Untersuchungen zur Struktur und Dynamik von Proteinen in Lösung mittels multidimensionaler NMR-Spektroskopie:
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1998
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INHALTSVERZEICHNIS
I
INHALTSVERZEICHNIS
1.
EINLEITUNG
1
2.
GRUNDLAGEN
UND
EXPERIMENTELLE
ASPEKTE
DER
7
NMR-SPEKTROSKOPIE
AN
PROTEINEN
2.1
DER
EINSATZ
GEPULSTER
FELDGRADIENTEN
16
2.2
EXPERIMENTE
MIT
EMPFINDLICHKEITSSTEIGERUNG
22
2.3
FALTEN
IN
DER
INDIREKTEN
DIMENSION
28
2.4
OFFRESONANZ-EFFEKTE
33
3.
DIE
ENZYMKLASSE
DER
PHOSPHOLIPASEN
36
3.1
ALLGEMEINES
36
3.2
DIE
GRUPPE
DER
PHOSPHOLIPASEN
A
2
(PLA
2
)
38
3.2.1
CHARAKTERISIERUNG
VERSCHIEDENER
PHOSPHOLIPASEN
A
2
38
3.2.2
DIE
ROLLE
DER
PHOSPHOLIPASEN
A
2
IM
ENTZUENDUNGSGESCHEHEN
41
3.3
DIE
HUMANE
NICHTPANKREATISCHE
SEKRETORISCHE
PHOSPHO
43
LIPASE
A
2
(HNPS-PLA
2
)
3.3.1
BESONDERE
EIGENSCHAFTEN
DER
HNPS-PLA
2
43
3.3.2
DIE
STRUKTUR
DER
HNPS-PLA
2
46
3.3.3
DER
KATALYSEMECHANISMUS
49
3.3.4
DIE
EXPRIMIERUNG
UND
ISOTOPENMARKIERUNG
DER
HNPS-PLA
2
53
4.
NMR-UNTERSUCHUNGEN
AN
HNPS-PLA
2
56
4.1
ALLGEMEINES
56
4.2
NMR-UNTERSUCHUNGEN
AN
DER
UNMARKIERTEN
PROBE
57
INHALTSVERZEICHNIS
N
4.3
NMR-UNTERSUCHUNGEN
AN
DER
[U
15
N]-HNPS-PLA
2
60
4.4
NMR-UNTERSUCHUNGEN
AN
DER
[U
LS
N/
13
C]-HNPS-PLA
2
69
4.4.1
DAS
HNCA-EXPERIMENT
71
4.4.2
DAS
HN(CO)CA-EXPERIMENT
75
4.4.3
DAS
HNCO-EXPERIMENT
77
4.4.4
DAS
HCACO-EXPERIMENT
79
4.4.5
DAS
CBCA(CO)NH-EXPERIMENT
82
4.4.6
DAS
HNCACB-EXPERIMENT
86
4.4.7
DAS
HCCH-TOCSY-EXPERIMENT
89
4.4.8
DAS
13
C-NOESY-EXPERIMENT
93
4.4.9
SEQUENZIELLE
ZUORDNUNG
MIT
TRIPELRESONANZEXPERIMENTEN
96
4.5
EXTRAKTION
VON
STRUKTURRELEVANTEN
PARAMETERN
98
4.5.1
NOE-EFFEKTE
99
4.5.2
J-KOPPLUNGEN
101
4.5.3
CHEMISCHE
VERSCHIEBUNGEN
108
4.5.4
DIASTEREOTOPE
ZUORDNUNG
112
4.5.5
BESTIMMUNG
DER
SEKUNDAERSTRUKTUR
VON
HNPS-PLA
2
118
5.
AUTOMATISCHE
BACKBONE
ZUORDNUNG
VON
HNPS
121
PLA
2
MITTELS
PASTA
5.1
ALLGEMEINES
121
5.2
GRUNDLAGEN
DES
PROGRAMMS
PASTA
122
5.3
AUTOMATISCHE
RFICKGRATZUORDNUNG
VON
HNPS-PLA
2
MITTELS
PASTA
130
INHALTSVERZEICHNIS
M
6.
UNTERSUCHUNGEN
ZUR
DYNAMIK
VON
HNPS-PLA
2
137
6.1
ALLGEMEINE
GRUNDLAGEN
DER
HETERONUKLEAREN
RELAXATION
138
6.2
PULSSEQUENZEN
ZUR
MESSUNG
VON
RELAXATIONSPARAMETERN
145
6.3
ERGEBNISSE
DER
RELAXATIONSMESSUNGEN
AN
HNPS-PLA
2
147
7.
LOESUNGSSTRUKTUR
VON
HNPS-PLA
2
156
7.1
STRUKTURRECHNUNGEN
AN
HNPS-PLA
2
157
7.2
STRUKTURDISKUSSION
VON
HNPS-PLA
2
162
8.
ZUSAMMENFASSUNG
UND
AUSBLICK
171
9.
LITERATURVERZEICHNIS
173
10.
EXPERIMENTELLER
TEIL
190
ANHANG
A
215
ANHANG
B
217
ANHANG
C
222 |
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