Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2000
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Frankfurt (Main), Univ., Diss., 2001 |
| Beschreibung: | 171 S. Ill., graph. Darst. : 30 cm |
Internformat
MARC
| LEADER | 00000nam a2200000 c 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | BV013853910 | ||
| 003 | DE-604 | ||
| 007 | t | ||
| 008 | 010731s2000 gw ad|| m||| 00||| ger d | ||
| 016 | 7 | |a 961691492 |2 DE-101 | |
| 035 | |a (OCoLC)248226420 | ||
| 035 | |a (DE-599)BVBBV013853910 | ||
| 040 | |a DE-604 |b ger |e rakddb | ||
| 041 | 0 | |a ger | |
| 044 | |a gw |c DE | ||
| 049 | |a DE-355 | ||
| 100 | 1 | |a Rappsilber, Juri |d 1971- |e Verfasser |0 (DE-588)122956117 |4 aut | |
| 245 | 1 | 0 | |a Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie |c vorgelegt von Juri Rappsilber |
| 264 | 1 | |c 2000 | |
| 300 | |a 171 S. |b Ill., graph. Darst. : 30 cm | ||
| 336 | |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |b nc |2 rdacarrier | ||
| 500 | |a Frankfurt (Main), Univ., Diss., 2001 | ||
| 650 | 4 | |a Multienzymkomplex - Proteomanalyse | |
| 650 | 0 | 7 | |a Multienzymkomplex |0 (DE-588)4170709-6 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 650 | 0 | 7 | |a Proteomanalyse |0 (DE-588)4596545-6 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 655 | 7 | |0 (DE-588)4113937-9 |a Hochschulschrift |2 gnd-content | |
| 689 | 0 | 0 | |a Multienzymkomplex |0 (DE-588)4170709-6 |D s |
| 689 | 0 | 1 | |a Proteomanalyse |0 (DE-588)4596545-6 |D s |
| 689 | 0 | |5 DE-604 | |
| 856 | 4 | 2 | |m DNB Datenaustausch |q application/pdf |u http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009476183&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |3 Inhaltsverzeichnis |
| 943 | 1 | |a oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009476183 | |
Datensatz im Suchindex
| _version_ | 1812460819271647232 |
|---|---|
| adam_text |
INHALTSVERZEICHNIS
1 MASSENSPEKTROMETRIE - VON DER GENOMFORSCHUNG ZUR
PROTEOMFORSCHUNG.9
1.1 DIE ZELLE . 9
1.2 DAS GENOM.11
1.3 DAS TRANSKRIPTOM.12
1.4 DAS PROTEOM.13
1.4.1 EXPRESSIONS-PROTEOMANALYSE
.14
1.4.2 INTERAKTIONS-PROTEOMANALYSE
.17
1.5 DREI WERKZEUGE DER PROTEOMFORSCHUNG. 19
1.5.1 MASSENSPEKTROMETRIE
.19
1.5.1.1 TECHNISCHER HINTERGRUND.20
1.5.1.2 SEQUENZDATENBANKEN.28
1.5.1.3 MODIFIKATIONEN.38
1.5.2 BIOINFORMATIK.
.40
1.5.3 MOLEKULARBIOLOGIE.
.42
1.5.3.1 ZELLULAERE LOKALISIERUNG.42
1.5.3.2 REINIGUNG DER DIREKTEN INTERAKTIONSPARTNER.45
1.5.3.3 FUNKTIONELLE CHARAKTERISIERUNG.46
1.5.4 ALTERNATIVEN ZUM PA GE-MASSENSPEKTROMETRIE-ANSATZ DER
PROTEOMANALYSE.^.46
1.6 EINORDNUNG UND ZUSAMMENFASSUNG DER DISSERTATION.48
2 INTELLIGENTE PEPTIDANALYSE ZUR CHARAKTERISIERUNG VON
PROTEINEN.51
2.1 PROTEINIDENTIFIKATION MITTELS MASSENSPEKTROMETRIE.51
2.1.1 WAS BEDEUTET YYDIE IDENTIFIZIERUNG" EINES PROTEINS?
.'.51
2.2
CAF1 -BINDENDE PROTEINE ALS BEISPIEL MASSENSPEKTROMETRISCHER
IDENTIFIKATION. 52
2.2.1 ALLGEMEINER ABLAUF.
.53
2.2.2 IDENTIFIKATION DURCH MALDI-TOF-MASSENSPEKTROMETRIE.55
2.2.3 IDENTIFIKATION MIT NANOES-TANDEM-MASSENSPEKTROMETRIE.58
2.3 NACHTEILE DER TRENNUNG VON EXPERIMENT UND AUSWERTUNG.60
2.4 DAS KONZEPT DER INTELLIGENTEN PEPTID AN ALYSE (TP A).61
3
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/961691492
2.5
ANWENDUNG DER INTELLIGENTEN PEPTIDANALYSE
(IPA).63
2.5.1 ANALYSE VON PROTEINGEMISCHEN MIT IPA
.65
2.5.2 IPA UND SEQUENZISOFORMEN.67
2.5.3 IPA UND POSTTRANSLATIONALE MODIFIKATIONEN
.69
2.5.4 BESTAETIGUNG UND ERWEITERUNG VON ESTS DURCH IPA
.70
2.5.5 GENOMDATENBANK UND IPA.71
2.5.6 BESTAETIGUNG VON EXONS
.71
2.5.7 SCHLUESSELPEPTIDE DURCH GENVORHERSAGE
.73
2.6 DATENBANKAUSWAHL.76
2.6.1 VERGLEICH DER DBEST MIT DER GENOMDATENBANK
.76
2.6.2 VIER EFFIZIENZKRITERIEN FUER DIE DATENBANKSUCHE.77
2.6.2.1 ERFOLGSRATE.78
2.6.2.2 SELEKTIVITAET.79
2.6.2.3 SEQUENZLAENGE. 80
2.6.2.4 SUCHZEIT.81
2.6.3 ERGEBNIS DES DATENBANKVERGLEICHES.81
2.7
ZUSAMMENFASSUNG
.82
INTERAKTIONS-PROTEOMANALYSE - UNTERSUCHUNGEN AM
HUMANEN SPLEISSOSOM.85
3.1 EINFUEHRUNG.85
3.2 PHASE I: UNTERSUCHUNG DES SPLEIBOSOMS ALS BEISPIEL FUER
INTERAKTIONS-PROTEOMANALYSE.86
3.2.1 BIOLOGISCHE GRUNDLAGEN.86
3.2.1.1 AUFBAU DES SPLEISSOSOMS.86
3.2.1.2 BIOGENESE DER SNRNPS UND DIE ROLLE VON SMN1.88
3.2.2 ANALYSE DES SPLEISSOSOMS
.89
3.2.3 IDENTIFIZIERUNG BEKANNTER PROTEINE IM SPLEISSOSOM
.91
3.2.4 IDENTIFIZIERUNG BISHER UNBEKANNTER PROTEINE IM SPLEISSOSOM
.93
3.2.5 VERGLEICHENDE SEQUENZANALYSE
.94
3.2.5.1 SPF30 HAT SEQUENZAEHNLICHKEIT MIT SMN1.97
3.2.6 GPP-MARKIERUNG
.99
3.2.6.1 KEMLOKALISIERUNG VON SPF30.100
3.2.7 ZUSAMMENFASSUNG VON PHASE 1
.100
3.3 PHASE II: FOLGEUNTERSUCHUNG DER INTERAKTIONS-PROTEOMANALYSE
AM BEISPIEL VON SPF30.103
3.3.1 MOLEKULARBIOLOGISCHE UNTERSUCHUNG VON SPF30
.103
3.3.1.1 REAGENZIEN FUER DIE MOLEKULARBIOLOGISCHE UNTERSUCHUNG
VON SPF30.103
3.3.1.2 SPF30 IST EIN ESSENTIELLER SPLEISSFAKTOR.104
3.3.1.3 SPLEISSOSOMAUFBAU ENDET IN ABWESENHEIT VON SPF30
BEIM A-KOMPLEX.106
3.3.1.4 SPF30 IST NICHT NOTWENDIG FUER DIE EXISTENZ DES TRI-SNRNP
.107
3.3.1.5 SPF30 INTERAGIERT MIT DEM TRI-SNRNP UND DEM
U2-SNRNP.107
3.3.1.6 GST-SFP30 INTERAGIERT MIT TRI-SNRNP-PROTEINEN.111
3.3.2 DISKUSSION DER BIOLOGISCHEN RELEVANZ.113
3.4 ZUSAMMENFASSUNG.118
4 INTERAKTIONS-PROTEOMANALYSE - UNTERSUCHUNGEN DER
QUARTAERSTRUKTUR VON KOMPLEXEN.121
4.1 HINTERGRUND.121
4.1.1 REINIGUNG EINES MULTIPROTEINKOMPLEXES
.123
4.1.2 QUERVEMETZUNG VON PROTEINEN
.123
4.1.3 IDENTIFIZIERUNG DER VERNETZTEN PROTEINE
.123
4.1.4 ENTWURF DES EXPERIMENTELLEN ANSATZES.124
4.2 REINIGUNG DES NUP84P-KOMPLEXES.125
4.3 CHEMISCHES VERNETZEN DER UNTEREINHEITEN DES NUP84P-
KOMPLEXES.128
4.4 ANALYSE DER VERNETZUNGSPRODUKTE.131
4.4.1 EFFIZIENZ DER VEMETZUNGSAGENZIEN
.131
4.4.2 ANALYSE DER VEMETZUNGSPRODUKTE MIT SPEZIFISCHEN ANTIKOERPERN 132
4.4.3 IDENTIFIKATION VON LYSIN-MODIFIZIERTEN PROTEINEN MITTELS
MASSENSPEKTROMETRIE.T. 132
4.4.4 ANALYSE DER VEMETZUNGSPRODUKTE OHNE A-PRIORI-KENNTNIS DER
PROTEINKOMPONENTEN.133
4.4.5 ANALYSE DER VEMETZUNGSPRODUKTE MIT A-PRIORI-KENNTNIS DER
PROTEINKOMPONENTEN.135
4.5 DAS VORGESCHLAGENE MODELL IM LICHT NEUER ERGEBNISSE.138
4.6 ZUSAMMENFASSUNG.139
5 ANHANG.143
5.1 MASSENSPEKTROMETRISCHE TECHNIKEN.143
5
5.1.1 VEMETZUNGSREAKTION
.143
5.1.2 IN-GEL- VERDAU DER PROTEINE
.144
5.1.3 PROBENVORBEREITUNG FIIR MALDI-MASSENSPEKTROMETRIE
.144
5.1.4 PEPTIDMASSENANALYSE MIT MALDI-TOF-MASSENSPEKTROMETRIE. 144
5.1.5 PROBENVORBEREITUNG FIIR ESI-MASSENSPEKTROMETRIE
.145
5.1.6 FRAGMENTIERUNGSANALYSE
.145
5.1.7 DATENBANKSUCHE MIT DEN MASSENSPEKTROMETRISCHEN INFORMATIONEN
.146
5.2
BIOINFORMATIK.147
5.2.1 DATENBANKSUCHE MIT SEQUENZEN UND MULTIPLE ALIGNMENTS
. 147
5.3 MOLEKULARBIOLOGISCHE TECHNIKEN.147
5.3.1 PRAEPARATION DES REHOMBINANTEN PROTEINS, DER ANTIKOERPER UND
EXTRAKTE.147
5.3.2 ZELLKULTUR UND TRANSFEKTIONSEXPERIMENTE.148
5.3.3 ZELLFAERBUNG UND IMMUNFLUORESZENZ
.148
5.3.4 IN-VITRO-SPLEISSREAKTION.149
5.3.5 AFFINITAETSREINIGUNG
.149
5.3.6 IN-VITRO-TRANSCRIPTION UND ANTISENSESONDEN
.150
5.3.7 SEDIMENTATION DER SNRNPS.150
5.3.8 REINIGUNG DES NUP84P-KOMPLEXES.151
5.4 LITERATURVERZEICHNIS.153
6 |
| any_adam_object | 1 |
| author | Rappsilber, Juri 1971- |
| author_GND | (DE-588)122956117 |
| author_facet | Rappsilber, Juri 1971- |
| author_role | aut |
| author_sort | Rappsilber, Juri 1971- |
| author_variant | j r jr |
| building | Verbundindex |
| bvnumber | BV013853910 |
| ctrlnum | (OCoLC)248226420 (DE-599)BVBBV013853910 |
| format | Book |
| fullrecord | <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><collection xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim"><record><leader>00000nam a2200000 c 4500</leader><controlfield tag="001">BV013853910</controlfield><controlfield tag="003">DE-604</controlfield><controlfield tag="007">t</controlfield><controlfield tag="008">010731s2000 gw ad|| m||| 00||| ger d</controlfield><datafield tag="016" ind1="7" ind2=" "><subfield code="a">961691492</subfield><subfield code="2">DE-101</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(OCoLC)248226420</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(DE-599)BVBBV013853910</subfield></datafield><datafield tag="040" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-604</subfield><subfield code="b">ger</subfield><subfield code="e">rakddb</subfield></datafield><datafield tag="041" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">ger</subfield></datafield><datafield tag="044" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">gw</subfield><subfield code="c">DE</subfield></datafield><datafield tag="049" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-355</subfield></datafield><datafield tag="100" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Rappsilber, Juri</subfield><subfield code="d">1971-</subfield><subfield code="e">Verfasser</subfield><subfield code="0">(DE-588)122956117</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="245" ind1="1" ind2="0"><subfield code="a">Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie</subfield><subfield code="c">vorgelegt von Juri Rappsilber</subfield></datafield><datafield tag="264" ind1=" " ind2="1"><subfield code="c">2000</subfield></datafield><datafield tag="300" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">171 S.</subfield><subfield code="b">Ill., graph. Darst. : 30 cm</subfield></datafield><datafield tag="336" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">txt</subfield><subfield code="2">rdacontent</subfield></datafield><datafield tag="337" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">n</subfield><subfield code="2">rdamedia</subfield></datafield><datafield tag="338" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">nc</subfield><subfield code="2">rdacarrier</subfield></datafield><datafield tag="500" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Frankfurt (Main), Univ., Diss., 2001</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1=" " ind2="4"><subfield code="a">Multienzymkomplex - Proteomanalyse</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Multienzymkomplex</subfield><subfield code="0">(DE-588)4170709-6</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Proteomanalyse</subfield><subfield code="0">(DE-588)4596545-6</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="655" ind1=" " ind2="7"><subfield code="0">(DE-588)4113937-9</subfield><subfield code="a">Hochschulschrift</subfield><subfield code="2">gnd-content</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="0"><subfield code="a">Multienzymkomplex</subfield><subfield code="0">(DE-588)4170709-6</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="1"><subfield code="a">Proteomanalyse</subfield><subfield code="0">(DE-588)4596545-6</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2=" "><subfield code="5">DE-604</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="2"><subfield code="m">DNB Datenaustausch</subfield><subfield code="q">application/pdf</subfield><subfield code="u">http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009476183&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA</subfield><subfield code="3">Inhaltsverzeichnis</subfield></datafield><datafield tag="943" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009476183</subfield></datafield></record></collection> |
| genre | (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content |
| genre_facet | Hochschulschrift |
| id | DE-604.BV013853910 |
| illustrated | Illustrated |
| indexdate | 2024-10-09T18:08:51Z |
| institution | BVB |
| language | German |
| oai_aleph_id | oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009476183 |
| oclc_num | 248226420 |
| open_access_boolean | |
| owner | DE-355 DE-BY-UBR |
| owner_facet | DE-355 DE-BY-UBR |
| physical | 171 S. Ill., graph. Darst. : 30 cm |
| publishDate | 2000 |
| publishDateSearch | 2000 |
| publishDateSort | 2000 |
| record_format | marc |
| spelling | Rappsilber, Juri 1971- Verfasser (DE-588)122956117 aut Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie vorgelegt von Juri Rappsilber 2000 171 S. Ill., graph. Darst. : 30 cm txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Frankfurt (Main), Univ., Diss., 2001 Multienzymkomplex - Proteomanalyse Multienzymkomplex (DE-588)4170709-6 gnd rswk-swf Proteomanalyse (DE-588)4596545-6 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Multienzymkomplex (DE-588)4170709-6 s Proteomanalyse (DE-588)4596545-6 s DE-604 DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009476183&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
| spellingShingle | Rappsilber, Juri 1971- Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie Multienzymkomplex - Proteomanalyse Multienzymkomplex (DE-588)4170709-6 gnd Proteomanalyse (DE-588)4596545-6 gnd |
| subject_GND | (DE-588)4170709-6 (DE-588)4596545-6 (DE-588)4113937-9 |
| title | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie |
| title_auth | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie |
| title_exact_search | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie |
| title_full | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie vorgelegt von Juri Rappsilber |
| title_fullStr | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie vorgelegt von Juri Rappsilber |
| title_full_unstemmed | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie vorgelegt von Juri Rappsilber |
| title_short | Proteomanalyse an Multiproteinkomplexen durch Massenspektrometrie, Bioinformatik und Molekularbiologie |
| title_sort | proteomanalyse an multiproteinkomplexen durch massenspektrometrie bioinformatik und molekularbiologie |
| topic | Multienzymkomplex - Proteomanalyse Multienzymkomplex (DE-588)4170709-6 gnd Proteomanalyse (DE-588)4596545-6 gnd |
| topic_facet | Multienzymkomplex - Proteomanalyse Multienzymkomplex Proteomanalyse Hochschulschrift |
| url | http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009476183&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |
| work_keys_str_mv | AT rappsilberjuri proteomanalyseanmultiproteinkomplexendurchmassenspektrometriebioinformatikundmolekularbiologie |