Aberrante Methylierung des RARB2-Promotors als Tumormarker für die molekularzytologische Diagnostik des Lungenkarzinoms an Bronchialaspiraten:
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2007
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adam_text | Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis 1
1. Einleitung 4
1.1 Das Lungenkarzinom 4
1.1.1 Diagnostik von Lungenkarzinomen 6
1.1.2 Problematik der Diagnosestellung 8
1.1.3 Molekularbiologische Veränderungen des Lungenkarzinoms 9
1.2 DNA-Methylierung 10
1.3 DNA-Methylierung und die Entstehung von Lungentumoren 12
1.4 Biomarker zur Lungenkrebsdiagnostik 13
1.4.1 Mutationen als Biomarker 14
1.4.2 Chromosomenaberrationen als Biomarker 15
1.4.3 Aberrante Promotor-Methylierung als Biomarker 15
1.5 RARB2 16
1.6 Ziel der Arbeit 16
2. Material und Methoden 18
2.1 Studien-Kollektiv 18
2.2 Bronchialaspirate 20
2.2.1 Vorbehandlung und Aufarbeitung der Bronchialaspirate für die
zytologische Diagnostik 20
2.3 Humane Zelllinien und ihre Kultivierung 21
2.4 Chemikalien 21
2.5 Färbungen, Lösungen und Puffer 22
2.5.1 Färbungen 22
2.5.2 Lösung für die Bisulfitkonversion 22
2.5.3 Lösungen für Elektrophoresen 22
2.6 Molekularbiologische Kits 23
2.7 Enzyme 23
2.8 Geräte und Apparaturen 23
2.9 Oligonukleotide 23
2.10 Isolierung von Nukleinsäuren 24
2.11 Quantifizierung und Qualitätskontrolle der Nukleinsäurelösung 25
1
Inhaltsverzeichnis
2.12 Methylierung der DNA mit 5^7-Methylase 25
2.13 DNA-Bisulfitkonversion 25
2.14 Ethanolfällung der DNA 27
2.15 Quantitative Methylierungs-spezifische PCR (QMSP) 27
2.16 DNA-Agarosegelelektrophorese 30
2.17 Statistische Auswertung 31
3. Ergebnisse 32
3.1 Quantifizierung der Tumorzellen 32
3.2 i?A/?jB2-Promotor-Hypermethylierung in Bronchialaspiraten 32
3.2.1 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten in Bezug auf histologische
Subtypen 32
3.2.2 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten verschiedender
diagnostischer Gruppen 33
3.2.3 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten in Bezug auf histologische
Subtypen und Tumorzellzahl 35
3.2.4 Methylierungslevel der /?A/?jB2-Hypermethylierung 37
3.3 Diskriminierung zwischen benigner und maligner Lungenerkrankung 39
3.3.1 Sensitivität und Spezifität der aberranten RARB2-Methylierung als
Biomarker 39
3.3.2 /?A/?ß2-Hypermethylierung unter Berücksichtigung des Cut offs 30 in
Abhängigkeit vom histologischen Subtyp 39
3.3.3 /?A/?ß2-Hypermethylierung unter Berücksichtigung des Cut offs 30 in
Abhängigkeit von der zytologischen Diagnosegruppe 40
3.4 Klinisch-pathologische Korrelation 41
3.4.1 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Geschlecht 41
3.4.2 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Alter 42
3.4.3 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Rauchhabitus 43
3.4.4 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Tumorstadium 44
3.5 Mehrfacheinsendungen 46
4. Diskussion 50
4.1 Aberrante Promotor-Methylierung als molekularbiologischer Tumormarker
für die Lungenkarzinom-Diagnostik 50
4.1.1 RARB2 50
4.1.2 DNA-Hypermethylierung von Genen in Tumoren 52
2
Inhaltsverzeichnis
4.1.3 Promotor-Methylierung in Untersuchungsmaterial der pulmonalen
Exfoliativzytologie 53
4.1.4 Aberrante Hypermethylierung des ÄA/?ß2-Promotors 54
4.1.5 Einsatz der i?A/?52-Promotor-Hypermethylierung als molekularer
Biomarker für die Diagnostik des Lungenkarzinoms 57
4.1.6 Diagnostischer Zugewinn 59
4.1.7 Klinisch-pathologische Korrelation 59
4.2 Ausblick 61
4.3 Therapiemöglichkeiten 63
5. Zusammenfassung 65
6. Literaturverzeichnis 66
7. Abkürzungen 82
8. Danksagung 84
9. Lebenslauf 85
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Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis 1
1. Einleitung 4
1.1 Das Lungenkarzinom 4
1.1.1 Diagnostik von Lungenkarzinomen 6
1.1.2 Problematik der Diagnosestellung 8
1.1.3 Molekularbiologische Veränderungen des Lungenkarzinoms 9
1.2 DNA-Methylierung 10
1.3 DNA-Methylierung und die Entstehung von Lungentumoren 12
1.4 Biomarker zur Lungenkrebsdiagnostik 13
1.4.1 Mutationen als Biomarker 14
1.4.2 Chromosomenaberrationen als Biomarker 15
1.4.3 Aberrante Promotor-Methylierung als Biomarker 15
1.5 RARB2 16
1.6 Ziel der Arbeit 16
2. Material und Methoden 18
2.1 Studien-Kollektiv 18
2.2 Bronchialaspirate 20
2.2.1 Vorbehandlung und Aufarbeitung der Bronchialaspirate für die
zytologische Diagnostik 20
2.3 Humane Zelllinien und ihre Kultivierung 21
2.4 Chemikalien 21
2.5 Färbungen, Lösungen und Puffer 22
2.5.1 Färbungen 22
2.5.2 Lösung für die Bisulfitkonversion 22
2.5.3 Lösungen für Elektrophoresen 22
2.6 Molekularbiologische Kits 23
2.7 Enzyme 23
2.8 Geräte und Apparaturen 23
2.9 Oligonukleotide 23
2.10 Isolierung von Nukleinsäuren 24
2.11 Quantifizierung und Qualitätskontrolle der Nukleinsäurelösung 25
1
Inhaltsverzeichnis
2.12 Methylierung der DNA mit 5^7-Methylase 25
2.13 DNA-Bisulfitkonversion 25
2.14 Ethanolfällung der DNA 27
2.15 Quantitative Methylierungs-spezifische PCR (QMSP) 27
2.16 DNA-Agarosegelelektrophorese 30
2.17 Statistische Auswertung 31
3. Ergebnisse 32
3.1 Quantifizierung der Tumorzellen 32
3.2 i?A/?jB2-Promotor-Hypermethylierung in Bronchialaspiraten 32
3.2.1 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten in Bezug auf histologische
Subtypen 32
3.2.2 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten verschiedender
diagnostischer Gruppen 33
3.2.3 Methylierungsfrequenz in Bronchialaspiraten in Bezug auf histologische
Subtypen und Tumorzellzahl 35
3.2.4 Methylierungslevel der /?A/?jB2-Hypermethylierung 37
3.3 Diskriminierung zwischen benigner und maligner Lungenerkrankung 39
3.3.1 Sensitivität und Spezifität der aberranten RARB2-Methylierung als
Biomarker 39
3.3.2 /?A/?ß2-Hypermethylierung unter Berücksichtigung des Cut offs 30 in
Abhängigkeit vom histologischen Subtyp 39
3.3.3 /?A/?ß2-Hypermethylierung unter Berücksichtigung des Cut offs 30 in
Abhängigkeit von der zytologischen Diagnosegruppe 40
3.4 Klinisch-pathologische Korrelation 41
3.4.1 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Geschlecht 41
3.4.2 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Alter 42
3.4.3 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Rauchhabitus 43
3.4.4 Methylierungsfrequenz in Abhängigkeit vom Tumorstadium 44
3.5 Mehrfacheinsendungen 46
4. Diskussion 50
4.1 Aberrante Promotor-Methylierung als molekularbiologischer Tumormarker
für die Lungenkarzinom-Diagnostik 50
4.1.1 RARB2 50
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2
Inhaltsverzeichnis
4.1.3 Promotor-Methylierung in Untersuchungsmaterial der pulmonalen
Exfoliativzytologie 53
4.1.4 Aberrante Hypermethylierung des ÄA/?ß2-Promotors 54
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4.2 Ausblick 61
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