Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1999
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | XII, 237 S. Ill., graph. Darst. |
Internformat
MARC
| LEADER | 00000nam a2200000 c 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | BV013301925 | ||
| 003 | DE-604 | ||
| 007 | t | ||
| 008 | 000816s1999 ad|| m||| 00||| ger d | ||
| 016 | 7 | |a 959568328 |2 DE-101 | |
| 035 | |a (OCoLC)49236530 | ||
| 035 | |a (DE-599)BVBBV013301925 | ||
| 040 | |a DE-604 |b ger |e rakwb | ||
| 041 | 0 | |a ger | |
| 049 | |a DE-91 |a DE-12 |a DE-355 |a DE-83 |a DE-188 | ||
| 100 | 1 | |a Pradella, Silke |e Verfasser |4 aut | |
| 245 | 1 | 0 | |a Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella |c von Silke Pradella |
| 264 | 1 | |c 1999 | |
| 300 | |a XII, 237 S. |b Ill., graph. Darst. | ||
| 336 | |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |b nc |2 rdacarrier | ||
| 502 | |a Braunschweig, Techn. Univ., Diss., 1999 | ||
| 650 | 0 | 7 | |a Desulfurella |0 (DE-588)4608806-4 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 650 | 0 | 7 | |a Genom |0 (DE-588)4156640-3 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 650 | 0 | 7 | |a Genkartierung |0 (DE-588)4123274-4 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 655 | 7 | |0 (DE-588)4113937-9 |a Hochschulschrift |2 gnd-content | |
| 689 | 0 | 0 | |a Desulfurella |0 (DE-588)4608806-4 |D s |
| 689 | 0 | 1 | |a Genom |0 (DE-588)4156640-3 |D s |
| 689 | 0 | 2 | |a Genkartierung |0 (DE-588)4123274-4 |D s |
| 689 | 0 | |5 DE-604 | |
| 856 | 4 | 2 | |m DNB Datenaustausch |q application/pdf |u http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009069255&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |3 Inhaltsverzeichnis |
| 943 | 1 | |a oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009069255 | |
Datensatz im Suchindex
| _version_ | 1807683410235228160 |
|---|---|
| adam_text |
INHALTSVERZEICHNIS
I
ABKUERZUNGEN
X
1
EINLEITUNG
1
1.1
DIE
ANGEHOERIGEN
DER
GATTUNG
DESULFURELLA
1
1.2
DIE
BAKTERIELLE
GENOMIK
4
1.3
VERFAHREN
ZUR
KONSTRUKTION
VON
PHYSIKALISCHEN
UND
GENETI
SCHEN
CHROMOSOMENKARTEN
5
1.4
VERGLEICHENDE
ANALYSE
VON
GENOMSTRUKTUREN
9
1.5
ZIELSETZUNG
DIESER
ARBEIT
15
2
MATERIAL
UND
METHODEN
17
2.1
CHEMIKALIEN,
GEBRAUCHSMATERIALIEN,
GERAETE
UND
ALLGEMEINE
ARBEITSWEISE
17
2.2
DIE
STAEMME
DER
GATTUNG
DESULFURELLA
UND
IHRE
KULTIVIERUNG
17
2.2.1
DIE
DESULFURELLA-STAEMME
UND
KULTURBEDINGUNGEN
17
2.2.2
ZUSAMMENSETZUNG
DES
NAEHRMEDIUMS
FUER
DIE
DESULFURELLA-SXAEXN.
ME
18
2.2.3
BEREITUNG
DES
NAEHRMEDIUMS
FUER
DIE
DESULFARELLA-STOEMME
19
2.3
MATERIAL
UND
METHODEN
ZUR
SEQUENZANALYSE
DER
16S
RRNA
GENE
20
2
3.1
PRAEPARATION
VON
GENOMISCHER
DNA
AUS
DEN
DESULFURELLA-'SXBM
MEN
IN
FLUESSIGER
PHASE
ALS
MATRIZE
FUER
POLYMERASE-KETTENREAK
TIONEN
(PCR)
20
2.3
2
AMPLIFIKATION
DER
16S
RDNA
MITTELS
PCR
21
2.3.2.1
ANSATZ
DER
PCR-REAKTIONEN
21
2.3.2.2
REINIGUNG
DER
PCR-PRODUKTE
23
2.3.2.2.1
DURCHFUEHRUNG
DER
REINIGUNG
MIT
YYPREP-A-GENE
"
23
2
3.3
AUTOMATISCHE
SEQUENZIERUNG
DER
PCR-AMPLIFIZIERTEN
16S
RDNA
23
2.3.3.1
DURCHFUEHRUNG
DER
ZYKLISCHEN
DNA-SEQUENZIERUNG
UNTER
VER
WENDUNG
VON
FLUORESZENZFARBSTOFFMARKIERTEN
TERMINATOREN
24
2.3.3
2
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
UND
DNA-SEQUENZIERUNG
IM
ABI
373
A
DNA
SEQUENCER
24
2.3.3.3
ANALYSE
DER
SEQUENZDATEN
24
2.3.4
KONVENTIONELLE,
UNIDIREKTIONALE
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
ZUR
ANALYSE
VON
DNA
25
2
3.4
1
PUFFER
25
2.3.4.2
DURCHFUEHRUNG
DER
KONVENTIONELLEN
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
26
2.4
MATERIAL
UND
METHODEN
ZUR
MAKRORESTRIKTIONSANALYSE,
ZUR
KONSTRUKTION
VON
PHYSIKALISCHEN
UND
GENETISCHEN
CHROMO
SOMENKARTEN
UND
ZUR
ANALYSE
DES
PLASMIDGEHALTES
DER
DE
SULFURELLA-STAEMME
27
2.4.1
METHODEN
ZUR
EINDIMENSIONALEN
(ID)
MAKRORESTRIKTIONSANALYSE
UND
ZUR
PHYSIKALISCHEN
KARTIERUNG
DER
DESULFURELLA-STAMME
MIT
HILFE
DER
ZWEIDIMENSIONALEN
(2D)
PULSFELDGELELEKTROPHORESE
(PFGE)
27
2.4.1.1
LOESUNGEN
UND
PUFFER
27
2.4.1.1.1
STAMMLOESUNGEN
27
2.4.1.1.2
LOESUNGEN
UND
PUFFER
ZUR
DNA-PRAEPARATION
IM
INNEREN
VON
AGA
ROSE
28
2.4
1.1
3
LAUFPUFFER
FUER
PFGE
29
2.4.1.1.4
LOESUNGEN
UND
PUFFER
ZUR
MAKRORESTRIKTIONSVERDAUUNG
VON
DNA,
DIE
IN
AGAROSE
EINGEBETTET
WAR
29
2.4.1.2
PRAEPARATION
HOCHMOLEKULARER
GENOMISCHER
BAKTERIEN-DNA
IN
AGAROSE-BLOECKEN
31
2
4
1.3
MAKRORESTRIKTIONSVERDAUUNG
DER
IN
AGAROSE-BLOECKE
EINGEBETTE
TEN
DNA
FUER
ID
PFGE-ANWENDUNGEN
33
2.4.1.3.1
RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN
UND
HERSTELLER
33
2.4
1.3.2
KOMPLETTE
EINFACHVERDAUUNG
DER
EINGEBETTETEN
GENOMISCHEN
DNA
33
2.4.1.3.3
KOMPLETTE
DOPPEIVERDAUUNG
DER
EINGEBETTETEN
GENOMISCHEN
DNA
34
2.4.1.3.4
PARTIALVERDAUUNG
DER
EINGEBETTETEN
GENOMISCHEN
DNA
DURCH
LIMITIERENDE
BEDINGUNGEN
35
2.4.1.4
PULSFELDGELELEKTROPHORESE
(PFGE)
36
2.4.1.4.1
ID
PULSFELDGELELEKTROPHORESE
(PFGE)
36
2.4.1.4.1
1
CONTOUR
CLAMPED
HOMOGENEOUS
ELECTRIC
FIELD-ELEKTROPHORESE
(CHEF)
36
2.4.1.4.1.2
TRANSVERSE
ALTERNATING
FIELD-ELEKTROPHORESE
(TAFE)
37
2.4.1
4
1.3
EINSTELLUNG
DER
PFGE-BEDINGUNGEN
38
2.4.1.4
2
2D
PULSFELDGELELEKTROPHORESE
(PFGE)
38
2.4
1.5
KONVENTIONELLE,
UNIDIREKTIONALE
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
ZUR
ANALYSE
VON
MAKRORESTRIKTIONSFRAGMENTEN
40
2.4.1
6
FAERBEN
UND
PHOTOGRAPHIEREN
DER
DNA
IM
AGAROSEGEL
40
2.4.1.7
DNA-GROESSENSTANDARDS
ZUR
MOLEKULARGEWICHTSBESTIMMUNG
41
2.4.1.8
BESTIMMUNG
DER
GROESSE
VON
MAKRORESTRIKTIONSFRAGMENTEN
41
2.4
1
9
NOMENKLATUR
DER
MAKRORESTRIKTIONSFRAGMENTE
42
2.4.2
METHODEN
ZUR
PLASMIDANALYSE
DER
DESULFURELLA-STUEINME
43
2.4.3
ERZEUGUNG
VON
MATRIZEN-DNA
ZUR
HERSTELLUNG
DIG-MARKIERTER
SONDEN
44
2.4.3
1
ISOLIERTE
MAKRORESTRIKTIONSFRAGMENTE
ALS
DNA-MATRIZEN
44
2.4
3.2
AUS
DEN
DESULFURELLA-STLMANEN
ISOLIERTE
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
ALS
MATRIZE
45
2.4.3
3
ISOLIERTE
GENE
ODER
GENFRAGMENTE
ALS
MATRIZEN-DNA
ZUR
HER
STELLUNG
VON
HOMO
UND
HETEROLOGEN
GENSONDEN
46
2.4.33.1
KLONIERTE
GENE
ODER
GENFRAGMENTE
ALS
MATRIZEN
FUER
HETEROLOGE
SONDEN
46
2.4.3
3
1
1
ERHALTENE
REKOMBINANTE
PLASMIDE,
DIE
ALS
HETEROLOGE
HYBRIDISIE
RUNGSSONDEN
VERWENDET
WURDEN
46
2.4.3.3.1.2
RETRANSFORMATION
ERHALTENER
PLASMID-DNA
49
2.4
3
3.1.2.1
MEDIEN
UND
REAGENZIEN
ZUR
TRANSFORMATION
49
2.4.3.3.1.2.2
DURCHFUEHRUNG
DER
TRANSFORMATION
50
2
4.3.3.1.3
KONSERVIERUNG
VON
TRANSFORMIERTEN
E.
CO/Z-STAEMMEN
50
2.4.3.3.1.4
PLASMIDISOLIERUNG
51
2.4.3.3.1.4.1
MEDIEN
UND
REAGENZIEN
ZUR
PLASMIDISOLIERUNG
51
2.4.3
3
1.4.2
PROTOKOLL
DER
PLASMIDISOLIERUNG
53
24.3.3.1
5
PRAEPARATION
VON
MATRIZEN-DNA
FUER
HETEROLOGE
HYBRIDISIE
RUNGSSONDEN
53
2.4.3.3
1.5.1
PRAEPARATION
VON
MATRIZEN-DNA
FUER
HETEROLOGE
SONDEN
DURCH
RESTRIKTIONSVERDAUUNGEN
DER
ERHALTENEN
PLASMIDE
53
2.4
3.3
1.5.2
PRAEPARATION
VON
MATRIZEN-DNA
FUER
HETEROLOGE
SONDEN
DURCH
AMPLIFIKATION
DER
KLONIERTEN
INSERT-DNA
MITTELS
M13-PCR
55
2.4
3.3
2
PCR-AMPLIFIZIERTE
GENTEILE
ALS
MATRIZEN-DNA
FUER
HOMOLOGE
HYBRIDISIERUNGSSONDEN
55
2.4.3.3.2.1
PCR-AMPLIFIZIERTE
GENFRAGMENTE,
VERWENDETE
PRIMER
UND
PCR
BEDINGUNGEN
56
2.4.3.3.2.1.1
BAKTERIENSTAEMME,
DEREN
GENOMISCHE
DNA
ALS
POSITIVKONTROLLE
EINGESETZT
WURDE,
UND
DURCHFUEHRUNG
DER
DNA-EXTRAKTION
59
2.4.3.3.2.1.1.1
PUFFER
UND
LOESUNGEN
ZUR
DNA-EXTRAKTION
59
2.4.3.3
2.1.1
2
DURCHFUEHRUNG
DER
DNA-EXTRAKTION
UND
REINIGUNG
60
2.4.3.3.2.1.2
REKOMBINANTE
PLASMID-DNA,
DIE
ALS
POSITIVKONTROLLE
IN
PCR
ANSAETZEN
EINGESETZT
WURDE
60
2.4.3.3.2.2
ISOLIERUNG
GEWUENSCHTER
PCR-PRODUKTE
DURCH
PRAEPARATIVE
AGARO
SEGELELEKTROPHORESE
61
2.4.3.4
X-DNA
ALS
MATRIZE
62
2.4.4
HERSTELLUNG
VON
DIGOXIGENIN
(DIG)-MARKIERTEN
DNA-SONDEN
62
2.4.4.1
LOESUNGEN
UND
PUFFER
FUER
DIE
DIG-MARKIERUNG
62
2.4.4.2
ANSATZ
DER
MARKIERUNGSREAKTION
63
2.4.4.3
ABTRENNEN
VON
NICHT
EINGEBAUTEM
DIG-11-DUTP
63
2.4.4
4
ABSCHAETZUNG
DER
AUSBEUTE
VON
DNA-MARKIERUNGSREAKTIONEN
64
2.4.5
YYBLOTTING
"
NACH
SOUTHERN
(1975)
UND
CHEMOLUMINESZENTE
HYBRI
DISIERUNG
MIT
DEM
DIG-SYSTEM
(BOEHRINGER
MANNHEIM)
64
2.4.5.1
LOESUNGEN
UND
PUFFER
64
2.4.5.1.1
LOESUNGEN
UND
PUFFER
FUER
DAS
YYSOUTHERN
BLOTTING
"
64
2.4.5.1.2
LOESUNGEN
UND
PUFFER
ZUR
HYBRIDISIERUNG
UND
CHEMOLUMINES
ZENTEN
DETEKTION
65
2
4.5.2
YYSOUTHERN
BLOTTING
"
67
2.4.5.3
HYBRIDISIERUNG
VON YYSOUTHERN
BLOTS
"
MIT
HOMO
UND
HETEROLOGEN
DIGOXIGENIN
(DIG)-MARKIERTEN
SONDEN
UND
CHEMOLUMINESZENTE
SIGNALDETEKTION
68
2.4.5.3
1
PRAEHYBRIDISIERUNG
68
2.4.5.3.2
HYBRIDISIERUNG
69
2.4.5.3
3
WASCHEN
69
24.5.3.4
CHEMOLUMINESZENTE
DETEKTION
70
24.5.3.5
WIEDERVERWERTUNG
VON
HYBRIDISIERTEN
YYSOUTHERN
BLOTS
"
NACH
DEM
ENTFERNEN
DER
GEBUNDENEN
SONDE
71
2.4.6
SONSTIGE
METHODEN
ZUR
ANALYSE
DER
RRN-OPERONE
UND
ZUR
KAR
TIERUNG
VON
I-CEUL-,
EAGL-,
UND
SACII-SCHNITTSTELLEN
INNERHALB
DER
RRNA-GENE
72
2.4.6.1
PCR-AMPLIFIKATION
EINES
2,4
KB
GROSSEN
FRAGMENTS
DER
23S
RDNA
72
2.4.6.2
16S
UND
23S
RDNA-SELEKTIVE
RESTRIKTIONSFRAGMENTHYBRIDISIERUNG
(RDNA-SRFH,
YYRIBOTYPISIERUNG
"
)
72
2.5
METHODEN
ZUR
ANALYSE
DES
BEREICHES
ZWISCHEN
DEN
16S
UND
23S
RRNA-GENEN
DER
DESULFURELLA-STIKMME
(16S-23S
RDNA
SPACER-REGION,
ISR)
73
2.5.1
PCR-AMPLIFIZIERUNG
DER
16S-23S
RDNA-SPACER-REGION
(ISR)
73
2.5.2
AUTOMATISCHE
SEQUENZIERUNG
DER
ISR
73
2
5.3
ANALYSE
DER
SEQUENZDATEN
74
3
ERGEBNISSE
75
3.1
SEQUENZANALYSE
DER
16S
RRNA-GENE
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
75
3.2
UNTERSUCHUNGEN
ZUR
GENOMORGANISATION
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
77
3.2.1
PRAEPARATION
HOCHMOLEKULARER
GENOMISCHER
DNA
IM
INNEREN
VON
AGAROSE,
DIE
PFGE-TAUGLICH
WAR
77
3.2.1
1
WACHSTUMSVERSUCHE
ZUR
OPTIMIERUNG
DES
ZELLERTRAGES
DER
DESUL
YUEREZ/A-STAEMME
77
3.2
1.2
ZENTRIFUEGATIONSVERFAHREN
ZUR
ABTRENNUNG
DER
ZELLEN
VOM
ELE
MENTAREN
S
BEIM
ERNTEN
DER
BIOMASSE
77
3.2
1
3
EMPIRISCHE
EINSTELLUNG
OPTIMALER
DNA-KONZENTRATIONEN
IM
AGA
ROSE-BLOECKCHEN
UND
BEURTEILUNG
DER
RESULTIERENDEN
DNA-QUA
LITAET
78
3
2.1.4
VERSUCHE
ZUR
VERBESSERUNG
DER
DNA-QUALITAET
AUS
D.
SPEC.
STAMM
TI
DURCH
MODIFIZIERUNGEN
DER
DNA-PRAEPARATIONS
METHODE
80
3
2.2
GROBABSCHAETZUNG
DER
CHROMOSOMENGROESSEN,
BESTIMMUNG
DER
CHROMOSOMENTOPOLOGIEN
UND
UEBERSICHT
UEBER
DIE
ANZAHL
DER
IN
DEN
DESULFURELLA-STAEMMEN
VORKOMMENDEN
REPLIKONE
81
3.2
3
MAKRORESTRIKTIONSANALYSE
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
MIT
HILFE
VON
EINDIMENSIONALER
(ID)
PFGE
84
3.2.3.1
AUSWAHL
VON
SELTEN-SCHNEIDENDEN
RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN
84
3.2.3.2
OPTIMIERUNG
DER
BEDINGUNGEN
FUER
DIE
RESTRIKTIONSVERDAUUNG
AGAROSEUMHUELLTER
DNA
ZUR
VERMEIDUNG
VON
DNA-DEGENERATION
UND
PARTIALVERDAU
86
3.2.3.3
OPTIMALE
AUFTRENNUNG
DER
ENTSTANDENEN
MAKRORESTRIKTIONS
FRAGMENTE
DURCH
ADAPTIERUNG
DER
PFGE-BEDINGUNGEN
90
3.2.3.4
GROESSE
UND
ANZAHL
DER
AUS
DER
GENOMISCHEN
DNA
VON
D.
ACETI
VORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
ERZEUGTEN
MAKRORESTRIKTIONSFRAGMENTE
UND
BERECHNUNG
DER
CHROMOSOMENGROESSEN
93
3.2.3.5
VERGLEICH
DER
DESULFURELLA-STAEMSNE
AUF
EBENE
DES
RFLP
DER
MAKRORESTRIKTIONSMUSTER
99
3.2.4
ERSTELLUNG
PHYSIKALISCHER
CHROMOSOMENKARTEN
VON
D.
ACETIVO
RANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS
UND
D.
PROPIONICA
104
3
2.4.1
KARTIERUNG
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
ACETIVORANS
105
3.2.4.1.1
PARTIAL/KOMPLETTE
2D
PFGE
ZUR
KONSTRUKTION
DER
AESRII-KARTE
VON
D.
ACETIVORANS
105
3.2.4.1.2
POSITIONIERUNG
DER
I-CEWL-SCHNITTSTELLEN
AUF
DIE
PHYSIKALISCHE
AESRII-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
UND
BESTIMMUNG
VON
ANZAHL
UND
LAGE
DER
23
S
RRNA-GENE
111
3.2.4.1.2.1
KONSTRUKTION
DER
ASRII/I-CEUI-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETI
VORANS
111
3
2.4.1.2.2
ANZAHL
UND
LAGE
DER
23
S
RRNA-GENE
NACH
DER
L-CEUL
ANALYSE
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
ACETIVORANS
114
3.2.4.1.3
KONSTRUKTION
DER
PHYSIKALISCHEN
AESRLLZ/FJCI-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
116
3.2.4.1.3.1
ID
PFGE-ANALYSE
VON
AESRLLMSCI-DOPPELVERDAUS
DER
GENOMI
SCHEN
DNA
VON
D.
ACETIVORANS
116
3.2.4.1.3.2
VERVOLLSTAENDIGUNG
DER
AESRLL/ASCL-MAKRORESTRIKTIONSKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
DURCH
ID
PFGE
VON
AESCL-PARTIALVERDAUS
118
3.2.4.1.4
KONSTRUKTION
DER
PHYSIKALISCHEN
AESRLL/ERIGL-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
122
3.24.1.4.1
2D
PFGE-ANALYSE
VON
AESRII/AGI-DOPPELVERDAUS
122
3.2.4.1.4.2
HYBRIDISIERUNGEN
MIT
SPEZIFISCHEN
16S
UND
23
S
RRNA-GENSON
DEN
ZUR
VERVOLLSTAENDIGUNG
DER
AESRIVEAGL-CHROMOSOMENKARTE
128
3.2.4.1.5
KONSTRUKTION
DER
PHYSIKALISCHEN
SAFL-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
131
3.2.4.1.5.1
2D
PFGE-ANALYSE
VON
AEWII/SAFI-DOPPELVERDAUS
DER
GENOMI
SCHEN
DNA
VON
D.
ACETIVORANS
131
3.2.4.1.5.2
2D
PFGE-ANALYSE
VON
EAGL/SAZI-DOPPELVERDAUS
DER
GENOMI
SCHEN
DNA
VON
D.
ACETIVORANS
134
3.2.4.1
5.3
REZIPROKE
2D
PFGE-ANALYSE
VON
KOMPLETTEN
SALUSACU
BZW.
&JCIL/&ZFL-DOPPELVERDAUS
136
3.2.4
1.6
KONSTRUKTION
DER
PHYSIKALISCHEN
SACII-CHROMOSOMENKARTE
VON
D.
ACETIVORANS
144
3.2.4.1
6.1
2D
PFGE-ANALYSE
VON
KOMPLETTEN
AESRLLZSACII-DOPPELVERDAUS
DER
GENOMISCHEN
DNA
VON
D.
ACETIVORANS
144
3.2.4.1.6.2
HYBRIDISIERUNGEN
MIT
SPEZIFISCHEN
16S
UND
23S
RRNA-GENSON
DEN
ZUR
,SACII-KARTIERUNG
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
ACETIVORANS
148
3.2.4.1.6.3
2D
PFGE-ANALYSE
VON
KOMPLETTEN
&FL/&JEII-DOPPELVERDAUS
DER
GENOMISCHEN
DNA
VON
D.
ACETIVORANS
150
3.2.4
2
KARTIERUNG
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
MULTIPOTENS
152
3
2.4.3
KARTIERUNG
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
KAMCHATKENSIS
152
3
2.4.4
KARTIERUNG
DES
CHROMOSOMS
VON
D.
PROPIONICA
153
3.2.5
LOKALISIERUNG
VON
GENETISCHEN
MARKERN
AUF
DIE
PHYSIKALISCHEN
CHROMOSOMENKARTEN
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS
UND
D.
PROPIONICA
154
3
2.5.1
LOKALISIERUNG
VON
HETEROLOGEN
GENSONDEN
155
3
2.5.1.1
OPTIMIERUNG
DER
HYBRIDISIERUNGSBEDINGUNGEN
ZUR
VERWENDUNG
HETEROLOGER
GENSONDEN
155
3.2
5
1.2
POSITIONEN
HETEROLOGER
GENSONDEN
AUF
DEN
CHROMOSOMENKARTEN
DER
DESULJURELLA-ST&MME
156
3.2.5.2
LOKALISIERUNG
VON
HOMOLOGEN
GENSONDEN
157
3
2
5.2.1
OPTIMIERUNG
DER
PCR-BEDINGUNGEN
ZUR
AMPLIFIZIERUNG
VON
GENFRAGMENTEN
157
3.2.5.2
1.1
PCR-AMPLIFIZIERUNG
VON
16S
RDNA
157
3.2.5.2.1.2
PCR-AMPLIFIZIERUNG
VON
ZWEI
INTERNEN
GENFRAGMENTEN
DER
23S
RRNA-GENE
158
3.2.52.13
PCR-AMPLIFIZIERUNG
EINES
INTERNEN
FRAGMENTS
DES
GYRSS-GENS
159
3.2.5
2
1
4
PCR-AMPLIFIZIERUNG
EINES
INTERNEN
FRAGMENTS
DES
RECA
-GENS
160
3.2.5.2.1.5
PCR-AMPLIFIZIERUNG
VON
ZWEI
INTERNEN
FRAGMENTEN
DER
RPOD
GENE
161
3
2.5.2.1.6
PCR-AMPLIFIZIERUNG
VON
DNA-BEREICHEN,
DIE
DAS
3
'
-ENDE
DES
23S
RRNA-GENS,
DEN
INTERGENISCHEN
SPACER
UND
DAS
5
'
-ENDE
DES
5S
RRNA-GENS
UMFASSEN
163
3.2.5.2.2
POSITIONEN
HOMOLOGER
GENSONDEN
AUF
DEN
CHROMOSOMENKARTEN
DER
DESULFURELLA-ST&MME
164
3.2.6
VERGLEICH
DER
PHYSIKALISCHEN
UND
GENETISCHEN
CHROMOSOMEN
KARTEN
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS
UND
D.
PROPIONICA
166
3.2.7
ANALYSE
DES
PLAMIDGEHALTES
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
175
3
2.7.1
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
IN
D.
ACETIVORANS
175
3.2.7.2
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
IN
D.
MULTIPOTENS
178
3
2.7.3
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
IN
D.
KAMCHATKENSIS
179
3.2
7
4
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
IN
D.
PROPIONICA
180
3.2.7
5
EXTRACHROMOSOMALE
DNA
IN
D.
SPEC.
STAMM
TI
184
3.2.7
6
HOMOLOGIEN
ZWISCHEN
DEN
EXTRACHROMOSOMALEN
ELEMENTEN
DER
DESULFURELLA-STAEMME
185
3.3
CHARAKTERISIERUNG
DER
STAMMESBEZIEHUNGEN
ZWISCHEN
DEN
ANGEHOERIGEN
DER
GATTUNG
DESULFURELLA
DURCH
EINE
DIREKTE
SEQUENZIERUNG
DER
DNA
IM
BEREICH
ZWISCHEN
DEN
16S
UND
23S
RRNA-GENEN
186
4
DISKUSSION
191
4.1
MAKRORESTRIKTIONSANALYSE
191
4.2
BEWERTUNG
DER
KARTIERUNGSSTRATEGIEN
196
4.3
VERGLEICH
DER
CHROMOSOMENARCHITEKTUREN
198
4.4
EXTRACHROMOSOMALE
ELEMENTE
203
4.5
KONSEQUENZEN
FUER
DIE
TAXONOMIE
INNERHALB
DES
GENUS
DESULFURELLA
204
4.6
AUSBLICK
206
5
ZUSAMMENFASSUNG
208
6
LITERATURVERZEICHNIS
210
7
ANHANG
223
7.1
ANHANG
A:
16S
RDNA-SEQUENZEN
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
223
7.2
ANHANG
B:
DNA-SEQUENZEN
DER
INTERGENISCHEN
16S-23S
RDNA-SPACER-REGION
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAMCHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
(INKLUSIVE
ILE-TRNA
UND
ALA-TRNA)
233
7.3
ANHANG
C:
DIE
ERSTEN
216
BASEN
DES
S
'
-ENDES
DER
23S
RRNA
GENSEQUENZEN
VON
D.
ACETIVORANS,
D.
MULTIPOTENS,
D.
KAM
CHATKENSIS,
D.
PROPIONICA
UND
D.
SPEC.
STAMM
TI
235
7.4
FIRMENVERZEICHNIS
237 |
| any_adam_object | 1 |
| author | Pradella, Silke |
| author_facet | Pradella, Silke |
| author_role | aut |
| author_sort | Pradella, Silke |
| author_variant | s p sp |
| building | Verbundindex |
| bvnumber | BV013301925 |
| ctrlnum | (OCoLC)49236530 (DE-599)BVBBV013301925 |
| format | Thesis Book |
| fullrecord | <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><collection xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim"><record><leader>00000nam a2200000 c 4500</leader><controlfield tag="001">BV013301925</controlfield><controlfield tag="003">DE-604</controlfield><controlfield tag="007">t</controlfield><controlfield tag="008">000816s1999 ad|| m||| 00||| ger d</controlfield><datafield tag="016" ind1="7" ind2=" "><subfield code="a">959568328</subfield><subfield code="2">DE-101</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(OCoLC)49236530</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(DE-599)BVBBV013301925</subfield></datafield><datafield tag="040" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-604</subfield><subfield code="b">ger</subfield><subfield code="e">rakwb</subfield></datafield><datafield tag="041" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">ger</subfield></datafield><datafield tag="049" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-91</subfield><subfield code="a">DE-12</subfield><subfield code="a">DE-355</subfield><subfield code="a">DE-83</subfield><subfield code="a">DE-188</subfield></datafield><datafield tag="100" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Pradella, Silke</subfield><subfield code="e">Verfasser</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="245" ind1="1" ind2="0"><subfield code="a">Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella</subfield><subfield code="c">von Silke Pradella</subfield></datafield><datafield tag="264" ind1=" " ind2="1"><subfield code="c">1999</subfield></datafield><datafield tag="300" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">XII, 237 S.</subfield><subfield code="b">Ill., graph. Darst.</subfield></datafield><datafield tag="336" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">txt</subfield><subfield code="2">rdacontent</subfield></datafield><datafield tag="337" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">n</subfield><subfield code="2">rdamedia</subfield></datafield><datafield tag="338" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">nc</subfield><subfield code="2">rdacarrier</subfield></datafield><datafield tag="502" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Braunschweig, Techn. Univ., Diss., 1999</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Desulfurella</subfield><subfield code="0">(DE-588)4608806-4</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Genom</subfield><subfield code="0">(DE-588)4156640-3</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Genkartierung</subfield><subfield code="0">(DE-588)4123274-4</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="655" ind1=" " ind2="7"><subfield code="0">(DE-588)4113937-9</subfield><subfield code="a">Hochschulschrift</subfield><subfield code="2">gnd-content</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="0"><subfield code="a">Desulfurella</subfield><subfield code="0">(DE-588)4608806-4</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="1"><subfield code="a">Genom</subfield><subfield code="0">(DE-588)4156640-3</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="2"><subfield code="a">Genkartierung</subfield><subfield code="0">(DE-588)4123274-4</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2=" "><subfield code="5">DE-604</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="2"><subfield code="m">DNB Datenaustausch</subfield><subfield code="q">application/pdf</subfield><subfield code="u">http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009069255&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA</subfield><subfield code="3">Inhaltsverzeichnis</subfield></datafield><datafield tag="943" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009069255</subfield></datafield></record></collection> |
| genre | (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content |
| genre_facet | Hochschulschrift |
| id | DE-604.BV013301925 |
| illustrated | Illustrated |
| indexdate | 2024-08-18T00:33:58Z |
| institution | BVB |
| language | German |
| oai_aleph_id | oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-009069255 |
| oclc_num | 49236530 |
| open_access_boolean | |
| owner | DE-91 DE-BY-TUM DE-12 DE-355 DE-BY-UBR DE-83 DE-188 |
| owner_facet | DE-91 DE-BY-TUM DE-12 DE-355 DE-BY-UBR DE-83 DE-188 |
| physical | XII, 237 S. Ill., graph. Darst. |
| publishDate | 1999 |
| publishDateSearch | 1999 |
| publishDateSort | 1999 |
| record_format | marc |
| spelling | Pradella, Silke Verfasser aut Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella von Silke Pradella 1999 XII, 237 S. Ill., graph. Darst. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Braunschweig, Techn. Univ., Diss., 1999 Desulfurella (DE-588)4608806-4 gnd rswk-swf Genom (DE-588)4156640-3 gnd rswk-swf Genkartierung (DE-588)4123274-4 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Desulfurella (DE-588)4608806-4 s Genom (DE-588)4156640-3 s Genkartierung (DE-588)4123274-4 s DE-604 DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009069255&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
| spellingShingle | Pradella, Silke Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella Desulfurella (DE-588)4608806-4 gnd Genom (DE-588)4156640-3 gnd Genkartierung (DE-588)4123274-4 gnd |
| subject_GND | (DE-588)4608806-4 (DE-588)4156640-3 (DE-588)4123274-4 (DE-588)4113937-9 |
| title | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella |
| title_auth | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella |
| title_exact_search | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella |
| title_full | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella von Silke Pradella |
| title_fullStr | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella von Silke Pradella |
| title_full_unstemmed | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella von Silke Pradella |
| title_short | Vergleichende physikalische und genetische Kartierung der Genome von Angehörigen der Gattung Desulfurella |
| title_sort | vergleichende physikalische und genetische kartierung der genome von angehorigen der gattung desulfurella |
| topic | Desulfurella (DE-588)4608806-4 gnd Genom (DE-588)4156640-3 gnd Genkartierung (DE-588)4123274-4 gnd |
| topic_facet | Desulfurella Genom Genkartierung Hochschulschrift |
| url | http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009069255&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |
| work_keys_str_mv | AT pradellasilke vergleichendephysikalischeundgenetischekartierungdergenomevonangehorigendergattungdesulfurella |