Nachweis chromosomaler Rearrangierungen im PLAG1-Gen myoepithelialer Tumoren der Speicheldrüsen:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
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2008
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|---|---|
| adam_text | Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung
1.1 Myoepitheliale Tumoren 5
1.1.1 Myoepitheliome - Benigne myoepitheliale Tumoren 5
1.1.2 Myoepitheliale Karzinome -
Maligne myoepitheliale Tumoren 6
1.2 Markerprofil 7
1.2.1 Myoepitheliome 7
1.2.2 Myoepitheliale Karzinome 8
1.3 Cytogenetische Befunde myoepithelialer Tumoren 9
1.4 PLAG1 und seine Funktionen 10
1.5 Fragestellung der vorliegenden Arbeit 13
2. Material
2.1 Patientengut:Tabelle 1 14
2.2 Spezifität der PLAG- Sonden 19
2.3 Chemikalien, Reagenzien, Enzyme, Versuchslösungen, Geräte 21
3. Methoden
3.1 Fluoreszenz-/« situ -Hybridisierung 26
3.2 Probenvorbereitung Paraffinschnitte 26
3.3 Zellkernisolierung nach Hedley 26
3.4 Isolierungen von Plasmid - DNA 28
3.5 Quantifizierungen der Sonden - DNA 29
3.5.1 Gelelektrophoretische Quantifizierung
3.5.2 Photometrische Quantifizierung
3.6 Sondenmarkierung PLAG 233, PLAG 234, PLAG 235 31
3.6.1 DIG - Nick - Translation
3.6.2 Biotin - Nick - Translation
3.7 Spezifitätskontrolle an Metaphasechromosomenpräparaten 33
3.7.1 Herstellung der Präparate
3
3.7.2 Spezifitätskontrolle - Protokoll
3.8 FISH an Patientengut 37
3.8.1 Paraffinschnitte
3.8.2 Isolierte Tumorzellkerne
3.9 Laserfluoreszenzmikroskopie 40
3.9.1 Auswertung
4. Ergebnisse
4.1 Abbildungen zu verschiedenen Patientenparametern 43
4.2 Spezifitätsüberprfifung der PLAG - Sonden 45
4.3 Etablierung der Methode 46
4.4 Chromosomale Rearrangierungen im PLAG 1 - Gen von
Myoepitheliomen 47
4.4.1 Exemplarische Bilder der FISH an Myoepitheliomen
4.4.2 Ergebnisauswertung: Graphische Darstellungen
4.5 Chromosomale Rearrangierungen im PLAG 1 - Gen von
myoepithelialen Karzinomen 53
4.5.1 Exemplarische Bilder der FISH an myoepithelialen
Karzinomen
4.5.2 Ergebnisauswertung: Graphische Darstellungen
5. Diskussion 60
5.1 Ausblick
6. Zusammenfassung 67
7. Anhang
Tabellen 69
8. Literaturverzeichnis 75
9. Danksagung 80
Lebenslauf 81
Eidesstattliche Versicherung 82
4
|
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Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung
1.1 Myoepitheliale Tumoren 5
1.1.1 Myoepitheliome - Benigne myoepitheliale Tumoren 5
1.1.2 Myoepitheliale Karzinome -
Maligne myoepitheliale Tumoren 6
1.2 Markerprofil 7
1.2.1 Myoepitheliome 7
1.2.2 Myoepitheliale Karzinome 8
1.3 Cytogenetische Befunde myoepithelialer Tumoren 9
1.4 PLAG1 und seine Funktionen 10
1.5 Fragestellung der vorliegenden Arbeit 13
2. Material
2.1 Patientengut:Tabelle 1 14
2.2 Spezifität der PLAG- Sonden 19
2.3 Chemikalien, Reagenzien, Enzyme, Versuchslösungen, Geräte 21
3. Methoden
3.1 Fluoreszenz-/« situ -Hybridisierung 26
3.2 Probenvorbereitung Paraffinschnitte 26
3.3 Zellkernisolierung nach Hedley 26
3.4 Isolierungen von Plasmid - DNA 28
3.5 Quantifizierungen der Sonden - DNA 29
3.5.1 Gelelektrophoretische Quantifizierung
3.5.2 Photometrische Quantifizierung
3.6 Sondenmarkierung PLAG 233, PLAG 234, PLAG 235 31
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3.6.2 Biotin - Nick - Translation
3.7 Spezifitätskontrolle an Metaphasechromosomenpräparaten 33
3.7.1 Herstellung der Präparate
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3.7.2 Spezifitätskontrolle - Protokoll
3.8 FISH an Patientengut 37
3.8.1 Paraffinschnitte
3.8.2 Isolierte Tumorzellkerne
3.9 Laserfluoreszenzmikroskopie 40
3.9.1 Auswertung
4. Ergebnisse
4.1 Abbildungen zu verschiedenen Patientenparametern 43
4.2 Spezifitätsüberprfifung der PLAG - Sonden 45
4.3 Etablierung der Methode 46
4.4 Chromosomale Rearrangierungen im PLAG 1 - Gen von
Myoepitheliomen 47
4.4.1 Exemplarische Bilder der FISH an Myoepitheliomen
4.4.2 Ergebnisauswertung: Graphische Darstellungen
4.5 Chromosomale Rearrangierungen im PLAG 1 - Gen von
myoepithelialen Karzinomen 53
4.5.1 Exemplarische Bilder der FISH an myoepithelialen
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4.5.2 Ergebnisauswertung: Graphische Darstellungen
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5.1 Ausblick
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