Molekulare Differenzierung von Mykobakterien:
Gespeichert in:
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Veröffentlicht: |
2001
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INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
.
1
2
MATERIAL
UND
METHODEN
.
6
2.1
MATERIAL
.
6
2.1.1
LABOREINRICHTUNGEN
UND
GERAETE
.
6
2.1.2
CHEMIKALIEN
UND
VERBRAUCHSMATERIALIEN
.
6
2.1.3
ENZYME
.
7
2.1.4
SYNTHETISCHE
OLIGONUKLEOTIDE
.
7
2.1.5
NAEHRMEDIEN
.
8
2.1.6
BAKTERIENSTAEMME
.
9
2.1.7
SOFTWARE
.
9
2.2
METHODEN
.
13
2.2.1
KONVENTIONELLE
METHODEN
.
13
2.2.1.1
ANZUCHT
VON
MYKOBAKTERIEN
.
13
2.2.1.2
ZIEHL-NEELSEN-FAERBUNG
.
13
2.2.2
MOLEKULARBIOLOGISCHE
METHODEN
.
13
2.2.2.1
DNA-EXTRAKTION,
16S-RDNA-UND
ITS-PCR
UND
SEQUENZIERUNG
.
13
2.2.2.1.1
DNA-EXTRAKTION
.
13
2.2.2.1
.2
5
'
-16S-RDNA
PCR
.
14
2.2.2.1.3
YYINTERNAL
TRANSCRIBED
SPACER*
REGION
(ITS)
PCR
.
14
2.2.2.1.4
SUBKLONIERUNG
VON
PCR-PRODUKTEN
.
15
2.2.2.1
.5
AUTOMATISIERTE
SEQUENZIERUNG
MIT
ABI
PRISMYY
377
SEQUENCER
.
16
2.22.2
GYRASEB-GEN-,
INSERTIONSELEMENT-PCRS
UND
RFLP-ANALYSEN
.
17
2.2.2.2.1
M.
TUBERCULOSIS
COMPLEX
GYRB
PCR
.
17
2.2.2.2.2
M.
TUBERCULOSIS
GYRB
PCR
.
17
2.2.2.2.3
M.
TUBERCULOSIS COMPLEX
GYRB
PCR
RSAL
UND
SADL
VERDAU
.
18
2.2.2.2A
M.
BOVIS
BCG
RD1
MULTIPLEX
PCR
.
18
2.2.2.2.OE
M.
ULCERANS
IS
2404
PCR
.
19
2.2.2.2.6
M.
AVIUM
SSP
PARATUBERCULOSIS
IS
900
PCR
.
19
2.2.3
AUSWERTUNG
DER
SEQUENZDATEN
.
20
2.2.4
GENBANK-SEQUENZEVALUIERUNG
.
20
2.2.5
DATENSAMMLUNG
FUER
DAS
RIDOM-PROJEKT
.
21
2.2.6
LITERATURRECHERCHE
.
22
3
ERGEBNISSE.
23
3.1
VERGLEICHENDE
SEQUENZANALYSE
.
23
3.1.1
ANALYSE
DER
5
'
-16S-RDNA
.
23
3.1.2
ANALYSE
DER
YYINTERNAL
TRANSCRIBED
SPACER"
REGION
(ITS)
.
27
3.1.3
GENBANK-SEQUENZEVALUIERUNG
.
.
.
29
3.2
GYRASESS-GEN-,
INSERTIONSELEMENT-RCRS
UND
RFLP-ANALYSEN
.
30
3.2.1
M.
TUBERCULOSIS
COMPLEX
GYRB
PCR
.
30
3.2.2
M.
TUBERCULOSIS
GYRB
PCR
.
31
3.2.3
M.
TUBERCULOSIS
COMPLEX
GYRB
PCR
RSAL
UND
SACL)
VERDAU
.
32
3.2.4
M.
BOVIS
BCG
RD1
MULTIPLEX
PCR
.
32
3.2.5
M.
ULCERANS
IS
2404
PCR
.
34
3.2.6
M.
AVIUM
SSP.
PARATUBERCULOSIS
IS
900
PCR
.
34
4
DISKUSSION
.
36
5
ZUSAMMENFASSUNG
.
51
6
LITERATURVERZEICHNIS.
52
7
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
.
60
8
INDEX
.
62 |
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