Methodische Entwicklungen zur Genomanalyse bei Gerste und Weizen:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1997
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| Beschreibung: | München, Techn. Univ., Diss., 1997 |
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I
NHALTSVERZEICHNIS
I
INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
.
1
2
LITERATURUEBERSICHT
.
2
2.1
MOLEKULARE
MARKER
UND
DEREN
ANWENDUNG
.
2
2.1.1
RFLP-MARKER
.
2
2.1.2
STS-MARKER
.
5
2.1.3
MIKROSATELLITEN
.
7
2.1.4
RAPD-MARKER
.
9
2.1.5
AFLP-MARKER
.
10
2.2
KLONIERUNG
PFLANZLICHER
RESISTENZGENE
.
11
2.3
STRUKTURELLE
ELEMENTE
PFLANZLICHER
RESISTENZGENE
.
15
3
MATERIAL
UND
METHODEN
.
19
3.1
PFLANZENMATERIAL
.
19
3.2
RFLP-MARKER
.
19
3.3
BAKTERIENSTAEMME
.
20
3.4
OLIGONUKLEOTIDE
.
20
3.5
DNA-MOLEKULARGEWICHTSTANDARDS
.
22
3.6
BASISLOESUNGEN
.
23
3.7
STANDARDMETHODEN
.
24
3.8
MODIFIKATIONEN
DER
DNA
.
29
3.8.1
DEPHOSPHORYLIERUNG
LINEARISIERTER
DNA
.
29
3.8.2
ERZEUGUNG
GLATTER
ENDEN
VON
PCR-PRODUKTEN
.
30
3.8.3
PHOSPHORYLIERUNG
VON
PCR-PRODUKTEN
.
30
3.8.4
LIGATION
GLATTER
DNA-ENDEN
.
31
3.9
IN
VITRO
AMPLIFIKATION
VON
DNA
MITTELS
POLYMERASE-KETTEN-REAKTION
(PCR)
NACH
S
AIKI
ET
AL.
(1988)
.
32
3.9.1
STANDARD-PCR
.
32
3.9.2
PCR
AUS
BAKTERIELLEN
ZELLEN
.
33
3.9.3
ALLELSPEZIFISCHE
PCR
.
33
3.9.4
AFLP-ANALYSE
.
36
3.10
DNA-SEQUENZIERUNG
.
39
3.10.1
SEQUENZIERUNG
MIT
DER
THERMOSEQUENASE
UNTER
VERWENDUNG
VON
RADIOAKTIV-MARKIERTEN
PRIMERN
.
39
3.10.2
NICHTRADIOAKTIVE
SEQUENZIERUNG
MIT
DER
TAQ-DNA-POLYMERASE
UNTER
VERWENDUNG
VON
DIGOXIGENIN-MARKIERTEN
PRIMERN
.
39
3.10.3
NICHTRADIOAKTIVE
SEQUENZIERUNG
MIT
DER
TAG-FS
DNA-POLYMERASE
UNTER
VERWENDUNG
VON
FLUORESZENZ-MARKIERTEN
DIDESOXYNUKLEOTIDEN
.
40
3.11
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
.
40
3.11.1
VERTIKALE
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
.
40
I
NHALTSVERZEICHNIS
II
3.11.2
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
MIT
UEBERTRAGUNG
DER
DNA-FRAGMENTE
AUF
EINE
NYLONMEMBRAN
.
41
3.11.3
IMMUNOLOGISCHER
NACHWEIS
DIGOXIGENIN-MARKIERTER
NUKLEINSAEUREN
.
42
3.12
DATENAUSWERTUNG
.
43
4
ERGEBNISSE
.
45
4.1
UMWANDLUNG
VON
MIT
MEHLTAURESISTENZGENEN
GEKOPPELTEN
RFLP-MARKERN
IN
STS-MARKER
.
45
4.1.1
DESIGN
VON
PCR-PRIMERN
.
45
4.1.2
CHARAKTERISIERUNG
VON
STS-MARKERN
MITTELS
ANEUPLOIDER
LINIEN
.47
4.1.3
TRANSFER
VON
STS-MARKERN
ZWISCHEN
GERSTE
UND
WEIZEN
.
50
4.1.4
KARTIERUNG
VON
STS
MARKERN
IN
STANDARDPOPULATIONEN
.
52
4.2
DNA-SEQUENZANALYSE
DER
STS-MARKERSEQUENZEN
MEHLTAURESISTENTER
UND
-ANFAELLIGER
GENOTYPEN
.
53
4.2.1
VERGLEICH
DER
GERSTEN-STS-SEQUENZEN
.
54
4.2.2
VERGLEICH
DER
WEIZEN-STS-SEQUENZEN
.
56
4.3
KONSTRUKTION
ALLEISPEZIFISCHER
PRIMER
ZUR
DIAGNOSE
DER
MEHLTAURESISTENZ
GENE
MILA
DER
GERSTE
UND
PM2
DES
WEIZENS
.
58
4.3.1
MILA
.
58
4.3.2
PM2
.
63
4.4
EVALUIERUNG
VON
AFLP-MARKERN
FUER
DIE
GENOMKARTIERUNG
BEI
GERSTE
.
67
4.4.1
SELEKTION
VON
PRIMERKOMBINATIONEN
.
67
4.4.2
POLYMORPHIEGRAD
VON
AFLP-MARKERN
.
67
4.4.3
SPALTUNGSANALYSE
DER
AFLP-MARKER
.
70
4
4.4
VERTEILUNG
DER
AFLP-MARKER
INNERHALB
DES
GERSTENGENOMS
.
71
4.4.5
KLONIERUNG
UND
SEQUENZIERUNG
VON
AFLP-FRAGMENTEN
.
72
4
5
INTEGRATION
VON
MEHLTAURESISTENZGENEN
IN
EINE
KONSENSUSKARTE
DER
GERSTE
.
73
5
DISKUSSION.
81
5.1
UMWANDLUNG
VON
RFLP-MARKERN
IN
'
SEQUENCE-TAGGED
SITE
'
-MARKER
.
81
5.2
AFLPS
ALS
GENETISCHE
MARKER
FUER
DIE
GENOMANALYSE
BEI
GERSTE
.
91
5.3
MARKERGESTUETZTE
SELEKTION
IN
DER
PFLANZENZUECHTUNG
.
97
6
ZUSAMMENFASSUNG
.
104
7
LITERATURVERZEICHNIS.
106
8
ANHANG
.
119
8.1
KARTIERTE
RFLP-MARKER
DER
KREUZUNG
'
HS1B-87
XVADA
'
.
119
8.2
CHEMIKALIEN
.
120 |
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