Genstruktur und Genfluss in ausgewählten Populationen der Tüpfelhyäne (Crocuta crocuta):
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Würzburg [u.a.]
Dt. Wiss.-Verl.
2002
|
| Ausgabe: | 1. Aufl. |
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Zugl.: Berlin, Freie Univ., Diss., 2001 |
| Beschreibung: | 152 S. Ill., graph. Darst., Kt. |
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INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
UND
LITERATURUEBERSICHT
.
1
1.1
DAS
VERHALTEN
UND
SEIN
EINFLUSS
AUF
DIE
GENETISCHE
STRUKTUR
INNERHALB
EINES
CLANS
.
1
1.2
GENETISCHE
ANALYSE
DER
POPULATIONS-STRUKTUR
IN
DER
SERENGETI
UND
ANGRENZENDEN GEBIETEN
5
1.3
PHYLOGENIE
DER
HYAENIDAE
UNTER
BESONDERER
BERUECKSICHTIGUNG
DER
SERENGETI-POPULATION
VON
CROCUTA
CROCUTA
.
10
1.4
DIE
GENETIK
ALS
HILFSMITTEL
FUER
ARTENSCHUTZ
UND
ZOOMANAGEMENT
DER
TUEPFELHYAENE
.
12
1.5
GENETISCHE
GRUNDLAGEN
.
13
2
MATERIAL
UND
METHODEN
.
19
2.1
UNTERSUCHUNGSGEBIET
UND
PROBENHISTORIE
.
19
2.2
PROBENGEWINNUNG
UND
MATERIAL
.
19
2.3
ANGEWANDTE
GENETISCHE
ARBEITSMETHODEN
.
20
2.3.1
DNA-EXTRAKTION
.
20
2.3.1.1
PHENOL-CHLOROFORM-ISOAMYL-METHODE
.
20
2.3.1.2
DNA-EXTRAKTION
AUS
GEWEBE
UND
BLUT
MITTELS
EINES
KITS
DER
FINNA
QIAGEN
.
2
1
2.3.1.3
DNA-EXTRAKTION
MIT
CHELEX
(SIGMA)
AUS
HAAREN
.
21
2.3.2
GEL-ELEKTROPHORESE
.
21
2.3.3
AUFBEWAHRUNG
.
21
2.3.4
PRIMERDESIGN
.
22
2.3.5
PCR
UND
ANSCHLIESSENDE
AUFREINIGUNG
.
25
2.3.5.1
PCR
.
25
2.3.5.2
KONTAMINATIONSPROPHYLAXE
.
26
2.3.5.3
PROOF-READING
.
27
2.3.5.4
AUFREINIGUNG
DER
FRAGMENTE
.
27
2.3.6
DNA-SEQUENZIERUNG
.
27
2.3.7
KLONIERUNG
.
29
2.3.7.1
LIGATION
.
29
2.3.7.2
TRANSFORMATION
.
30
2.3.7.3
SELEKTION
DER
BAKTERIEN-KOLONIEN
.
30
2.3.8
RESTRIKTIONSANALYSE
.
31
2.4
COMPUTERGESTUETZTE
ANALYSE
DER
DATEN
.
32
2.4.1
ALIGNMENT
.
32
2.4.2
DISTANZ-ERRECHNUNG
.
33
2.4.2.1
P-DISTANZ
.
33
2.4.2.2
JUKES-CANTOR
(JC)
(JUKES
&
CANTOR
1969)
.
33
2.4.2.3
TAJIMA-NEI
(TAJ1MA
&
N
EI
1984)
.
33
2.4.2.4
KIMURA
'
S
2
(
K2P)
(KIMURA
1980)
.
34
2.4.2.5
HASEGAWA,
KISHINO
AND
YANO
1985
(HKY85)
(HASEGAWAET
AL.
1985)
.
34
2.4.3
AUSWAHL
DER
AUSSENGRUPPEN
.
35
2.4.4
ERMITTLUNG
VON
LANGEN
AESTEN
(LONG-BRANCHES)
.
36
2.4.5
GRAPHISCHE
DARSTELLUNG
DER
PHYLOGENETISCHEN
ZUSAMMENHAENGE
.
37
2.4.5.1
STAMMBAEUME
.
37
2.4.5.1.1
NEIGHBOUR
JOINING
(NJ)
(S
AITOUE
&
N
EI
1987)
.
37
2.4.5.1.2
MAXIMUM
PARSIMONY
(MP)
(CAVALLI-SFORZA
&
EDWARDS
1966)
.
38
2.4.5.1.3
MAXIMUM
LIKELIHOOD
(ML,
FELSENSTEIN
1981)
.
38
2.4.5.1.4
QUARTET
PUZZELING-ANALYSE
(S
TRIMMER
&
VAN
H
AESELER
1996)
.
38
2.4.5.2
GOODNESS
OF
FIT-STATISTIK
.
39
2.4.5.2.1
CONSISTENCY-INDEX
(K
LUGE
&
FERRIS
1969)
.
39
2.4.5.2.2
BOOTSTRAP-WERTE
(FELSENSTEIN
1985)
.
39
2.4.5.2.3
AUTO-DECAY-WERTE
(E
RIKSON
1988)
.
39
2.4.5.3
SPEKTRALANALYSE
(H
ENDY
&
PENNY
1993)
.
40
2.4.5.4
MEDIAN
JOINING
NETWORKS
(B
ANDELT
ET
AL.
1999,2000)
.
40
2.4.6
ANALYSE
DER
GENETISCHEN
STRUKTUR
EINER
POPULATION
.
40
2.5
LOESUNGEN:
.
42
3
ERGEBNISSE
.
43
3.1
CONTROL-REGION
.
43
3.1.1
STRUKTUR
DER
CONTROL-REGION
BEI
CROCUTA
CROCUTA
.
43
3.1.2
AUSWAHL
DES
ANALYSIERTEN
SEQUENZBEREICHS
.
52
3.1.3
KONTROLLE
DES
GEWAEHLTEN
SEQUENZBEREICHS
.
53
3.1.4
ERMITTELTE
HAPLOTYPEN
.
55
3.1.5
ANALYSEN
INNERHALB
EINES
CLANS
.
58
3.1.6
ANALYSE
ALLER
PROBEN
.
59
3.1.6.1
ANALYSE
DER
VERSCHIEDENEN
CLANS
.
59
3.1.6.2
ANALYSE
DER
Z-PROBEN
.
60
3.1.6.3
ANALYSE
DER
IMMIGRIERTEN
MAENNCHEN
.
61
3.1.7
ANALYSE
DER
POPULATION
MIT
AMOVA
.
62
3.1.8
ZUSAMMENFASSUNG
ERGEBNISSE
CONTROL-REGION
.
64
3.2
CYTOCHROM
B
.
65
3.2.1
PHYLOGENETISCHE
ANALYSE
DER
FAMILIE
HYAENIDAE
(VOLLSTAENDIGES
CYTOCHROM
B)
.
65
3.2.1.1
AUSWAHL
DER
AUSSENGRUPPE
.
65
3.2.1.2
GRUNDINFORMATIONEN
UEBER
DEN
ANALYSIERTEN
BEREICH
.
66
3.2.1.3
STAMMBAEUME
.
73
3.2.1.3.1
ANALYSEMETHODE
YYNEIGHBOUR
JOINING
"
(NJ)
.
73
3.2.1.3.2
ANALYSEMETHODE
YYMAXIMUM
PARSIMONY
"
(MP)
.
74
3.2.1.3.3
ANALYSEMETHODE
YYMAXIMUM
LIKELIHOOD
"
(ML)
.
75
3.2.1.4
ANALYSE-METHODE
SPEKTRAL-ANALYSE
.
76
3.2.2
ZUSAMMENFASSUNG
CYTOCHROM
B
(PHYLOGENIE
DER
HYAENIDAE)
.
77
3.2.3
PHYLOGEOGRAPHIE
DER
GATTUNG
CROCUTA
(CYTOCHROM
B
UND
CONTROL-REGION)
.
78
3.2.3.1
EINLEITENDE
UNTERSUCHUNGEN
.
78
3.2.3.2
STAMMBAUMANALYSEN
.
82
3.2.3.2.1
ANALYSEMETHODE
YYNEIGHBOUR
JOINING
"
(NJ)
.
82
3.23.2.2
ANALYSEMETHODE
YYMAXIMUM
PARSIMONY
"
(MP)
.
83
3.23.2.3
ANALYSEMETHODE
YYSPEKTRALANALYSE
"
.
84
3.2.3.2.4
ANALYSEMETHODE
YYPHYLOGENETISCHE
NETZWERKE
"
.
85
3.2.4
ZUSAMMENFASSUNG
PHYLOGEOGRAPHIE
GATTUNG CROCUTA
.
88
II
4
DISKUSSION
.
89
4.1
DIE
GENETISCHE
STRUKTUR
INNERHALB
EINES
CLANS
.
89
4.1.1
ENTSTEHUNG
EINES
HAPLOTYPS
.
89
4.1.2
AUSBREITUNG
EINES
HAPLOTYPS
IN
EINEM
CLAN
.
90
4.1.3
GENETISCHER
AUSTAUSCH
.
91
4.2
POPULATIONS-STRUKTUR
IN
DER
SERENGETI
UND
ANGRENZENDEN
GEBIETEN
.
92
4.2.1
HYPOTHESEN
FUER
DIE URSACHEN
DER
GENETISCHEN
VERARMUNG
IM
MITOCHONDRIALEN
GENOM
BEI
CROCUTA
CROCUTA
IN
DEN NORDTANSANISCHEN
POPULATIONEN
.
92
4.2.2
HYPOTHESEN
ZUR
ENTSTEHUNG
DER
GENETISCH
SIGNIFIKANTEN
EINHEITEN
.
96
4.3
PHYLOGENIE
DER
HYAENIDAE
.
98
4.3.1
PHYLOGENIE
DER
FAMILIE
HYAENIDAE
.
98
4.3.2
PHYLOGEOGRAPHIE
DER
GATTUNG
CROCUTA
.
99
4.4
DIE
GENETIK
IM
ZOOMANAGEMENT
.
103
4.4.1
DERZEITIGER
STATUS
DER
ART
CROCUTA
CROCUTA
.
103
4.4.2
UNTERSUCHUNG
DER
DEUTSCHEN
ZOOTIERE
.
103
5
ZUSAMMENFASSUNG
.
105
5.1
DIE
GENETISCHE
STRUKTUR
INNERHALB
EINES
CLANS
.
105
5.2
POPULATIONS-STRUKTUR
IN
DER
SERENGETI
UND ANGRENZENDEN
GEBIETEN
.
105
5.3
PHYLOGENIE
DER
HYAENIDAE
.
105
5.4
DIE
GENETIK
IM
ZOOMANAGEMENT
.
106
6
SUMMARY
.
107
6.1
PECULIARITIES
OF
THE
GENETIC
STRUCTURE
IN
MEMBERS
OF
HYAENA-CLANS
FTOM
NORTH
TANZANIA.
107
6.2
POPULATION
STRUCTURES
IN
HYAENAS
OF
THE
SERENGETI
AND
ADJACENT
TERRITORIES
.
107
6.3
PHYLOGENY
OFRECENT
HYAENIDAE
.
108
6.4
USE
OF
GENETICS
IN
ZOO
MANAGEMENT
.
108
7
DANKSAGUNG
.
109
8
LITERATURVERZEICHNIS
.
111
9
VERZEICHNIS
DER
BILDER
UND
TABELLEN
.
129
9.1
BILDER
.
129
9.2
TABELLEN
.
132
10
ANHANG
.
135
LEBENSLAUF
.
157
SELBSTAENDIGKEITSERKLAERUNG
.
159
III |
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