Gewebespezifische Transkriptionsfaktoren: Struktur und Regulation der Gene des Transkriptionsfaktors "Hepatocyte nuclear factor 1a" (HNF-1a) und seines Cofaktors "Dimerization cofaktor of HNF-1" (DCoH) aus Huhn
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Format: | Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
München
Diss.-Verl. NG-Kopierladen
1998
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Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
Beschreibung: | Zugl.: München, Univ., Fak. für Chemie und Pharmazie, Diss., 1997 |
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INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
1
EINLEITUNG
1
1.1
PRINZIPIEN
DER
GEWEBESPEZIFISCHEN
GENEXPRESSION
1
1.2
HNF-1
REGULIERT
DIE
EXPRESSION
VON
ETWA
40
BEKANNTEN
GENEN
2
1.3
HISTORISCHES:
DIE
ENTDECKUNG
VON
HNF-1
UND
VON
HNF-1
SUBTYPEN
3
1.4
STRUKTUR
UND
FUNKTIONELLE
DOMAENEN
DER
HNF-1
SUBTYPEN
4
1.5
EXPRESSIONSMUSTER
VON
HNF-LA
UND
HNF-LSS
BEI
SAEUGERN
7
1.6
DER
DIMERISIERUNGS-COFAKTOR
VON
HNF-1
(DCOH),
EIN
YYDUAL
FUNCTION
7
PROTEIN
"
,
IST
IDENTISCH
MIT
DEM
PTERIDIN-STOFIWECHSELENZYM
4A
CARBINOLAMIN
DEHYDRATASE
1.7
VORGESCHICHTE
ZU
DIESER
DISSERTATIONSARBEIT:
UNERWARTETE
EXPRESSION
9
VON
HNF-LA
IM
HUEHNEROVIDUKT
UND
MOEGLICHE
ROLLE
BEI
DER
REGULATION
DES
HUEHNER
LYSOZYMGENS
1.8
AUFGABENSTELLUNG
10
2
ERGEBNISSE
DER
ARBEITEN
ZUM
HNF-LA
GEN
AUS
HUHN
13
2.1
SEQUENZANALYSE
DER
30
KB
LANGEN
GENDOMAENE
13
2.2
GENOMISCHE
STRUKTUR
DES
HNF
1
A
GENS
AUS
HUHN
14
2.3
VERGLEICH
DER
PROMOTOREN
DES
HNF-LA
GENS
VON
HUHN,
XENOPUS,
17
RATTE,
MAUS
UND
MENSCH
2.4
GEWEBESPEZIFISCHE
EXPRESSION
VON
HNF
1
A
AUS
HUHN
20
2.5
BESTIMMUNG
VON
TRANSKRIPTIONSSTART
UND-ENDE
DES
HNF-LA
GENS
AUS
21
HUHN
MIT
HILFE
DER
RACE-TECHNIK
2.6
ANALYSE
VON
DNASE
I-HYPERSENSITIVEN
STELLEN
IM
CHROMATIN
DES
24
HUEHNER
HNF-LA
GENS
IN
EXPRIMIERENDEN
UND
IN
NICHT
EXPRIMIERENDEN
GEWEBEN
2.6.1
DNASE
I-HYPERSENSITIVE
STELLEN
IN
DER
5
'-REGION
DER
GENDOMAENE
24
2.6.2
DNASE
I-HYPERSENSITIVE
STELLEN
IN
DER
PROMOTOR-REGION
27
2.6.3
DNASE
I-HYPERSENSITIVE
STELLEN
IM
1.
INTRON
30
2.6.4
DNASE
I-HYPERSENSITIVE
STELLEN
NACH
DEM
2.
EXON
BIS
ZUR
POLY
34
ADENYLIERUNGSSTELLE
SEITE
2.6.5
DNASE
L-HYPERSENSITIVE
STELLEN
IN
DER
3
'-REGION
DER
GENDOMAENE
34
2.6.6
ZUSAMMENFASSUNG
DER
EXPERIMENTE
ZUR
KARTIERUNG
DNASE
I
HYPERSENSITIVER
STELLEN
39
2.7
FUNKTIONSANALYSE
VON
DNA-FRAGMENTEN
AUS
DEN
HYPERSENSITIVEN
REGIONEN
DES
HNF-LA
GENS
41
2.7.1
DARSTELLUNG
VON
REPORTERKONSTRUKTEN
UND
TRANSFEKTIONSMETHODE
41
2.7.2
TRANSFEKTION
MIT
KONSTRUKTEN
AUS
HS
-0,2
(PROMOTORREGION
DES
HNF
LA
GENS)
43
2.7.3
TRANSFEKTION
MIT
KONSTRUKTEN
AUS
HS
+4,8
UND
HS
+5,6
IM
1.
INTRON
DES
HNF-LA-GENS;
ENTDECKUNG
EINES
LEBERSPEZIFISCHEN
ENHANCERS
45
3
ERGEBNISSE
DER
ARBEITEN
ZUM
DCOH
GEN AUS
HUHN
49
3.1
ENTWICKLUNG
EINES
HEMISPEZIFISCHEN
PCR-VERFAHRENS
ZUR
ERSCHLIESSUNG
UNBEKANNTER
GENOMISCHER
REGIONEN
49
3.2
ISOLIERUNG
DER
CDNA
SOWIE
BESTIMMUNG
VON
TRANSKRIPTIONSSTART
UND
-ENDE
DES
DCOH
GENS
AUS
HUHN
51
3.3
ERWEITERUNG
DER
DNA
SEQUENZ
AUF
DIE
FLANKIERENDEN
5'
UND
3'
REGIONEN
DES
HUEHNER
DCOH
GENS
MIT
HILFE
DER
NEU
ENTWICKELTEN
PCR-TECHNIK
54
3.4
OPTIMIERUNG
DER
NEUEN
HEMISPEZIFISCHEN
PCR-TECHNIK
55
3.5
GEWEBESPEZIFISCHE
EXPRESSION
DES
DCOH
GENS
AUS
HUHN
60
3.6
EVOLUTIONAERE
KONSERVIERUNG
EINER
UNGEWOEHNLICHEN
EXON-INTRON
STRUKTUR
IM
DCOH
GEN
VON
HUHN,
RATTE
UND
MENSCH
61
4
DISKUSSION
63
4.1
ANALYSE
DER
CHROMATINSTRUKTUR
DES
HNF-LA
GENS:
UNTERSCHIEDLICHE
SAETZE
VON
DNASE
I-HYPERSENSITIVEN
STELLEN
KORRELIEREN
MIT
DER
GEWEBESPEZIFISCHEN
EXPRESSION
DES
GENS
64
4.2
ENTDECKUNG
EINES
ENHANCERS
IM
ERSTEN
INTRON
DES
HNF-LA
GENS
AUS
HUHN
64
4.3
SIND
DIE
UBIQUITAER
VORKOMMENDEN
DNASE
I-HYPERSENSITIVEN
STELLEN
HS
-6,3
UND
HS
+19,6
MOEGLICHERWEISE
YYINSULATOR
"
-ELEMENTE?
66
SEITE
4.4
WEITETENTWICKLUNG
HEMISPEZIFISCHER
PCR-VERFAHREN
ZUR
ERSCHLIESSUNG
67
UNBEKANNTER
GENOMISCHER
REGIONEN
4.5
IST
DIE
KONSERVIERTE
UNGEWOEHNLICHE
EXON-INTRON-STRUKTUR
DES
DCOH
70
GENS
DER
SCHLUESSEL
ZUM
VERSTAENDNIS
DER
REGULATION?
5
MATERIALIEN
UND
METHODEN
71
5.1
REAGENTIEN
71
5.1.1
CHEMIKALIEN
71
5.1.2
VERBRAUCHSMATERIAL
72
5.1.3
ENZYME
72
5.1.4
YYKITS
"
73
5.1.5
MIKROBIOLOGIE
74
5.1.6
ZELLKULTUR
74
5.1.7
RADIOCHEMIKALIEN
74
5.2
LOESUNGEN,
PUFFER
UND
MEDIEN
75
5.3
BAKTERIENSTAEMME
76
5.4
KLONIERUNGSVEKTOREN
77
5.5
GERAETE
78
5.6
TIERE
78
5.7
COMPUTERPROGRAMME
78
5.8
STANDARDPROZEDUREN
78
5.9
KLONIERUNGEN
79
5.10
ISOLIERUNG
UND
REINIGUNG
VON
PLASMID-DNA
AUS
E.
COLI
79
5.11
ISOLIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
EUKARYONTISCHEN
URSPRUNGS
79
5.11.1
ISOLIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
AUS
HUEHNERGEWEBEN
79
5.11.2
ISOLIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
AUS
MENSCHLICHEN
ZELLKULTURZELLEN
80
(HEPG2)
5.12
RADIOAKTIVE
MARKIERUNG
VON
DNA
81
5.13
DNA-TRANSFER
AUF
NYLONMEMBRANEN
UND
HYBRIDISIERUNG
81
5.14
SEQUENZANALYSE
82
5.15
ISOLIERUNG
VON
ZELLKERNEN
UND
DNASE
I-BEHANDLUNG
82
5.16
DNA-AMPLIFIKATION
UEBER
DIE
POLYMERASE-KETTENREAKTION
(
YYPCR
"
)
84
YYLIGATION
MEDIATED
"
-PCR
5.17
DARSTELLUNG
VON
REPORTERKONSTRUKTEN
85
5.17.1
AMPLIFIKATION
VON
DNA-SEQUENZEN
AUS
DEN
HYPERSENSITIVEN
85
ABSCHNITTEN
VON
HNF-LA
5.17.2
KLONIERUNG
UND
PRAEPARATION
DER
REPORTERKONSTRUKTE
88
5.18
ZELLKULTUR
89
5.19
LIPOSOMENVERMITTELTE
TRANSIENTE
TRANSFEKTION
90
5.20
REPORTERGEN-ANALYSE
UND
AUSWERTUNG
DER
MESSERGEBNISSE
91
5.21
RT-PCR
93
5.22
BESTIMMUNG
VON
TRANSKRIPTIONSSTART
UND
-ENDE
MITTELS
RACE
95
5.22.1
5
-RACE
96
5.22.2
3
'-RACE
98
5.23
ERSCHLIESSUNG
UNBEKANNTER
GENOMISCHER
DNA-REGIONEN
UBER
DIE
99
6
ZUSAMMENFASSUNG
102
7
LITERATURVERZEICHNIS
105
8
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
115
9
ANHANG
116
9.1
TABELLE
BEKANNTER
HNF-LA
ABHAENGIGER
GENE
116
9.2
NUKLEOTIDSEQUENZ
DER
30
KB
LANGEN
DOMAENE
DES
HNF-LA
GENS
AUS
HUHN
118
9.3
NUKLEOTIDSEQUENZ
DES
BISLANG
ISOLIERTEN,
12,5
KB
LANGEN
GENOMISCHEN
ABSCHNITTS
DES
DCOH
GENS
AUS
HUHN
142
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spelling | Bossow, Sascha Verfasser aut Gewebespezifische Transkriptionsfaktoren Struktur und Regulation der Gene des Transkriptionsfaktors "Hepatocyte nuclear factor 1a" (HNF-1a) und seines Cofaktors "Dimerization cofaktor of HNF-1" (DCoH) aus Huhn von Sascha Bossow München Diss.-Verl. NG-Kopierladen 1998 IV, 151 S. Ill., graph. Darst. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Zugl.: München, Univ., Fak. für Chemie und Pharmazie, Diss., 1997 Transkriptionsfaktor (DE-588)4303350-7 gnd rswk-swf Huhn (DE-588)4026126-8 gnd rswk-swf Leber (DE-588)4034933-0 gnd rswk-swf Genexpression (DE-588)4020136-3 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Huhn (DE-588)4026126-8 s Leber (DE-588)4034933-0 s Transkriptionsfaktor (DE-588)4303350-7 s Genexpression (DE-588)4020136-3 s DE-604 DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=007940968&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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