Protein-Fingerprinting zur Abgrenzung von Spezies und Stämmen aus der "Lactobacillus acidophilus-Gruppe":
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1997
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-
1
-
I
NHALTSVERZEICHNIS
SEITE
1
E
INLEITUNG
1
2
L
ITERATURUEBERSICHT
2
2.1
DIE
ENTWICKLUNG
DER
TAXONOMIE
UND
NOMENKLATUR
DER
STAEMME
DES
GENUS
LACTOBACILLUS
BEIJERINCK
2
2.2
PHYLOGENETISCHE
UND
TAXONOMISCHE
STELLUNG
DER
LAKTOBAZILLEN
10
2.3
BEDEUTUNG
VON
LAKTOBAZILLEN
12
2.3.1
NATUERLICHES
VORKOMMEN
12
2.3.2
LEBENSMITTEL
15
2.3.3
BIOTECHNOLOGISCHE
VERWENDUNG
17
2.3.3.1
STARTERKULTUREN
17
2.3.3.2
PROBIOTIKA
19
2.3.3.3
PHARMAZEUTISCHE
PRAEPARATE
27
2.4
PATHOGENITAET
VON
LAKTOBAZILLEN
27
2.5
SICHERHEIT
IM
UMGANG
MIT
LAKTOBAZILLEN
29
2.6
IDENTIFIZIERUNG
UND
DIFFERENZIERUNG
VON
LAKTOBAZILLEN
31
2.6.1
NOTWENDIGKEIT
ZUR
GENAUEN
IDENTIFIZIERUNG
31
2.6.2
PHAENOTYPISCHE
METHODEN
ZUR
IDENTIFIZIERUNG
UND
DIFFERENZIERUNG
31
2.6.2.1
PROTEIN-FINGERPRINTING
31
2.6.2.2
WEITERE
PHAENOTYPISCHE
METHODEN
37
2.6.3
GENOTYPISCHE
METHODEN
ZUR
IDENTIFIZIERUNG
UND
DIFFERENZIERUNG
39
2.6.3.1
RANDOMLY
AMPLIFIED
POLYMORPHIE
DNA
-PCR-METHODE
39
2.6.3.2
WEITERE
GENOTYPISCHE
METHODEN
40
-II
3
E
IGENE
U
NTERSUCHUNGEN
43
3.1
MATERIAL
43
3.1.1
BAKTERIENSTAEMME
43
3.1.2
NAEHRMEDIEN
UND
REAGENZIEN
48
3.1.2.1
STAMMANZUCHT
UND
STAMMHALTUNG
48
3.1.2.2
PHYSIOLOGISCHE
UND
BIOCHEMISCHE
PRUEFUNG,
PROTEIN-FINGERPRINTING
UND
RAPD-PCR 48
3.1.2.3
REAGENZIEN
UND
LOESUNGEN
50
3.1.3
ARBEITSGERAETE
UND
SONSTIGES
MATERIAL
53
3.2
METHODEN
55
3.2.1
KONVENTIONELLE
PHAENOTYPISCHE
IDENTIFIZIERUNG
DER
LAKTOBAZILLENSTAEMME
55
3.2.2
PROTEIN-FINGERPRINTING
MIT
DEN
GESAMTEN
LOESLICHEN
ZELLPROTEINEN
55
3.2.2.1
GEWINNUNG
DER
LOESLICHEN
ZELLPROTEINE
55
3.2.2.2
EINSTELLEN
AUF
DIE
STANDARDKONZENTRATION
58
3.2.2.3
SDS-PAGE
DER
GESAMTEN
LOESLICHEN
ZELLPROTEINE
60
3.2.2.4
COMPUTERUNTERSTUETZTE
AUSWERTUNG
61
3.2.2.5
GESAMTPROFIL-
UND
TEILPROFILANALYSE
64
3.2.3
DNA-FINGERPRINTING
MIT
RAPD-PCR
64
3.2.4
VORGEHEN
ZUR
IDENTIFIZIERUNG
VON
SPEZIES
UND
ERMITTLUNG
STAMM
SPEZIFISCHER
UNTERSCHIEDE
INNERHALB
VON
SPEZIES
68
3.2.5
KONTROLLE
DER
WIEDERHOLBARKEIT DER
ERGEBNISSE
69
4
E
RGEBNISSE
70
4.1
METHODISCHE
ERKENNTNISSE
70
4.2
PHYSIOLOGISCHE
UND
BIOCHEMISCHE
EIGENSCHAFTEN
DER
UNTERSUCHTEN
LACTOBAC///US-STAEMME
71
4.2.1
L.
ACIDOPHILUS
-STAEMME
72
4.2.2
L.
GASSERI
-STAEMME
72
4.2.3
L.
JOHNSONII
-STAEMME
73
4.2.4
L.
CRISPATUS-,
L.
AMYLOVORUS
UND
L.
GALLINARUM
-STAEMME
73
-III
4.3
SPEZIESABGRENZUNG
INNERHALB
DER
"L.
ACIDOPHILUS-GRUPPE"
75
4.3.1
SPEZIESABGRENZUNG
DURCH
GESAMTPROFILANALYSE
75
4.3.1.1
ABGRENZUNG
VON
PROTEINHAUPTGRUPPEN
75
4.3.1.2
ABGRENZUNG
VON
PROTEINUNTERGRUPPEN
78
4.3.2
SPEZIESABGRENZUNG
DURCH
TEILPROFILANALYSE
82
4.3.2.1
DIFFERENZIERUNG
ZWISCHEN
L.
ADDOPHILUS
UND
L.
GALLINARUM
82
4.3.2.2
DIFFERENZIERUNG
ZWISCHEN
L.
GASSERI
UND
L.
JOHNSON
83
4.3.3
DIFFERENZIERUNG
ZWISCHEN
L.
GASSERI
UND
L.
JOHNSONII
MIT
DER
RAPD-PCR
METHODE
85
4.4
STAMMABGRENZUNGEN
INNERHALB
DER
"L.
ACIDOPHILUS-GRUPPE"
89
4.4.1
INNERHALB
DER
PROTEINUNTERGRUPPE
A1
(L.
ADDOPHILUS)
89
4.4.2
INNERHALB
DER
PROTEINUNTERGRUPPE
B1
(L
GASSERI)
92
4.4.3
INNERHALB
DER
PROTEINUNTERGRUPPE
B2
(L.
JOHNSONII)
96
4.4.4
INNERHALB
DER
PROTEINUNTERGRUPPEN
A2
(L.
AMYLOVORUS),
A3
(L.
CRISPATUS)
UND
A4
(L.
GALLINARUM)
98
4.4.5
STAMMSPEZIFISCHE
GRUPPIERUNGEN
DER
KONTROLLSTAEMME
98
5
D
ISKUSSION
100
5.1
SPEZIESIDENTIFIZIERUNG
DURCH
PROTEIN-FINGERPRINTING
100
5.1.1
DIFFERENZIERUNG
DER
REFERENZ
UND
SAMMLUNGSSTAEMME
100
5.1.2
SPEZIESIDENTIFIZIERUNG
DER
ISOLATE
AUS
MILCHPRODUKTEN,
PHARMAZEU
TISCHEN
PRAEPARATEN
UND
DER
ISOLATE
AUS
LYOPHILISATEN
UND
KULTUREN
101
5.1.3
SPEZIESIDENTIFIZIERUNG
NEUER
ISOLATE
VOM
MENSCHEN
104
5.2
BEWERTUNG
DER
STAMMSPEZIFISCHEN
UNTERSCHIEDE
106
5.2.1
INNERHALB
DER
SPEZIES
L.
ADDOPHILUS
(PROTEINUNTERGRUPPE
A1)
107
5.2.2
INNERHALB
DER
SPEZIES
L.
GASSERI
(PROTEINUNTERGRUPPE
B1
)
110
5.2.3
INNERHALB
DER
SPEZIES
L.
JOHNSONII
(PROTEINUNTERGRUPPE
B2)
114
5.2.4
INNERHALB
DER
SPEZIES
L.
AMYLOVORUS
(PROTEINUNTERGRUPPE
A2),
L.
CRISPATUS (PROTEINUNTERGRUPPE
A3)
UND
L.
GALLINARUM
(PROTEIN
UNTERGRUPPE
A4)
116
-IV
5.3
ZUR
RAPD-PCR
BEI
L.
JOHNSONH-STIMMM
118
5.4
ZUR
AUSSAGEKRAFT
DES
PROTEIN-FINGERPRINTLNG
119
5.5
ZUR
METHODENWAHL
120
5.6
WIEDERHOLBARKEIT
UND
VERGLEICHBARKEIT
DES
PROTEIN-FINGERPRINTINGS
123
6
S
CHLUSSFOLGERUNGEN
126
7
Z
USAMMENFASSUNG
127
8
SUMMARY
129
9
A
NHANG
131
10
L
ITERATURVERZEICHNIS
142 |
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