Angewandte Bioinformatik: eine Einführung ; mit 6 Tabellen sowie Übungen und Lösungen
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Berlin [u.a.]
Springer
2004
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adam_text | P. M. SELZER * R. J. MARHOEFER * A. ROHWER ANGEWANDTE BIOINFORMATIK EINE
EINFUEHRUNG MIT 51 ABBILDUNGEN, 6 TABELLEN SOWIE UEBUNGEN UND LOESUNGEN
SPRINGER INHALTSVERZEICHNIS 1 COMPUTER, BETRIEBSSYSTEME UND INTERNET 1
1.1 COMPUTER UND BETRIEBSSYSTEME 1 1.2 INTERNET UND WWW 5 1.3 DIE
PHYSIKALISCHE ANBINDUNG AN DAS INTERNET 6 1.4 DIE LOGISCHE ANBINDUNG AN
DAS INTERNET 9 1.5 INTERNET-SERVICES 11 1.5.1 EMAIL 11 1.5.2 NEWS 13
1.5.3 FTP 15 1.5.4 WORLD WIDE WEB 20 1.6 DIE BENUTZUNG VON UNIX 23 1.7
UEBUNGEN 29 1.8 WWW-VERWEISE 31 1.9 LITERATUR 31 2 DIE BIOLOGISCHEN
GRUNDLAGEN DER BIOINFORMATIK .. 33 2.1 NUKLEINSAEUREN UND PROTEINE 33 2.2
AUFBAU DER NUKLEINSAEUREN DNA UND RNA 33 2.3 DIE SPEICHERUNG DER
GENETISCHEN INFORMATION .... 35 2.4 AUFBAU DER PROTEINE 39 2.4.1
PRIMAERSTRUKTUR 39 2.4.2 SEKUNDAERSTRUKTUR 41 2.4.3 TERTIAER- UND
QUARTAERSTRUKTUR 44 2.5 UEBUNGEN 45 JI INHALTSVERZEICHNIS 2.6 WWW-VERWEISE
46 2.7 LITERATUR 46 3 BIOLOGISCHE DATENBANKEN 47 3.1 BIOLOGISCHES WISSEN
WIRD IN GLOBALEN DATENBANKEN GESPEICHERT 47 3.2 PRIMAERE DATENBANKEN 49
3.2.1 NUKLEOTID-SEQUENZDATENBANKEN 49 3.2.2 PROTEIN-SEQUENZDATENBANKEN
56 3.3 SEKUNDAERE DATENBANKEN 59 3.3.1 PROSITE 59 3.3.2 PRINTS 62 3.3.3
PFAM 62 3.3.4 INTERPRO 63 3.3.5 SCOP 64 3.3.6 CATH 64 3.4 UEBUNGEN 66 3.5
WWW-VERWEISE 69 3.6 LITERATUR 69 4 SEQUENZVERGLEICHE UND SEQUENZBASIERTE
DATENBANKSUCHEN 71 4.1 PAARWEISE UND MULTIPLE SEQUENZVERGLEICHE 71 4.2
DATENBANKSUCHEN MIT NUKLEOTID- UND PROTEINSEQUENZEN 76 4.2.1 WICHTIGE
ALGORITHMEN ZUR DATENBANKSUCHE 81 4.3 SOFTWARE ZUR SEQUENZANALYSE 82 4.4
UEBUNGEN 84 4.5 WWW-VERWEISE 88 4.6 LITERATUR 88 INHALTSVERZEICHNIS XIII
5 DIE ENTSCHLUESSELUNG EUKARYOTISCHER GENOME 91 5.1 DIE SEQUENZIERUNG
KOMPLETTER GENOME 91 5.1.1 DIE CHARAKTERISIERUNG VON GENOMEN MIT STS-
UND EST-SEQUENZEN 92 5.1.2 GENETISCHE URSACHEN FUER INDIVIDUELLE
UNTERSCHIEDE 106 5.2 UEBUNGEN 112 5.3 WWW-VERWEISE 115 5.4 LITERATUR 116
6 PROTEINSTRUKTUREN UND STRUCTURE- BASED-RATIONAL-DRUG-DESIGN 117 6.1
PROTEINAUFBAU 117 6.2 SIGNALPEPTIDE 118 6.3 TRANSMEMBRANPROTEINE 122 6.4
PROTEINSTRUKTURANALYSEN 123 6.4.1 PROTEINMODELLIERUNG 124 6.4.2 DIE
BESTIMMUNG VON PROTEINSTRUKTUREN IM HOCHDURCHSATZVERFAHREN 125 6.5
STRUCTURE-BASED-RATIONAL-DRUG-DESIGN 127 6.5.1 EIN BEISPIEL FUER DOCKING
128 6.5.2 ERFOLGE DES STRUCTURE-BASED-RATIONAL- DRUG-DESIGNS 131 6.6
UEBUNGEN 133 6.7 WWW-VERWEISE 135 6.8 LITERATUR 135 7 DIE FUNKTIONELLE
ANALYSE VON GENOMEN 137 7.1 DIE IDENTIFIZIERUNG DER ZELLULAEREN
FUNKTIONEN VON GENPRODUKTEN 137 7.1.1 DNA-MICROARRAYS 138 7.1.2 SERIAL
ANALYSIS OF GENE EXPRESSION 150 7.1.3 PROTEOMICS 151 7.2 UEBUNGEN 161 XIV
INHALTSVERZEICHNIS 7.3 WWW-VERWEISE 165 7.4 LITERATUR 166 8
VERGLEICHENDE GENOMANALYSEN 167 8.1 DAS ZEITALTER DER GENOMSEQUENZIERUNG
167 8.2 WIRKSTOFFFORSCHUNG AM ZIELPROTEIN 168 8.3 VERGLEICHENDE
GENOMANALYSEN GEBEN AUFSCHLUSS UEBER DIE BIOLOGIE VON ORGANISMEN 171
8.3.1 DIE GENOMSTRUKTUR 172 8.3.2 KODIERENDE REGIONEN 174 8.3.3
NICHT-KODIERENDE REGIONEN 175 8.4 VERGLEICHENDE STOFFWECHSELANALYSEN 175
8.4.1 KYOTO ENCYDOPEDIA OF GENES AND GENOMES 179 8.5 GRUPPEN ORTHOLOGER
PROTEINE 182 8.6 UEBUNGEN 185 8.7 WWW-VERWEISE 187 8.8 LITERATUR 188
LOESUNGEN ZU DEN UEBUNGEN 189 GLOSSAR 239 SACHVERZEICHNIS 271
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