Untersuchungen zur Expression der MUC/Y und MUC/Z-Spleißvarianten des Tumorantigens MUC1 in Normalgeweben und Karzinomen des Magens sowie des ösophagogastrischen Überganges:
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|---|---|
| adam_text | Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung 1
1.1. Das Maaenkarzinom 1
1.1.1. Epidemiologie 1
1.1.2. Atiologie 2
1.1.2.1. Genetische Disposition 2
1.1.2.2. Risikoerhöhung durch Erkrankungen 3
1.1.2.3. Umwelteinflüsse 4
1.1.3. Klassifikationen, Grading und Stadieneinteilung 5
1.1.3.1. Histologische Klassifikationen 5
1.1.3.2. Makroskopische Klassifikationen 8
1.1.3.3. TIMM- Klassifikation 11
1.1.3.4. Grading 14
1.1.3.5. Stadieneinteilung 14
1.1.4. Therapie 16
1.1.5. Prognose 17
1.2. Adenokarzinome am ösophaqoqastrischen Übergang 19
1.2.1. Allgemeines zu den Schwierigkeiten einer einheitlichen Klassifikation 19
1.2.1.1. Klassifikation für Adenokarzinome am ösophagogastrischen
Übergang nach Stein und Siewert 19
1.2.2. Epidemiologie 21
1.2.3 Atiologie 21
1.2.4. Klassifikationen 23
1.2.4.1. Histopathologische Klassifikationen 23
1.2.4.2. TNM- Klassifikation 24
1.2.5. Therapie 26
1.2.6. Prognose 28
1.3. Muzine 30
1.3.1. Was sind Muzine? 30
1.3.2. Molekulare Struktur der Muzine 30
Inhaltsverzeichnis
1.3.3. Tumorbiologische Relevanz der Muzine im gastrointestinalen Bereich 35
1.3.4. MUC1 38
1.3.4.1. Tumorbiologische Bedeutung von MUC1 im Magenkarzinom 40
1.3.5. MUC1- Spleißvarianten 44
1.3.6. MUC1/Y 47
1.3.7. MUC1/Z 50
1.4. Fragestellung der Arbeit 51
2. Material und Methoden 52
2.1. Gewebeproben und Patientengut 52
2.2. Methoden 55
2.2.1. RNA-Extraktion 56
2.2.1.I.Integrität der Gesamt- RNA 58
2.2.2. cDNA- Synthese mit dem RT- for- PCR- Kit 59
2.2.3. PCR 60
2.2.3.1. Zur Methode 60
2.2.3.2. Durchführung 61
2.2.4. Agarose- Gelelektrophorese 63
2.2.4.1. Zur Methode 63
2.2.4.2. Herstellung eines 1,7%igen Agarosegels 63
2.2.4.3. Durchführung 64
2.2.5. DNA- Sequenzierung 64
2.2.5.1. Zur Methode 64
2.2.5.2. Durchführung 65
2.2.6. Quantitative real time RT- PCR 66
2.2.6.1. Zur Methode 66
2.2.6.2. Durchführung 69
2.2.7. Statistische Auswertung 71
3. Ergebnisse 73
Inhaltsverzeichnis
3.1. PCR zur Amplifikation MUC1/Y- bzw. MUC1/Z- spezifischer Sequenzen
mit anschließender Aaarose- Gelelektrophorese 73
3.2. Quantitative real time RT- PCR zur Amplifikation
der Spleißvariante MUC1/Y 75
4. Diskussion 80
5. Zusammenfassung 88
6. Literaturverzeichnis 91
7. Lebenslauf 106
|
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Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung 1
1.1. Das Maaenkarzinom 1
1.1.1. Epidemiologie 1
1.1.2. Atiologie 2
1.1.2.1. Genetische Disposition 2
1.1.2.2. Risikoerhöhung durch Erkrankungen 3
1.1.2.3. Umwelteinflüsse 4
1.1.3. Klassifikationen, Grading und Stadieneinteilung 5
1.1.3.1. Histologische Klassifikationen 5
1.1.3.2. Makroskopische Klassifikationen 8
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1.1.3.4. Grading 14
1.1.3.5. Stadieneinteilung 14
1.1.4. Therapie 16
1.1.5. Prognose 17
1.2. Adenokarzinome am ösophaqoqastrischen Übergang 19
1.2.1. Allgemeines zu den Schwierigkeiten einer einheitlichen Klassifikation 19
1.2.1.1. Klassifikation für Adenokarzinome am ösophagogastrischen
Übergang nach Stein und Siewert 19
1.2.2. Epidemiologie 21
1.2.3 Atiologie 21
1.2.4. Klassifikationen 23
1.2.4.1. Histopathologische Klassifikationen 23
1.2.4.2. TNM- Klassifikation 24
1.2.5. Therapie 26
1.2.6. Prognose 28
1.3. Muzine 30
1.3.1. Was sind Muzine? 30
1.3.2. Molekulare Struktur der Muzine 30
Inhaltsverzeichnis
1.3.3. Tumorbiologische Relevanz der Muzine im gastrointestinalen Bereich 35
1.3.4. MUC1 38
1.3.4.1. Tumorbiologische Bedeutung von MUC1 im Magenkarzinom 40
1.3.5. MUC1- Spleißvarianten 44
1.3.6. MUC1/Y 47
1.3.7. MUC1/Z 50
1.4. Fragestellung der Arbeit 51
2. Material und Methoden 52
2.1. Gewebeproben und Patientengut 52
2.2. Methoden 55
2.2.1. RNA-Extraktion 56
2.2.1.I.Integrität der Gesamt- RNA 58
2.2.2. cDNA- Synthese mit dem RT- for- PCR- Kit 59
2.2.3. PCR 60
2.2.3.1. Zur Methode 60
2.2.3.2. Durchführung 61
2.2.4. Agarose- Gelelektrophorese 63
2.2.4.1. Zur Methode 63
2.2.4.2. Herstellung eines 1,7%igen Agarosegels 63
2.2.4.3. Durchführung 64
2.2.5. DNA- Sequenzierung 64
2.2.5.1. Zur Methode 64
2.2.5.2. Durchführung 65
2.2.6. Quantitative real time RT- PCR 66
2.2.6.1. Zur Methode 66
2.2.6.2. Durchführung 69
2.2.7. Statistische Auswertung 71
3. Ergebnisse 73
Inhaltsverzeichnis
3.1. PCR zur Amplifikation MUC1/Y- bzw. MUC1/Z- spezifischer Sequenzen
mit anschließender Aaarose- Gelelektrophorese 73
3.2. Quantitative real time RT- PCR zur Amplifikation
der Spleißvariante MUC1/Y 75
4. Diskussion 80
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