Molekulare Evolution von Gruppe-I-Introns im Genom der Zygnematales und anderer Algen:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
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1999
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| adam_text | MOLEKULARE EVOLUTION VON GRUPPE-I-INTRONS IM GENOM DER ZYGNEMATALES UND
ANDERER ALGEN DISSERTATION ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES DER
MATHEMATISCH-NATURWISSENSCHAFTLICHEN FAKULTAETEN DER
GEORG-AUGUST-UNIVERSITAET ZU GOETTINGEN VORGELEGT VON ANJA BESENDAHL AUS
UELZEN GOETTINGEN 1999 INHALTSVERZEICHNIS 1 EINLEITUNG 1 2 THEORIE 3 2.1
GRUPPE-I-INTRONS : 3 2.2 SPLEISSEN UND DIE DAFUER BENOETIGTEN
STRUKTURELEMENTE DER GRUPPE-I-INTRONS 3 2.3 VERBREITUNGSMECHANISMEN VON
GRUPPE-I-INTRONS 8 2.4 STABIL INS GENOM INTEGRIERTE GRUPPE-I-INTRONS 10
2.5 TAXONOMISCHE EINORDNUNG DER ZYGNEMATALES (CHAROPHYCEAE) 11 2.6
PHYLOGENETISCHE METHODEN -. 14 3 MATERIAL 20 3.1 CHEMIKALIEN 20 3.2
ENZYME 20 3.3 KUNSTSTOFF- UND VERBRAUCHSMATERIAL 21 3.4 GERAETE 21 3.5
SOFTWARE . 22 3.6 UNTERSUCHTE TAXA 22 3.7 BAKTERIENSTAEMME 26 3.8
PLASMIDE 26 3.9 PRIMER 27 3.10 MEDIEN 28 3.11 PUFFER UND LOESUNGEN 30 4
METHODEN 34 4.1 KULTIVIERUNG VON BAKTERIEN, HEFEN UND ALGEN 34 4.2
PRAEPARATION VON NUKLEINSAEUREN 35 4.3 REINIGUNG UNDDETEKTION VON
NUKLEINSAEUREN 37 4.4 PROTEINSPEZIFISCHE TECHNIKEN 40 4.5
//Z-VJYRO-MANIPULATION VON DNA 42 4.6 RNA-TECHNIKEN 47 4.7
DATENVERARBEITUNG 49 5 ERGEBNISSE 50 5.1 PHYLOGENIE UND SEKUNDAERSTRUKTUR
DER 1506-INTRONS 50 5.1.1 PHYLOGENIE VON 1506-INTRONS UND SSU-RDNA-GENEN
DER ZYGNEMATALES 50 5.1.2 DAS ELEMENT C ALS PHYLOGENETISCHER MARKER 54
5.1.3 DIE ENTFERNUNG DES ELEMENTS C AUS DEM 1506-INTRON VON GONATOZYGON
ACULEATUM 55 5.2 SPLEISSANALYSEN DER 1506-INTRONS 57 5.2.1 SPLEISSEN DES
1506-INTRONS IN DEN ZYGNEMATALES 57 5.2.2 /N-V/FRO-SPLEISSREAKTIONEN DER
1506-INTRONS 58 5.2.3 MUTATIONEN DES 3 -TERMINUS BEWIRKTEN DRASTISCHE
VERAENDERUNGEN IM IN-VITRO- SPLEISSVERHALTEN DES 1506-INTRONS AUS
GONATOZYGON ACULEATUM 60 5.2.4 DER KLON KS-A VERWENDETE EINE NEUE
SPLEISSSTELLE 62 5.2.5 ANALYSEN ZUR NAEHEREN BESTIMMUNG DER NEUEN
3 -SPLEISSSTELLE IN KS-A 64 5.2.6 NUKLEARE HEFEPROTEINE BEWIRKTEN KEINE
ERHOEHUNG DER SPLEISSAKTIVITAET 67 5.2.7 DAS SPLEISSEN VON 1506-INTRONS IN
E. COLI 68 5.3 PHYLOGENIE UND SPLEISSEN DER TRNL-GRUPPE-I-INTRONS 73
5.3.1 VERBREITUNG UND PHYLOGENIE DES TRNL-INTRONS 73 5.3.2
SEQUENZKONSERVIERUNG UND SPLEISSEN DER TRNL-INTRONS AUS DEN
ZYGNEMATALES.. 81 6 DISKUSSION 85 6.1 PHYLOGENETISCHE BEZIEHUNGEN
INNERHALB DER ZYGNEMATALES 85 6.2 ANALYSEN DES SPLEISSENS VON
1506-INTRONS IN VITRO UND IN VIVO 88 6.3 EIN MODELL ZUR EVOLUTION DER
1506-INTRONS 92 6.4 PHYLOGENIE, VERBREITUNG UND EVOLUTION DER
TRNL-INTRONS 93 6.5 AUSBLICK 98 7 ANHANG 99 7.1 ALIGNEMENT DER
ERMITTELTEN ZYGNEMATALES-1506-INTRONSEQUENZEN 99 7.2 ALIGNEMENT DER IN
DIESER ARBEIT SEQUENZIERTEN ZYGNEMATALES-SSU-RDNA-GENE 100 7.3
ALIGNEMENT DER ERMITTELTEN TRNL-INTRONSEQUENZEN 104 7.4
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 105 8 LITERATUR 106
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