Entwicklung einer gruppenspezifischen Polymerasekettenreaktion zum Nachweis von Helicobacter-Spezies:
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2001
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INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 6
1. EINLEITUNG G
1.1. DAS GENUS
HELICOBACTER 8
1.1.1. HISTORISCHER UEBERBLICK 8
1.1.2. HELICOBACTER-ASSOZIIERTE ERKRANKUNGEN BEIM MENSCHEN 8
A)
HELICOBACTER PYLORI 8
B) NON-PYLORI
HELICOBACTER SPECIES 9
1.1.3. GENETISCHE UND TAXONOMISCHE CHARAKTERISTIKA~~
DER GATTUNG
HELICOBACTER 11
1.2. DAS 16S-RRNA-GEN BEI PROKARYONTEN 12
1.3. ZIEL DER EIGENEN ARBEIT 13
2. MATERIAL UND METHODIK 14
2.1. 16S-RRNA-SEQUENZVERGLEICH 14
2.2. OLIGONUKLEOTIDSYNTHESE 14
2.3. BAKTERIENSTAEMME 15
2.4. DNA-PRAEPARATION AUS DEN ATCC-BAKTERIENSTAEMMEN 17
2.5. DNA-KONZENTRATIONSBESTIMMUNG 17
2.6. POLYMERASEKETTENREAKTION 17
2.6.1. UNIVERSELLE 16S-RRNA-PCR , 17
2.6.2. GRUPPENSPEZIFISCHE PCR 19
2.6.3. SENSITIVITAET DER GRUPPENSPEZIFISCHEN PCR 20
2.7. AGAROSEGELELEKTROPHORESE 20
3. ERGEBNISSE 22
3.1. EIN PHYLOGENETISCHER STAMMBAUM DES GENUS
HELICOBACTER 22
3.2. ERGEBNISSE DER SEQUENZANALYSEN 26
3.3. TESTORGANISMEN 28
4
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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3.4. AUSSCHLUSS VON PCR-HEMMSTOFFEN
DURCH ANWENDUNG EINER UNIVERSELLEN PCR 30
3.5. NACHWEIS VON
HELICOBACTER SPECIES MITTELS PCR YYHELI" 30
3.5.1. OPTIMIERUNG DER PCR-BEDINGUNGEN 30
3.5.2. EVALUATION DER SPEZIFITAET 31
3.5.3. EVALUATION DER SENSITIVITAET 35
4. DISKUSSION 36
4.1. DIE POLYMERASEKETTENREAKTION IM VERGLEICH
ZU DEN GAENGIGEN MIKROBIELLEN NACHWEISMETHODEN 36
4.1.1. DIE KLASSISCHEN MIKROBIELLEN NACHWEISMETHODEN 36
4.1.2. WEITERE METHODEN ZUM NACHWEIS VON
HELICOBACTER PYLORI 38
4.2. DIE GRUPPENSPEZIFISCHE PCR YYHELI" IM VERGLEICH ZU
ANDEREN PCR-VERFAHREN ZUM NACHWEIS VON
HELICOBACTER SPECIES 38
4.2.1. SPEZIFITAET DER GRUPPENSPEZIFISCHEN PCR 39
4.2.2. SENSITIVITAET DER GRUPPENSPEZIFISCHEN PCR 40
4.2.3. SPEZIESIDENTIFIKATION DURCH SEQUENZIERUNG DES PCR-PRODUKTES 41
4.3. E
INSATZ DER GRUPPENSPEZIFISCHEN PCR ALS SCREENINGMETHODE FUER
HELICOBACTER SPECIES
IN MENSCHLICHEM DARMGEWEBE 42
5. ZUSAMMENFASSUNG 45
I
6. LITERATURVERZEICHNIS 47
DANKSAGUNGEN 58
5 |
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