Isolierung und Beschreibung neuer Viren der crenarchaealen Gattung Sulfolobus:
Gespeichert in:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
München
Utz, Wiss.
1998
|
| Schriftenreihe: | Biologie
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Zugl.: München, Univ., Fak. für Biologie, Diss., 1998 |
| Beschreibung: | 176 S. Ill. |
| ISBN: | 3896753541 |
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ZUSAMMENFASSUNG
11
SUMMARY
12
A
EINLEITUNG
14
DEM
LETZTEN
GEMEINSAMEN AHN
AUF
DER
SPUR
14
WAS
IST
MIT
DEN
VIREN?
16
VIREN
DER
ARCHAEA
18
BEDEUTUNG
DER
VIREN
FUER
DIE
GENETIK/BIOTECHNOLOGIE
20
WARUM
AUSGERECHNET
SULFOLOBUS-VIREN?
21
ZIELE
UND
ERGEBNISSE
DER
VORLIEGENDEN
ARBEIT
23
B
MATERIAL
UND
METHODEN
24
1.
MATERIAL
24
1.1
BESONDERE
CHEMIKALIEN
UND
HILFSMITTEL
24
1.2
ENZYME
25
1.3
LOESUNGEN
UND
PUFFER
25
1.4
SULFOLOBUS-STAEMME
26
2.
METHODEN
26
2.1
MIKROBIOLOGISCHE
METHODEN
26
2.1.1
ANZUCHT
UND
PLATTIERUNG
VON
SULFOELOBUS
26
2.1.2
PLAQUETEST
27
2.1.3
ERMITTELUNG
DER
INFEKTIONSZEIT
27
2.1.4
ERMITTELUNG
DER
EKLIPSE
VON
SIRV2
27
2.1.5
UV-INDUKTION
SSV-LYSOGENER
SULFOLOBEN
28
2.1.6
ISOLATION
VON
VIRUSPARTIKELN
28
2.1.7
HERSTELLUNG
UND
AUFBEWAHRUNG
VON
STAMMKULTUREN
29
2.1.8
FRAGMENTIERUNG
VON
SIFV-PARTIKELN
29
2.2
MANIPULATIONEN
MIT
DNA
30
2.2.1
ISOLATION
VON
GESAMT-DNA
AUS
ARCHAEEN
30
2.2.2
ISOLATION
ZIRKULAERER,
EXTRACHROMOSOMALER
DNA
AUS
ARCHAEEN
30
2.2.3
ISOLATION
VON
DNA
AUS
GEREINIGTEN
VIRUSPARTIKELN
31
2.2.4
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
VON
DNA
IN
LOESUNG
31
2.2.5
GROESSENBESTIMMUNG
VON
DNA-FRAGMENTEN
31
2.2.6
ENZYMATISCHE
MODIFIKATION
VON
DNA
31
2.2.7
ELEKTROPHORESE
VON
DNA
31
2.2.8
ISOLATION
VON
DNA-FRAGMENTEN
31
2.2.9
SOUTHERN-TRANSFER
VON
DNA
AUF
NYLONMEMBRAN
32
2.2.10
DIG-MARKIERTE
DNA-SONDEN
UND
HYBRIDISIERUNGSREAKTION
32
2.2.11
BAL
57-ABBAU
VON
VIRUS-DNA
32
2.2.12
TRANSFEKTION
VON
SU//O/OBUS-ZELLEN
32
2.3
PROTEINCHEMISCHE
METHODEN
33
2.3.1
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
VON
PROTEINEN
33
2.3.2
SDS-POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
(SDS-PAGE)
33
2.3.3
BESTIMMUNG
VON
AMINOSAEURESEQUENZEN
33
2.4
IMMUNOLOGISCHE
METHODEN
33
2.4.1
HERSTELLUNG
VON
ANTISERUM
33
2.4.2
IVESRERN-WOT-ANALYSE
34
2J
ELEKTRONENMIKROSKOPIE
34
2.5.1
VORBEREITUNG
DER
TRAEGEMETZCHEN
34
2.5.2
PRAEPARATION
VON
PROBEN
34
2.5.3
ELEKTRONENMIKROSKOPISCHE
ABBILDUNGEN
34
2.5.4
ELEKTRONENMIKROSKOPISCHE
AUSZAEHLUNG
VON
VIRUSPARTIKELN
34
2.5.5
IMMUNOMARKTERUNG
VON
VITUS-PRAEPARATEN
35
2.5.6
COMPUTERGESTUETZE
BILDANALYSEN
UND
POWER-SPEKTREN
35
2.6
LIPIDEXTRAKTION
UND
-ANALYSE
(DUENNSCHICHTCHROMATOGRAPHIE)
35
2.7
GENOMANALYSE
36
C
ERGEBNISSE
37
1.
DAS
VIRUS
SIFV
(ULFOLOBUS
ISLANDICUS
FILAMENTOUS
VIRUS)
37
1.1
HERKUNFT
UND
AUSSEHEN
37
1.2
DAS
VIRUS-WIRTS-SYSTEM
37
1.2.1
PLAQUETEST
37
1.2.2
VIRUSVERMEHRUNG
UND
EINFLUSS
AUF
DIE
WIRTS-WACHSTUMSRATE
40
1.2.3
ZIELSTRUKTUR
DER
INFEKTION:
MEMBRAN
ODER
S-LAYER
?
44
1.3
VIRUSKOMPONENTEN
UND
AUFBAU
DES
VIRIONS
44
1.3.1
PROTEINZUSAMMENSETZUNG
44
1.3.2
STRUKTURELLER
AUFBAU
DES
VIRIONS
48
1.3.2.1
DARSTELLUNG
VON
VIRUSKEMEN
DURCH
INKUBATION
VON
VIRUSPARTIKELN
MIT
MEMBRANVESIKELN
VON
HVE10/4
48
1.3.2.2
FRAGMENTIERUNG
DER
VIRIONEN
UND
ISOLATION
VON
REINEM
VIRUSKEM
DURCH
BEHANDLUNG
MIT
ORGANISCHEN
LOESUNGSMITTELN
UND
DETERGENZIEN
51
1.3.2.2.1
PROTEINZUSAMMENSETZUNG
VIRALER
STRUKTURELEMENTE
58
1.3.2.2.2
NACHWEIS
VON
DNA
IN
VIRALEN
STRUKTURELEMENTEN
60
1.3.2.2.3
NACHWEIS VON
LIPIDEN
IN
DER
VIRUSHUELLE
60
1.3.2.3
ELEKTRONENOPTISCHE
ANALYSE
DER
FEINSTRUKTUR
UND
ENTWICKLUNG
EINES
MODELLS
62
1.3.3
DIE
VIRUS-DNA
65
1.3.3.1
ART
UND
BESCHAFFENHEIT
DER
DNA
65
1.3.3.2
DAS
VIRUS-GENOM
69
1.3.3.2.1
STRUKTURIERUNG
DES
GENOMS
71
1.3.3.2.2
HOMOLOGIE
DER
LESERAHMEN
73
1.3.3.3
SIND
SIFV
UND
DAFV
AUF
DNA-EBENE
HOMOLOG?
80
-8
2.
DAS
VIRUS
SNDV
(GULFOLOBUS
NEWZEALANDICUS
DROPLET-
FORMED
VIRUS)
81
2.1
HERKUNFT
UND
AUSSEHEN
81
2.2
DAS
VIRUS-WIRTS-SYSTEM
81
2.2.1
SUCHE
NACH
EINEM
LABORWIRT 81
2.2.2
VERSUCHE
ZUR
ENTWICKLUNG
EINES
PLAQUETESTS
84
2.2.3
ELEKTRONENOPTISCHER
NACHWEIS
DES
INFEKTIONSVORGANGS
84
2.2.4
VIRUSVEHRTNEHRUNG
UND
EINFLUSS
AUF
DAS
WIRTSWACHSTUM
86
2.2.5
KURIERUNG
ODER
RESISTENZ
DER WIRTSZELLEN
90
2.2.6
NACHWEIS
DER
NICHT-INTEGRATION
DES
VINIS-GENOMS
IN
DAS
WIRTS-CHROMOSOM
90
2.3
VIRUSKOMPONENTEN
UND
-STRUKTUR
92
2.3.1
PROTEINZUSAMMENSETZUNG
92
2.3.2
STRUKTURELLER
AUFBAU
DES
VIRIONS
94
2.3.3
DIE
VIRUS-DNA
95
3.
DAS
VIRUS
SIRV2
(GULFOLOBUS
FSLANDICUS
ROD-SHAPED
VIRUS
2)
98
3.1
HERKUNFT
UND
AUSSEHEN
98
3.2
DAS
VIRUS-WIRTS-SYSTEM
98
3.2.1
SUCHE
NACH
EINEM
LABORWIRT
98
3.2.2
ENTWICKLUNG
EINES
PLAQUETESTS
100
3.2.3
VIRUSVERMEHRUNG
UND
EINFLUSS
AUF
DAS
WIRTS-WACHSTUM
100
3.2.4
RESISTENZ
DER
WIRTSZELLEN
104
3.2.5
NACHWEIS
DER
NICHT-INTEGRATION
DES
VIRUS-GENOMS
IN
DAS
WIRTS-CHROMOSOM
105
3.2.6
ADSORPTION
AN
DIE
WIRTSZELLE
105
3.3
VIRUSKOMPONENTEN
UND
-STRUKTUR
108
3.3.1
PROTEINZUSAMMENSETZUNG
108
3.3.2
STRUKTURELLER
AUFBAU
DES
VIRIONS
109
3.3.3
DIE
VIRUS-DNA
115
3.4
GENETISCHE
STABILITAET
VON
SIRV2
UND
VARIABILITAET
VON
SIRV1
118
4.
NEUE
VIREN
AUS
DER
FAMILIE
FUSELLOVIRIDAE
122
4.1
HERKUNFT
UND
AEHNLICHKEIT
MIT
SSV1
122
4.2
DAS
ISLAENDISCHE
SSV2
122
4.2.1
HERKUNFT
UND
AUSSEHEN
125
4.2.2
AUSSCHLEUSUNG
VON
SSV2
AUS
DER
WIRTSZELLE
125
4.2.3
VIRUS-GENOM
UND
INTEGRATION
125
4.2.4
VIRUSPRODUKTION
UND
ENTDECKUNG
VON
SSVX
128
9
4.3
SSVX
131
4.3.1
WECHSELWIRKUNG
MIT
SSV2
131
4.3.2
SSVX
IST
MIT
DEN
5U//O/OEZ?M5-PLASMIDEN
PRNL
UND
PRN2
VERWANDT
132
D
DISKUSSION
138
1.
DAS
VIRUS
SIFV
138
1.1
DAS
VIRUS-WIRTS-VERHAELTNIS
138
1.2
AUFBAU,
STRUKTUR
UND
SCHEMATISCHES
MODELL
VON
SIFV
139
1.3
DAS
GENOM
VON
SIFV
141
2.
DAS
VIRUS
SNDV
144
2.1
DAS
VIRUS-WIRTS-VERHAELTNIS
144
2.2
AUFBAU
UND
GENOM
145
3.
DAS
VIRUS
SIRV2
146
3.1
MORPHOLOGIE
UND
PROTEINE
146
3.2
VIRUS-WIRTS-BEZIEHUNG
VON
SIRV2
147
3.3
DIE
GENOM-TERMINI
148
3.4
GENETISCHE
VARIABILITAET
VON
SIRVI
148
4.
DIE
FUSELLOVIRIDAE
150
5.
SSVX:
FAHRGAST
ODER
PARASIT?
151
6.
AUSBLICK:
EIN
VIRUS-BASIERTES
VEKTORSYSTEM
FUER
SULFOLOBUS?
153
7.
PHYLOGENETISCHE
BETRACHTUNG
ARCHAEALER
VIREN
155
LITERATURVERZEICHNIS
161
ANHANG
174
10 |
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