Isolierung und Analyse haploider Ustilago-maydis-Stämme, die ein b-abhängiges Expressionsmuster zeigen:
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Sprache: | German |
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2002
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INHALTSVERZEICHNIS
Z
USAMMENFASSUNG
.
I
A
BKUERZUNGEN
UND
F
ACHBEGRIFFE
.
II
1.
E
INLEITUNG
.
1
1.1.
USTILAGO
MAYDIS
.
1
1.2.
KONTROLLE
DER
ENTWICKLUNG
VON
UMAYDIS
.
3
1.3.
DERB-LOCUS
.
7
1.4.
STRUKTUR
UND
FUNKTION
VON
HOMEODOMAENENPROTEINEN
.
7
1.5.
DIE
REGULATION
B-ABHAENGIGER
GENE
.
10
1.6.
DIE
FRAGESTELLUNG
DER
VORGELEGTEN
ARBEIT
.
13
2.
E
RGEBNISSE
.
14
2.1.
DIE
HERSTELLUNG
VON
STAEMMEN,
DIE
IN
IHRER
B-ABHAENGIGEN
ENTWICKLUNG
BETROFFEN
SIND
.
14
2.1.1.
VERSUCHE
ZUR
ERZEUGUNG
RTFL
-AEHNLICHER
STAEMME
.
14
2.1.1.1.
DIE
WIRTSPFLANZE
MAIS
ALS
DIREKTES
SELEKTIONSSYSTEM
FUER
PATHOGENE
UMAYDIS
STAEMME
.
14
2.1.1.2.
DIE
ENTWICKLUNG
EINES
REMI-MUTAGENESESYSTEM
ZUR
AKTIVIERUNG
UND
INAKTIVIERUNG
VON
GENEN
.
15
2.1.2.
DIE
ISOLIERUNG
UND
KLASSIFIZIERUNG
VON
MUTANTEN
MIT
EG-AKTIVITAET
.
18
2.1.2.1.
DIE
HERSTELLUNG
UND
ISOLIERUNG
DER
MRN-1
STAEMME
.
18
2.1.2.2.
DIE
PATHOGENE
ENTWICKLUNG
DER
MRN-1
STAEMME
.
18
2.1.2.3.
DIE
KOLONIEMORPHOLOGIE
DER
MRN-1
STAEMME
.
19
2.1.2.4.
DIE
MRN-1
STAEMME
IM
KREUZUNGSTEST
.
20
2.I.2.5.
DAS
EXPRESSIONSPROFIL
VON
B-ABHAENGIGEN
GENEN
IN
STAEMMEN
MIT
EG-AKTIVITAET
.
21
2.2.
DIE
HISTONDEACETYLASE
HDAL
.
24
2.2.1.
DIE
CHARAKTERISIERUNG
DER
UV-INDUZIERTEN
MUTATION
IN
MR9-1
.
24
2.2.1.1.
DIE
KOMPLEMENTATION
VON
MR9-1
.
24
2.2.1.2.
DIE
IDENTIFIKATION
VON
HDAL
.
25
2.2.2.
DIE
ANALYSE
VON
HDAL
.
29
2.2.2.1.
DIE
HERSTELLUNG
VON
TSHDAL
-STAEMMEN
.
29
2.2.2.2.
DIE
MAZ-ABHAENGIGE,
DIFFERENTIELLE
GENEXPRESSION
.
31
2.2.2.3.
DIE
KONTROLLE
DER
TRANSKRIPTION
VON
HDAL
.
35
2.2.2.4.
DIE
PATHOGENE
ENTWICKLUNG
VON
AMAZ-STAEMMEN
.
36
2.3.
DIE
KONTROLLE
DES
MAZ-ABHAENGIGEN
GENS
EGLL
DURCH
MODIFIKATION
VON
CHROMATIN
.
40
2.3.1.
DIE
ZUGAENGLICHKEIT
VON
CHROMATIN
DER
REGULATORISCHEN
REGION
DES
AEDAZ-ABHAENGIGEN
GENS
EGLL
.
40
2.3.2.
DIE
ACETYLIERUNG
VON
HISTON
H3
IN
DER
REGULATORISCHEN
REGION
DES
BCFAZ-ABHAENGIGEN
GENS
EGLL
.
42
2.4.
UNTERSUCHUNGEN
ZUR
MOEGLICHEN
INTERAKTION
VON
HDAL
MIT
RUML
.
45
2.4.1.
HDAL
UND
RUML
IM
ZWEI-HYBRID
SYSTEM
.
45
2.4.2.
DIE
ANALYSE
DER
MOEGLICHEN
INTERAKTION
VON
HDAL
UND
RUML
DURCH
COIMMUNPRAEZIPITATION
.
46
2.5.
DER
HDAL
-KOMPLEX
.
49
INHALTSVERZEICHNIS
3.
D
ISKUSSION
52
3.1.
DER
REMT"
1
'
OFF
-MUTAGENESEANSATZ
.
52
3.2.
DER
UV-MUTAGENESEANSATZ
ZUR
ISOLIERUNG
VON
HAPLOIDEN
STAEMMEN
MIT
EG-AKTIVITAET
.
54
3.3.
HDAL
ZEIGT
HOMOLOGIE
ZU
KLASSE
(I)
HISTONDEACETYLASEN
.
56
3.4.
HDAL
BETRIFFT
DIE
CHROMATINSTRUKTUR
UND
DEN
ACETYLIERUNGSSTATUS
VON
HISTON
H3.
57
3.5.
DER
HDAL-KOMPLEX
.
59
3.6.
GENREGULATION
DURCH
HDAL
.
61
3.7.
TSHDAL
-STAEMME
BILDEN
TUMORE,
DIE
KEINE
REIFEN
TELIOSPOREN
ENTHALTEN
.
66
3.8.
WEITERE
HISTONDEACETYLASEN
IN
UMAYDIS
UND
ANDEREN
PHYTOPATHOGENEN
PILZEN
.
67
4.
M
ATERIAL
UND
M
ETHODEN
.
70
4.1.
CHEMIKALIEN
UND
ENZYME
.
70
4.2.
SONSTIGE
MATERIALIEN
.
70
4.3.
STAEMME
.
70
4.4.
PLASMIDE
UND
PLASMIDKONSTRUKTIONEN
.
73
4.4.1.
ALLGEMEINE
VEKTOREN
.
73
4.4.2.
DNA-BIBLIOTHEKEN
FUER
U.MAYDIS
.
75
4.4.3.
GENOMISCHE
SUBKLONE
VON
HDAL
.
75
4.4.4.
CDNA
SUBKLONE
VON
HDAL
.
76
4.4.5. KONSTRUKTE
ZUR
HOMOLOGEN
INTEGRATION
IN
DEN
WA/-LOCUS
.
76
4.4.6.
FUSIONSKONSTRUKTE
.
77
4.5.
OLIGONUKLEOTIDE
.
78
4.6.
ANTIKOERPER
.
80
4.7. MIKROBIOLOGISCHE
UND
GENETISCHE
METHODEN
.
80
4.7.1.
KULTIVIERUNGSBEDINGUNGEN
.
80
4.7.2.
TRANSFORMATION
VON
E.COLI
.
80
4.7.3.
TRANSFORMATION
VON
U.MAYDIS
.
81
4.7.4.
TRANSFORMATION
VON S.CEREVISIAE
.
82
4.7.5. BESTIMMUNG
DER
SS-GALAKTOSIDASE
AKTIVITAET
VON
HEFESTAEMMEN
.
82
4.7.5.1.
DER
LACZ
FILTERTEST
.
.
'
.
82
4.7.5.2.
DER
LACZ
FLUESSIGTEST
.
82
4.7.6.
INFEKTION
UND
AMPLIFIKATION
VON
XGTLO-PHAGEN
IN
E.COLI
.
83
4.7.7.
KOMPATIBILITAETSTEST
UND
FILAMENTOESES
WACHSTUM
.
83
4.7.8.
PATHOGENITAETSTEST
.
83
4.7.9.
SPORENANALYSE
.
84
4.8.
MOLEKULARBIOLOGISCHE
STANDARDTECHNIKEN
.
84
4.8.1.
ISOLIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
.
84
4.8.1.1.
PLASMID-PRAEPARATION
AUS
E.COLI
.
84
4.8.1.2. PRAEPARATION
VON
X-DNA
.
85
4.8.I.3.
PRAEPARATION
VON
CHROMOSOMALER
DNA
AUS
U.MAYDIS
.
85
4.8.1.4.
RNA-ISOLIERUNG
AUS
ZELLEN
NACH
WACHSTUM
AUF
AGARPLATTEN
.
85
4.8.1.5. RNA-ISOLIERUNG
AUS
TUMOR
UND
PFLANZENGEWEBE
.
86
4.8.1.6.
RNA-ISOLIERUNG
AUS
ZELLEN
NACH
WACHSTUM
IN
FLUESSIGKULTUR
.
86
4.8.2.
IMMOBILISIERUNG
UND
ANALYSE
VON
NUKLEINSAEUREN
.
86
4.8.2.I.
SOUTHERN-BLOT
.
86
4.8.2.2.
DURCHMUSTERUNG
EINER
PHAGENBANK
.
87
4.8.2.3.
NORTHERN-BLOT
.
87
4.8.2.4. EXPRESSIONSANALYSE
MIT
DOT-BLOT-HYBRIDISIERUNG
.
88
4.8.2.5.
GENSONDEN
.
88
4.8.2.OE.
RADIOAKTIVE
MARKIERUNG
VON
DNA-FRAGMENTEN
.
89
INHALTSVERZEICHNIS
4.8.3.
PCR
.
89
4.8.3.1.
STANDARD-PCR
.
89
4.8.3.2.
GANZ-ZELL-PCR
.
89
4.8.3.3.
QUANTITATIVE
PCR
.
90
4.8.4.
CDNA-SYNTHESE
.
90
4.8.5.
SEQUENZIERUNG
VON
DNA
.
91
4.9.
NACHWEIS
VON
CELLULASE-AKTIVITAET
AUF
FESTMEDIEN
(CMC-TEST)
.
91
4.10.
ISOLIERUNG
DES
MAL-GENS
.
91
4.10.1.
UV-MUTAGENESE
.
91
4.10.2.
SCREEN
NACH
MUTANTEN
MIT
CELLULASE-AKTIVITAET
.
92
4.10.3.
KOMPLEMENTATION
MIT
EINER
FREI
REPLIZIERENDEN
PCM54
BANK,
DIE
GENOMISCHE
DNA-FRAGMENTE
TRAEGT
.
92
4.10.4.
ISOLIERUNG
VON
HDAL
CDNA-KLONEN
.
92
4.10.5.
SEQUENZIERUNG
DES
HDAL
-LOCUS
.
92
4.11.
MIKROSKOPIE
.
93
4.12.
MNASEL-ANALYSE
DER
CHROMATINSTRUKTUR
.
93
4.13.
BIOCHEMISCHE
METHODEN
.
94
4.13.1.
ISOLIERUNG
VON
GESAMTPROTEIN
AUS
U.
MAYDIS
.
94
4.13.2.
SDS-POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
VON
PROTEINEN
.
94
4.13.3.
TRANSFER
UND
NACHWEIS
VON
PROTEINEN
AUF
MEMBRANEN
(WESTERN
BLOT)
.
95
4.13.4.
IMMUNPRAEZIPITATION
VON
PROTEINEN
AUS
U.MAYDIS
.
95
4.13.5.
IN VIVO
VERNETZUNG
UND
ANALYSE
COIMMUNPRAEZIPITIERTER
DNA
.
96
4.13.6.
GELFILTRATION
VON
PROTEINEN
.
97
5.
L
ITERATURVERZEICHNIS
.
98
6.
A
NHANG
.
116
6.1.
LEBENSLAUF
.
116
6.2
DANKSAGUNG
.
117
6.3.
VEROEFFENTLICHUNGSLISTE
.
117 |
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