Spektroskopische Strukturanalytik synthetischer Polypeptide:
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| Veröffentlicht: |
2002
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INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG 1
2 AUFBAU UND STRUKTUR DER PROTEINE 5
2.1 DIE BAUSTEINE DER PROTEINE. 5
2.2 SEKUNDAERSTRUKTURELEMENTE. 7
2.2.1 HELIX- UND FALTBLATTSTRUKTUREN . 10
2.2.2 /5-SCHLEIFE. 12
2.2.3 RANDOM COI/-KONFORMATION . 12
2.2.4 CIS-TRANS-ISOMERASEN. 12
2.3 VORHERSAGEN VON SEKUNDAERSTRUKTUREN . . I. 14
3 GRUNDLAGEN DER SPEKTROSKOPISCHEN EXPERIMENTE 21
3.1 CIRCULAR-DICHROISMUS. 21
3.2 RAMAN-SPEKTROSKOPIE . 25
3.2.1 MIKRO-RAMAN-SPEKTROSKOPIE . 27
3.2.2 FT-RAMAN-SPEKTROSKOPIE. 29
3.3 GRUNDLAGEN DER NMR-SPEKTROSKOPIE. 30
3.3.1 KERNSPIN, ENERGIEQUANTELUNG UND RESONANZBEDINGUNG. 31
3.3.2 GLEICHGEWICHTSMAGNETISIERUNG. 33
3.3.3 BLOCH-GLEICHUNGEN UND RELAXATIONSPROZESSE. 36
3.3.4 CHEMISCHE VERSCHIEBUNG UND SPIN-SPIN-KOPPLUNG . 38
3.3.5 AUFBAU DES NMR-SPEKTROMETERS . 40
3.4 STRUKTURUNTERSUCHUNGEN AN PROTEINEN UND POLYPEPTIDEN . 41
3.4.1 EXTRAZELLULAERE SCHLEIFE DES GNRH-REZEPTORS. 41
3.4.2 ALANIN-PROLIN-POLYPEPTIDE. 46
3.4.3 HELIKALE MODELLPEPTIDE. 48
4 MATERIALIEN UND METHODEN 51
4.1 EINGESETZTE CHEMIKALIEN UND PUFFERLOESUNGEN. 51
4.2 FESTPHASENPEPTIDSYNTHESE . 53
4.3 AUFREINIGEN DER PROBEN. 55
4.4 PROBENVERIFIZIERUNG MIT MASSENSPEKTROMETRIE. 55
L
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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11
INHALTSVERZEICHNIS
4.5 ABSORPTIONSMESSUNGEN. 57
5 RESULTATE UND DISKUSSION 59
5.1 EXTRAZELLULAERE SCHLEIFE DES GNRH-REZEPTORS. 59
5.1.1 VORBEMERKUNGEN UND MOTIVATION. 59
5.1.2 ECL3-PEPTID DES GNRH-REZEPTORS. 61
5.1.3 CD-SPEKTROSKOPIE AM ECL3-PEPTID . 63
5.1.4 MIKRO- UND FT-RAMAN-SPEKTROSKOPIE AM ECL3-PEPTID. 67
5.1.5 2D-NMR-SPEKTROSKOPIE. 74
5.1.6 STRUKTUR-FUNKTIONS-RELATIONEN AM GNRH-REZEPTOR . 76
5.1.7 MOLECULAR MODELING EXPERIMENT. 79
5.1.8 ZUSAMMENFASSUNG UND DISKUSSION. 80
5.2 ALANIN-PROLIN-POLYPEPTIDE. 82
5.2.1 PROBENAUFBEREITUNG MIT HPLC. 84
5.2.2 STRUKTURANALYSE MIT CD-SPEKTROSKOPIE. 85
5.2.3 VORBEMERKUNGEN ZUR RAMAN-SPEKTROSKOPIE AN GELOESTEN UND AN FE
STEN PROBEN. 86
5.2.4 RAMAN-SPEKTROSKOPIE AN POLYPEPTIDLOESUNGEN. 89
5.2.5 RAMAN-SPEKTROSKOPIE AM FESTSTOFF. 96
5.2.6 BEDINGUNGEN DER QUANTITATIVEN KONFORMATIONSANALYSE. 98
5.2.7 SPEKTRENAUSWERTUNG.102
5.2.8 ERGEBNISSE DER KONFORMATIONSANALYSE.106
5.2.9 STRUKTURAUFKLAERUNG MIT ^-NMR-SPEKTROSKOPIE.110
5.2.10 ZUSAMMENFASSENDE BETRACHTUNG DER ERGEBNISSE.124
5.3 HELIKALE MODELLPEPTIDE.126
5.3.1 VORBEREITENDE ANALYSEN MIT MS UND HPLC.'. . . 128
5.3.2 CD-SPEKTROSKOPIE AN MODELLPEPTIDEN.129
5.3.3 AUSWERTUNGEN DER MIKRO-RAMAN-SPEKTROSKOPIE.130
5.3.4 ERGEBNISSE DER 2D-NMR-SPEKTROSKOPIE.132
5.3.5 QUANTITATIVE KONFORMATIONSANALYSE.134
5.3.6 MOLECULAR MODELING EXPERIMENT.139
5.3.7 SEKUNDAERSTRUKTURVORHERSAGEN.141
5.3.8 SEKUNDAERSTRUKTURUNTERSUCHUNGEN AN ALANIN-PROLIN- UND HELIKALEN
MODELLPEPTIDEN IM VERGLEICH.144
6 ZUSAMMENFASSUNG 147
SUMMARY 151
LITERATURVERZEICHNIS 155
ABKUERZUNGEN UND SYMBOLE
169
INHALTSVERZEICHNIS
UI
ANHANG
175
PUBLIKATIONSVERZEICHNIS
DANKSAGUNG
LEBENSLAUF
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