Clusteranalysen von Stadium-III-Neuroblastomen vor dem Hintergrund des prädiktiven Ansprechens von Chemotherapeutika:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2008
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| Beschreibung: | 105 S. Ill., graph. Darst. 21 cm |
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|---|---|
| adam_text | Inhaltsverzeichnis
1. EINLEITUNG 1
1.1. Das Neuroblastom 1
1.2. Methoden zur Multigenanalyse 12
2. MATERIAL UND METHODEN 15
2.1. RNA-Isolierung 15
2.2. Northern-BIot : 20
2.3. cDNA- Synthese 25
2.4.RT-PCR 28
2.5. Überblick über die Microarray-Technik 31
2.6. Der „ 96er-Chip zur Etablierung der cDNA-Microarray-Vnit 32
2.7. Der Chip mit 4608 Genen zur Clusteranalyse 34
2.8. Hybridisierung der fluoreszenzmarkierten Proben und anseht.. Waschschritte. ..34
2.9. Der Scanner/Bearbeitung der eingescannten Bilder. 35
2.10. Clusteranalysen 41
3. FRAGESTELLUNG 45
4. ERGEBNISSE 46
4.1. Etablierung einer cDNA-Microarray-Unit 46
4.1.1. Gewinnung von DNA-freier RNA aus Zellen 46
4.1.2. Gewinnung von homogenem Tumormaterials 47
4.1.3. Gewinnung von cDNA aus RNA 49
4.1.4. Alle Gene an jeder Stelle vorhanden? 53
4.1.5. Ausgangsmenge mRNA zur Gewinnung von cDNA 54
4.1.6. Erstellung von Tumor-Gen-Expressions-Profilen 57
4.1.7. Die Validierung 59
4.1.8. cDNA wird direkt aus Total-RNA hergestellt 59
4.1.9. Ausgangsmenge RNA zur Gewinnung von cDNA 61
4.1.10. Reliabilität 63
4.1.11. Das Scannen 66
4.1.12. interne Kontrollen 70
4.2. Clusteranalysen von Stadium-III-Neuroblastomen 71
4.2.1. Versuchsanordnung 72
4.2.2. Ergebnis 74
5. DISKUSSION 75
6. ZUSAMMENFASSUNG 78
7. ABKÜRZUNGSVERZEICHNIS 80
8. LITERATURANGABEN 82
9. AKADEMISCHE LEHRER 103
10. DANKSAGUNG 104
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Inhaltsverzeichnis
1. EINLEITUNG 1
1.1. Das Neuroblastom 1
1.2. Methoden zur Multigenanalyse 12
2. MATERIAL UND METHODEN 15
2.1. RNA-Isolierung 15
2.2. Northern-BIot : 20
2.3. cDNA- Synthese 25
2.4.RT-PCR 28
2.5. Überblick über die Microarray-Technik 31
2.6. Der „ 96er-Chip " zur Etablierung der cDNA-Microarray-Vnit 32
2.7. Der Chip mit 4608 Genen zur Clusteranalyse 34
2.8. Hybridisierung der fluoreszenzmarkierten Proben und anseht. Waschschritte. .34
2.9. Der Scanner/Bearbeitung der eingescannten Bilder. 35
2.10. Clusteranalysen 41
3. FRAGESTELLUNG 45
4. ERGEBNISSE 46
4.1. Etablierung einer cDNA-Microarray-Unit 46
4.1.1. Gewinnung von DNA-freier RNA aus Zellen 46
4.1.2. Gewinnung von homogenem Tumormaterials 47
4.1.3. Gewinnung von cDNA aus RNA 49
4.1.4. Alle Gene an jeder Stelle vorhanden? 53
4.1.5. Ausgangsmenge mRNA zur Gewinnung von cDNA 54
4.1.6. Erstellung von Tumor-Gen-Expressions-Profilen 57
4.1.7. Die Validierung 59
4.1.8. cDNA wird direkt aus Total-RNA hergestellt 59
4.1.9. Ausgangsmenge RNA zur Gewinnung von cDNA 61
4.1.10. Reliabilität 63
4.1.11. Das Scannen 66
4.1.12. interne Kontrollen 70
4.2. Clusteranalysen von Stadium-III-Neuroblastomen 71
4.2.1. Versuchsanordnung 72
4.2.2. Ergebnis 74
5. DISKUSSION 75
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