Struktur-Funktionsbeziehung von Lipasen: In-silico-Assays und Protein-Design
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2000
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INHALT
1 EINLEITUNG
1.1 ENZYME. 1
1.1.1 EINSATZ VON ENZYMEN 1
1.1.2 MODELLIERUNG VON ENZYMEN 1
1.1.3 SEQUENZ UND STRUKTUR 3
1.1.4 VORHERSAGEN 5
1.2 LIPASEN.6
1.2.1 ANWENDUNG 6
1.2.2 SUBSTRATE 7
1.2.3 STRUKTUR 10
1.2.4 MODELLIERUNG UND PROTEIN ENGINEERING 14
2 MODELLIERUNG VON STEREOSELEKTIVITAET UND PROTEIN DESIGN
2.1 ZIELSETZUNG.20
2.2 ENANTIOSELEKTIVITAET FUER SEKUNDAERE ALKOHOLE.21
2.2.1 AUSWAHL DER SUBSTRATE 21
2.2.2 STRUKTUR DER BINDUNGSTASCHE 23
2.2.3 BINDUNGSMODEN 24
2.2.4 KORRELATION VON D(HNE-O
AIC) MIT DER EXPERIMENTELL BESTIMMTEN
ENANTIOSELEKTIVITAET 26
2.2.5 GUELTIGKEIT DES MODELLS 28
2.2.6 LACTONE 29
2.3 STEREOSELEKTIVITAET FUER TRIACYLGLYCEROLE UND
SN-2 SUBSTITUIERTE ANALOGA.32
2.3.1
MUCORALES LIPASEN 33
2.3.2
CANDIDA RUGOSA LIPASE 37
2.3.3
CANDIDA ANTARCTICA LIPASE B 38
2.3.4
RHIZOPUS LIPASE-MUTANTEN 39
2.4 ENANTIOSELEKTIVITAET FUER PRIMAERE ALKOHOLE.41
2.4.1 VORHERSAGE DER ENANTIOPRAEFERENZ DURCH D O-C 41
2.4.2 MUTANTEN 43
2.4.3 MODELLIERUNG DER ENANTIOSELEKTIVITAET 47
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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3 DIE LIPASE ENGINEERING DATABASE - EINE INTEGRIERTE SEQUENZ- UND
STRUKTURDATENBANK
3.1 VON DATENSAMMLUNGEN ZU WISSEN.49
3.2 DATENBANK DESIGN.53
3.3 AUSWERTUNG DER DATENBANK.55
3.3.1 ANNOTATION DER KATALYTISCHEN TRIADE UND DES OXYANION HOLE 55
3.3.2 FORM UND EIGENSCHAFTEN DER SUBSTRATBINDUNGSSTELLE 56
3.3.3 KLASSIFIKATION DURCH KONSERVIERTE ELEMENTE 60
3.3.4 ANALYSE VON POLYMORPHISMEN 64
4 DISKUSSION UND AUSBLICK
4.1 ENERGIEMETHODEN.67
4.2
IN SILICO ASSAYS: VON QUALITATIVEM ZU QUANTITATIVEM MODELLING.68
4.3 SIND
IN SILICO ASSAYS VERALLGEMEINERBAR?.70
4.4
IN SILICO ASSAYS IM POST GENOMICS ZEITALTER.71
5 LITERATURVERZEICHNIS
72 |
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