCH-CLAMP-TECHNIK 187 R. KRAFT
BIOLOGISCHE MEMBRANEN UND IONENKANAELE 187 PHYSIKALISCHE GRUNDLAGEN UND
PATCH-CLAMP-KONFIGURATIONEN 188 ANWENDUNGEN DER PATCH-CLAMP-METHODE 190
ZELLZYKLUSMESSUNGEN 193 S. WOELFL, A. KITANOVIC
UNTERSUCHUNG DES ZELLZYKLUS 193 EXPERIMENTELLE ANALYSE DES ZELLZYKLUS
195 EINE BEOBACHTUNG DES ZELLZYKLUS KANN IN NICHTSYNCHRONEN
(ASYNCHRONEN) UND SYNCHRONEN KULTUREN DURCHGEFUEHRT WERDEN 196
HERSTELLUNG SYNCHRONER ZELLKULTUREN VON SACCHAROMYCES CEREVISIAE 196
ZENTRIFUGALE ELUTRIATION 196 ZENTRIFUGALE ELUTRIATION 197
NACHWEIS DER ZELLZYKLUSSTADIEN 198 KNOSPUNGSINDEX 198 FLUORESZENZFARBUNG
DES KERNS 198
MIKROSKOPIE-TECHNIKEN 203 S. DIEKMANN
ELEKTRONENMIKROSKOPIE 203 KRYO-ELEKTRONENMIKROSKOPIE 204
ELEKTRONEN-TOMOGRAPHIE 205 RASTERKRAFTMIKROSKOPIE 205 MESSUNG
INTRAMOLEKULARER BINDUNGSKRAEFTE 207 LIDITMIKROSKOPIE 207
PHASENKONTRASTMIKROSKOPIE 208 POLARISATIONS- UND INTERFERENZMIKROSKOPIE
208 KONFOKALE FLUORESZENZMIKROSKOPIE 209 NANOSKOPIE 210 MIKROSKOPIE IN
DER LEBENDEN ZELLE 21 1
UNTERSUCHUNG FLUORESZENZ-MARKIERTER PROTEINE IN VIVO 212 FRAP 213 FCS
213 FRET, FLIM 214
IASERANWENDUNGEN 217 M. VOGEL, R. FINK LASERPRINZIP 217 EIGENSCHAFTEN
DER LASERSTRAHLUNG 219 AUFBAU UND LASERTYPEN 21 9 ANWENDUNGEN 220
LASER-SCAN-MIKROSKOPIE 220 OPTISCHE PINZETTE 221 LASER-MIKRODISSEKTION
222
SCHWERPUNKTTHEMEN DER MOLEKULAREN BIOTECHNOLOGIE 223
CENOMIK UND FUNKTIONELLE CENOMIK 225
S. WIEMANN, M. FROHME EINLEITUNG 225 TECHNOLOGIEENTWICKLUNG IN DER
DNA-SEQUENZIERUNG 227
IMAGE 6
GENOMSEQUENZIERUNG 228 KARTIERUNG 228 RESTRICTION MAPPING UND
RESTRICTION FINGERPRINTING 231 BAC-END-SEQUENZIEMNG 231 GENETISCHE
KARTIERUNG 233
RADIATION HYBRID-MAPPING 234 HAPPY-MAPPING 235 KARTIERUNG DURCH
HYBRIDISIERUNG 235 STS, ESTS, SNPS UND SEQUENZLAENGEN-POLYMORPHISMEN
(AFLP) 238
FISH, FIBRE FISH, OPTICAL MAPPING UND CGH 239 ZEITACHSE DER
GENOMSEQUENZIERUNG 240 GENOM-SEQUENZIERUNGSSTRATEGIEN 242
KONVENTIONELLER ANSATZ - RANDOM-SHOTGUN-STRATEGIE 242
DIE WHOLE-GENOME-SHOTGUN-STRATEGIE 243 DIE SEQUENZIERUNG DES
MENSCHLICHEN GENOMS 245 AUSBLICK DER GENOMSEQUENZIERUNG 246
CDNA-PROJEKTE 247 CDNA-BIBLIOTHEKEN REPRAESENTIEREN MRNA DER ZELLE 247
DIE HERSTELLUNG VON CDNA-BIBLIOTHEKEN 249 EST-PROJEKTE ZUR
GENIDENTIFIZIERUNG 251 VOLL-LAENGE-PROJEKTE ZUR HERSTELLUNG VON
RESSOURCEN FUER DIE FUNKTIONELLE GENOMIK 253
FUNKTIONELLE GENOMIK 255 DIE IDENTIFIZIERUNG UND ANALYSE EINZELNER GENE
257 POSITIONAL CLONING 257 GENE TRAP 260 DNA-RNA-IN-SITU-HYBRIDISIERUNG
261 TISSUE-ARRAYS 261
DIE UNTERSUCHUNG TRANSKRIPTIONELLER AKTIVITAET 262 SAGE 263 SUBTRAKTIVE
HYBRIDISIERUNG 264 RNA-FINGERPRINTING 266 ARRAY BASIERENDE TECHNIKEN 268
MAKROARRAYS 271 MIKROARRAYS 272 GLOBALE UND SPEZIFISCHE ARRAYS 274
SPEZIFITAET UND SENSITIVITAET 275 ZELLBASIERTE METHODEN 276 GFP-TECHNIKEN
276 ALTERNATIVEN ZU GFP 277
FRET - FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER 278 FRAP - FLUORESCENCE
RECOVERY AFTER PHOTOBLEACHING 279 ZELLBASIERTE ASSAYS 280 ASSAY DESIGN
280
PIPETTIERSYSTEME 280 DATENAUFNAHME 281 DATENANALYSE 282 DIE FUNKTIONELLE
ANALYSE GANZER GENOME 283
GENOTYPISCHES SCREENING IN DER HEFE 283 PHAENOTYPISCHES SCREENING IN DER
MAUS 284
BIOINFORRNATIK 287 B. BRORS
EINLEITUNG 287 DATENQUELLEN 288 PRIMAERDATENBANKEN: EMBL/GENBANK/DDBJ,
PIR, SWISSPROT 288 GENOMDATENBANKEN: ENSEMBL, GOLDENPATH 289
IMAGE 7
LNHALTSVERZEICHNIS L
MOTIVDATENBANKEN: BLOCKS, PROSITE, PFAM, PRODOM, SMART 289 MOLEKULARE
STRUKTURDATENBANKEN: PDB, SCOP 289 TRANSKRIPTOMDATENBANKEN: SAGE,
ARRAYEXPRESS, GE0 290 REFERENZDATENBANKEN: PUBMED, OMIM, GENECARDS 290
PATHWAY-DATENBANKEN, GENE ONTOIOGY 291 SEQUENZANALYSE 291
KYTE-DOOLITTLE, HELICAL WHEEL, SIGNALSEQUENZANALYSE 291 PAARWEISER
VERGLEICH (ALIGNMENT) 293 LOKAL/GLOBAL 294 OPTIMAL/HEURISTISCH 294
ALIGNMENT-STATISTIK 294
MULTIPLES ALIGNMENT 295 EVOLUTIONAERE BIOINFORMATIK 296 STATISTISCHE
MODELLE DER EVOLUTION 297 ZUSAMMENHANG MIT SCORE-MATRIZEN 298
PHYLOGENETISCHE ANALYSE 298 GENVORHERSAGE 300 NEURONALE NETZE ODER
HIDDEN-MARKOV-MODELLE AUF GRUNDLAGE DER HEXANUCLEOTIDZUSAMMENSETZUNG 300
VERGLEICH MIT ESTS ODER ANDEREN GENOMEN (FUGU, MAUS) 301
BIOINFORMATIK IN DER TRANSKRIPTOM- UND PROTEOMANALYSE 302
VORVERARBEITUNG, NORMALISIERUNG 302 MERKMALSAUSWAHL 303
AEHNLICHKEITSMASSE: EUKLIDISCHE DISTANZ, KORRELATION,
MANHATTAN-, MAHALANOBIS-DISTANZ, ENTROPIEMASSE 304 UNUEBERWACHTE
LERNVERFAHREN: CLUSTERUNG, HAUPTKOMPONENTENANA- LYSE, MULTIDIMENSIONALE
SKALIERUNG, KORRESPONDENZANALYSE 304 UBERWACHTE LERNVERFAHREN: LINEARE
DISKRIMINANZANALYSE,
ENTSCHEIDUNGSBAEUME, SUPPORT VECTOR MACHINES, KUENSTLICHE NEURONALE NETZE
305 ANALYSE DER UEBERREPRAESENTATION FUNKTIONELLER KATEGORIEN 307
BIOINFORMATISCHE SOFTWARE 308
ZELLULAERE SYSTEM-BIOLOGIE 309 R. KOENIG, B. BRORS, H.
SCHMIDT-GLENEWINKEL, S. LEGEWIE
EINLEITUNG 309 ZELLULAERE NETZWERKANALYSE MIT TOP-DOWN-ANSAETZEN 3 10
MOTIVATION 3 10 DEFINITIONEN UND REKONSTRUIEREN DER NETZWERKE 3 11
ANREICHERUNGSTESTS VON GENGRUPPEN 3 12 ATTRIBUTE ZUR NETZWERKTOPOLOGIE 3
13
SKALENFREIE NETZE 31 3 DREIECKSMOTIVE 3 14 ZENTRALITAET UND WEITERE
TOPOLOGIEMERKMALE 314 MASCHINENLERNVERFAHREN FINDEN ESSENTIELLE ENZYME
316
ELEMENTARE FLUSSMODEN (ELEMENTARYJUX MODES) 317 REKONSTRUIEREN DER
REGULATION DURCH BOOL'SCHE UND BAYES'SCHE NETZWERKE 3 19 UBERBLICK ZUR
BOTTOM-UP-MODELLIERUNG BIOCHEMISCHER NETZWERKE 320
MOTIVATION 320 MODELLKOMPLEXITAET 320 MODELLERSTELLUNG 321
MODELLSIMULATION 322 MODELLKALIBRIERUNG 323 MODELBESTAETIGUNG 325
BIOLOGISCHE BEISPIELE 325
IMAGE 8
PROTEIN-PROTEIN- UND PROTEIN-DNA-INTERAKTIONEN 269
P . UETZ, E . POHL
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 332 KLASSIFIKATION UND SPEZIFITAET:
PROTEINDOMAENEN 332 PROTEINNETZWERKE UND -KOMPLEXE 333 STRUKTURMERKMALE
INTERAGIERENDER PROTEINE 333 WELCHE KRAEFTE VERMITTELN EINE
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTION? 335 THERMODYNAMIK 335
ENERGETIK 336 METHODEN ZUR UNTERSUCHUNG VON
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 337 REGULATION VON
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 337 THEORETISCHE VORHERSAGE VON
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 340 VORHERSAGE VON INTERAGIERENDEN
PROTEINEN ANHAND VON GENOMSEQUENZEN 340
PHYLOGENETISCHE PROFILE 340 BIOTECHNISCHE UND MEDIZINISCHE ANWENDUNGEN
VON PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 341 PROTEIN-DNA-INTERAKTIONEN 341
SEQUENZSPEZIFISCHE DNA-BINDUNG 341 THERMODYNAMISCHE UEBERLEGUNGEN ZU
PROTEIN-DNA-KOMPLEXEN 342 METHODEN ZUM STUDIUM VON
PROTEIN-DNA-WECHSELWIRKUNGEN 342 STRUKTURELLE KLASSIFIZIEMNG VON
PROTEIN-DNA-KOMPLEXEN 343
REGULATORISCHE NETZWERKE UND SYSTEMBIOLOGIE 343 MEDIZINISCHE BEDEUTUNG
VON PROTEIN-DNA-WECHSELWIRKUNGEN 345 BIOTECHNOLOGISCHE ANWENDUNGEN VON
PROTEIN-DNA-INTERAKTIONEN 345
SYNTHETISCHE BIOLOGIE 346
WIRKSTOFITORSCHUNG 347
M . KOEGL, R. TOLLE, U. DEUSCHLE, C. KREMOSER
EINLEITUNG 347 WIRKSTOFFE UND WIRKORTE 347 IDENTIFIZIERUNG VON
POTENZIELLEN TARGETS IM MENSCHLICHEN GENOM 349 VERGLEICHENDE
GENOMANALYSE 350
EXPERIMENTELLE TARGET-IDENTIFIZIERUNG IN-VITRO-METHODEN 351
EXPERIMENTELLE TARGET-IDENTIFIZIERUNG - MODELLORGANISMEN 352
EXPERIMENTELLE TARGET-IDENTIFIZIERUNG AM MENSCHEN 352 DER UNTERSCHIED
ZWISCHEN TARGET-KANDIDATEN UND ECHTEN TARGETS 353 BIOLOGICALS 355 DNA
UND RNA ALS NEUE THERAPEUTISCHE ANSAETZE 355 SCHUTZ VON TARGETS DURCH
PATENTE 356 SUBSTANZBANKEN DIENEN ALS RESERVOIR ZUR WIRKSTOFFFINDUNG 357
SCREENING IM HOCHDURCHSATZ 358 SCREENING-ASSAYS MUESSEN VON HOHER
QUALITAET SEIN 359 VIRTUELLES LIGANDEN-SCREENING 361 EFFIZIENZ UND POTENZ
BESCHREIBEN DIE AKTIVITAET VON WIRKSTOFFEN 361
LEITSTRUKTUREN WERDEN CHEMISCH OPTIMIERT (LEAD-OPTIMIZATION) 362 DIE
PRAEKLINISCHE PHARMAKOLOGIE UND TOXIKOLOGIE 362 DIE KLINISCHE ENTWICKLUNG
364 DIE KLINISCHE PRUEFUNG 364
IMAGE 9
INHALTSVERZEICHNIS I
DRUG TARGETING UND PRODRUGS 367 G. FRICKER DRUG TARGETING 367 PASSIVES
TARGETING MITTELS AUSNUTZUNG PHYSIOLOGISCHER BESONDERHEITEN DES
ZIELGEWEBES 368 PHYSIKALISCHES TARGETING 368 AKTIVES TARGETING 369
ZELLULAERE TRAEGERSYSTEME 373 PRODRUGS 373 PRODRUGS ZUR VERBESSERUNG DER
WIRKSTOFFLOESLICHKEIT 374 PRODRUGS ZUR ERHOEHUNG DER STABILITAET 374
PENETRATION VON WIRKSTOFFEN DURCH BIOLOGISCHE MEMBRANEN 374
PRODRUGS ZUR VERLAENGERUNG DER WIRKUNGSDAUER 376 PRODRUGS ZUR
ZIELGERICHTETEN WIRKSTOFFABGABE 376 PRODRUGS ZUR VERRINGERUNG VON
NEBENWIRKUNGEN 377
MOLEKULARE DIAGNOSTIK IN DER MEDIZIN 379
S . WOEEFL, R. GESSNER
ANWENDUNGEN DER MOLEKULAREN DIAGNOSTIK 379 EINFUEHRUNG 379 MONOGENE UND
POLYGENE KRANKHEITEN 380 INDIVIDUELLE VARIABILITAET IM GENOM: FORENSIK
382 INDIVIDUELLE VARIABILITAET IM GENOM: HLA-TYPISIERUNG 382
INDIVIDUELLE VARIABILITAET IM GENOM: PHARMAKOGENOMIK 382 INDIVIDUELLE
VARIABILITAET IM GENOM: ANFAELLIGKEIT FUER INFEKTIONSKRANKHEITEN 383
VIMSDIAGNOSE 383 MIKROBIELLE DIAGNOSE UND RESISTENZDIAGNOSE 384 WELCHE
MOLEKULAREN VARIATIONEN MUESSEN NACHGEWIESEN WERDEN? 385
PUNKTMUTATIONEN 385 INSERTIONEN UND DELETIONEN 386
NUCLEOTIDWIEDERHOLUNGEN 386 DELETION ODER DUPLIKATION VON GENEN 387
REKOMBINATION ZWISCHEN CHROMOSOMEN 387 EPIGENETISCHE VERAENDERUNGEN 388
VERFAHREN DER MOLEKULAREN DIAGNOSTIK 388 DNAIRNA-AUFREINIGUNG 389
BESTIMMUNG BEKANNTER SEQUENZVARIATIONEN 389 DIREKTER
LAENGENPOLYMORPHISMUS 389 RFLP
(RESTRIKTIONSFRAGMENT-LAENGENPOLYMORPHISMEN) 389 ACRS
(AMPLIFIATION-CREATED RESTRICTION SITES) 390 ARMS (AMPLIFICATION
REFRACTORY MUTATION SYSTEM) 391 MS-PCR 391 ALLELSPEZIFISCHE
HYBRIDISIERUNG 391
LCR 392 MINISEQUENZIERUNG 392 PYROSEQUENZIERUNG 392 QUANTITATIVE PCR 393
CHIP-TECHNOLOGIE 394 AUFBAU UND HERSTELLUNG VON MIKROARRAYS 394
BESTIMMUNG UNBEKANNTER MUTATIONEN 396 AUSBLICK 397
IMAGE 10
REKOMBINANTE ANTIKOERPER UND PHAGEN-DISPLAY 399 S. DUEBEL
EINFUEHRUNG 399 WARUM REKOMBINANTE ANTIKOERPER? 401 REKOMBINANTE
ANTIKOERPER LASSEN SICH OHNE IMMUNISIERUNG IN VITRO GEWINNEN 401
ANTIKOERPER MIT NEUED EIGENSCHAFTEN KOENNEN ERZEUGT WERDEN 401
GEWINNUNG SPEZIFISCHER REKOMBINANTER ANTIKOERPER 402 BEREITSTELLUNG DER
VIELFALT AN ANTIKOERPERGENEN 402 SELEKTIONSSYSTEME FUER REKOMBINANTE
ANTIKOERPER 403 TRANSGENE MAEUSE 403
IN-VITRO-SELEKTIONSSYSTEME 404 HERSTELLUNG REKOMBINANTER ANTIKOERPER 407
REKOMBINANTE PRODUKTIONSSYSTEME 407 REINIGUNG REKOMBINANTER ANTIKOERPER
UND IHRER FRAGMENTE 407 FORMATE FUER REKOMBITLANTE ANTIKOERPER 409
MONOSPEZIFISCHE ANTIKOERPERFRAGMENTE 409
FAB-FRAGMENTE 409 FV-FRAGMENTE 41 1 SINGLE-CHAIN-ANTIKOERPERFRAGMENTE
(SCFV) 41 1 SINGLE-CHAIN-FAB-FRAGMENTE (SCFAB) 41 1 DISULFIDBRUECKEN
STABILISIERTE FV-FRAGMENTE (DSFV) 412 VH- UND KAMEL-ANTIKOERPER 41 2
MULTIVALENTE ANTIKOERPERFRAGMENTE 412 BIFUNKTIONELLE ANTIKOERPERFRAGMENTE
413 BISPEZIFISCHE ANTIKOERPER 413 ANWENDUNGEN FUER REKOMBINANTE ANTIKOERPER
41 6
KLINISCHE ANWENDUNGEN 41 6 ANWENDUNGEN IN DER FORSCHUNG UND DER
IN-VITRO-DIAGNOSTIK 417 REKOMBINANTE ANTIKOERPER MIT KONTROLLIERBARER
KREUZREAKTIVITAET 417 INTRAZELLULAERE ANTIKOERPER 41 7
REKOMBINANTE ANTIKOERPER FUER DIE PROTEOMFORSCHUNG 417 AUSBLICK 41 8
GENETISCH VERAENDERTE MAEUSE (TRANSGENE UND KNOCK(IN)OUT-MAEUSE) UND DEREN
BEDEUTUNG IN DER BIOMEDIZIN 419 R. SPRENGEL UBERBLICK 41 9 TRANSGENE
MAEUSE 420
DIE RETROVIRALE INFEKTION 420 DIE PRONUKLEUS-INJEKTION 421 DIE HOMOLOGE
REKOMBINATION: KNOCK-INLOUT-MAEUSE 422 KONDITIONAL REGULIERTE
GENEXPRESSION 424 DIE BEDEUTUNG GENETISCH VERAENDERTER MAEUSE IN DER
IOMEDIZIN 425 ALZHEIMER-KRANKHEIT 425 AMYOTROPHE LATERALSKLEROSE 425
MENTALE ERKRANKUNGEN 426 AUSBLICK 426
CENTHERAPIE: STRATEGIEN UND VEKTOREN A. GROTH, I. HERR
EINFUEHRUNG 429 PRINZIPIEN DER SOMATISCHEN GENTHERAPIE 430 DIE
KEIMBAHNTHERAPIE 432 RUECKSCHLAEGE IN DER GENTHERAPIE 432 VEKTOREN FUER DIE
GENTHERAPIE 433
RETROVIRALE VEKTOREN 434
IMAGE 11
INHALTSVERZEICHNIS L
ADENOVIRALE VEKTOREN 436 ADENO-ASSOZIIERTE VEKTOREN (AAV) 438 ANDERE
VIRALE VEKTOREN 440 SPEZIFISCHE EXPRESSION 441
MODIFIZIERTE DNA, PNA UND IHRE ANWENDUNGEN IN DER MEDIZIN UND
BIOTECHNOLOGIE 443 N. METZLER-NOLTE, A. SOSNIAK EINLEITUNG 443
MODIFIZIERTE NUCLEINSAEUREN 444 PHOSPHORTHIOATE 444 METHYLPHOSPHONATE 446
PEPTID-NUCLEINSAEUREN (PNA) 446 WECHSELWIRKUNG VON DNA-ANALOGA MIT
KOMPLEMENTAERER DNA UND RNA 447
SCHMELZTEMPERATUR 447 MISMATCH-EMPFINDLICHKEIT 449 RNA INTERFERENZ 450
BIOGENESE KLEINER RNA MOLEKUELE 450 BIOGENESE VON SIRNAS 450 BIOGENESE
VON MIRNAS 450 EINLAGERUNG IN DEN RNA-INDUCED SILENCING COMPLEX (RISC)
451 POSTTRANSKRIPTIONALE REPRESSION DURCH MIRNA UND SIRNA 451
ANWENDUNGEN 453 ANTISENSE-TECHNIK MIT DNA-ANALOGA 453
SIRNA IN BIOTECHNOLOGISCHEN ANWENDUNGEN 454 DESIGN VON SIRNAS 455 NICHT
VEKTORIELLE APPLIKATIONEN 456 VEKTORIELLE APPLIKATIONEN 456 VERGLEICH
VON RNAI MIT DNA-ANALOGA FUER ANTISENSE-ANWENDUNGEN 458
PFLANZLICHE BIOTECHNOLOGIE 459 H. HILLEBRAND, R. HELL EINLEITUNG 459 DIE
*GRUENE" GENTECHNOLOGIE - EINE NEUE METHODE AUF DEM WEG ZU TRADITIONELLEN
ZIELEN 459
BESONDERE ANFORDERUNGEN UND AKTUELLE FORSCHUNGSGEBIETE DER
PFLANZENBIOTECHNOLOGIE 460 GENREGULATION 461 PRODUKTION TRANSGENER
PFLANZEN 462 TRANSFORMATIONSSYSTEME 463 AGROBACTERIUM ALS NATUERLICHES
TRANSFORMATIONSSYSTEM 463
BIOLISTISCHE METHODE: GENE GUN 465 PLASTIDENTRANSFORMATION 467 VIRALE
SYSTEME 468 SELEKTION TRANSFORMIERTER PFLANZENZELLEN 468
ANFORDERUNGEN AN EIN OPTIMALES SELEKTIONSMARKERSYSTEM 469 NEGATIVE
SELEKTIONSMARKERSYSTEME 470 POSITIVE SELEKTIONSMARKERSYSTEME 471
GEGENSELEKTION MIT BIFUNKTIONALEN MARKERGENEN 472 VISUELLE MARKER 472
SELEKTIONSSYSTEME, GENTECHNIKSICHERHEIT UND MARKERFREIE PFLANZEN 473
REGENERATION TRANSGENER PFLANZEN 475 VERFAHREN DER REGENERATION 475
ZUSAMMENSETZUNG VON REGENERATIONSMEDIEN 475
IMAGE 12
TEIL IV
ANALYSE PFLANZLICHER GENOME: NACHWEIS UND CHARAKTERISIERUNG TRANS- GENER
PFLANZEN 476 DNA- UND RNA-NACHWEISE 476 PROTEINNACHWEISE 478
GENETISCHE UND MOLEKULARE KARTEN 478 STABILITAET TRANSGENER PFLANZEN 479
BIOKATALYSE IN DER CHEMISCHEN INDUSTRIE 481 M. BREUER, B. HAUER
EINLEITUNG 481 BIOTRANSFORMATIONEN/ENZYMATISCHE VERFAHREN 485
ENTWICKLUNG EINES ENZYMS FUER DIE INDUSTRIELLE BIOKATALYSE 487
IDENTIFIZIERUNG NEUARTIGER BIOKATALYSATOREN 487 VERBESSERUNG VON
BIOKATALYSATOREN 489 PRODUKTION VON BIOKATALYSATOREN 489 AUSBLICK 490
FALLBEISPIEL 1: SCREENING NACH NEUEN NITRILASEN 490 FALLBEISPIEL 2:
VERWENDUNG BEKANNTER ENZYME FUER NEUE REAKTIONEN: LIPASEN ZUR HERSTELLUNG
OPTISCH AKTIVER AMINE UND ALKOHOLE 491 FALLBEISPIEL 3: ENZYMOPTIMIERUNG
MIT RATIONALEN UND EVOLUTIVEN METHODEN 493
FERMENTATIVE VERFAHREN 493 VERBESSERUNG FERMENTATIVER VERFAHREN 494
KLASSISCHE STAMMOPTIMIERUNG 494 METABOLIC ENGINEERING 496
FALLBEISPIEL 4: FERMENTATIVE HERSTELLUNG VON N-BUTANOL 497
FALLBEISPIEL5: HERSTELLUNG VON GLUTAMINSAEURE MIT CORYNEBACTERIUM
GLUTAMICUM 498 MOLEKULARER MECHANISMUS DER GLUTAMATUEBERPRODUKTION 499
FALLBEISPIEL 6: HERSTELLUNG VON LYSIN MIT CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM 500
MOLEKULARER MECHANISMUS DER LYSINBIOSYNTHESE 500 DEREGULIERUNG DES
SCHLUESSELENZYMS ASPARTAT-KINASE 501 GENOMFORSCHUNG UND FUNKTIONELLE
GENOMIK 502
FALLBEISPIEL 7: FERMENTATIVE PENICILLINPRODUKTION 503 FALLBEISPIEL 8:
VITAMIN-B2-PRODUKTION 503 RIBOFLAVINBIOSYNTHESE 504 KLASSISCHE
STAMMENTWICKLUNG 504
WIRTSCHAFTLICHE PERSPEKTIVEN DER MOLEKULAREN BIOTECHNOLOGIE 505
INDUSTRIELLE UMSETZUNG (BIOTECH-INDUSTRIE, ~ AE R K T E UND CHANCEN) SO7
J. SCHUELER GESCHICHTLICHER UEBERBLICK UND BEGRIFFSDEFINITIONEN 507
INDUSTRIELLE ANWENDUNGSBEREICHE
DER MOLEKULAREN BIOTECHNOLOGIE 508 ROTE BIOTECHNOLOGIE 509
BIOPHARMAZEUTISCHE WIRKSTOFFENTWICKLUNG 509 DRUG DELIVERY 512 ZELL- UND
GENTHERAPIE 512
TISSUE ENGINEERINGLREGENERATIVE MEDIZIN 513 PHARMAKOGENOMIK UND
PERSONALISIERTE MEDIZIN 514 MOLEKULARDIAGNOSTIKA 515 SYSTEMBIOLOGIE 51 6
GRUENE BIOTECHNOLOGIE 516 TRANSGENE PFLANZEN 51 6
GENOMIK-ANSAETZE IN DER GRUENEN BIOTECHNOLOGIE 517
IMAGE 13
LNHALTSVERZEICHNIS L X'X
,,NOVEL FOOD" UND ,,FUNCTIONAL FOOD" 51 7 TIERZUCHT 51 8 WEISSE UND GRAUE
BIOTECHNOLOGIE 518 STATUS QUO DER BIOTECH-INDUSTRIE WELTWEIT 518
GLOBALER UEBERBLICK 51 9 USA 519 EUROPA 519
DEUTSCHLAND 51 9
PATENTE UND SCHUTZ VON IDEEN 521 C. AMSHOFL ALLGEMEINE EINFUEHRUNG 521
UEBERSICHT UEBER DIE BESONDERHEITEN IM GEWERBLICHEN RECHTSSCHUTZ 522
ASPEKTE DES PATENTRECHTS 522 KRITERIEN FUER DIE PATENTFAHIGKEIT 523
RECHTE AUS DEM PATENT 525 BIOTECHNOLOGISCHE ERFINDUNGEN 526
PATENTIERBARE BIOTECHNOLOGISCHE GEGENSTAENDE 527 ALLGEMEINE MERKMALE FUER
PATENTIERBARE, BIOTECHNOLOGISCHE GEGENSTAENDE 527 BEISPIELE AUS DER
PRAXIS 528 NICHTPATENTIERBARE BIOTECHNOLOGISCHE ERFINDUNGEN 529 ETHISCHE
UEBERLEGUNGEN 530
ZULASSUNG VON ARZNEIMITTELN IN DER EUROPAEISCHEN UNION UND DEN
VEREINIGTEN STAATEN 531 G. WALSH EINFUEHRUNG 53 1
REGULIERUNG INNERHALB DER EUROPAEISCHEN UNION 531 DER REGULATORISCHE
RAHMEN DER EU 531 EMA 532 NEUE WEGE DER ARZNEIMITTELZULASSUNG 534
DAS ZENTRALISIERTE VERFAHREN 534 GEGENSEITIGE ANERKENNUNG 535
REGULIERUNG IN DEN USA 535 CDER UND CBER 536
DAS ZULASSUNGSVERFAHREN 537 DIE EINFUEHRUNG UND REGULIERUNG VON
BIOSIMILARS 539 INTERNATIONALE HARMONISIERUNG DER REGULIERUNG 540
ZUSAMMENSPIEL ZWISCHEN BIG PHARMA UND BIOTECH-START-UP-UNTERNEHMEN 543
C. KREMOSER ENTWICKLUNG DER PHARMAZEUTISCHEN UND DER BIOTECHNOLOGISCHEN
INDUSTRIE 543 WAS UNTERSCHEIDET BIOTECHNOLOGIE- VON PHARMAFIRMEN? 547
KULTURELLE UNTERSCHIEDE ZWISCHEN BIG PHARMA UND BIOTECH 548
DAS KLEINE 1X1 DER FIRMENGRUENDUNG 551 C. KREMOSER DIE ERSTEN SCHRITTE
ZUR EIGENEN FIRMA 551 BUSINESSPLAN 552 FINANZIERUNG UND RISIKOKAPITAL
555 MITARBEITER: REKRUTIERUNG, ENTLOHNUNG, ERFOLGSBETEILIGUNG 559 DIE
ERSTEN SCHRITTE MIT DER EIGENEN FIRMA, ERFOLGSFAKTOREN 563
IMAGE 14
39 MARKETING 565
C. KREMOSER
39.1 EINFUEHRUNG 565
39.2 WELCHE ARTEN VON DEALS GIBT ES? 566 39.2.1 WAS WIRD AN
MEILENSTEINEN BZW. LIZENZGEBUEHREN BEI EINER BIOTECHIPHARMA-KOOPERATION
WIRKLICH GEZAHLT? 567 39.3 PUBLIC RELATIONS ( P R ) UND INVESTOR
RELATIONS ( I R )
FUER BIOTECH-FIRMEN 568
ANHANG 571
WEITERFUHRENDE LITERATUR 573
GLOSSAR 589 M. WINK
SACHVERREICHNIS 629 |
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