Charakterisierung des Integrin-assoziiertes Protein-(IAP-)Gen: Aufklärung der Exon-Intron-Struktur
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
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2003
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I
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS I
VERZEICHNIS DER VERWENDETEN ABKUERZUNGEN III
1 EINLEITUNG 1
1.1 INTEGRIN-ASSOZIIERTES PROTEIN 1
1.1.1 AUFBAU DES IAP 1
1.1.2 SPLEISSVARIANTEN 1
1.1.3 VORKOMMEN UND FUNKTION IN VERSCHIEDENEN GEWEBEN 2
1.1.4 PHYSIKALISCHE KARTIERUNG 4
1.2 ZIEL DIESER ARBEIT 5
2 MATERIAL UND METHODEN 6
2.1 I SOLIERUNG VON P
YY
: A 6
2.1.1 ANZUCHT VON
F SCHERICHIA COLI 6
2.1.2 COSMID-DNA-ISOLIERUNG AUS
E. COLI 6
2.2 AUFTRENNUNG VON DNA 6
2.2.1 AUFTRENNUNG VON DNA IM AGAROSEGEL 7
2.2.2 AUFTRENNUNG VON DNA IN POLYACRYLAMIDGELEN 7
2.3 AMPLIFIKATION VON DNA MITTELS POLYMERASEKETTENREAKTION (PCR) 8
2.3.1 OLIGONUCLEOTIDSYNTHESE 9
2.3.2 PCR-PROTOKOLL 9
2.3.3 AUFREINIGEN DER PCR-PRODUKTE 12
2.4 ERMITTLUNG DER EXON-INTRON-GRENZEN MITTELS
"LONG-DISTANCE-SEQUENCER"-METHODE 12
2.4.1 HERSTELLEN DER VEKTORETTE 14
2.4.2 RESTRIKTION VON COSMID-DNA 14
2.4.3 LIGATION 14
2.5 DNA-SEQUENZIERUNG 15
3
ERGEBNISSE
16
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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II
INHALTSVERZEICHNIS
3.1 EXON-LNTRON-STRUKTUR DES IAP-GENS 16
3.2 EXON-INTRON-GRENZBEREICH 21
3.3 SPLEISSVARIANTEN DES IAP 21
4 DISKUSSION 23
4.1 EXON-LNTRON-STRUKTUR DES IAP-GENS 23
4.2 VERGLEICH MIT ANDEREN SPEZIES 24
4.3 EXON-LNTRON-STRUKTUR UND PROTEINSTRUKTUR 26
4.4 ALTERNATIVE SPLEISSVARIANTEN 28
4.5 SPLEISSSTELLENSEQUENZEN UND KRYPTISCHE SPLEISSSTELLEN 30
4.6 AUSBLICK 32
5 ZUSAMMENFASSUNG 34
6 LITERATURVERZEI UNIS 36
7 ANHANG 42
7.1 AMINOSAEURESEQUENZ IAP FORM 4 (IUPAC-CODE) 42
7.2 CDNA IAP (KOMPLEMENTAER ZUR PRAEMATUREN MRNA) 42
7.3 IAP FORM 4: AMINOSAEURESEQUENZ UND CDNA-SEQUENZ 43
7.4 IUPAC-CODE 44 |
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